Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_12046
• Subject: NM_022720.7
• Aligned Length: 2319
• Identities: 1470
• Gaps: 849

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGGAGACAGATGAGAGCCCCTCTCCGCTCCCGTGTGGGCCCGCAGGAGAAGCGGTGATGGAGAGCCGAGCTCG  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  CCCCTTCCAAGCGCTGCCCCGTGAGCAGTCTCCACCACCTCCCCTGCAAACGTCCAGTGGTGCAGAGGTAATGG  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  ACGTTGGCTCTGGTGGTGATGGACAGTCCGAACTCCCTGCTGAGGACCCCTTCAACTTCTACGGAGCTTCTCTT  222

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  223  CTCTCCAAAGGATCCTTCTCTAAGGGCCGCCTCCTCATAGACCCGAACTGTAGTGGCCACAGCCCGCGCACCGC  296

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  297  CCGGCACGCACCTGCGGTCCGGAAGTTCTCCCCTGACCTTAAGTTGCTTAAGGATGTAAAGATTAGCGTGAGCT  370

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  371  TTACCGAGAGCTGCAGGAGTAAGGACAGGAAGGTGCTGTACACAGGAGCAGAGCGCGACGTGCGGGCGGAGTGC  444

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  445  GGTCTGCTCCTTAGCCCTGTCAGTGGGGACGTGCATGCTTGTCCCTTTGGCGGGAGTGTTGGTGACGGGGTAGG  518

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  519  CATAGGGGGTGAGAGTGCTGATAAGAAGGATGAGGAGAATGAGCTGGATCAGGAAAAGAGAGTGGAGTATGCAG  592

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  593  TGCTCGATGAGTTAGAAGATTTTACTGACAATTTGGAGCTAGATGAAGAAGGAGCAGGCGGGTTCACGGCTAAA  666

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  667  GCAATCGTTCAGAGAGACAGAGTGGATGAAGAGGCCTTGAATTTCCCCTACGAGGATGACTTTGACAACGATGT  740

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  741  GGATGCTCTGCTGGAAGAAGGCCTTTGTGCCCCCAAAAAGAGGCGAACAGAGGAAAAATATGGCGGAGACAGCG  814

Query    1  -----------------------------------ATGATGACCAAGATTAAAACAGTGCTCAAAAGTCGTGGC  39
                                               |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  ACCATCCGTCCGATGGAGAGACAAGTGTGCAGCCGATGATGACCAAGATTAAAACAGTGCTCAAAAGTCGTGGC  888

Query   40  CGCCCACCTACAGAGCCGCTGCCCGACGGGTGGATCATGACATTCCATAACTCTGGAGTCCCGGTGTACCTACA  113
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CGCCCACCTACAGAGCCGCTGCCCGACGGGTGGATCATGACATTCCATAACTCTGGAGTCCCGGTGTACCTACA  962

Query  114  CAGAGAGTCTCGGGTGGTCACCTGGTCCAGGCCATACTTCTTGGGAACGGGAAGCATACGGAAACACGACCCTC  187
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CAGAGAGTCTCGGGTGGTCACCTGGTCCAGGCCATACTTCTTGGGAACGGGAAGCATACGGAAACACGACCCTC  1036

Query  188  CTCTGAGTAGCATCCCTTGTCTGCATTATAAGAAAATGAAGGACAACGAGGAACGGGAGCAAAGCAGTGACCTC  261
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CTCTGAGTAGCATCCCTTGTCTGCATTATAAGAAAATGAAGGACAACGAGGAACGGGAGCAAAGCAGTGACCTC  1110

Query  262  ACCCCTAGTGGGGATGTGTCCCCCGTCAAGCCCCTGAGCCGATCTGCAGAGCTGGAGTTTCCCCTGGATGAGCC  335
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  ACCCCTAGTGGGGATGTGTCCCCCGTCAAGCCCCTGAGCCGATCTGCAGAGCTGGAGTTTCCCCTGGATGAGCC  1184

Query  336  TGACTCTATGGGTGCTGACCCGGGGCCCCCGGACGAGAAAGACCCACTAGGGGCTGAGGCAGCCCCTGGGGCCC  409
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TGACTCTATGGGTGCTGACCCGGGGCCCCCGGACGAGAAAGACCCACTAGGGGCTGAGGCAGCCCCTGGGGCCC  1258

Query  410  TGGGGCAGGTGAAGGCCAAAGTCGAGGTGTGCAAAGATGAATCCGTTGATCTCGAGGAATTTCGAAGCTACCTG  483
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TGGGGCAGGTGAAGGCCAAAGTCGAGGTGTGCAAAGATGAATCCGTTGATCTCGAGGAATTTCGAAGCTACCTG  1332

