Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_12183
- Subject:
- XM_011533928.1
- Aligned Length:
- 4422
- Identities:
- 2772
- Gaps:
- 1650
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGAGCATTGCAATCCCTCTGGGAGTCACCACATCAGATACATCCTACTCAGATATGGCTGCTGGATCAGACCC 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 TGAATCTGTGGAGGCTAGTCCAGCAGTTAATGAGAAGAGCGTGTATTCCACTCATAATTATGGGACCACTCAGA 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 149 GGCATGGGTGTCGAGGACTGCCTTATGCTACGATCATCCCTCGTTCTGACCTGAATGGCCTGCCGTCGCCTGTA 222
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 223 GAGGAACGCTGTGGAGACAGCCCGAACTCTGAAGGAGAAACTGTACCTACCTGGTGTCCTTGTGGTCTTTCTCA 296
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 297 GGATGGCTTCCTTCTCAACTGTGACAAGTGCAGGGGAATGAGCAGGGGGAAGGTTATTAGACTTCATCGGCGGA 370
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 371 AGCAGGACAACATATCAGGTGGGGATAGCAGTGCAACAGAAAGCTGGGATGAGGAGCTTTCTCCTTCCACTGTG 444
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 445 TTGTATACAGCAACACAGCACACACCTACAAGCATCACCTTAACTGTTAGAAGAACCAAACCCAAGAAGCGGAA 518
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 519 AAAGAGTCCAGAAAAGGGTCGTGCAGCACCAAAGACGAAGAAAATCAAGGCATTTCGAGAGGGATCCCGGAAGT 592
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 593 CCTTGCGGATGAAGAATTCTCCCTCTGAAGCACAGAATTTAGATGAGAATACAACTGAGGGCTGGGAAAATCGG 666
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 667 ATAAGACTATGGACTGACCAGTATGAAGAAGCTTTCACTAATCAGTACAGTGCAGATGTACAGAACGCGCTTGA 740
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 741 ACAACACCTACATTCTAGCAAGGAATTTGTGGGCAAACCTACTATTTTAGACACTATTAATAAGACTGAATTGG 814
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 815 CCTGTAATAACACAGTTATTGGTTCCCAAATGCAGTTACAGCTGGGAAGAGTCACTCGTGTTCAAAAGCACCGG 888
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 889 AAGATCCTGAGGGCTGCAAGAGATTTGGCTTTGGACACTCTTATAATAGAGTATCGTGGGAAAGTCATGTTACG 962
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 963 ACAGCAATTTGAGGTCAATGGGCATTTCTTCAAAAAACCATACCCCTTTGTGCTCTTCTACTCAAAATTCAATG 1036
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1037 GTGTAGAGATGTGTGTGGATGCCCGTACTTTCGGTAATGATGCTCGGTTCATCAGAAGATCATGTACACCAAAT 1110
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1111 GCAGAGGTGCGACACATGATTGCAGATGGGATGATTCACCTGTGCATCTATGCTGTGTCTGCCATCACCAAGGA 1184
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1185 TGCTGAGGTCACCATAGCATTTGATTATGAGTATAGTAACTGTAATTATAAAGTGGACTGTGCCTGTCACAAGG 1258
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1259 GAAACCGGAATTGTCCTATACAAAAAAGGAATCCTAATGCTACAGAACTGCCACTCCTACCACCTCCTCCAAGC 1332
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1333 CTACCCACCATTGGAGCAGAGACTAGACGTAGAAAAGCACGACGGAAAGAGCTAGAGATGGAGCAGCAGAATGA 1406
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1407 GGCTTCAGAGGAGAATAATGACCAGCAATCACAAGAAGTTCCAGAAAAAGTAACTGTATCCAGTGATCATGAGG 1480
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1481 AAGTAGACAATCCAGAAGAAAAACCAGAAGAAGAGAAAGAAGAGGTTATAGATGACCAGGAGAACCTAGCTCAT 1554
