Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_12029
- Subject:
- XM_024452099.1
- Aligned Length:
- 1338
- Identities:
- 938
- Gaps:
- 399
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGGGGGAAGTTCCCAGGTCCCCCTTCAGTGAGGTCTTCCTGATGGATGCTGATATGGTCTGGCTGTGTCCCCA 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 CCCAAATCTCATCTTGAATTGTAGCTCCCACAATTCCTACAGGTCATGGGAGGGACTCAGTGGGAGCATCTCAT 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 149 CTTGTCTAAACGGGGAGAGTGGCCATCTGTCCGATACCCACATCAAACCTGATCGTTCCCAGCCTCACAGAGCT 222
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 223 GCTTTGTTCCAAGGTGACGCCTTCTGGGCCCCATCTGTCCTTCCTCACAGCACCCTCAGCACCTTAAGCCACCA 296
Query 1 -------------------------ATGGAGTCCAAGGTCTCAGAAGGTGGCCTGAATGTGACCCTCACCATCC 49
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 CCCTCAGCCACAATTTGGCAGAAGGATGGAGTCCAAGGTCTCAGAAGGTGGCCTGAATGTGACCCTCACCATCC 370
Query 50 GCCTGCTGATGCATGGAAAGGAAGTTGGAAGCATCATCGGGAAGAAAGGAGAAACTGTGAAGAAGATGCGTGAG 123
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 GCCTGCTGATGCATGGAAAGGAAGTTGGAAGCATCATCGGGAAGAAAGGAGAAACTGTGAAGAAGATGCGTGAG 444
Query 124 GAGAGTGGTGCAAGGATCAACATCTCAGAGGGAAACTGCCCAGAGAGGATTGTGACCATCACAGGCCCCACAGA 197
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GAGAGTGGTGCAAGGATCAACATCTCAGAGGGAAACTGCCCAGAGAGGATTGTGACCATCACAGGCCCCACAGA 518
Query 198 CGCCATCTTCAAGGCCTTTGCCATGATCGCATACAAGTTTGAGGAGGATATCATCAACTCCATGAGCAACAGCC 271
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 CGCCATCTTCAAGGCCTTTGCCATGATCGCATACAAGTTTGAGGAGGATATCATCAACTCCATGAGCAACAGCC 592
Query 272 CTGCCACCAGCAAGCCCCCAGTGACGCTGAGGCTGGTGGTGCCTGCCAGCCAGTGCGGGTCCCTGATCGGCAAA 345
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 593 CTGCCACCAGCAAGCCCCCAGTGACGCTGAGGCTGGTGGTGCCTGCCAGCCAGTGTGGGTCCCTGATCGGCAAA 666
Query 346 GGAGGCTCCAAGATCAAGGAGATCAGGGAGTCCACAGGTGCCCAGGTGCAGGTGGCTGGGGACATGCTGCCCAA 419
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 GGAGGCTCCAAGATCAAGGAGATCAGGGAGTCCACAGGTGCCCAGGTGCAGGTGGCTGGGGACATGCTGCCCAA 740
Query 420 CTCCACGGAGCGAGCGGTGACCATCTCGGGGACCCCAGATGCCATCATCCAGTGCGTCAAGCAGATCTGTGTGG 493
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 CTCCACGGAGCGAGCGGTGACCATCTCGGGGACCCCAGATGCCATCATCCAGTGCGTCAAGCAGATCTGTGTGG 814
Query 494 TCATGCTGG----------------------------------------------------------------- 502
|||||||||
Sbjct 815 TCATGCTGGAGTCCCCACCGAAAGGTGCCACCATTCCCTACCGCCCAAAGCCCGCCTCCACCCCTGTCATTTTT 888
Query 503 ----------AGGCCTACACAATCCAGGGACAGTATGCCATCCCTCACCCGGAT---TTGACCAAGCTCCACCA 563
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 889 GCAGGTGGTCAGGCCTACACAATCCAGGGACAGTATGCCATCCCTCACCCGGATCAGTTGACCAAGCTCCACCA 962
Query 564 GTTGGCCATGCAGCAAACCCCCTTTCCTCCCCTCGGACAGACCAACCCCGCTTTCCCCGGAGAAAAGCTGCCTT 637
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 GTTGGCCATGCAGCAAACCCCCTTTCCTCCCCTCGGACAGACCAACCCCGCTTTCCCCGGAGAAAAGCTGCCTT 1036
Query 638 TACACTCCTCCGAAGAAGCTCAAAATCTGATGGGCCAGTCATCAGGTCTGGACGCCAGCCCACCGGCCAGCACT 711
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 TACACTCCTCCGAAGAAGCTCAAAATCTGATGGGCCAGTCATCAGGTCTGGACGCCAGCCCACCGGCCAGCACT 1110
Query 712 CATGAGCTCACCATTCCCAATGATCTAATAGGCTGCATAATTGGACGCCAAGGGACCAAAATCAATGAAATTCG 785
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 CATGAGCTCACCATTCCCAATGATCTAATAGGCTGCATAATTGGACGCCAAGGGACCAAAATCAATGAAATTCG 1184
Query 786 ACAGATGTCTGGAGCTCAGATCAAAATCGCCAACGCCACGGAAGGGTCCTCAGAGCGTCAGATCACCATCACGG 859
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 ACAGATGTCTGGAGCTCAGATCAAAATCGCCAACGCCACGGAAGGGTCCTCAGAGCGTCAGATCACCATCACGG 1258
Query 860 GGACCCCGGCCAACATCAGCCTTGCCCAGTATCTCATCAACGCCAGGCTGACGTCCGAGGTCACCGGGATGGGC 933
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 GGACCCCGGCCAACATCAGCCTTGCCCAGTATCTCATCAACGCCAGGCTGACGTCCGAGGTCACCGGGATGGGC 1332
Query 934 ACGCTG 939
||||||
Sbjct 1333 ACGCTG 1338