Protein Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroadEn_12183
Subject:
XM_011533933.1
Aligned Length:
1350
Identities:
924
Gaps:
426

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  MSRGKVIRLHRRKQDNISGGDSSATESWDEELSPSTVLYTATQHTPTSITLTVRRTKPKKRKKSPEKGRAAPKT  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  KKIKNSPSEAQNLDENTTEGWENRIRLWTDQYEEAFTNQYSADVQNALEQHLHSSKEFVGKPTILDTINKTELA  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  CNNTVIGSQMQLQLGRVTRVQKHRKILRAARDLALDTLIIEYRGKVMLRQQFEVNGHFFKKPYPFVLFYSKFNG  222

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  223  VEMCVDARTFGNDARFIRRSCTPNAEVRHMIADGMIHLCIYAVSAITKDAEVTIAFDYEYSNCNYKVDCACHKG  296

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  297  NRNCPIQKRNPNATELPLLPPPPSLPTIGAETRRRKARRKELEMEQQNEASEENNDQQSQEVPEKVTVSSDHEE  370

Query    1  -------------------------------------MHAFENLEKRKKRRDQPLEQSNSDVEITTTTSETPVG  37
                                                 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  VDNPEEKPEEEKEEVIDDQENLAHSRRTREDRKVEAIMHAFENLEKRKKRRDQPLEQSNSDVEITTTTSETPVG  444

Query   38  EETKTEAPESEVSNSVSNVTIPSTPQSVGVNTRRSSQAGDIAAEKLVPKPPPAKPSRPRPKSRISRYRTSSAQR  111
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  EETKTEAPESEVSNSVSNVTIPSTPQSVGVNTRRSSQAGDIAAEKLVPKPPPAKPSRPRPKSRISRYRTSSAQR  518

Query  112  LKRQKQANAQQAELSQAALEEGGSNSLVTPTEAGSLDSSGENRPLTGSDPTVVSITGSHVNRAASKYPKTKKYL  185
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  LKRQKQANAQQAELSQAALEEGGSNSLVTPTEAGSLDSSGENRPLTGSDPTVVSITGSHVNRAASKYPKTKKYL  592

Query  186  VTEWLNDKAEKQECPVECPLRITTDPTVLATTLNMLPGLIHSPLICTTPKHYIRFGSPFIPERRRRPLLPDGTF  259
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  VTEWLNDKAEKQECPVECPLRITTDPTVLATTLNMLPGLIHSPLICTTPKHYIRFGSPFIPERRRRPLLPDGTF  666

Query  260  SSCKKRWIKQALEEGMTQTSSVPQETRTQHLYQSNENSSSSSICKDNADLLSPLKKWKSRYLMEQNVTKLLRPL  333
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  SSCKKRWIKQALEEGMTQTSSVPQETRTQHLYQSNENSSSSSICKDNADLLSPLKKWKSRYLMEQNVTKLLRPL  740

Query  334  SPVTPPPPNSGSKSPQLATPGSSHPGEEECRNGYSLMFSPVTSLTTASRCNTPLQF------------------  389
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                  
Sbjct  741  SPVTPPPPNSGSKSPQLATPGSSHPGEEECRNGYSLMFSPVTSLTTASRCNTPLQFENISSPESSPAHRPESLS  814

Query  390  -ELCHRKDLDLAKVGYLDSNTNSCADRPSLLNSGHSDLAPHPSLGPTSETGFPSRSGDGHQTLVRNSDQAFRTE  462
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  PELCHRKDLDLAKVGYLDSNTNSCADRPSLLNSGHSDLAPHPSLGPTSETGFPSRSGDGHQTLVRNSDQAFRTE  888

Query  463  FNLMYAYSPLNAMPRADGLYRGSPLVGDRKPLHLDGGYCSPAEGFSSRYEHGLMKDLSRGSLSPGGERACEGVP  536
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  FNLMYAYSPLNAMPRADGLYRGSPLVGDRKPLHLDGGYCSPAEGFSSRYEHGLMKDLSRGSLSPGGERACEGVP  962

Query  537  SAPQNPPQRKKVSLLEYRKRKQEAKENSAGGGGDSAQSKSKSAGAGQGSSNSVSDTGAHGVQGSSARTPSSPHK  610
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  SAPQNPPQRKKVSLLEYRKRKQEAKENSAGGGGDSAQSKSKSAGAGQGSSNSVSDTGAHGVQGSSARTPSSPHK  1036

Query  611  KFSPSHSSMSHLEAVSPSDSRGTSSSHCRPQENISSRWMVPTSVERLREGGSIPKVLRSSVRVAQKGEPSPTWE  684
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  KFSPSHSSMSHLEAVSPSDSRGTSSSHCRPQENISSRWMVPTSVERLREGGSIPKVLRSSVRVAQKGEPSPTWE  1110

Query  685  SNITEKDSDPADGEGPETLSSALSKGATVYSPSRYSYQLLQCDSPRTESQSLLQQSSSPFRGHPTQSPGYSYRT  758
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  SNITEKDSDPADGEGPETLSSALSKGATVYSPSRYSYQLLQCDSPRTESQSLLQQSSSPFRGHPTQSPGYSYRT  1184

Query  759  TALRPGNPPSHGSSESSLSSTSYSSPAHPVSTDSLAPFTGTPGYFSSQPHSGNSTGSNLPRRSCPSSAASPTLQ  832
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TALRPGNPPSHGSSESSLSSTSYSSPAHPVSTDSLAPFTGTPGYFSSQPHSGNSTGSNLPRRSCPSSAASPTLQ  1258

Query  833  GPSDSPTSDSVSQSSTGTLSSTSFPQNSRSSLPSDLRTISLPSAGQSAVYQASRVSAVSNSQHYPHRGSGGVHQ  906
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  GPSDSPTSDSVSQSSTGTLSSTSFPQNSRSSLPSDLRTISLPSAGQSAVYQASRVSAVSNSQHYPHRGSGGVHQ  1332

Query  907  YRLQPLQGSGVKTQTGLS  924
            ||||||||||||||||||
Sbjct 1333  YRLQPLQGSGVKTQTGLS  1350