Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_12183
- Subject:
- XM_017006783.1
- Aligned Length:
- 3822
- Identities:
- 2772
- Gaps:
- 1050
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGAAGAATTCTCCCTCTGAAGCACAGAATTTAGATGAGAATACAACTGAGGGCTGGGAAAATCGGATAAGACT 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 ATGGACTGACCAGTATGAAGAAGCTTTCACTAATCAGTACAGTGCAGATGTACAGAACGCGCTTGAACAACACC 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 149 TACATTCTAGCAAGGAATTTGTGGGCAAACCTACTATTTTAGACACTATTAATAAGACTGAATTGGCCTGTAAT 222
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 223 AACACAGTTATTGGTTCCCAAATGCAGTTACAGCTGGGAAGAGTCACTCGTGTTCAAAAGCACCGGAAGATCCT 296
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 297 GAGGGCTGCAAGAGATTTGGCTTTGGACACTCTTATAATAGAGTATCGTGGGAAAGTCATGTTACGACAGCAAT 370
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 371 TTGAGGTCAATGGGCATTTCTTCAAAAAACCATACCCCTTTGTGCTCTTCTACTCAAAATTCAATGGTGTAGAG 444
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 445 ATGTGTGTGGATGCCCGTACTTTCGGTAATGATGCTCGGTTCATCAGAAGATCATGTACACCAAATGCAGAGGT 518
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 519 GCGACACATGATTGCAGATGGGATGATTCACCTGTGCATCTATGCTGTGTCTGCCATCACCAAGGATGCTGAGG 592
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 593 TCACCATAGCATTTGATTATGAGTATAGTAACTGTAATTATAAAGTGGACTGTGCCTGTCACAAGGGAAACCGG 666
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 667 AATTGTCCTATACAAAAAAGGAATCCTAATGCTACAGAACTGCCACTCCTACCACCTCCTCCAAGCCTACCCAC 740
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 741 CATTGGAGCAGAGACTAGACGTAGAAAAGCACGACGGAAAGAGCTAGAGATGGAGCAGCAGAATGAGGCTTCAG 814
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 815 AGGAGAATAATGACCAGCAATCACAAGAAGTTCCAGAAAAAGTAACTGTATCCAGTGATCATGAGGAAGTAGAC 888
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 889 AATCCAGAAGAAAAACCAGAAGAAGAGAAAGAAGAGGTTATAGATGACCAGGAGAACCTAGCTCATAGCAGGAG 962
Query 1 -------------------------------ATGCATGCTTTTGAAAACTTAGAGAAAAGAAAGAAGCGGCGGG 43
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 GACCAGGGAAGATAGAAAGGTAGAAGCCATCATGCATGCTTTTGAAAACTTAGAGAAAAGAAAGAAGCGGCGGG 1036
Query 44 ATCAGCCCTTGGAACAGAGCAACTCTGATGTAGAGATTACTACAACCACCTCAGAGACTCCTGTTGGTGAAGAG 117
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 ATCAGCCCTTGGAACAGAGCAACTCTGATGTAGAGATTACTACAACCACCTCAGAGACTCCTGTTGGTGAAGAG 1110
Query 118 ACAAAAACTGAAGCCCCTGAATCTGAAGTTAGCAACTCTGTTTCAAATGTTACCATCCCAAGCACCCCACAGAG 191
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 ACAAAAACTGAAGCCCCTGAATCTGAAGTTAGCAACTCTGTTTCAAATGTTACCATCCCAAGCACCCCACAGAG 1184
Query 192 TGTTGGTGTGAATACCCGGAGGTCTTCCCAAGCAGGGGATATTGCTGCAGAAAAACTAGTCCCCAAGCCACCTC 265
