Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_12183
- Subject:
- XM_017006771.1
- Aligned Length:
- 4440
- Identities:
- 2772
- Gaps:
- 1668
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGAGCATTGCAATCCCTCTGGGAGTCACCACATCAGATACATCCTACTCAGATATGGCTGCTGGATCAGACCC 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 TGAATCTGTGGAGGCTAGTCCAGCAGTTAATGAGAAGAGCGTGTATTCCACTCATAATTATGGGACCACTCAGA 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 149 GGCATGGGTGTCGAGGACTGCCTTATGCTGATCATAATTACGGAGCCCCTCCTCCTCCGACACCTCCTGCTTCT 222
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 223 CCCCCTGTCCAGACGATCATCCCTCGTTCTGACCTGAATGGCCTGCCGTCGCCTGTAGAGGAACGCTGTGGAGA 296
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 297 CAGCCCGAACTCTGAAGGAGAAACTGTACCTACCTGGTGTCCTTGTGGTCTTTCTCAGGATGGCTTCCTTCTCA 370
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 371 ACTGTGACAAGTGCAGGGGAATGAGCAGGGGGAAGGTTATTAGACTTCATCGGCGGAAGCAGGACAACATATCA 444
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 445 GGTGGGGATAGCAGTGCAACAGAAAGCTGGGATGAGGAGCTTTCTCCTTCCACTGTGTTGTATACAGCAACACA 518
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 519 GCACACACCTACAAGCATCACCTTAACTGTTAGAAGAACCAAACCCAAGAAGCGGAAAAAGAGTCCAGAAAAGG 592
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 593 GTCGTGCAGCACCAAAGACGAAGAAAATCAAGAATTCTCCCTCTGAAGCACAGAATTTAGATGAGAATACAACT 666
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 667 GAGGGCTGGGAAAATCGGATAAGACTATGGACTGACCAGTATGAAGAAGCTTTCACTAATCAGTACAGTGCAGA 740
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 741 TGTACAGAACGCGCTTGAACAACACCTACATTCTAGCAAGGAATTTGTGGGCAAACCTACTATTTTAGACACTA 814
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 815 TTAATAAGACTGAATTGGCCTGTAATAACACAGTTATTGGTTCCCAAATGCAGTTACAGCTGGGAAGAGTCACT 888
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 889 CGTGTTCAAAAGCACCGGAAGATCCTGAGGGCTGCAAGAGATTTGGCTTTGGACACTCTTATAATAGAGTATCG 962
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 963 TGGGAAAGTCATGTTACGACAGCAATTTGAGGTCAATGGGCATTTCTTCAAAAAACCATACCCCTTTGTGCTCT 1036
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1037 TCTACTCAAAATTCAATGGTGTAGAGATGTGTGTGGATGCCCGTACTTTCGGTAATGATGCTCGGTTCATCAGA 1110
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1111 AGATCATGTACACCAAATGCAGAGGTGCGACACATGATTGCAGATGGGATGATTCACCTGTGCATCTATGCTGT 1184
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1185 GTCTGCCATCACCAAGGATGCTGAGGTCACCATAGCATTTGATTATGAGTATAGTAACTGTAATTATAAAGTGG 1258
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1259 ACTGTGCCTGTCACAAGGGAAACCGGAATTGTCCTATACAAAAAAGGAATCCTAATGCTACAGAACTGCCACTC 1332
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1333 CTACCACCTCCTCCAAGCCTACCCACCATTGGAGCAGAGACTAGACGTAGAAAAGCACGACGGAAAGAGCTAGA 1406
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1407 GATGGAGCAGCAGAATGAGGCTTCAGAGGAGAATAATGACCAGCAATCACAAGAAGTTCCAGAAAAAGTAACTG 1480
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1481 TATCCAGTGATCATGAGGAAGTAGACAATCCAGAAGAAAAACCAGAAGAAGAGAAAGAAGAGGTTATAGATGAC 1554