Query 1 ---------------------------------------ATGCATGCTTTTGAAAACTTAGAGAAAAGAAAGAA 35
|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 AGCAGGAGGACCAGGGAAGATAGAAAGGTAGAAGCCATCATGCATGCTTTTGAAAACTTAGAGAAAAGAAAGAA 1628
Query 36 GCGGCGGGATCAGCCCTTGGAACAGAGCAACTCTGATGTAGAGATTACTACAACCACCTCAGAGACTCCTGTTG 109
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 GCGGCGGGATCAGCCCTTGGAACAGAGCAACTCTGATGTAGAGATTACTACAACCACCTCAGAGACTCCTGTTG 1702
Query 110 GTGAAGAGACAAAAACTGAAGCCCCTGAATCTGAAGTTAGCAACTCTGTTTCAAATGTTACCATCCCAAGCACC 183
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 GTGAAGAGACAAAAACTGAAGCCCCTGAATCTGAAGTTAGCAACTCTGTTTCAAATGTTACCATCCCAAGCACC 1776
Query 184 CCACAGAGTGTTGGTGTGAATACCCGGAGGTCTTCCCAAGCAGGGGATATTGCTGCAGAAAAACTAGTCCCCAA 257
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 CCACAGAGTGTTGGTGTGAATACCCGGAGGTCTTCCCAAGCAGGGGATATTGCTGCAGAAAAACTAGTCCCCAA 1850
Query 258 GCCACCTCCAGCAAAGCCTTCTAGGCCCCGGCCGAAGAGTCGAATTTCTCGGTACAGGACCAGTTCAGCCCAAA 331
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 GCCACCTCCAGCAAAGCCTTCTAGGCCCCGGCCGAAGAGTCGAATTTCTCGGTACAGGACCAGTTCAGCCCAAA 1924
Query 332 GACTAAAGCGTCAGAAGCAGGCCAATGCACAGCAGGCAGAATTGTCACAAGCTGCCTTGGAAGAGGGAGGAAGT 405
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 GACTAAAGCGTCAGAAGCAGGCCAATGCACAGCAGGCAGAATTGTCACAAGCTGCCTTGGAAGAGGGAGGAAGT 1998
Query 406 AACAGTTTAGTAACTCCTACTGAAGCTGGAAGTCTAGACAGTTCAGGAGAAAACAGGCCATTAACAGGGTCTGA 479
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 AACAGTTTAGTAACTCCTACTGAAGCTGGAAGTCTAGACAGTTCAGGAGAAAACAGGCCATTAACAGGGTCTGA 2072
Query 480 CCCAACTGTGGTGTCAATTACTGGATCCCATGTCAACCGTGCTGCATCTAAATACCCCAAAACCAAAAAGTATC 553
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073 CCCAACTGTGGTGTCAATTACTGGATCCCATGTCAACCGTGCTGCATCTAAATACCCCAAAACCAAAAAGTATC 2146
Query 554 TAGTTACAGAATGGTTGAATGACAAAGCAGAGAAGCAAGAGTGCCCTGTTGAGTGCCCTTTACGTATCACAACG 627
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147 TAGTTACAGAATGGTTGAATGACAAAGCAGAGAAGCAAGAGTGCCCTGTTGAGTGCCCTTTACGTATCACAACG 2220
Query 628 GATCCAACTGTACTGGCAACGACCCTAAACATGTTACCAGGTCTTATCCATTCCCCGTTAATTTGCACCACCCC 701
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221 GATCCAACTGTACTGGCAACGACCCTAAACATGTTACCAGGTCTTATCCATTCCCCGTTAATTTGCACCACCCC 2294
Query 702 CAAACACTACATTCGCTTTGGCTCACCCTTTATCCCTGAGAGACGTCGAAGGCCCCTTCTGCCTGATGGCACAT 775
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295 CAAACACTACATTCGCTTTGGCTCACCCTTTATCCCTGAGAGACGTCGAAGGCCCCTTCTGCCTGATGGCACAT 2368
Query 776 TCAGCTCCTGTAAGAAGCGCTGGATAAAACAAGCCTTAGAAGAAGGGATGACTCAAACATCATCTGTACCCCAA 849
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369 TCAGCTCCTGTAAGAAGCGCTGGATAAAACAAGCCTTAGAAGAAGGGATGACTCAAACATCATCTGTACCCCAA 2442
Query 850 GAGACTAGAACTCAGCACCTATACCAAAGCAATGAGAATAGTAGCTCTTCTAGTATCTGCAAAGACAATGCAGA 923
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443 GAGACTAGAACTCAGCACCTATACCAAAGCAATGAGAATAGTAGCTCTTCTAGTATCTGCAAAGACAATGCAGA 2516
