Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_12106
• Subject: XM_006517981.2
• Aligned Length: 1542
• Identities: 1200
• Gaps: 192

Alignment

Query    1  ATGGCCTTCATGGAGAAGCCGCCAGCCGGCAAGGTGCTGCTGGACGACACGGTGCCGCTGACAGCAGCCATCGA  74
            |||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.||||
Sbjct    1  ATGGCCTTCATGGAGAAGCCGCCGGCTGGCAAGGTGCTGCTGGACGACACGGTGCCGCTGACAGCGGCCGTCGA  74

Query   75  GGCGAGCCAGAGCCTGCAGTCCCACACGGAATATATTATTCGAGTGCAAAGAGGAATTTCTGTGGAAAACAGCT  148
            ||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||||..||||||||||
Sbjct   75  GGCGAGCCAGAGTCTGCAGTCGCACACGGAATATATCATCCGGGTGCAAAGAGGAATTTCTGCAGAAAACAGCT  148

Query  149  GGCAGATTGTTAGAAGATACAGTGACTTTGATTTGCTTAACAACAGCTTACAGATTGCAGGCCTAAGTCTACCT  222
            |||||||.||.|||||||||||||||||.|||.||||||||||||||||.||.|||.|||||||.||.||.|||
Sbjct  149  GGCAGATCGTCAGAAGATACAGTGACTTCGATCTGCTTAACAACAGCTTGCAAATTACAGGCCTGAGCCTGCCT  222

Query  223  CTTCCTCCCAAAAAATTGATTGGTAACATGGATCGTGAATTCATAGCTGAAAGGCAGAAAGGTCTTCAGAACTA  296
            ||||||||.||.|||.|||||||.||||||||.|||||.|||||.|||||.||||||..|||.||.||||||||
Sbjct  223  CTTCCTCCTAAGAAACTGATTGGAAACATGGACCGTGAGTTCATCGCTGAGAGGCAGCGAGGCCTGCAGAACTA  296

Query  297  TCTCAACGTGATCACAACAAATCATATCTTGTCTAATTGTGAGCTGGTTAAGAAGTTTTTAGATCCAAACAACT  370
            .||.|||||.||||...||||||||.|||||||.||.|||||||||.||||||||||..||||.||||||||||
Sbjct  297  CCTTAACGTCATCATGGCAAATCATGTCTTGTCCAACTGTGAGCTGCTTAAGAAGTTCCTAGACCCAAACAACT  370

Query  371  ATTCCGCAAACTATACTGAGATTGCCTTGCAACAGGTTTCCATGTTCTTCCGATCAGAACCAAAGTGGGAGGTG  444
            ||||.|||||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ATTCTGCAAACTATACTGAGATCGCCTTACAGCAGGTTTCCATGTTCTTCCGATCAGAACCAAAGTGGGAGGTG  444

Query  445  GTGGAACCTTTGAAAGACATAGGTTGGAGAATAAGGAAGAAATATTTCTTGATGAAGATTAAAAATCAGCCAAA  518
            ||.|||||..||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||.|||||
Sbjct  445  GTAGAACCACTGAAGGACATAGGTTGGAGGATAAGGAAGAAATATTTCTTGATGAAAATAAAAAACCAACCAAA  518

Query  519  GGAACGGCTAGTGTTAAGCTGGGCTGACCTTGGCCCAGACAAGTATTTGTCAGATAAAGATTTTCAGTGTCTAA  592
            |||.|||||.|||.|||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GGAGCGGCTGGTGCTAAGCTGGGCTGATCTTGGCCCAGACAAGTACTTGTCAGATAAAGATTTTCAGTGTCTAA  592

Query  593  TCAAACTTCTGCCTTCTTGTTTGCACCCTTACATCTATCGGGTTACCTTTGCCACAGCTAATGAATCCTCAGCG  666
            ||||||||||||||||.|||.||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||..||.|||||.||.
Sbjct  593  TCAAACTTCTGCCTTCCTGTGTGCACCCTTACATCTATCGGGTCACCTTTGCCACGGCTAGCGAGTCCTCCGCA  666

Query  667  TTGCTAATTAGGATGTTTAACGAAAAGGGAACATTGAAGGATCTGATCTACAAGGCAAAACCAAAAGACCCATT  740
            |||||.|||||....|||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||
Sbjct  667  TTGCTGATTAGAGCCTTTAATGAGAAGGGAACTTTGAAGGATCTGATCTACAAGGCAAAACCAAAGGACCCCTT  740

