Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_12183
- Subject:
- XM_017006778.1
- Aligned Length:
- 4089
- Identities:
- 2772
- Gaps:
- 1317
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGAGCAGGGGGAAGGTTATTAGACTTCATCGGCGGAAGCAGGACAACATATCAGGTGGGGATAGCAGTGCAAC 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 AGAAAGCTGGGATGAGGAGCTTTCTCCTTCCACTGTGTTGTATACAGCAACACAGCACACACCTACAAGCATCA 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 149 CCTTAACTGTTAGAAGAACCAAACCCAAGAAGCGGAAAAAGAGTCCAGAAAAGGGTCGTGCAGCACCAAAGACG 222
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 223 AAGAAAATCAAGGCATTTCGAGAGGGATCCCGGAAGTCCTTGCGGATGAAGAATTCTCCCTCTGAAGCACAGAA 296
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 297 TTTAGATGAGAATACAACTGAGGGCTGGGAAAATCGGATAAGACTATGGACTGACCAGTATGAAGAAGCTTTCA 370
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 371 CTAATCAGTACAGTGCAGATGTACAGAACGCGCTTGAACAACACCTACATTCTAGCAAGGAATTTGTGGGCAAA 444
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 445 CCTACTATTTTAGACACTATTAATAAGACTGAATTGGCCTGTAATAACACAGTTATTGGTTCCCAAATGCAGTT 518
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 519 ACAGCTGGGAAGAGTCACTCGTGTTCAAAAGCACCGGAAGATCCTGAGGGCTGCAAGAGATTTGGCTTTGGACA 592
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 593 CTCTTATAATAGAGTATCGTGGGAAAGTCATGTTACGACAGCAATTTGAGGTCAATGGGCATTTCTTCAAAAAA 666
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 667 CCATACCCCTTTGTGCTCTTCTACTCAAAATTCAATGGTGTAGAGATGTGTGTGGATGCCCGTACTTTCGGTAA 740
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 741 TGATGCTCGGTTCATCAGAAGATCATGTACACCAAATGCAGAGGTGCGACACATGATTGCAGATGGGATGATTC 814
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 815 ACCTGTGCATCTATGCTGTGTCTGCCATCACCAAGGATGCTGAGGTCACCATAGCATTTGATTATGAGTATAGT 888
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 889 AACTGTAATTATAAAGTGGACTGTGCCTGTCACAAGGGAAACCGGAATTGTCCTATACAAAAAAGGAATCCTAA 962
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 963 TGCTACAGAACTGCCACTCCTACCACCTCCTCCAAGCCTACCCACCATTGGAGCAGAGACTAGACGTAGAAAAG 1036
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1037 CACGACGGAAAGAGCTAGAGATGGAGCAGCAGAATGAGGCTTCAGAGGAGAATAATGACCAGCAATCACAAGAA 1110
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1111 GTTCCAGAAAAAGTAACTGTATCCAGTGATCATGAGGAAGTAGACAATCCAGAAGAAAAACCAGAAGAAGAGAA 1184
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1185 AGAAGAGGTTATAGATGACCAGGAGAACCTAGCTCATAGCAGGAGGACCAGGGAAGATAGAAAGGTAGAAGCCA 1258
Query 1 --ATGCATGCTTTTGAAAACTTAGAGAAAAGAAAGAAGCGGCGGGATCAGCCCTTGGAACAGAGCAACTCTGAT 72
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 TCATGCATGCTTTTGAAAACTTAGAGAAAAGAAAGAAGCGGCGGGATCAGCCCTTGGAACAGAGCAACTCTGAT 1332
Query 73 GTAGAGATTACTACAACCACCTCAGAGACTCCTGTTGGTGAAGAGACAAAAACTGAAGCCCCTGAATCTGAAGT 146