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 TGTTGGTGTGAATACCCGGAGGTCTTCCCAAGCAGGGGATATTGCTGCAGAAAAACTAGTCCCCAAGCCACCTC 1258
Query 266 CAGCAAAGCCTTCTAGGCCCCGGCCGAAGAGTCGAATTTCTCGGTACAGGACCAGTTCAGCCCAAAGACTAAAG 339
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 CAGCAAAGCCTTCTAGGCCCCGGCCGAAGAGTCGAATTTCTCGGTACAGGACCAGTTCAGCCCAAAGACTAAAG 1332
Query 340 CGTCAGAAGCAGGCCAATGCACAGCAGGCAGAATTGTCACAAGCTGCCTTGGAAGAGGGAGGAAGTAACAGTTT 413
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 CGTCAGAAGCAGGCCAATGCACAGCAGGCAGAATTGTCACAAGCTGCCTTGGAAGAGGGAGGAAGTAACAGTTT 1406
Query 414 AGTAACTCCTACTGAAGCTGGAAGTCTAGACAGTTCAGGAGAAAACAGGCCATTAACAGGGTCTGACCCAACTG 487
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 AGTAACTCCTACTGAAGCTGGAAGTCTAGACAGTTCAGGAGAAAACAGGCCATTAACAGGGTCTGACCCAACTG 1480
Query 488 TGGTGTCAATTACTGGATCCCATGTCAACCGTGCTGCATCTAAATACCCCAAAACCAAAAAGTATCTAGTTACA 561
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 TGGTGTCAATTACTGGATCCCATGTCAACCGTGCTGCATCTAAATACCCCAAAACCAAAAAGTATCTAGTTACA 1554
Query 562 GAATGGTTGAATGACAAAGCAGAGAAGCAAGAGTGCCCTGTTGAGTGCCCTTTACGTATCACAACGGATCCAAC 635
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 GAATGGTTGAATGACAAAGCAGAGAAGCAAGAGTGCCCTGTTGAGTGCCCTTTACGTATCACAACGGATCCAAC 1628
Query 636 TGTACTGGCAACGACCCTAAACATGTTACCAGGTCTTATCCATTCCCCGTTAATTTGCACCACCCCCAAACACT 709
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 TGTACTGGCAACGACCCTAAACATGTTACCAGGTCTTATCCATTCCCCGTTAATTTGCACCACCCCCAAACACT 1702
Query 710 ACATTCGCTTTGGCTCACCCTTTATCCCTGAGAGACGTCGAAGGCCCCTTCTGCCTGATGGCACATTCAGCTCC 783
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 ACATTCGCTTTGGCTCACCCTTTATCCCTGAGAGACGTCGAAGGCCCCTTCTGCCTGATGGCACATTCAGCTCC 1776
Query 784 TGTAAGAAGCGCTGGATAAAACAAGCCTTAGAAGAAGGGATGACTCAAACATCATCTGTACCCCAAGAGACTAG 857
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 TGTAAGAAGCGCTGGATAAAACAAGCCTTAGAAGAAGGGATGACTCAAACATCATCTGTACCCCAAGAGACTAG 1850
Query 858 AACTCAGCACCTATACCAAAGCAATGAGAATAGTAGCTCTTCTAGTATCTGCAAAGACAATGCAGACTTGTTGA 931
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 AACTCAGCACCTATACCAAAGCAATGAGAATAGTAGCTCTTCTAGTATCTGCAAAGACAATGCAGACTTGTTGA 1924
Query 932 GCCCATTAAAGAAATGGAAGTCTCGCTATCTGATGGAGCAGAATGTCACCAAGTTACTTCGGCCTCTGTCTCCA 1005
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 GCCCATTAAAGAAATGGAAGTCTCGCTATCTGATGGAGCAGAATGTCACCAAGTTACTTCGGCCTCTGTCTCCA 1998
Query 1006 GTCACACCACCCCCTCCCAATTCAGGCTCAAAGAGTCCCCAGCTGGCCACACCTGGCTCATCTCACCCAGGAGA 1079
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 GTCACACCACCCCCTCCCAATTCAGGCTCAAAGAGTCCCCAGCTGGCCACACCTGGCTCATCTCACCCAGGAGA 2072
Query 1080 AGAGGAGTGTCGAAATGGATACAGCCTCATGTTTTCACCAGTCACATCTCTTACTACTGCTAGTCGCTGCAACA 1153