Query 1 ---------------------------------------------------------ATGCATGCTTTTGAAAA 17
|||||||||||||||||
Sbjct 1555 CAGGAGAACCTAGCTCATAGCAGGAGGACCAGGGAAGATAGAAAGGTAGAAGCCATCATGCATGCTTTTGAAAA 1628
Query 18 CTTAGAGAAAAGAAAGAAGCGGCGGGATCAGCCCTTGGAACAGAGCAACTCTGATGTAGAGATTACTACAACCA 91
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 CTTAGAGAAAAGAAAGAAGCGGCGGGATCAGCCCTTGGAACAGAGCAACTCTGATGTAGAGATTACTACAACCA 1702
Query 92 CCTCAGAGACTCCTGTTGGTGAAGAGACAAAAACTGAAGCCCCTGAATCTGAAGTTAGCAACTCTGTTTCAAAT 165
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 CCTCAGAGACTCCTGTTGGTGAAGAGACAAAAACTGAAGCCCCTGAATCTGAAGTTAGCAACTCTGTTTCAAAT 1776
Query 166 GTTACCATCCCAAGCACCCCACAGAGTGTTGGTGTGAATACCCGGAGGTCTTCCCAAGCAGGGGATATTGCTGC 239
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 GTTACCATCCCAAGCACCCCACAGAGTGTTGGTGTGAATACCCGGAGGTCTTCCCAAGCAGGGGATATTGCTGC 1850
Query 240 AGAAAAACTAGTCCCCAAGCCACCTCCAGCAAAGCCTTCTAGGCCCCGGCCGAAGAGTCGAATTTCTCGGTACA 313
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 AGAAAAACTAGTCCCCAAGCCACCTCCAGCAAAGCCTTCTAGGCCCCGGCCGAAGAGTCGAATTTCTCGGTACA 1924
Query 314 GGACCAGTTCAGCCCAAAGACTAAAGCGTCAGAAGCAGGCCAATGCACAGCAGGCAGAATTGTCACAAGCTGCC 387
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 GGACCAGTTCAGCCCAAAGACTAAAGCGTCAGAAGCAGGCCAATGCACAGCAGGCAGAATTGTCACAAGCTGCC 1998
Query 388 TTGGAAGAGGGAGGAAGTAACAGTTTAGTAACTCCTACTGAAGCTGGAAGTCTAGACAGTTCAGGAGAAAACAG 461
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 TTGGAAGAGGGAGGAAGTAACAGTTTAGTAACTCCTACTGAAGCTGGAAGTCTAGACAGTTCAGGAGAAAACAG 2072
Query 462 GCCATTAACAGGGTCTGACCCAACTGTGGTGTCAATTACTGGATCCCATGTCAACCGTGCTGCATCTAAATACC 535
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073 GCCATTAACAGGGTCTGACCCAACTGTGGTGTCAATTACTGGATCCCATGTCAACCGTGCTGCATCTAAATACC 2146
Query 536 CCAAAACCAAAAAGTATCTAGTTACAGAATGGTTGAATGACAAAGCAGAGAAGCAAGAGTGCCCTGTTGAGTGC 609
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147 CCAAAACCAAAAAGTATCTAGTTACAGAATGGTTGAATGACAAAGCAGAGAAGCAAGAGTGCCCTGTTGAGTGC 2220
Query 610 CCTTTACGTATCACAACGGATCCAACTGTACTGGCAACGACCCTAAACATGTTACCAGGTCTTATCCATTCCCC 683
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221 CCTTTACGTATCACAACGGATCCAACTGTACTGGCAACGACCCTAAACATGTTACCAGGTCTTATCCATTCCCC 2294
Query 684 GTTAATTTGCACCACCCCCAAACACTACATTCGCTTTGGCTCACCCTTTATCCCTGAGAGACGTCGAAGGCCCC 757
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295 GTTAATTTGCACCACCCCCAAACACTACATTCGCTTTGGCTCACCCTTTATCCCTGAGAGACGTCGAAGGCCCC 2368
Query 758 TTCTGCCTGATGGCACATTCAGCTCCTGTAAGAAGCGCTGGATAAAACAAGCCTTAGAAGAAGGGATGACTCAA 831
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369 TTCTGCCTGATGGCACATTCAGCTCCTGTAAGAAGCGCTGGATAAAACAAGCCTTAGAAGAAGGGATGACTCAA 2442
Query 832 ACATCATCTGTACCCCAAGAGACTAGAACTCAGCACCTATACCAAAGCAATGAGAATAGTAGCTCTTCTAGTAT 905
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443 ACATCATCTGTACCCCAAGAGACTAGAACTCAGCACCTATACCAAAGCAATGAGAATAGTAGCTCTTCTAGTAT 2516
