Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_12183
- Subject:
- XM_017006773.1
- Aligned Length:
- 4404
- Identities:
- 2772
- Gaps:
- 1632
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGGAAGTATTAAGAGATCCAATTAAGAAGAATAGTTCTGAGTCTAAACCAGCCCAGAGTGGCTTCTCTAGGGG 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 AAACTCCCCGCTCAGCTGCCCTGAATCTGTGGAGGCTAGTCCAGCAGTTAATGAGAAGAGCGTGTATTCCACTC 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 149 ATAATTATGGGACCACTCAGAGGCATGGGTGTCGAGGACTGCCTTATGCTACGATCATCCCTCGTTCTGACCTG 222
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 223 AATGGCCTGCCGTCGCCTGTAGAGGAACGCTGTGGAGACAGCCCGAACTCTGAAGGAGAAACTGTACCTACCTG 296
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 297 GTGTCCTTGTGGTCTTTCTCAGGATGGCTTCCTTCTCAACTGTGACAAGTGCAGGGGAATGAGCAGGGGGAAGG 370
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 371 TTATTAGACTTCATCGGCGGAAGCAGGACAACATATCAGGTGGGGATAGCAGTGCAACAGAAAGCTGGGATGAG 444
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 445 GAGCTTTCTCCTTCCACTGTGTTGTATACAGCAACACAGCACACACCTACAAGCATCACCTTAACTGTTAGAAG 518
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 519 AACCAAACCCAAGAAGCGGAAAAAGAGTCCAGAAAAGGGTCGTGCAGCACCAAAGACGAAGAAAATCAAGAATT 592
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 593 CTCCCTCTGAAGCACAGAATTTAGATGAGAATACAACTGAGGGCTGGGAAAATCGGATAAGACTATGGACTGAC 666
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 667 CAGTATGAAGAAGCTTTCACTAATCAGTACAGTGCAGATGTACAGAACGCGCTTGAACAACACCTACATTCTAG 740
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 741 CAAGGAATTTGTGGGCAAACCTACTATTTTAGACACTATTAATAAGACTGAATTGGCCTGTAATAACACAGTTA 814
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 815 TTGGTTCCCAAATGCAGTTACAGCTGGGAAGAGTCACTCGTGTTCAAAAGCACCGGAAGATCCTGAGGGCTGCA 888
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 889 AGAGATTTGGCTTTGGACACTCTTATAATAGAGTATCGTGGGAAAGTCATGTTACGACAGCAATTTGAGGTCAA 962
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 963 TGGGCATTTCTTCAAAAAACCATACCCCTTTGTGCTCTTCTACTCAAAATTCAATGGTGTAGAGATGTGTGTGG 1036
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1037 ATGCCCGTACTTTCGGTAATGATGCTCGGTTCATCAGAAGATCATGTACACCAAATGCAGAGGTGCGACACATG 1110
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1111 ATTGCAGATGGGATGATTCACCTGTGCATCTATGCTGTGTCTGCCATCACCAAGGATGCTGAGGTCACCATAGC 1184
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1185 ATTTGATTATGAGTATAGTAACTGTAATTATAAAGTGGACTGTGCCTGTCACAAGGGAAACCGGAATTGTCCTA 1258
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1259 TACAAAAAAGGAATCCTAATGCTACAGAACTGCCACTCCTACCACCTCCTCCAAGCCTACCCACCATTGGAGCA 1332
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1333 GAGACTAGACGTAGAAAAGCACGACGGAAAGAGCTAGAGATGGAGCAGCAGAATGAGGCTTCAGAGGAGAATAA 1406
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1407 TGACCAGCAATCACAAGAAGTTCCAGAAAAAGTAACTGTATCCAGTGATCATGAGGAAGTAGACAATCCAGAAG 1480
