Protein Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroadEn_12183
Subject:
NM_001080517.3
Aligned Length:
1442
Identities:
924
Gaps:
518

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  MSIAIPLGVTTSDTSYSDMAAGSDPESVEASPAVNEKSVYSTHNYGTTQRHGCRGLPYATIIPRSDLNGLPSPV  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  EERCGDSPNSEGETVPTWCPCGLSQDGFLLNCDKCRGMSRGKVIRLHRRKQDNISGGDSSATESWDEELSPSTV  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  LYTATQHTPTSITLTVRRTKPKKRKKSPEKGRAAPKTKKIKNSPSEAQNLDENTTEGWENRIRLWTDQYEEAFT  222

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  223  NQYSADVQNALEQHLHSSKEFVGKPTILDTINKTELACNNTVIGSQMQLQLGRVTRVQKHRKILRAARDLALDT  296

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  297  LIIEYRGKVMLRQQFEVNGHFFKKPYPFVLFYSKFNGVEMCVDARTFGNDARFIRRSCTPNAEVRHMIADGMIH  370

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  371  LCIYAVSAITKDAEVTIAFDYEYSNCNYKVDCACHKGNRNCPIQKRNPNATELPLLPPPPSLPTIGAETRRRKA  444

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  445  RRKELEMEQQNEASEENNDQQSQEVPEKVTVSSDHEEVDNPEEKPEEEKEEVIDDQENLAHSRRTREDRKVEAI  518

Query    1  MHAFENLEKRKKRRDQPLEQSNSDVEITTTTSETPVGEETKTEAPESEVSNSVSNVTIPSTPQSVGVNTRRSSQ  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  MHAFENLEKRKKRRDQPLEQSNSDVEITTTTSETPVGEETKTEAPESEVSNSVSNVTIPSTPQSVGVNTRRSSQ  592

Query   75  AGDIAAEKLVPKPPPAKPSRPRPKSRISRYRTSSAQRLKRQKQANAQQAELSQAALEEGGSNSLVTPTEAGSLD  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AGDIAAEKLVPKPPPAKPSRPRPKSRISRYRTSSAQRLKRQKQANAQQAELSQAALEEGGSNSLVTPTEAGSLD  666

Query  149  SSGENRPLTGSDPTVVSITGSHVNRAASKYPKTKKYLVTEWLNDKAEKQECPVECPLRITTDPTVLATTLNMLP  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  SSGENRPLTGSDPTVVSITGSHVNRAASKYPKTKKYLVTEWLNDKAEKQECPVECPLRITTDPTVLATTLNMLP  740

Query  223  GLIHSPLICTTPKHYIRFGSPFIPERRRRPLLPDGTFSSCKKRWIKQALEEGMTQTSSVPQETRTQHLYQSNEN  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GLIHSPLICTTPKHYIRFGSPFIPERRRRPLLPDGTFSSCKKRWIKQALEEGMTQTSSVPQETRTQHLYQSNEN  814

Query  297  SSSSSICKDNADLLSPLKKWKSRYLMEQNVTKLLRPLSPVTPPPPNSGSKSPQLATPGSSHPGEEECRNGYSLM  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  SSSSSICKDNADLLSPLKKWKSRYLMEQNVTKLLRPLSPVTPPPPNSGSKSPQLATPGSSHPGEEECRNGYSLM  888

Query  371  FSPVTSLTTASRCNTPLQFELCHRKDLDLAKVGYLDSNTNSCADRPSLLNSGHSDLAPHPSLGPTSETGFPSRS  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  FSPVTSLTTASRCNTPLQFELCHRKDLDLAKVGYLDSNTNSCADRPSLLNSGHSDLAPHPSLGPTSETGFPSRS  962

Query  445  GDGHQTLVRNSDQAFRTEFNLMYAYSPLNAMPRADGLYRGSPLVGDRKPLHLDGGYCSPAEGFSSRYEHGLMKD  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GDGHQTLVRNSDQAFRTEFNLMYAYSPLNAMPRADGLYRGSPLVGDRKPLHLDGGYCSPAEGFSSRYEHGLMKD  1036

Query  519  LSRGSLSPGGERACEGVPSAPQNPPQRKKVSLLEYRKRKQEAKENSAGGGGDSAQSKSKSAGAGQGSSNSVSDT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  LSRGSLSPGGERACEGVPSAPQNPPQRKKVSLLEYRKRKQEAKENSAGGGGDSAQSKSKSAGAGQGSSNSVSDT  1110

Query  593  GAHGVQGSSARTPSSPHKKFSPSHSSMSHLEAVSPSDSRGTSSSHCRPQENISSRWMVPTSVERLREGGSIPKV  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GAHGVQGSSARTPSSPHKKFSPSHSSMSHLEAVSPSDSRGTSSSHCRPQENISSRWMVPTSVERLREGGSIPKV  1184

Query  667  LRSSVRVAQKGEPSPTWESNITEKDSDPADGEGPETLSSALSKGATVYSPSRYSYQLLQCDSPRTESQSLLQQS  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  LRSSVRVAQKGEPSPTWESNITEKDSDPADGEGPETLSSALSKGATVYSPSRYSYQLLQCDSPRTESQSLLQQS  1258

Query  741  SSPFRGHPTQSPGYSYRTTALRPGNPPSHGSSESSLSSTSYSSPAHPVSTDSLAPFTGTPGYFSSQPHSGNSTG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  SSPFRGHPTQSPGYSYRTTALRPGNPPSHGSSESSLSSTSYSSPAHPVSTDSLAPFTGTPGYFSSQPHSGNSTG  1332

Query  815  SNLPRRSCPSSAASPTLQGPSDSPTSDSVSQSSTGTLSSTSFPQNSRSSLPSDLRTISLPSAGQSAVYQASRVS  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  SNLPRRSCPSSAASPTLQGPSDSPTSDSVSQSSTGTLSSTSFPQNSRSSLPSDLRTISLPSAGQSAVYQASRVS  1406

Query  889  AVSNSQHYPHRGSGGVHQYRLQPLQGSGVKTQTGLS  924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  AVSNSQHYPHRGSGGVHQYRLQPLQGSGVKTQTGLS  1442