Query 906 CTGCAAAGACAATGCAGACTTGTTGAGCCCATTAAAGAAATGGAAGTCTCGCTATCTGATGGAGCAGAATGTCA 979
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517 CTGCAAAGACAATGCAGACTTGTTGAGCCCATTAAAGAAATGGAAGTCTCGCTATCTGATGGAGCAGAATGTCA 2590
Query 980 CCAAGTTACTTCGGCCTCTGTCTCCAGTCACACCACCCCCTCCCAATTCAGGCTCAAAGAGTCCCCAGCTGGCC 1053
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591 CCAAGTTACTTCGGCCTCTGTCTCCAGTCACACCACCCCCTCCCAATTCAGGCTCAAAGAGTCCCCAGCTGGCC 2664
Query 1054 ACACCTGGCTCATCTCACCCAGGAGAAGAGGAGTGTCGAAATGGATACAGCCTCATGTTTTCACCAGTCACATC 1127
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2665 ACACCTGGCTCATCTCACCCAGGAGAAGAGGAGTGTCGAAATGGATACAGCCTCATGTTTTCACCAGTCACATC 2738
Query 1128 TCTTACTACTGCTAGTCGCTGCAACACTCCTCTACAGTTT---------------------------------- 1167
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2739 TCTTACTACTGCTAGTCGCTGCAACACTCCTCTACAGTTTGAGAACATATCCTCCCCTGAGAGTTCCCCTGCGC 2812
Query 1168 -----------------------GAGCTTTGTCACCGAAAAGACCTGGATTTGGCAAAAGTAGGATACCTTGAC 1218
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2813 ATAGGCCCGAGTCCCTGTCACCCGAGCTTTGTCACCGAAAAGACCTGGATTTGGCAAAAGTAGGATACCTTGAC 2886
Query 1219 TCCAACACTAACAGCTGTGCTGATAGACCTTCCCTACTCAACTCAGGTCATTCTGACCTGGCTCCTCATCCCTC 1292
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2887 TCCAACACTAACAGCTGTGCTGATAGACCTTCCCTACTCAACTCAGGTCATTCTGACCTGGCTCCTCATCCCTC 2960
Query 1293 CCTCGGACCCACTTCTGAGACTGGTTTCCCAAGCAGAAGTGGAGATGGACATCAGACCCTCGTGAGAAACTCAG 1366
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2961 CCTCGGACCCACTTCTGAGACTGGTTTCCCAAGCAGAAGTGGAGATGGACATCAGACCCTCGTGAGAAACTCAG 3034
Query 1367 ACCAGGCATTTCGGACAGAGTTCAACTTGATGTATGCCTACTCCCCTTTGAATGCTATGCCTCGAGCAGATGGA 1440
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3035 ACCAGGCATTTCGGACAGAGTTCAACTTGATGTATGCCTACTCCCCTTTGAATGCTATGCCTCGAGCAGATGGA 3108
Query 1441 CTGTATCGAGGATCTCCTCTAGTGGGGGATAGGAAGCCTTTACATTTGGATGGGGGATATTGTTCCCCTGCAGA 1514
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3109 CTGTATCGAGGATCTCCTCTAGTGGGGGATAGGAAGCCTTTACATTTGGATGGGGGATATTGTTCCCCTGCAGA 3182
Query 1515 AGGATTTTCCAGCAGATATGAACATGGCTTAATGAAAGACCTCTCTCGTGGATCCTTGTCACCTGGTGGTGAAA 1588
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3183 AGGATTTTCCAGCAGATATGAACATGGCTTAATGAAAGACCTCTCTCGTGGATCCTTGTCACCTGGTGGTGAAA 3256
Query 1589 GGGCCTGTGAAGGAGTCCCATCTGCCCCCCAGAACCCACCACAGAGGAAAAAAGTATCCCTGCTGGAGTACCGA 1662
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3257 GGGCCTGTGAAGGAGTCCCATCTGCCCCCCAGAACCCACCACAGAGGAAAAAAGTATCCCTGCTGGAGTACCGA 3330
Query 1663 AAACGGAAACAAGAAGCTAAGGAAAATTCTGCTGGTGGGGGAGGTGACTCTGCACAGAGCAAAAGCAAGTCTGC 1736
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3331 AAACGGAAACAAGAAGCTAAGGAAAATTCTGCTGGTGGGGGAGGTGACTCTGCACAGAGCAAAAGCAAGTCTGC 3404
Query 1737 AGGAGCTGGGCAAGGCAGCAGTAACTCCGTTTCCGACACTGGTGCCCATGGTGTGCAGGGATCCTCAGCCCGAA 1810
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3405 AGGAGCTGGGCAAGGCAGCAGTAACTCCGTTTCCGACACTGGTGCCCATGGTGTGCAGGGATCCTCAGCCCGAA 3478