Query 924 CTTGTTGAGCCCATTAAAGAAATGGAAGTCTCGCTATCTGATGGAGCAGAATGTCACCAAGTTACTTCGGCCTC 997
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517 CTTGTTGAGCCCATTAAAGAAATGGAAGTCTCGCTATCTGATGGAGCAGAATGTCACCAAGTTACTTCGGCCTC 2590
Query 998 TGTCTCCAGTCACACCACCCCCTCCCAATTCAGGCTCAAAGAGTCCCCAGCTGGCCACACCTGGCTCATCTCAC 1071
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591 TGTCTCCAGTCACACCACCCCCTCCCAATTCAGGCTCAAAGAGTCCCCAGCTGGCCACACCTGGCTCATCTCAC 2664
Query 1072 CCAGGAGAAGAGGAGTGTCGAAATGGATACAGCCTCATGTTTTCACCAGTCACATCTCTTACTACTGCTAGTCG 1145
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2665 CCAGGAGAAGAGGAGTGTCGAAATGGATACAGCCTCATGTTTTCACCAGTCACATCTCTTACTACTGCTAGTCG 2738
Query 1146 CTGCAACACTCCTCTACAGTTT---------------------------------------------------- 1167
||||||||||||||||||||||
Sbjct 2739 CTGCAACACTCCTCTACAGTTTGAGAACATATCCTCCCCTGAGAGTTCCCCTGCGCATAGGCCCGAGTCCCTGT 2812
Query 1168 -----GAGCTTTGTCACCGAAAAGACCTGGATTTGGCAAAAGTAGGATACCTTGACTCCAACACTAACAGCTGT 1236
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2813 CACCCGAGCTTTGTCACCGAAAAGACCTGGATTTGGCAAAAGTAGGATACCTTGACTCCAACACTAACAGCTGT 2886
Query 1237 GCTGATAGACCTTCCCTACTCAACTCAGGTCATTCTGACCTGGCTCCTCATCCCTCCCTCGGACCCACTTCTGA 1310
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2887 GCTGATAGACCTTCCCTACTCAACTCAGGTCATTCTGACCTGGCTCCTCATCCCTCCCTCGGACCCACTTCTGA 2960
Query 1311 GACTGGTTTCCCAAGCAGAAGTGGAGATGGACATCAGACCCTCGTGAGAAACTCAGACCAGGCATTTCGGACAG 1384
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2961 GACTGGTTTCCCAAGCAGAAGTGGAGATGGACATCAGACCCTCGTGAGAAACTCAGACCAGGCATTTCGGACAG 3034
Query 1385 AGTTCAACTTGATGTATGCCTACTCCCCTTTGAATGCTATGCCTCGAGCAGATGGACTGTATCGAGGATCTCCT 1458
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3035 AGTTCAACTTGATGTATGCCTACTCCCCTTTGAATGCTATGCCTCGAGCAGATGGACTGTATCGAGGATCTCCT 3108
Query 1459 CTAGTGGGGGATAGGAAGCCTTTACATTTGGATGGGGGATATTGTTCCCCTGCAGAAGGATTTTCCAGCAGATA 1532
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3109 CTAGTGGGGGATAGGAAGCCTTTACATTTGGATGGGGGATATTGTTCCCCTGCAGAAGGATTTTCCAGCAGATA 3182
Query 1533 TGAACATGGCTTAATGAAAGACCTCTCTCGTGGATCCTTGTCACCTGGTGGTGAAAGGGCCTGTGAAGGAGTCC 1606
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3183 TGAACATGGCTTAATGAAAGACCTCTCTCGTGGATCCTTGTCACCTGGTGGTGAAAGGGCCTGTGAAGGAGTCC 3256
Query 1607 CATCTGCCCCCCAGAACCCACCACAGAGGAAAAAAGTATCCCTGCTGGAGTACCGAAAACGGAAACAAGAAGCT 1680
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3257 CATCTGCCCCCCAGAACCCACCACAGAGGAAAAAAGTATCCCTGCTGGAGTACCGAAAACGGAAACAAGAAGCT 3330
Query 1681 AAGGAAAATTCTGCTGGTGGGGGAGGTGACTCTGCACAGAGCAAAAGCAAGTCTGCAGGAGCTGGGCAAGGCAG 1754
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3331 AAGGAAAATTCTGCTGGTGGGGGAGGTGACTCTGCACAGAGCAAAAGCAAGTCTGCAGGAGCTGGGCAAGGCAG 3404
Query 1755 CAGTAACTCCGTTTCCGACACTGGTGCCCATGGTGTGCAGGGATCCTCAGCCCGAACTCCATCTTCCCCTCACA 1828
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3405 CAGTAACTCCGTTTCCGACACTGGTGCCCATGGTGTGCAGGGATCCTCAGCCCGAACTCCATCTTCCCCTCACA 3478