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1481 AAAAACCAGAAGAAGAGAAAGAAGAGGTTATAGATGACCAGGAGAACCTAGCTCATAGCAGGAGGACCAGGGAA 1554
Query 1 ---------------------ATGCATGCTTTTGAAAACTTAGAGAAAAGAAAGAAGCGGCGGGATCAGCCCTT 53
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 GATAGAAAGGTAGAAGCCATCATGCATGCTTTTGAAAACTTAGAGAAAAGAAAGAAGCGGCGGGATCAGCCCTT 1628
Query 54 GGAACAGAGCAACTCTGATGTAGAGATTACTACAACCACCTCAGAGACTCCTGTTGGTGAAGAGACAAAAACTG 127
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 GGAACAGAGCAACTCTGATGTAGAGATTACTACAACCACCTCAGAGACTCCTGTTGGTGAAGAGACAAAAACTG 1702
Query 128 AAGCCCCTGAATCTGAAGTTAGCAACTCTGTTTCAAATGTTACCATCCCAAGCACCCCACAGAGTGTTGGTGTG 201
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 AAGCCCCTGAATCTGAAGTTAGCAACTCTGTTTCAAATGTTACCATCCCAAGCACCCCACAGAGTGTTGGTGTG 1776
Query 202 AATACCCGGAGGTCTTCCCAAGCAGGGGATATTGCTGCAGAAAAACTAGTCCCCAAGCCACCTCCAGCAAAGCC 275
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 AATACCCGGAGGTCTTCCCAAGCAGGGGATATTGCTGCAGAAAAACTAGTCCCCAAGCCACCTCCAGCAAAGCC 1850
Query 276 TTCTAGGCCCCGGCCGAAGAGTCGAATTTCTCGGTACAGGACCAGTTCAGCCCAAAGACTAAAGCGTCAGAAGC 349
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 TTCTAGGCCCCGGCCGAAGAGTCGAATTTCTCGGTACAGGACCAGTTCAGCCCAAAGACTAAAGCGTCAGAAGC 1924
Query 350 AGGCCAATGCACAGCAGGCAGAATTGTCACAAGCTGCCTTGGAAGAGGGAGGAAGTAACAGTTTAGTAACTCCT 423
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 AGGCCAATGCACAGCAGGCAGAATTGTCACAAGCTGCCTTGGAAGAGGGAGGAAGTAACAGTTTAGTAACTCCT 1998
Query 424 ACTGAAGCTGGAAGTCTAGACAGTTCAGGAGAAAACAGGCCATTAACAGGGTCTGACCCAACTGTGGTGTCAAT 497
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 ACTGAAGCTGGAAGTCTAGACAGTTCAGGAGAAAACAGGCCATTAACAGGGTCTGACCCAACTGTGGTGTCAAT 2072
Query 498 TACTGGATCCCATGTCAACCGTGCTGCATCTAAATACCCCAAAACCAAAAAGTATCTAGTTACAGAATGGTTGA 571
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073 TACTGGATCCCATGTCAACCGTGCTGCATCTAAATACCCCAAAACCAAAAAGTATCTAGTTACAGAATGGTTGA 2146
Query 572 ATGACAAAGCAGAGAAGCAAGAGTGCCCTGTTGAGTGCCCTTTACGTATCACAACGGATCCAACTGTACTGGCA 645
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147 ATGACAAAGCAGAGAAGCAAGAGTGCCCTGTTGAGTGCCCTTTACGTATCACAACGGATCCAACTGTACTGGCA 2220
Query 646 ACGACCCTAAACATGTTACCAGGTCTTATCCATTCCCCGTTAATTTGCACCACCCCCAAACACTACATTCGCTT 719
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221 ACGACCCTAAACATGTTACCAGGTCTTATCCATTCCCCGTTAATTTGCACCACCCCCAAACACTACATTCGCTT 2294
Query 720 TGGCTCACCCTTTATCCCTGAGAGACGTCGAAGGCCCCTTCTGCCTGATGGCACATTCAGCTCCTGTAAGAAGC 793
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295 TGGCTCACCCTTTATCCCTGAGAGACGTCGAAGGCCCCTTCTGCCTGATGGCACATTCAGCTCCTGTAAGAAGC 2368
Query 794 GCTGGATAAAACAAGCCTTAGAAGAAGGGATGACTCAAACATCATCTGTACCCCAAGAGACTAGAACTCAGCAC 867
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369 GCTGGATAAAACAAGCCTTAGAAGAAGGGATGACTCAAACATCATCTGTACCCCAAGAGACTAGAACTCAGCAC 2442
Query 868 CTATACCAAAGCAATGAGAATAGTAGCTCTTCTAGTATCTGCAAAGACAATGCAGACTTGTTGAGCCCATTAAA 941
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443 CTATACCAAAGCAATGAGAATAGTAGCTCTTCTAGTATCTGCAAAGACAATGCAGACTTGTTGAGCCCATTAAA 2516