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 GTAGAGATTACTACAACCACCTCAGAGACTCCTGTTGGTGAAGAGACAAAAACTGAAGCCCCTGAATCTGAAGT 1406
Query 147 TAGCAACTCTGTTTCAAATGTTACCATCCCAAGCACCCCACAGAGTGTTGGTGTGAATACCCGGAGGTCTTCCC 220
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 TAGCAACTCTGTTTCAAATGTTACCATCCCAAGCACCCCACAGAGTGTTGGTGTGAATACCCGGAGGTCTTCCC 1480
Query 221 AAGCAGGGGATATTGCTGCAGAAAAACTAGTCCCCAAGCCACCTCCAGCAAAGCCTTCTAGGCCCCGGCCGAAG 294
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 AAGCAGGGGATATTGCTGCAGAAAAACTAGTCCCCAAGCCACCTCCAGCAAAGCCTTCTAGGCCCCGGCCGAAG 1554
Query 295 AGTCGAATTTCTCGGTACAGGACCAGTTCAGCCCAAAGACTAAAGCGTCAGAAGCAGGCCAATGCACAGCAGGC 368
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 AGTCGAATTTCTCGGTACAGGACCAGTTCAGCCCAAAGACTAAAGCGTCAGAAGCAGGCCAATGCACAGCAGGC 1628
Query 369 AGAATTGTCACAAGCTGCCTTGGAAGAGGGAGGAAGTAACAGTTTAGTAACTCCTACTGAAGCTGGAAGTCTAG 442
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 AGAATTGTCACAAGCTGCCTTGGAAGAGGGAGGAAGTAACAGTTTAGTAACTCCTACTGAAGCTGGAAGTCTAG 1702
Query 443 ACAGTTCAGGAGAAAACAGGCCATTAACAGGGTCTGACCCAACTGTGGTGTCAATTACTGGATCCCATGTCAAC 516
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 ACAGTTCAGGAGAAAACAGGCCATTAACAGGGTCTGACCCAACTGTGGTGTCAATTACTGGATCCCATGTCAAC 1776
Query 517 CGTGCTGCATCTAAATACCCCAAAACCAAAAAGTATCTAGTTACAGAATGGTTGAATGACAAAGCAGAGAAGCA 590
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 CGTGCTGCATCTAAATACCCCAAAACCAAAAAGTATCTAGTTACAGAATGGTTGAATGACAAAGCAGAGAAGCA 1850
Query 591 AGAGTGCCCTGTTGAGTGCCCTTTACGTATCACAACGGATCCAACTGTACTGGCAACGACCCTAAACATGTTAC 664
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 AGAGTGCCCTGTTGAGTGCCCTTTACGTATCACAACGGATCCAACTGTACTGGCAACGACCCTAAACATGTTAC 1924
Query 665 CAGGTCTTATCCATTCCCCGTTAATTTGCACCACCCCCAAACACTACATTCGCTTTGGCTCACCCTTTATCCCT 738
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 CAGGTCTTATCCATTCCCCGTTAATTTGCACCACCCCCAAACACTACATTCGCTTTGGCTCACCCTTTATCCCT 1998
Query 739 GAGAGACGTCGAAGGCCCCTTCTGCCTGATGGCACATTCAGCTCCTGTAAGAAGCGCTGGATAAAACAAGCCTT 812
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 GAGAGACGTCGAAGGCCCCTTCTGCCTGATGGCACATTCAGCTCCTGTAAGAAGCGCTGGATAAAACAAGCCTT 2072
Query 813 AGAAGAAGGGATGACTCAAACATCATCTGTACCCCAAGAGACTAGAACTCAGCACCTATACCAAAGCAATGAGA 886
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073 AGAAGAAGGGATGACTCAAACATCATCTGTACCCCAAGAGACTAGAACTCAGCACCTATACCAAAGCAATGAGA 2146
Query 887 ATAGTAGCTCTTCTAGTATCTGCAAAGACAATGCAGACTTGTTGAGCCCATTAAAGAAATGGAAGTCTCGCTAT 960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147 ATAGTAGCTCTTCTAGTATCTGCAAAGACAATGCAGACTTGTTGAGCCCATTAAAGAAATGGAAGTCTCGCTAT 2220
Query 961 CTGATGGAGCAGAATGTCACCAAGTTACTTCGGCCTCTGTCTCCAGTCACACCACCCCCTCCCAATTCAGGCTC 1034
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221 CTGATGGAGCAGAATGTCACCAAGTTACTTCGGCCTCTGTCTCCAGTCACACCACCCCCTCCCAATTCAGGCTC 2294
