Protein Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_12183
• Subject: NM_001292043.2
• Aligned Length: 1344
• Identities: 924
• Gaps: 420

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  MSRGKVIRLHRRKQDNISGGDSSATESWDEELSPSTVLYTATQHTPTSITLTVRRTKPKKRKKSPEKGRAAPKT  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  KKIKAFREGSRKSLRMKNSPSEAQNLDENTTEGWENRIRLWTDQYEEAFTNQYSADVQNALEQHLHSSKEFVGK  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  PTILDTINKTELACNNTVIGSQMQLQLGRVTRVQKHRKILRAARDLALDTLIIEYRGKVMLRQQFEVNGHFFKK  222

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  223  PYPFVLFYSKFNGVEMCVDARTFGNDARFIRRSCTPNAEVRHMIADGMIHLCIYAVSAITKDAEVTIAFDYEYS  296

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  297  NCNYKVDCACHKGNRNCPIQKRNPNATELPLLPPPPSLPTIGAETRRRKARRKELEMEQQNEASEENNDQQSQE  370

Query    1  --------------------------------------------------MHAFENLEKRKKRRDQPLEQSNSD  24
                                                              ||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  VPEKVTVSSDHEEVDNPEEKPEEEKEEVIDDQENLAHSRRTREDRKVEAIMHAFENLEKRKKRRDQPLEQSNSD  444

Query   25  VEITTTTSETPVGEETKTEAPESEVSNSVSNVTIPSTPQSVGVNTRRSSQAGDIAAEKLVPKPPPAKPSRPRPK  98
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  VEITTTTSETPVGEETKTEAPESEVSNSVSNVTIPSTPQSVGVNTRRSSQAGDIAAEKLVPKPPPAKPSRPRPK  518

Query   99  SRISRYRTSSAQRLKRQKQANAQQAELSQAALEEGGSNSLVTPTEAGSLDSSGENRPLTGSDPTVVSITGSHVN  172
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  SRISRYRTSSAQRLKRQKQANAQQAELSQAALEEGGSNSLVTPTEAGSLDSSGENRPLTGSDPTVVSITGSHVN  592

Query  173  RAASKYPKTKKYLVTEWLNDKAEKQECPVECPLRITTDPTVLATTLNMLPGLIHSPLICTTPKHYIRFGSPFIP  246
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  RAASKYPKTKKYLVTEWLNDKAEKQECPVECPLRITTDPTVLATTLNMLPGLIHSPLICTTPKHYIRFGSPFIP  666

Query  247  ERRRRPLLPDGTFSSCKKRWIKQALEEGMTQTSSVPQETRTQHLYQSNENSSSSSICKDNADLLSPLKKWKSRY  320
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  ERRRRPLLPDGTFSSCKKRWIKQALEEGMTQTSSVPQETRTQHLYQSNENSSSSSICKDNADLLSPLKKWKSRY  740

Query  321  LMEQNVTKLLRPLSPVTPPPPNSGSKSPQLATPGSSHPGEEECRNGYSLMFSPVTSLTTASRCNTPLQFELCHR  394
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  LMEQNVTKLLRPLSPVTPPPPNSGSKSPQLATPGSSHPGEEECRNGYSLMFSPVTSLTTASRCNTPLQFELCHR  814

Query  395  KDLDLAKVGYLDSNTNSCADRPSLLNSGHSDLAPHPSLGPTSETGFPSRSGDGHQTLVRNSDQAFRTEFNLMYA  468
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  KDLDLAKVGYLDSNTNSCADRPSLLNSGHSDLAPHPSLGPTSETGFPSRSGDGHQTLVRNSDQAFRTEFNLMYA  888

Query  469  YSPLNAMPRADGLYRGSPLVGDRKPLHLDGGYCSPAEGFSSRYEHGLMKDLSRGSLSPGGERACEGVPSAPQNP  542
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  YSPLNAMPRADGLYRGSPLVGDRKPLHLDGGYCSPAEGFSSRYEHGLMKDLSRGSLSPGGERACEGVPSAPQNP  962

Query  543  PQRKKVSLLEYRKRKQEAKENSAGGGGDSAQSKSKSAGAGQGSSNSVSDTGAHGVQGSSARTPSSPHKKFSPSH  616
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  PQRKKVSLLEYRKRKQEAKENSAGGGGDSAQSKSKSAGAGQGSSNSVSDTGAHGVQGSSARTPSSPHKKFSPSH  1036

Query  617  SSMSHLEAVSPSDSRGTSSSHCRPQENISSRWMVPTSVERLREGGSIPKVLRSSVRVAQKGEPSPTWESNITEK  690
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  SSMSHLEAVSPSDSRGTSSSHCRPQENISSRWMVPTSVERLREGGSIPKVLRSSVRVAQKGEPSPTWESNITEK  1110

Query  691  DSDPADGEGPETLSSALSKGATVYSPSRYSYQLLQCDSPRTESQSLLQQSSSPFRGHPTQSPGYSYRTTALRPG  764
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  DSDPADGEGPETLSSALSKGATVYSPSRYSYQLLQCDSPRTESQSLLQQSSSPFRGHPTQSPGYSYRTTALRPG  1184

Query  765  NPPSHGSSESSLSSTSYSSPAHPVSTDSLAPFTGTPGYFSSQPHSGNSTGSNLPRRSCPSSAASPTLQGPSDSP  838
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  NPPSHGSSESSLSSTSYSSPAHPVSTDSLAPFTGTPGYFSSQPHSGNSTGSNLPRRSCPSSAASPTLQGPSDSP  1258

Query  839  TSDSVSQSSTGTLSSTSFPQNSRSSLPSDLRTISLPSAGQSAVYQASRVSAVSNSQHYPHRGSGGVHQYRLQPL  912
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TSDSVSQSSTGTLSSTSFPQNSRSSLPSDLRTISLPSAGQSAVYQASRVSAVSNSQHYPHRGSGGVHQYRLQPL  1332

Query  913  QGSGVKTQTGLS  924
            ||||||||||||
Sbjct 1333  QGSGVKTQTGLS  1344