Query  741  TCTAAAGAAGTACTGCAACCCTAAGAAGATTCAGGGCCTGGAACTCCAGCAAATAAAAACATATGGACGGCAAA  814
            .||||||||.|||||||||||||||||.|..||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.|
Sbjct  741  CCTAAAGAAATACTGCAACCCTAAGAAAACCCAGGGCCTTGAACTCCAGCAAATAAAAACATATGGGCGGCAGA  814

Query  815  TATTAGAGGTACTGAAGTTTCTTCATGACAAGGGATTCCCTTATGGGCATCTTCACGCCTCCAATGTGATGCTC  888
            |||||||||.|||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||.||.||..|||||||||||||.
Sbjct  815  TATTAGAGGCACTAAAGTTTCTTCATGACAAGGGATTCCCTTACGGCCACCTCCATGCAGCCAATGTGATGCTG  888

Query  889  GATGGGGACACTTGTCGGCTGCTGGACCTTGAGAATTCCTTATTGGGCCTGCCTTCCTTCTACCGATCTTATTT  962
            |||||..|||||||.||||||||.|||||.||.||.||..|..||||.||||||||||||||||||||.||.||
Sbjct  889  GATGGCAACACTTGCCGGCTGCTAGACCTCGAAAACTCACTGCTGGGTCTGCCTTCCTTCTACCGATCCTACTT  962

Query  963  TTCACAATTCAGGAAAATCAATACATTGGAAAGTGTGGATGTCCACTGCTTTGGCCACTTACTGTATGAAATGA  1036
            ..||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||
Sbjct  963  CACACAATTCAGGAAAATCAATACATTGGAGAGTGTAGATGTGCACTGTTTTGGCCACTTACTCTATGAAATGA  1036

Query 1037  CTTATGGACGACCGCCAGACTCGGTGCCTGTGGACTCCTTCCCTCCTGCCCCGTCCATGGCTGTGGTGGCCGTG  1110
            |||||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||..|.|||.||||||||||||||||.
Sbjct 1037  CTTATGGACGACCTCCCGACTCCGTGCCTGTGGACTCCTTTCCTCCTGCATCATCCTTGGCTGTGGTGGCCGTA  1110

Query 1111  TTGGAGTCTACGCTGTCTTGTGAAGCCTGTAAAAATGGCATGCCTACCATCTCCCGGCTCTTACAGATGCCATT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  TTGGAGTCTACGCTGTCTTGTGAAGCCTGTAAAAATGGCATGCCTACCGTCTCCCGGCTCTTACAGATGCCATT  1184

Query 1185  ATTCAGCGATGTTTTACTAACCACTTCTGAAAAACCACAGTTTAAGATCCCTACAAAGTTAAAAGAGGCATTGA  1258
            ||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.||.|||||..||||||||||||||.
Sbjct 1185  ATTCAGTGATGTTTTACTAACAACTTCTGAAAAGCCACAGTTTAAGATTCCCACAAAACTAAAAGAGGCATTGC  1258

Query 1259  GAATTGCCAAAGAATGTATAGAGAAGAGACTAATTGAGGAACAGAAACAGATTCACCAGCATCGAAGACTGACA  1332
            ||||||||||.|||||.||||||||||||||.|..|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.
Sbjct 1259  GAATTGCCAAGGAATGCATAGAGAAGAGACTCACCGAGGAACAGAAGCAGATTCACCAGCATCGAAGACTAACG  1332

Query 1333  AGAGCTCAGTCCCACCAT--------------------------------------------------------  1350
            |||||.|||||.||||||                                                        
Sbjct 1333  AGAGCCCAGTCACACCATGGGTCTGAGGAAGAAAGGAAAAGGAGAAAGATCTTAGCTCGAAAGAAGTCAAAACG  1406

Query 1351  --------------------------------------------------------------------------  1350
                                                                                      
Sbjct 1407  ATCTGCTGTTGAAAACAGTGAGGAGCAGCCAGTGAAGCACAGTAACTCCAATAACTCAGGATCTGGGGCCAGCT  1480

Query 1351  --------------------------------------------------------------  1350
                                                                          
Sbjct 1481  CACCTCTCACATCCCCATCATCTCCAACTCCACCCTCCACAGCAGTAGAGCATGCACCACTT  1542