Protein Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroadEn_12167
Subject:
NM_030133.3
Aligned Length:
990
Identities:
549
Gaps:
379

Alignment

Query   1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                     
Sbjct   1  MPSLRKRVKIQAENAEPKDECSFFSELSSGSEEDNKEDSIWEPQKKVPRNRRQPASKGSKRKQGPRAKKSSQQV  74

Query   1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                     
Sbjct  75  DDESKDVAVKEELNSPVAIVDADLEEKSHKLQTTKTLKTAAKKQKKPVPRAKKRLKVDEETSQASPLEGGGSNV  148

Query   1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                     
Sbjct 149  ETPSTSACGNVCKKEESEDSFTFGQSPVKRIRTESCPQGRPARVPDGVSDIKEEVEMNWDVVQVLSERTNIEPW  222

Query   1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                     
Sbjct 223  VCANIIRLFNDDNTIPFIVRYRKELINNLDADFLREVRQTLDELRDVAKKVHSRIQKIKKEGKMSECLLQALLN  296

Query   1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                     
Sbjct 297  CKTFEELEHVSAPYKMGSKGTKAQRAKQLGLEGAAWTLLENPGQLNLLSYIKPDVKGLSELNDIETGVQHILAD  370

Query   1  MIAKDKDTLDFIRNLCQKRHVCIQSSLAKVSSKKVNEKDVDKFLLYQHFSCNIRNIHHHQILAINRGENLKVLT  74
           |||||||||||||.||..|..|||||||||||||||||.||||.|||.||||||.||||||||||||||||.||
Sbjct 371  MIAKDKDTLDFIRGLCKHRYICIQSSLAKVSSKKVNEKEVDKFQLYQNFSCNIRTIHHHQILAINRGENLKILT  444

Query  75  VKVNISDGVKDEFCRWCIQNRWRPRSFARPELMKILYNSLNDSFKRLIYPLLCREFRAKLTSDAEKESVMMFGR  148
           ||||||||||.||||||||||||||.||||||||||.|||.|||||||.|||||||||||||||||.||||||.
Sbjct 445  VKVNISDGVKNEFCRWCIQNRWRPRGFARPELMKILHNSLDDSFKRLIVPLLCREFRAKLTSDAEKQSVMMFGQ  518

Query 149  NLRQLLLTSPVPGRTLMGVDPGYKHGCKLAIISPTSQILHTDVVYLHCGQGFREAEKIKTLLLNFNCSTVVIGN  222
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.|||.||||||
Sbjct 519  NLRQLLLTSPVPGRTLMGVDPGYKHGCKLAIISPTSQILHTDVVYLHCGQGFREAEKIKRLLLHFNCRTVVIGN  592

Query 223  GTACRETEAYFADLIMKNYFAPLDVVYCIVSEAGASIYSVSPEANKEMPGLDPNLRSAVSIARRVQDPLAELVK  296
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593  GTACRETEAYFADLIMKNYFAPLDVVYCIVSEAGASIYSVSPEANKEMPGLDPNLRSAVSIARRVQDPLAELVK  666

Query 297  IEPKHIGVGMYQHDVSQTLLKATLDSVVEECVSFVGVDINICSEVLLRHIAGLNANRAKNIIEWREKNGPFINR  370
           ..||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667  FDPKHIGVGMYQHDVSQTLLKATLDSVVEECVSFVGVDINICSEVLLRHIAGLNANRAKNIIEWREKNGPFINR  740

Query 371  EQLKKVKGLGPKSFQQCAGFIRINQDYIRTFCSQQTETSGQIQGVAVTSSADVEVTNEKQGKKKSKTAVNVLLK  444
           ||||||||||||||||||||.|||||||||||||.|..|||.|..|.       |||||.||||.|  ....|.
Sbjct 741  EQLKKVKGLGPKSFQQCAGFVRINQDYIRTFCSQHTDSSGQSQETAM-------VTNEKLGKKKNK--ADATLI  805

Query 445  PNPLDQTCIHPESYDIAMRFLSSIGGTLYEVGKPEMQQKINSFLEKEGMEKIAERLQTTVHTLQVIIDGLSQPE  518
           |||||||||||||||||.||||.||||..|.||||||||||..|.|||.|..|||||||||||||||||||||.
Sbjct 806  PNPLDQTCIHPESYDIAVRFLSFIGGTMCEIGKPEMQQKINVSLGKEGIEETAERLQTTVHTLQVIIDGLSQPK  879

Query 519  SFDFRTDFDKPDFKRSIVCLEDLQIGTVLTGKVENATLFGIFVDIGVGKSGLIPIRNVTEAKLSKTKKRRSLGL  592
           .||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.||||||||.||||||..|||||||||.||||||
Sbjct 880  TFDIRTDFDKPDFKRSIVCLEDLQVGTVLTGKVENATLFGVFVDIGVGKAGLIPIRFITEAKLSKTKRRRSLGL  953

Query 593  GPGERVEVQVLNIDIPRSRITLDLIRVL  620
           ||||.|||.|||.|||||||.|||.|||
Sbjct 954  GPGEKVEVKVLNVDIPRSRISLDLLRVL  981