Query  484  GAGAAGCGTTTTGACTTTGAGCAAGTTACTGTGAAAAAATTCAGGACTTGGGCTGAGCGGCGGCAATTCAATCG  557
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GAGAAGCGTTTTGACTTTGAGCAAGTTACTGTGAAAAAATTCAGGACTTGGGCTGAGCGGCGGCAATTCAATCG  1406

Query  558  GGAAATGAAGCGGAAGCAGGCGGAGTCCGAGAGGCCCATCTTGCCAGCCAATCAGAAGCTCATTACTTTATCAG  631
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GGAAATGAAGCGGAAGCAGGCGGAGTCCGAGAGGCCCATCTTGCCAGCCAATCAGAAGCTCATTACTTTATCAG  1480

Query  632  TGCAAGATGCACCCACAAAGAAAGAGTTTGTTATTAACCCCAACGGGAAATCCGAGGTCTGCATCCTGCACGAG  705
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  TGCAAGATGCACCCACAAAGAAAGAGTTTGTTATTAACCCCAACGGGAAATCCGAGGTCTGCATCCTGCACGAG  1554

Query  706  TACATGCAGCGTGTCCTCAAGGTCCGCCCTGTCTATAATTTCTTTGAATGTGAGAACCCAAGTGAGCCTTTTGG  779
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  TACATGCAGCGTGTCCTCAAGGTCCGCCCTGTCTATAATTTCTTTGAATGTGAGAACCCAAGTGAGCCTTTTGG  1628

Query  780  TGCCTCGGTGACCATTGATGGTGTGACTTACGGATCTGGAACTGCAAGCAGCAAAAAACTTGCGAAGAATAAAG  853
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  TGCCTCGGTGACCATTGATGGTGTGACTTACGGATCTGGAACTGCAAGCAGCAAAAAACTTGCGAAGAATAAAG  1702

Query  854  CTGCCCGAGCTACACTGGAAATCCTCATCCCTGACTTTGTTAAACAGACCTCTGAAGAGAAGCCCAAAGACAGT  927
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  CTGCCCGAGCTACACTGGAAATCCTCATCCCTGACTTTGTTAAACAGACCTCTGAAGAGAAGCCCAAAGACAGT  1776

Query  928  GAAGAACTCGAGTATTTTAACCACATCAGCATCGAGGACTCGCGGGTCTACGAGCTGACCAGCAAGGCTGGGCT  1001
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  GAAGAACTCGAGTATTTTAACCACATCAGCATCGAGGACTCGCGGGTCTACGAGCTGACCAGCAAGGCTGGGCT  1850

Query 1002  GTTGTCTCCATATCAGATCCTCCACGAGTGCCTTAAAAGAAACCATGGGATGGGTGACACGTCTATCAAGTTTG  1075
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  GTTGTCTCCATATCAGATCCTCCACGAGTGCCTTAAAAGAAACCATGGGATGGGTGACACGTCTATCAAGTTTG  1924

Query 1076  AAGTGGTTCCTGGGAAAAACCAGAAGAGTGAATACGTCATGGCGTGTGGCAAGCACACAGTGCGCGGGTGGTGT  1149
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  AAGTGGTTCCTGGGAAAAACCAGAAGAGTGAATACGTCATGGCGTGTGGCAAGCACACAGTGCGCGGGTGGTGT  1998

Query 1150  AAGAACAAGAGAGTTGGAAAGCAGTTAGCCTCACAGAAGATCCTTCAGCTGCTGCACCCACATGTCAAGAACTG  1223
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  AAGAACAAGAGAGTTGGAAAGCAGTTAGCCTCACAGAAGATCCTTCAGCTGCTGCACCCACATGTCAAGAACTG  2072

Query 1224  GGGGTCTTTACTGCGCATGTATGGCCGTGAGAGCAGCAAGATGGTCAAGCAGGAGACATCGGACAAGAGTGTGA  1297
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  GGGGTCTTTACTGCGCATGTATGGCCGTGAGAGCAGCAAGATGGTCAAGCAGGAGACATCGGACAAGAGTGTGA  2146

Query 1298  TTGAGCTGCAGCAGTATGCCAAGAAGAACAAGCCCAACCTGCACATCCTCAGCAAGCTCCAAGAGGAGATGAAG  1371
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  TTGAGCTGCAGCAGTATGCCAAGAAGAACAAGCCCAACCTGCACATCCTCAGCAAGCTCCAAGAGGAGATGAAG  2220

Query 1372  AGGCTAGCTGAGGAAAGGGAGGAGACTCGAAAGAAGCCCAAGATGTCCATTGTGGCGTCCGCCCAGCCTGGCGG  1445
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  AGGCTAGCTGAGGAAAGGGAGGAGACTCGAAAGAAGCCCAAGATGTCCATTGTGGCGTCCGCCCAGCCTGGCGG  2294

Query 1446  TGAGCCCCTGTGCACCGTGGACGTG  1470
            |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295  TGAGCCCCTGTGCACCGTGGACGTG  2319