Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_12120
• Subject: NM_001164245.1
• Aligned Length: 1362
• Identities: 1050
• Gaps: 312

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGGGAAGAACCTACATTGTAGAAGAGACTGTTGGCCAGTATCTTTCAAACATAAATCTCCAAGGAAAGGCTTT  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  TGTCTCTGGCCTTTTAATAGGACAGTGTTCGTCACAAAAGGATTATGTGATTCTTGCCACTAGAACGCCACCCA  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  AAGAGGAGCAAAGTGAGAACCTCAAACATCCCAAAGCTAAGTTGGATAACTTGGATGAAGAATGGGCCACAGAA  222

Query    1  ---------------------ATGCTACCAGGGGGACTTTTAGTTCTTGGAGTATTTATTATTACTACTTTAGA  53
                                 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CATGCCTGCCAGGTATCCAGAATGCTACCAGGGGGACTTTTAGTTCTTGGAGTATTTATTATTACTACTTTAGA  296

Query   54  ACTGGCAAATGATTTTCAAAATGCCCTGCGTAGACTAATGTTTGCTGTGGAAAAGTCTATAAATAGAAAGAGAT  127
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  ACTGGCAAATGATTTTCAAAATGCCCTGCGTAGACTAATGTTTGCTGTGGAAAAGTCTATAAATAGAAAGAGAT  370

Query  128  TGTGGAATTTCACAGAGGAGGAAGTCTCAGAACGAGTGACACTTCACATTTGTGCTTCTACAAAAAAAATATTT  201
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TGTGGAATTTCACAGAGGAGGAAGTCTCAGAACGAGTGACACTTCACATTTGTGCTTCTACAAAAAAAATATTT  444

Query  202  TGTCGAACTTATGATATCCATGATCCAAAGAGTTCAGCAAGACCAGCAGATTGGAAGTATCAAAGTGGATTATC  275
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TGTCGAACTTATGATATCCATGATCCAAAGAGTTCAGCAAGACCAGCAGATTGGAAGTATCAAAGTGGATTATC  518

Query  276  ATCCTCATGGCTTTCTTTAGAGTGTACAGTTCACATTAATATTCACATCCCACTTTCTGCTACTTCTGTCAGCT  349
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  ATCCTCATGGCTTTCTTTAGAGTGTACAGTTCACATTAATATTCACATCCCACTTTCTGCTACTTCTGTCAGCT  592

Query  350  ATACTCTGGAGAAAAATACAAAGAATGGACTTACACGCTGGGCCAAGGAAATAGAAAATGGTGTTTATTTGATT  423
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ATACTCTGGAGAAAAATACAAAGAATGGACTTACACGCTGGGCCAAGGAAATAGAAAATGGTGTTTATTTGATT  666

Query  424  AATGGACAAGTTAAAGATGAAGATTGTGACCTATTAGAAGGACAGAAAAAATCTTCTAGAGGAAATACTCAAGC  497
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                              
Sbjct  667  AATGGACAAGTTAAAGATGAAGATTGTGACCTATTAGAAGGACA------------------------------  710

Query  498  AACTAGTCATTCTTTTGATGTCAGAGTGCTAACGCAGTTGCTCCTGAATTCAGACCACAGATCCACAGCCACAG  571
                                                   |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  711  ---------------------------------------GCTCCTGAATTCAGACCACAGATCCACAGCCACAG  745

Query  572  TCCAGATATGTAGCGGTTCTGTAAACCTTAAGGGTGCTGTGAAATGCAGAGCTTATATCCACAGCAGTAAACCC  645
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  746  TCCAGATATGTAGCGGTTCTGTAAACCTTAAGGGTGCTGTGAAATGCAGAGCTTATATCCACAGCAGTAAACCC  819

Query  646  AAAGTTAAAGATGCTGTGCAGGCAGTAAAGAGGGATATATTGAACACAGTTGCTGATCGTTGTGAAATGCTATT  719
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  820  AAAGTTAAAGATGCTGTGCAGGCAGTAAAGAGGGATATATTGAACACAGTTGCTGATCGTTGTGAAATGCTATT  893

Query  720  TGAGGATCTGCTTTTGAATGAAATTCCAGAAAAAAAAGATTCTGAAAAAGAGTTCCACGTCCTCCCTTATCGAG  793
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  894  TGAGGATCTGCTTTTGAATGAAATTCCAGAAAAAAAAGATTCTGAAAAAGAGTTCCACGTCCTCCCTTATCGAG  967

Query  794  TCTTTGTTCCCCTTCCTGGATCCACTGTAATGTTGTGTGATTATAAATTTGACGATGAGTCAGCTGAAGAAATC  867
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  968  TCTTTGTTCCCCTTCCTGGATCCACTGTAATGTTGTGTGATTATAAATTTGACGATGAGTCAGCTGAAGAAATC  1041

Query  868  AGGGACCATTTTATGGAGATGTTGGATCACACAATTCAAATAGAAGATTTGGAAATTGCAGAGGAAACAAACAC  941
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1042  AGGGACCATTTTATGGAGATGTTGGATCACACAATTCAAATAGAAGATTTGGAAATTGCAGAGGAAACAAACAC  1115

Query  942  AGCTTGTATGAGTTCTTCTATGAATAGTCAAGCTTCATTGGACAACACAGATGATGAACAACCAAAACAACCAA  1015
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1116  AGCTTGTATGAGTTCTTCTATGAATAGTCAAGCTTCATTGGACAACACAGATGATGAACAACCAAAACAACCAA  1189

Query 1016  TTAAAACTACAATGTTATTGAAAATTCAGCAAAACATAGGTGTGATTGCAGCATTTACAGTTGCAGTCCTTGCT  1089
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1190  TTAAAACTACAATGTTATTGAAAATTCAGCAAAACATAGGTGTGATTGCAGCATTTACAGTTGCAGTCCTTGCT  1263

Query 1090  GCGGGTATCTCCTTTCATTACTTCAGTGAT  1119
            ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1264  GCGGGTATCTCCTTTCATTACTTCAGTGAT  1293