Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_12029
• Subject: XM_024452102.1
• Aligned Length: 1338
• Identities: 878
• Gaps: 459

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGGGGGAAGTTCCCAGGTCCCCCTTCAGTGAGGTCTTCCTGATGGATGCTGATATGGTCTGGCTGTGTCCCCA  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  CCCAAATCTCATCTTGAATTGTAGCTCCCACAATTCCTACAGGTCATGGGAGGGACTCAGTGGGAGCATCTCAT  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  CTTGTCTAAACGGGGAGAGTGGCCATCTGTCCGATACCCACATCAAACCTGATCGTTCCCAGCCTCACAGAGCT  222

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  223  GCTTTGTTCCAAGGTGACGCCTTCTGGGCCCCATCTGTCCTTCCTCACAGCACCCTCAGCACCTTAAGCCACCA  296

Query    1  -------------------------ATGGAGTCCAAGGTCTCAGAAGGTGGCCTGAATGTGACCCTCACCATCC  49
                                     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CCCTCAGCCACAATTTGGCAGAAGGATGGAGTCCAAGGTCTCAGAAGGTGGCCTGAATGTGACCCTCACCATCC  370

Query   50  GCCTGCTGATGCATGGAAAGGAAGTTGGAAGCATCATCGGGAAGAAAGGAGAAACTGTGAAGAAGATGCGTGAG  123
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GCCTGCTGATGCATGGAAAGGAAGTTGGAAGCATCATCGGGAAGAAAGGAGAAACTGTGAAGAAGATGCGTGAG  444

Query  124  GAGAGTGGTGCAAGGATCAACATCTCAGAGGGAAACTGCCCAGAGAGGATTGTGACCATCACAGGCCCCACAGA  197
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GAGAGTGGTGCAAGGATCAACATCTCAGAGGGAAACTGCCCAGAGAGGATTGTGACCATCACAGGCCCCACAGA  518

Query  198  CGCCATCTTCAAGGCCTTTGCCATGATCGCATACAAGTTTGAGGAGGATATCATCAACTCCATGAGCAACAGCC  271
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CGCCATCTTCAAGGCCTTTGCCATGATCGCATACAAGTTTGAGGAGGATATCATCAACTCCATGAGCAACAGCC  592

Query  272  CTGCCACCAGCAAGCCCCCAGTGACGCTGAGGCTGGTGGTGCCTGCCAGCCAGTGCGGGTCCCTGATCGGCAAA  345
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct  593  CTGCCACCAGCAAGCCCCCAGTGACGCTGAGGCTGGTGGTGCCTGCCAGCCAGTGTGGGTCCCTGATCGGCAAA  666

Query  346  GGAGGCTCCAAGATCAAGGAGATCAGGGAGTCCACAGGTGCCCAGGTGCAGGTGGCTGGGGACATGCTGCCCAA  419
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GGAGGCTCCAAGATCAAGGAGATCAGGGAGTCCACAGGTGCCCAGGTGCAGGTGGCTGGGGACATGCTGCCCAA  740

Query  420  CTCCACGGAGCGAGCGGTGACCATCTCGGGGACCCCAGATGCCATCATCCAGTGCGTCAAGCAGATCTGTGTGG  493
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CTCCACGGAGCGAGCGGTGACCATCTCGGGGACCCCAGATGCCATCATCCAGTGCGTCAAGCAGATCTGTGTGG  814

Query  494  TCATGCTGG-----------------------------------------------------------------  502
            |||||||||                                                                 
Sbjct  815  TCATGCTGGAGTCCCCACCGAAAGGTGCCACCATTCCCTACCGCCCAAAGCCCGCCTCCACCCCTGTCATTTTT  888

Query  503  ----------AGGCCTACACAATCCAGGGACAGTATGCCATCCCTCACCCGGAT---TTGACCAAGCTCCACCA  563
                      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||
Sbjct  889  GCAGGTGGTCAGGCCTACACAATCCAGGGACAGTATGCCATCCCTCACCCGGATCAGTTGACCAAGCTCCACCA  962

Query  564  GTTGGCCATGCAGCAAACCCCCTTTCCTCCCCTCGGACAGACCAACCCCGCTTTCCCCGGAGAAAAGCTGCCTT  637
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                
Sbjct  963  GTTGGCCATGCAGCAAACCCCCTTTCCTCCCCTCGGACAGACCAACCCCGCTTTCCCC----------------  1020

Query  638  TACACTCCTCCGAAGAAGCTCAAAATCTGATGGGCCAGTCATCAGGTCTGGACGCCAGCCCACCGGCCAGCACT  711
                                                        ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1021  --------------------------------------------GGTCTGGACGCCAGCCCACCGGCCAGCACT  1050

Query  712  CATGAGCTCACCATTCCCAATGATCTAATAGGCTGCATAATTGGACGCCAAGGGACCAAAATCAATGAAATTCG  785
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1051  CATGAGCTCACCATTCCCAATGATCTAATAGGCTGCATAATTGGACGCCAAGGGACCAAAATCAATGAAATTCG  1124

Query  786  ACAGATGTCTGGAGCTCAGATCAAAATCGCCAACGCCACGGAAGGGTCCTCAGAGCGTCAGATCACCATCACGG  859
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1125  ACAGATGTCTGGAGCTCAGATCAAAATCGCCAACGCCACGGAAGGGTCCTCAGAGCGTCAGATCACCATCACGG  1198

Query  860  GGACCCCGGCCAACATCAGCCTTGCCCAGTATCTCATCAACGCCAGGCTGACGTCCGAGGTCACCGGGATGGGC  933
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1199  GGACCCCGGCCAACATCAGCCTTGCCCAGTATCTCATCAACGCCAGGCTGACGTCCGAGGTCACCGGGATGGGC  1272

Query  934  ACGCTG  939
            ||||||
Sbjct 1273  ACGCTG  1278