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073 AGAGGAGTGTCGAAATGGATACAGCCTCATGTTTTCACCAGTCACATCTCTTACTACTGCTAGTCGCTGCAACA 2146
Query 1154 CTCCTCTACAGTTT---------------------------------------------------------GAG 1170
|||||||||||||| |||
Sbjct 2147 CTCCTCTACAGTTTGAGAACATATCCTCCCCTGAGAGTTCCCCTGCGCATAGGCCCGAGTCCCTGTCACCCGAG 2220
Query 1171 CTTTGTCACCGAAAAGACCTGGATTTGGCAAAAGTAGGATACCTTGACTCCAACACTAACAGCTGTGCTGATAG 1244
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221 CTTTGTCACCGAAAAGACCTGGATTTGGCAAAAGTAGGATACCTTGACTCCAACACTAACAGCTGTGCTGATAG 2294
Query 1245 ACCTTCCCTACTCAACTCAGGTCATTCTGACCTGGCTCCTCATCCCTCCCTCGGACCCACTTCTGAGACTGGTT 1318
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295 ACCTTCCCTACTCAACTCAGGTCATTCTGACCTGGCTCCTCATCCCTCCCTCGGACCCACTTCTGAGACTGGTT 2368
Query 1319 TCCCAAGCAGAAGTGGAGATGGACATCAGACCCTCGTGAGAAACTCAGACCAGGCATTTCGGACAGAGTTCAAC 1392
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369 TCCCAAGCAGAAGTGGAGATGGACATCAGACCCTCGTGAGAAACTCAGACCAGGCATTTCGGACAGAGTTCAAC 2442
Query 1393 TTGATGTATGCCTACTCCCCTTTGAATGCTATGCCTCGAGCAGATGGACTGTATCGAGGATCTCCTCTAGTGGG 1466
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443 TTGATGTATGCCTACTCCCCTTTGAATGCTATGCCTCGAGCAGATGGACTGTATCGAGGATCTCCTCTAGTGGG 2516
Query 1467 GGATAGGAAGCCTTTACATTTGGATGGGGGATATTGTTCCCCTGCAGAAGGATTTTCCAGCAGATATGAACATG 1540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517 GGATAGGAAGCCTTTACATTTGGATGGGGGATATTGTTCCCCTGCAGAAGGATTTTCCAGCAGATATGAACATG 2590
Query 1541 GCTTAATGAAAGACCTCTCTCGTGGATCCTTGTCACCTGGTGGTGAAAGGGCCTGTGAAGGAGTCCCATCTGCC 1614
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591 GCTTAATGAAAGACCTCTCTCGTGGATCCTTGTCACCTGGTGGTGAAAGGGCCTGTGAAGGAGTCCCATCTGCC 2664
Query 1615 CCCCAGAACCCACCACAGAGGAAAAAAGTATCCCTGCTGGAGTACCGAAAACGGAAACAAGAAGCTAAGGAAAA 1688
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2665 CCCCAGAACCCACCACAGAGGAAAAAAGTATCCCTGCTGGAGTACCGAAAACGGAAACAAGAAGCTAAGGAAAA 2738
Query 1689 TTCTGCTGGTGGGGGAGGTGACTCTGCACAGAGCAAAAGCAAGTCTGCAGGAGCTGGGCAAGGCAGCAGTAACT 1762
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2739 TTCTGCTGGTGGGGGAGGTGACTCTGCACAGAGCAAAAGCAAGTCTGCAGGAGCTGGGCAAGGCAGCAGTAACT 2812
Query 1763 CCGTTTCCGACACTGGTGCCCATGGTGTGCAGGGATCCTCAGCCCGAACTCCATCTTCCCCTCACAAAAAATTC 1836
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2813 CCGTTTCCGACACTGGTGCCCATGGTGTGCAGGGATCCTCAGCCCGAACTCCATCTTCCCCTCACAAAAAATTC 2886
Query 1837 TCCCCATCTCATTCCTCTATGTCCCATTTGGAGGCGGTAAGCCCATCAGATTCCAGAGGCACTTCTTCATCTCA 1910
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2887 TCCCCATCTCATTCCTCTATGTCCCATTTGGAGGCGGTAAGCCCATCAGATTCCAGAGGCACTTCTTCATCTCA 2960