Query 1035 AAAGAGTCCCCAGCTGGCCACACCTGGCTCATCTCACCCAGGAGAAGAGGAGTGTCGAAATGGATACAGCCTCA 1108
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295 AAAGAGTCCCCAGCTGGCCACACCTGGCTCATCTCACCCAGGAGAAGAGGAGTGTCGAAATGGATACAGCCTCA 2368
Query 1109 TGTTTTCACCAGTCACATCTCTTACTACTGCTAGTCGCTGCAACACTCCTCTACAGTTT--------------- 1167
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369 TGTTTTCACCAGTCACATCTCTTACTACTGCTAGTCGCTGCAACACTCCTCTACAGTTTGAGAACATATCCTCC 2442
Query 1168 ------------------------------------------GAGCTTTGTCACCGAAAAGACCTGGATTTGGC 1199
||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443 CCTGAGAGTTCCCCTGCGCATAGGCCCGAGTCCCTGTCACCCGAGCTTTGTCACCGAAAAGACCTGGATTTGGC 2516
Query 1200 AAAAGTAGGATACCTTGACTCCAACACTAACAGCTGTGCTGATAGACCTTCCCTACTCAACTCAGGTCATTCTG 1273
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517 AAAAGTAGGATACCTTGACTCCAACACTAACAGCTGTGCTGATAGACCTTCCCTACTCAACTCAGGTCATTCTG 2590
Query 1274 ACCTGGCTCCTCATCCCTCCCTCGGACCCACTTCTGAGACTGGTTTCCCAAGCAGAAGTGGAGATGGACATCAG 1347
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591 ACCTGGCTCCTCATCCCTCCCTCGGACCCACTTCTGAGACTGGTTTCCCAAGCAGAAGTGGAGATGGACATCAG 2664
Query 1348 ACCCTCGTGAGAAACTCAGACCAGGCATTTCGGACAGAGTTCAACTTGATGTATGCCTACTCCCCTTTGAATGC 1421
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2665 ACCCTCGTGAGAAACTCAGACCAGGCATTTCGGACAGAGTTCAACTTGATGTATGCCTACTCCCCTTTGAATGC 2738
Query 1422 TATGCCTCGAGCAGATGGACTGTATCGAGGATCTCCTCTAGTGGGGGATAGGAAGCCTTTACATTTGGATGGGG 1495
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2739 TATGCCTCGAGCAGATGGACTGTATCGAGGATCTCCTCTAGTGGGGGATAGGAAGCCTTTACATTTGGATGGGG 2812
Query 1496 GATATTGTTCCCCTGCAGAAGGATTTTCCAGCAGATATGAACATGGCTTAATGAAAGACCTCTCTCGTGGATCC 1569
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2813 GATATTGTTCCCCTGCAGAAGGATTTTCCAGCAGATATGAACATGGCTTAATGAAAGACCTCTCTCGTGGATCC 2886
Query 1570 TTGTCACCTGGTGGTGAAAGGGCCTGTGAAGGAGTCCCATCTGCCCCCCAGAACCCACCACAGAGGAAAAAAGT 1643
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2887 TTGTCACCTGGTGGTGAAAGGGCCTGTGAAGGAGTCCCATCTGCCCCCCAGAACCCACCACAGAGGAAAAAAGT 2960
Query 1644 ATCCCTGCTGGAGTACCGAAAACGGAAACAAGAAGCTAAGGAAAATTCTGCTGGTGGGGGAGGTGACTCTGCAC 1717
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2961 ATCCCTGCTGGAGTACCGAAAACGGAAACAAGAAGCTAAGGAAAATTCTGCTGGTGGGGGAGGTGACTCTGCAC 3034
Query 1718 AGAGCAAAAGCAAGTCTGCAGGAGCTGGGCAAGGCAGCAGTAACTCCGTTTCCGACACTGGTGCCCATGGTGTG 1791
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3035 AGAGCAAAAGCAAGTCTGCAGGAGCTGGGCAAGGCAGCAGTAACTCCGTTTCCGACACTGGTGCCCATGGTGTG 3108
Query 1792 CAGGGATCCTCAGCCCGAACTCCATCTTCCCCTCACAAAAAATTCTCCCCATCTCATTCCTCTATGTCCCATTT 1865
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3109 CAGGGATCCTCAGCCCGAACTCCATCTTCCCCTCACAAAAAATTCTCCCCATCTCATTCCTCTATGTCCCATTT 3182
Query 1866 GGAGGCGGTAAGCCCATCAGATTCCAGAGGCACTTCTTCATCTCACTGCAGACCTCAAGAGAATATCAGCAGTA 1939
