Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_12029
- Subject:
- XM_024452112.1
- Aligned Length:
- 1182
- Identities:
- 878
- Gaps:
- 303
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGGGGGAAGGTGACGCCTTCTGGGCCCCATCTGTCCTTCCTCACAGCACCCTCAGCACCTTAAGCCACCACCC 74
Query 1 ----------------------ATGGAGTCCAAGGTCTCAGAAGGTGGCCTGAATGTGACCCTCACCATCCGCC 52
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 TCAGCCACAATTTGGCAGAAGGATGGAGTCCAAGGTCTCAGAAGGTGGCCTGAATGTGACCCTCACCATCCGCC 148
Query 53 TGCTGATGCATGGAAAGGAAGTTGGAAGCATCATCGGGAAGAAAGGAGAAACTGTGAAGAAGATGCGTGAGGAG 126
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 TGCTGATGCATGGAAAGGAAGTTGGAAGCATCATCGGGAAGAAAGGAGAAACTGTGAAGAAGATGCGTGAGGAG 222
Query 127 AGTGGTGCAAGGATCAACATCTCAGAGGGAAACTGCCCAGAGAGGATTGTGACCATCACAGGCCCCACAGACGC 200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 AGTGGTGCAAGGATCAACATCTCAGAGGGAAACTGCCCAGAGAGGATTGTGACCATCACAGGCCCCACAGACGC 296
Query 201 CATCTTCAAGGCCTTTGCCATGATCGCATACAAGTTTGAGGAGGATATCATCAACTCCATGAGCAACAGCCCTG 274
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 CATCTTCAAGGCCTTTGCCATGATCGCATACAAGTTTGAGGAGGATATCATCAACTCCATGAGCAACAGCCCTG 370
Query 275 CCACCAGCAAGCCCCCAGTGACGCTGAGGCTGGTGGTGCCTGCCAGCCAGTGCGGGTCCCTGATCGGCAAAGGA 348
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 371 CCACCAGCAAGCCCCCAGTGACGCTGAGGCTGGTGGTGCCTGCCAGCCAGTGTGGGTCCCTGATCGGCAAAGGA 444
Query 349 GGCTCCAAGATCAAGGAGATCAGGGAGTCCACAGGTGCCCAGGTGCAGGTGGCTGGGGACATGCTGCCCAACTC 422
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GGCTCCAAGATCAAGGAGATCAGGGAGTCCACAGGTGCCCAGGTGCAGGTGGCTGGGGACATGCTGCCCAACTC 518
Query 423 CACGGAGCGAGCGGTGACCATCTCGGGGACCCCAGATGCCATCATCCAGTGCGTCAAGCAGATCTGTGTGGTCA 496
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 CACGGAGCGAGCGGTGACCATCTCGGGGACCCCAGATGCCATCATCCAGTGCGTCAAGCAGATCTGTGTGGTCA 592
Query 497 TGCTGGAG------------------------------------------------------------------ 504
||||||||
Sbjct 593 TGCTGGAGTCCCCACCGAAAGGTGCCACCATTCCCTACCGCCCAAAGCCCGCCTCCACCCCTGTCATTTTTGCA 666
Query 505 -------------------------------------------------------------------------- 504
Sbjct 667 GGTGGTCAGGTAAGAGCCGATCCGCTCGCGGCCTCCACTGCCAACCTCAGCCTTTTACTGCAGCACCCGCCGCT 740
Query 505 ----GCCTACACAATCCAGGGACAGTATGCCATCCCTCACCCGGAT---TTGACCAAGCTCCACCAGTTGGCCA 571
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 GCCCGCCTACACAATCCAGGGACAGTATGCCATCCCTCACCCGGATCAGTTGACCAAGCTCCACCAGTTGGCCA 814
Query 572 TGCAGCAAACCCCCTTTCCTCCCCTCGGACAGACCAACCCCGCTTTCCCCGGAGAAAAGCTGCCTTTACACTCC 645
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 TGCAGCAAACCCCCTTTCCTCCCCTCGGACAGACCAACCCCGCTTTCCCC------------------------ 864
Query 646 TCCGAAGAAGCTCAAAATCTGATGGGCCAGTCATCAGGTCTGGACGCCAGCCCACCGGCCAGCACTCATGAGCT 719
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 865 ------------------------------------GGTCTGGACGCCAGCCCACCGGCCAGCACTCATGAGCT 902
Query 720 CACCATTCCCAATGATCTAATAGGCTGCATAATTGGACGCCAAGGGACCAAAATCAATGAAATTCGACAGATGT 793
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 903 CACCATTCCCAATGATCTAATAGGCTGCATAATTGGACGCCAAGGGACCAAAATCAATGAAATTCGACAGATGT 976
Query 794 CTGGAGCTCAGATCAAAATCGCCAACGCCACGGAAGGGTCCTCAGAGCGTCAGATCACCATCACGGGGACCCCG 867
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 977 CTGGAGCTCAGATCAAAATCGCCAACGCCACGGAAGGGTCCTCAGAGCGTCAGATCACCATCACGGGGACCCCG 1050
Query 868 GCCAACATCAGCCTTGCCCAGTATCTCATCAACGCCAGGCTGACGTCCGAGGTCACCGGGATGGGCACGCTG 939
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1051 GCCAACATCAGCCTTGCCCAGTATCTCATCAACGCCAGGCTGACGTCCGAGGTCACCGGGATGGGCACGCTG 1122