Query 1911 CTGCAGACCTCAAGAGAATATCAGCAGTAGGTGGATGGTTCCCACATCAGTAGAACGACTCCGAGAAGGAGGGA 1984
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2961 CTGCAGACCTCAAGAGAATATCAGCAGTAGGTGGATGGTTCCCACATCAGTAGAACGACTCCGAGAAGGAGGGA 3034
Query 1985 GCATCCCCAAGGTCCTCCGAAGCAGCGTGAGGGTGGCCCAAAAGGGAGAGCCCTCTCCCACATGGGAGAGTAAC 2058
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3035 GCATCCCCAAGGTCCTCCGAAGCAGCGTGAGGGTGGCCCAAAAGGGAGAGCCCTCTCCCACATGGGAGAGTAAC 3108
Query 2059 ATCACAGAGAAAGACTCAGACCCTGCAGATGGAGAAGGCCCAGAGACATTAAGCTCAGCACTCTCTAAAGGAGC 2132
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3109 ATCACAGAGAAAGACTCAGACCCTGCAGATGGAGAAGGCCCAGAGACATTAAGCTCAGCACTCTCTAAAGGAGC 3182
Query 2133 AACAGTTTACAGCCCTTCCAGATACAGCTACCAGCTCCTGCAGTGTGATAGTCCTCGGACAGAATCACAAAGCC 2206
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3183 AACAGTTTACAGCCCTTCCAGATACAGCTACCAGCTCCTGCAGTGTGATAGTCCTCGGACAGAATCACAAAGCC 3256
Query 2207 TCCTTCAGCAGAGTTCCTCCCCCTTCAGAGGACATCCTACACAGTCTCCAGGATACAGTTATCGAACTACTGCA 2280
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3257 TCCTTCAGCAGAGTTCCTCCCCCTTCAGAGGACATCCTACACAGTCTCCAGGATACAGTTATCGAACTACTGCA 3330
Query 2281 CTGAGACCTGGAAACCCCCCCTCTCACGGTTCTTCAGAATCATCCCTCTCTTCCACGTCCTATTCCAGCCCCGC 2354
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3331 CTGAGACCTGGAAACCCCCCCTCTCACGGTTCTTCAGAATCATCCCTCTCTTCCACGTCCTATTCCAGCCCCGC 3404
Query 2355 CCACCCTGTGTCCACAGACTCGTTGGCCCCATTTACGGGGACACCAGGGTATTTTAGCAGCCAGCCACATTCTG 2428
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3405 CCACCCTGTGTCCACAGACTCGTTGGCCCCATTTACGGGGACACCAGGGTATTTTAGCAGCCAGCCACATTCTG 3478
Query 2429 GAAACAGCACTGGCAGCAATCTTCCAAGGAGGAGCTGCCCTTCTAGTGCTGCTAGCCCTACCCTGCAGGGACCC 2502
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3479 GAAACAGCACTGGCAGCAATCTTCCAAGGAGGAGCTGCCCTTCTAGTGCTGCTAGCCCTACCCTGCAGGGACCC 3552
Query 2503 TCAGACTCGCCAACCTCAGATTCAGTTTCTCAGTCCAGCACAGGAACTCTGAGTTCCACCTCCTTTCCTCAGAA 2576
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3553 TCAGACTCGCCAACCTCAGATTCAGTTTCTCAGTCCAGCACAGGAACTCTGAGTTCCACCTCCTTTCCTCAGAA 3626
Query 2577 CTCTAGGTCGTCATTGCCATCAGACTTACGGACTATCAGTCTGCCCAGTGCTGGGCAGTCAGCTGTCTACCAGG 2650
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3627 CTCTAGGTCGTCATTGCCATCAGACTTACGGACTATCAGTCTGCCCAGTGCTGGGCAGTCAGCTGTCTACCAGG 3700
Query 2651 CCTCCAGGGTATCTGCGGTTTCCAATTCACAGCACTACCCACACCGTGGGAGTGGGGGTGTGCACCAGTACCGA 2724
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3701 CCTCCAGGGTATCTGCGGTTTCCAATTCACAGCACTACCCACACCGTGGGAGTGGGGGTGTGCACCAGTACCGA 3774
Query 2725 CTCCAGCCACTGCAAGGGTCAGGAGTCAAGACTCAGACGGGACTTTCC 2772
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3775 CTCCAGCCACTGCAAGGGTCAGGAGTCAAGACTCAGACGGGACTTTCC 3822