Query 942 GAAATGGAAGTCTCGCTATCTGATGGAGCAGAATGTCACCAAGTTACTTCGGCCTCTGTCTCCAGTCACACCAC 1015
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517 GAAATGGAAGTCTCGCTATCTGATGGAGCAGAATGTCACCAAGTTACTTCGGCCTCTGTCTCCAGTCACACCAC 2590
Query 1016 CCCCTCCCAATTCAGGCTCAAAGAGTCCCCAGCTGGCCACACCTGGCTCATCTCACCCAGGAGAAGAGGAGTGT 1089
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591 CCCCTCCCAATTCAGGCTCAAAGAGTCCCCAGCTGGCCACACCTGGCTCATCTCACCCAGGAGAAGAGGAGTGT 2664
Query 1090 CGAAATGGATACAGCCTCATGTTTTCACCAGTCACATCTCTTACTACTGCTAGTCGCTGCAACACTCCTCTACA 1163
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2665 CGAAATGGATACAGCCTCATGTTTTCACCAGTCACATCTCTTACTACTGCTAGTCGCTGCAACACTCCTCTACA 2738
Query 1164 GTTT---------------------------------------------------------GAGCTTTGTCACC 1180
|||| |||||||||||||
Sbjct 2739 GTTTGAGAACATATCCTCCCCTGAGAGTTCCCCTGCGCATAGGCCCGAGTCCCTGTCACCCGAGCTTTGTCACC 2812
Query 1181 GAAAAGACCTGGATTTGGCAAAAGTAGGATACCTTGACTCCAACACTAACAGCTGTGCTGATAGACCTTCCCTA 1254
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2813 GAAAAGACCTGGATTTGGCAAAAGTAGGATACCTTGACTCCAACACTAACAGCTGTGCTGATAGACCTTCCCTA 2886
Query 1255 CTCAACTCAGGTCATTCTGACCTGGCTCCTCATCCCTCCCTCGGACCCACTTCTGAGACTGGTTTCCCAAGCAG 1328
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2887 CTCAACTCAGGTCATTCTGACCTGGCTCCTCATCCCTCCCTCGGACCCACTTCTGAGACTGGTTTCCCAAGCAG 2960
Query 1329 AAGTGGAGATGGACATCAGACCCTCGTGAGAAACTCAGACCAGGCATTTCGGACAGAGTTCAACTTGATGTATG 1402
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2961 AAGTGGAGATGGACATCAGACCCTCGTGAGAAACTCAGACCAGGCATTTCGGACAGAGTTCAACTTGATGTATG 3034
Query 1403 CCTACTCCCCTTTGAATGCTATGCCTCGAGCAGATGGACTGTATCGAGGATCTCCTCTAGTGGGGGATAGGAAG 1476
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3035 CCTACTCCCCTTTGAATGCTATGCCTCGAGCAGATGGACTGTATCGAGGATCTCCTCTAGTGGGGGATAGGAAG 3108
Query 1477 CCTTTACATTTGGATGGGGGATATTGTTCCCCTGCAGAAGGATTTTCCAGCAGATATGAACATGGCTTAATGAA 1550
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3109 CCTTTACATTTGGATGGGGGATATTGTTCCCCTGCAGAAGGATTTTCCAGCAGATATGAACATGGCTTAATGAA 3182
Query 1551 AGACCTCTCTCGTGGATCCTTGTCACCTGGTGGTGAAAGGGCCTGTGAAGGAGTCCCATCTGCCCCCCAGAACC 1624
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3183 AGACCTCTCTCGTGGATCCTTGTCACCTGGTGGTGAAAGGGCCTGTGAAGGAGTCCCATCTGCCCCCCAGAACC 3256
Query 1625 CACCACAGAGGAAAAAAGTATCCCTGCTGGAGTACCGAAAACGGAAACAAGAAGCTAAGGAAAATTCTGCTGGT 1698
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3257 CACCACAGAGGAAAAAAGTATCCCTGCTGGAGTACCGAAAACGGAAACAAGAAGCTAAGGAAAATTCTGCTGGT 3330
Query 1699 GGGGGAGGTGACTCTGCACAGAGCAAAAGCAAGTCTGCAGGAGCTGGGCAAGGCAGCAGTAACTCCGTTTCCGA 1772
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3331 GGGGGAGGTGACTCTGCACAGAGCAAAAGCAAGTCTGCAGGAGCTGGGCAAGGCAGCAGTAACTCCGTTTCCGA 3404
Query 1773 CACTGGTGCCCATGGTGTGCAGGGATCCTCAGCCCGAACTCCATCTTCCCCTCACAAAAAATTCTCCCCATCTC 1846
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3405 CACTGGTGCCCATGGTGTGCAGGGATCCTCAGCCCGAACTCCATCTTCCCCTCACAAAAAATTCTCCCCATCTC 3478