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3183 GGAGGCGGTAAGCCCATCAGATTCCAGAGGCACTTCTTCATCTCACTGCAGACCTCAAGAGAATATCAGCAGTA 3256
Query 1940 GGTGGATGGTTCCCACATCAGTAGAACGACTCCGAGAAGGAGGGAGCATCCCCAAGGTCCTCCGAAGCAGCGTG 2013
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3257 GGTGGATGGTTCCCACATCAGTAGAACGACTCCGAGAAGGAGGGAGCATCCCCAAGGTCCTCCGAAGCAGCGTG 3330
Query 2014 AGGGTGGCCCAAAAGGGAGAGCCCTCTCCCACATGGGAGAGTAACATCACAGAGAAAGACTCAGACCCTGCAGA 2087
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3331 AGGGTGGCCCAAAAGGGAGAGCCCTCTCCCACATGGGAGAGTAACATCACAGAGAAAGACTCAGACCCTGCAGA 3404
Query 2088 TGGAGAAGGCCCAGAGACATTAAGCTCAGCACTCTCTAAAGGAGCAACAGTTTACAGCCCTTCCAGATACAGCT 2161
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3405 TGGAGAAGGCCCAGAGACATTAAGCTCAGCACTCTCTAAAGGAGCAACAGTTTACAGCCCTTCCAGATACAGCT 3478
Query 2162 ACCAGCTCCTGCAGTGTGATAGTCCTCGGACAGAATCACAAAGCCTCCTTCAGCAGAGTTCCTCCCCCTTCAGA 2235
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3479 ACCAGCTCCTGCAGTGTGATAGTCCTCGGACAGAATCACAAAGCCTCCTTCAGCAGAGTTCCTCCCCCTTCAGA 3552
Query 2236 GGACATCCTACACAGTCTCCAGGATACAGTTATCGAACTACTGCACTGAGACCTGGAAACCCCCCCTCTCACGG 2309
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3553 GGACATCCTACACAGTCTCCAGGATACAGTTATCGAACTACTGCACTGAGACCTGGAAACCCCCCCTCTCACGG 3626
Query 2310 TTCTTCAGAATCATCCCTCTCTTCCACGTCCTATTCCAGCCCCGCCCACCCTGTGTCCACAGACTCGTTGGCCC 2383
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3627 TTCTTCAGAATCATCCCTCTCTTCCACGTCCTATTCCAGCCCCGCCCACCCTGTGTCCACAGACTCGTTGGCCC 3700
Query 2384 CATTTACGGGGACACCAGGGTATTTTAGCAGCCAGCCACATTCTGGAAACAGCACTGGCAGCAATCTTCCAAGG 2457
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3701 CATTTACGGGGACACCAGGGTATTTTAGCAGCCAGCCACATTCTGGAAACAGCACTGGCAGCAATCTTCCAAGG 3774
Query 2458 AGGAGCTGCCCTTCTAGTGCTGCTAGCCCTACCCTGCAGGGACCCTCAGACTCGCCAACCTCAGATTCAGTTTC 2531
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3775 AGGAGCTGCCCTTCTAGTGCTGCTAGCCCTACCCTGCAGGGACCCTCAGACTCGCCAACCTCAGATTCAGTTTC 3848
Query 2532 TCAGTCCAGCACAGGAACTCTGAGTTCCACCTCCTTTCCTCAGAACTCTAGGTCGTCATTGCCATCAGACTTAC 2605
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3849 TCAGTCCAGCACAGGAACTCTGAGTTCCACCTCCTTTCCTCAGAACTCTAGGTCGTCATTGCCATCAGACTTAC 3922
Query 2606 GGACTATCAGTCTGCCCAGTGCTGGGCAGTCAGCTGTCTACCAGGCCTCCAGGGTATCTGCGGTTTCCAATTCA 2679
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3923 GGACTATCAGTCTGCCCAGTGCTGGGCAGTCAGCTGTCTACCAGGCCTCCAGGGTATCTGCGGTTTCCAATTCA 3996
Query 2680 CAGCACTACCCACACCGTGGGAGTGGGGGTGTGCACCAGTACCGACTCCAGCCACTGCAAGGGTCAGGAGTCAA 2753
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3997 CAGCACTACCCACACCGTGGGAGTGGGGGTGTGCACCAGTACCGACTCCAGCCACTGCAAGGGTCAGGAGTCAA 4070
Query 2754 GACTCAGACGGGACTTTCC 2772
|||||||||||||||||||
Sbjct 4071 GACTCAGACGGGACTTTCC 4089