Query 1829 AAAAATTCTCCCCATCTCATTCCTCTATGTCCCATTTGGAGGCGGTAAGCCCATCAGATTCCAGAGGCACTTCT 1902
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3479 AAAAATTCTCCCCATCTCATTCCTCTATGTCCCATTTGGAGGCGGTAAGCCCATCAGATTCCAGAGGCACTTCT 3552
Query 1903 TCATCTCACTGCAGACCTCAAGAGAATATCAGCAGTAGGTGGATGGTTCCCACATCAGTAGAACGACTCCGAGA 1976
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3553 TCATCTCACTGCAGACCTCAAGAGAATATCAGCAGTAGGTGGATGGTTCCCACATCAGTAGAACGACTCCGAGA 3626
Query 1977 AGGAGGGAGCATCCCCAAGGTCCTCCGAAGCAGCGTGAGGGTGGCCCAAAAGGGAGAGCCCTCTCCCACATGGG 2050
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3627 AGGAGGGAGCATCCCCAAGGTCCTCCGAAGCAGCGTGAGGGTGGCCCAAAAGGGAGAGCCCTCTCCCACATGGG 3700
Query 2051 AGAGTAACATCACAGAGAAAGACTCAGACCCTGCAGATGGAGAAGGCCCAGAGACATTAAGCTCAGCACTCTCT 2124
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3701 AGAGTAACATCACAGAGAAAGACTCAGACCCTGCAGATGGAGAAGGCCCAGAGACATTAAGCTCAGCACTCTCT 3774
Query 2125 AAAGGAGCAACAGTTTACAGCCCTTCCAGATACAGCTACCAGCTCCTGCAGTGTGATAGTCCTCGGACAGAATC 2198
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3775 AAAGGAGCAACAGTTTACAGCCCTTCCAGATACAGCTACCAGCTCCTGCAGTGTGATAGTCCTCGGACAGAATC 3848
Query 2199 ACAAAGCCTCCTTCAGCAGAGTTCCTCCCCCTTCAGAGGACATCCTACACAGTCTCCAGGATACAGTTATCGAA 2272
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3849 ACAAAGCCTCCTTCAGCAGAGTTCCTCCCCCTTCAGAGGACATCCTACACAGTCTCCAGGATACAGTTATCGAA 3922
Query 2273 CTACTGCACTGAGACCTGGAAACCCCCCCTCTCACGGTTCTTCAGAATCATCCCTCTCTTCCACGTCCTATTCC 2346
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3923 CTACTGCACTGAGACCTGGAAACCCCCCCTCTCACGGTTCTTCAGAATCATCCCTCTCTTCCACGTCCTATTCC 3996
Query 2347 AGCCCCGCCCACCCTGTGTCCACAGACTCGTTGGCCCCATTTACGGGGACACCAGGGTATTTTAGCAGCCAGCC 2420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3997 AGCCCCGCCCACCCTGTGTCCACAGACTCGTTGGCCCCATTTACGGGGACACCAGGGTATTTTAGCAGCCAGCC 4070
Query 2421 ACATTCTGGAAACAGCACTGGCAGCAATCTTCCAAGGAGGAGCTGCCCTTCTAGTGCTGCTAGCCCTACCCTGC 2494
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4071 ACATTCTGGAAACAGCACTGGCAGCAATCTTCCAAGGAGGAGCTGCCCTTCTAGTGCTGCTAGCCCTACCCTGC 4144
Query 2495 AGGGACCCTCAGACTCGCCAACCTCAGATTCAGTTTCTCAGTCCAGCACAGGAACTCTGAGTTCCACCTCCTTT 2568
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4145 AGGGACCCTCAGACTCGCCAACCTCAGATTCAGTTTCTCAGTCCAGCACAGGAACTCTGAGTTCCACCTCCTTT 4218
Query 2569 CCTCAGAACTCTAGGTCGTCATTGCCATCAGACTTACGGACTATCAGTCTGCCCAGTGCTGGGCAGTCAGCTGT 2642
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4219 CCTCAGAACTCTAGGTCGTCATTGCCATCAGACTTACGGACTATCAGTCTGCCCAGTGCTGGGCAGTCAGCTGT 4292
Query 2643 CTACCAGGCCTCCAGGGTATCTGCGGTTTCCAATTCACAGCACTACCCACACCGTGGGAGTGGGGGTGTGCACC 2716
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4293 CTACCAGGCCTCCAGGGTATCTGCGGTTTCCAATTCACAGCACTACCCACACCGTGGGAGTGGGGGTGTGCACC 4366
Query 2717 AGTACCGACTCCAGCCACTGCAAGGGTCAGGAGTCAAGACTCAGACGGGACTTTCC 2772
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4367 AGTACCGACTCCAGCCACTGCAAGGGTCAGGAGTCAAGACTCAGACGGGACTTTCC 4422