Query 1847 ATTCCTCTATGTCCCATTTGGAGGCGGTAAGCCCATCAGATTCCAGAGGCACTTCTTCATCTCACTGCAGACCT 1920
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3479 ATTCCTCTATGTCCCATTTGGAGGCGGTAAGCCCATCAGATTCCAGAGGCACTTCTTCATCTCACTGCAGACCT 3552
Query 1921 CAAGAGAATATCAGCAGTAGGTGGATGGTTCCCACATCAGTAGAACGACTCCGAGAAGGAGGGAGCATCCCCAA 1994
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3553 CAAGAGAATATCAGCAGTAGGTGGATGGTTCCCACATCAGTAGAACGACTCCGAGAAGGAGGGAGCATCCCCAA 3626
Query 1995 GGTCCTCCGAAGCAGCGTGAGGGTGGCCCAAAAGGGAGAGCCCTCTCCCACATGGGAGAGTAACATCACAGAGA 2068
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3627 GGTCCTCCGAAGCAGCGTGAGGGTGGCCCAAAAGGGAGAGCCCTCTCCCACATGGGAGAGTAACATCACAGAGA 3700
Query 2069 AAGACTCAGACCCTGCAGATGGAGAAGGCCCAGAGACATTAAGCTCAGCACTCTCTAAAGGAGCAACAGTTTAC 2142
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3701 AAGACTCAGACCCTGCAGATGGAGAAGGCCCAGAGACATTAAGCTCAGCACTCTCTAAAGGAGCAACAGTTTAC 3774
Query 2143 AGCCCTTCCAGATACAGCTACCAGCTCCTGCAGTGTGATAGTCCTCGGACAGAATCACAAAGCCTCCTTCAGCA 2216
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3775 AGCCCTTCCAGATACAGCTACCAGCTCCTGCAGTGTGATAGTCCTCGGACAGAATCACAAAGCCTCCTTCAGCA 3848
Query 2217 GAGTTCCTCCCCCTTCAGAGGACATCCTACACAGTCTCCAGGATACAGTTATCGAACTACTGCACTGAGACCTG 2290
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3849 GAGTTCCTCCCCCTTCAGAGGACATCCTACACAGTCTCCAGGATACAGTTATCGAACTACTGCACTGAGACCTG 3922
Query 2291 GAAACCCCCCCTCTCACGGTTCTTCAGAATCATCCCTCTCTTCCACGTCCTATTCCAGCCCCGCCCACCCTGTG 2364
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3923 GAAACCCCCCCTCTCACGGTTCTTCAGAATCATCCCTCTCTTCCACGTCCTATTCCAGCCCCGCCCACCCTGTG 3996
Query 2365 TCCACAGACTCGTTGGCCCCATTTACGGGGACACCAGGGTATTTTAGCAGCCAGCCACATTCTGGAAACAGCAC 2438
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3997 TCCACAGACTCGTTGGCCCCATTTACGGGGACACCAGGGTATTTTAGCAGCCAGCCACATTCTGGAAACAGCAC 4070
Query 2439 TGGCAGCAATCTTCCAAGGAGGAGCTGCCCTTCTAGTGCTGCTAGCCCTACCCTGCAGGGACCCTCAGACTCGC 2512
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4071 TGGCAGCAATCTTCCAAGGAGGAGCTGCCCTTCTAGTGCTGCTAGCCCTACCCTGCAGGGACCCTCAGACTCGC 4144
Query 2513 CAACCTCAGATTCAGTTTCTCAGTCCAGCACAGGAACTCTGAGTTCCACCTCCTTTCCTCAGAACTCTAGGTCG 2586
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4145 CAACCTCAGATTCAGTTTCTCAGTCCAGCACAGGAACTCTGAGTTCCACCTCCTTTCCTCAGAACTCTAGGTCG 4218
Query 2587 TCATTGCCATCAGACTTACGGACTATCAGTCTGCCCAGTGCTGGGCAGTCAGCTGTCTACCAGGCCTCCAGGGT 2660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4219 TCATTGCCATCAGACTTACGGACTATCAGTCTGCCCAGTGCTGGGCAGTCAGCTGTCTACCAGGCCTCCAGGGT 4292
Query 2661 ATCTGCGGTTTCCAATTCACAGCACTACCCACACCGTGGGAGTGGGGGTGTGCACCAGTACCGACTCCAGCCAC 2734
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4293 ATCTGCGGTTTCCAATTCACAGCACTACCCACACCGTGGGAGTGGGGGTGTGCACCAGTACCGACTCCAGCCAC 4366
Query 2735 TGCAAGGGTCAGGAGTCAAGACTCAGACGGGACTTTCC 2772
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4367 TGCAAGGGTCAGGAGTCAAGACTCAGACGGGACTTTCC 4404