Query 1811 CTCCATCTTCCCCTCACAAAAAATTCTCCCCATCTCATTCCTCTATGTCCCATTTGGAGGCGGTAAGCCCATCA 1884
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3479 CTCCATCTTCCCCTCACAAAAAATTCTCCCCATCTCATTCCTCTATGTCCCATTTGGAGGCGGTAAGCCCATCA 3552
Query 1885 GATTCCAGAGGCACTTCTTCATCTCACTGCAGACCTCAAGAGAATATCAGCAGTAGGTGGATGGTTCCCACATC 1958
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3553 GATTCCAGAGGCACTTCTTCATCTCACTGCAGACCTCAAGAGAATATCAGCAGTAGGTGGATGGTTCCCACATC 3626
Query 1959 AGTAGAACGACTCCGAGAAGGAGGGAGCATCCCCAAGGTCCTCCGAAGCAGCGTGAGGGTGGCCCAAAAGGGAG 2032
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3627 AGTAGAACGACTCCGAGAAGGAGGGAGCATCCCCAAGGTCCTCCGAAGCAGCGTGAGGGTGGCCCAAAAGGGAG 3700
Query 2033 AGCCCTCTCCCACATGGGAGAGTAACATCACAGAGAAAGACTCAGACCCTGCAGATGGAGAAGGCCCAGAGACA 2106
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3701 AGCCCTCTCCCACATGGGAGAGTAACATCACAGAGAAAGACTCAGACCCTGCAGATGGAGAAGGCCCAGAGACA 3774
Query 2107 TTAAGCTCAGCACTCTCTAAAGGAGCAACAGTTTACAGCCCTTCCAGATACAGCTACCAGCTCCTGCAGTGTGA 2180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3775 TTAAGCTCAGCACTCTCTAAAGGAGCAACAGTTTACAGCCCTTCCAGATACAGCTACCAGCTCCTGCAGTGTGA 3848
Query 2181 TAGTCCTCGGACAGAATCACAAAGCCTCCTTCAGCAGAGTTCCTCCCCCTTCAGAGGACATCCTACACAGTCTC 2254
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3849 TAGTCCTCGGACAGAATCACAAAGCCTCCTTCAGCAGAGTTCCTCCCCCTTCAGAGGACATCCTACACAGTCTC 3922
Query 2255 CAGGATACAGTTATCGAACTACTGCACTGAGACCTGGAAACCCCCCCTCTCACGGTTCTTCAGAATCATCCCTC 2328
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3923 CAGGATACAGTTATCGAACTACTGCACTGAGACCTGGAAACCCCCCCTCTCACGGTTCTTCAGAATCATCCCTC 3996
Query 2329 TCTTCCACGTCCTATTCCAGCCCCGCCCACCCTGTGTCCACAGACTCGTTGGCCCCATTTACGGGGACACCAGG 2402
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3997 TCTTCCACGTCCTATTCCAGCCCCGCCCACCCTGTGTCCACAGACTCGTTGGCCCCATTTACGGGGACACCAGG 4070
Query 2403 GTATTTTAGCAGCCAGCCACATTCTGGAAACAGCACTGGCAGCAATCTTCCAAGGAGGAGCTGCCCTTCTAGTG 2476
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4071 GTATTTTAGCAGCCAGCCACATTCTGGAAACAGCACTGGCAGCAATCTTCCAAGGAGGAGCTGCCCTTCTAGTG 4144
Query 2477 CTGCTAGCCCTACCCTGCAGGGACCCTCAGACTCGCCAACCTCAGATTCAGTTTCTCAGTCCAGCACAGGAACT 2550
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4145 CTGCTAGCCCTACCCTGCAGGGACCCTCAGACTCGCCAACCTCAGATTCAGTTTCTCAGTCCAGCACAGGAACT 4218
Query 2551 CTGAGTTCCACCTCCTTTCCTCAGAACTCTAGGTCGTCATTGCCATCAGACTTACGGACTATCAGTCTGCCCAG 2624
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4219 CTGAGTTCCACCTCCTTTCCTCAGAACTCTAGGTCGTCATTGCCATCAGACTTACGGACTATCAGTCTGCCCAG 4292
Query 2625 TGCTGGGCAGTCAGCTGTCTACCAGGCCTCCAGGGTATCTGCGGTTTCCAATTCACAGCACTACCCACACCGTG 2698
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4293 TGCTGGGCAGTCAGCTGTCTACCAGGCCTCCAGGGTATCTGCGGTTTCCAATTCACAGCACTACCCACACCGTG 4366
Query 2699 GGAGTGGGGGTGTGCACCAGTACCGACTCCAGCCACTGCAAGGGTCAGGAGTCAAGACTCAGACGGGACTTTCC 2772
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4367 GGAGTGGGGGTGTGCACCAGTACCGACTCCAGCCACTGCAAGGGTCAGGAGTCAAGACTCAGACGGGACTTTCC 4440
