Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_12183
- Subject:
- XM_024453621.1
- Aligned Length:
- 4137
- Identities:
- 2772
- Gaps:
- 1365
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGCAGAGACACTTCGCCCATGTGTGCTATGATGTGATGCATGCTGTTGGAAGGACTACTTTAAGTTTATTTTC 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 CCTCTTTAGGGGAATGAGCAGGGGGAAGGTTATTAGACTTCATCGGCGGAAGCAGGACAACATATCAGGTGGGG 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 149 ATAGCAGTGCAACAGAAAGCTGGGATGAGGAGCTTTCTCCTTCCACTGTGTTGTATACAGCAACACAGCACACA 222
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 223 CCTACAAGCATCACCTTAACTGTTAGAAGAACCAAACCCAAGAAGCGGAAAAAGAGTCCAGAAAAGGGTCGTGC 296
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 297 AGCACCAAAGACGAAGAAAATCAAGAATTCTCCCTCTGAAGCACAGAATTTAGATGAGAATACAACTGAGGGCT 370
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 371 GGGAAAATCGGATAAGACTATGGACTGACCAGTATGAAGAAGCTTTCACTAATCAGTACAGTGCAGATGTACAG 444
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 445 AACGCGCTTGAACAACACCTACATTCTAGCAAGGAATTTGTGGGCAAACCTACTATTTTAGACACTATTAATAA 518
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 519 GACTGAATTGGCCTGTAATAACACAGTTATTGGTTCCCAAATGCAGTTACAGCTGGGAAGAGTCACTCGTGTTC 592
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 593 AAAAGCACCGGAAGATCCTGAGGGCTGCAAGAGATTTGGCTTTGGACACTCTTATAATAGAGTATCGTGGGAAA 666
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 667 GTCATGTTACGACAGCAATTTGAGGTCAATGGGCATTTCTTCAAAAAACCATACCCCTTTGTGCTCTTCTACTC 740
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 741 AAAATTCAATGGTGTAGAGATGTGTGTGGATGCCCGTACTTTCGGTAATGATGCTCGGTTCATCAGAAGATCAT 814
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 815 GTACACCAAATGCAGAGGTGCGACACATGATTGCAGATGGGATGATTCACCTGTGCATCTATGCTGTGTCTGCC 888
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 889 ATCACCAAGGATGCTGAGGTCACCATAGCATTTGATTATGAGTATAGTAACTGTAATTATAAAGTGGACTGTGC 962
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 963 CTGTCACAAGGGAAACCGGAATTGTCCTATACAAAAAAGGAATCCTAATGCTACAGAACTGCCACTCCTACCAC 1036
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1037 CTCCTCCAAGCCTACCCACCATTGGAGCAGAGACTAGACGTAGAAAAGCACGACGGAAAGAGCTAGAGATGGAG 1110
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1111 CAGCAGAATGAGGCTTCAGAGGAGAATAATGACCAGCAATCACAAGAAGTTCCAGAAAAAGTAACTGTATCCAG 1184
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1185 TGATCATGAGGAAGTAGACAATCCAGAAGAAAAACCAGAAGAAGAGAAAGAAGAGGTTATAGATGACCAGGAGA 1258
Query 1 --------------------------------------------------ATGCATGCTTTTGAAAACTTAGAG 24
||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 ACCTAGCTCATAGCAGGAGGACCAGGGAAGATAGAAAGGTAGAAGCCATCATGCATGCTTTTGAAAACTTAGAG 1332
Query 25 AAAAGAAAGAAGCGGCGGGATCAGCCCTTGGAACAGAGCAACTCTGATGTAGAGATTACTACAACCACCTCAGA 98
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 AAAAGAAAGAAGCGGCGGGATCAGCCCTTGGAACAGAGCAACTCTGATGTAGAGATTACTACAACCACCTCAGA 1406
Query 99 GACTCCTGTTGGTGAAGAGACAAAAACTGAAGCCCCTGAATCTGAAGTTAGCAACTCTGTTTCAAATGTTACCA 172
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 GACTCCTGTTGGTGAAGAGACAAAAACTGAAGCCCCTGAATCTGAAGTTAGCAACTCTGTTTCAAATGTTACCA 1480
Query 173 TCCCAAGCACCCCACAGAGTGTTGGTGTGAATACCCGGAGGTCTTCCCAAGCAGGGGATATTGCTGCAGAAAAA 246
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 TCCCAAGCACCCCACAGAGTGTTGGTGTGAATACCCGGAGGTCTTCCCAAGCAGGGGATATTGCTGCAGAAAAA 1554
Query 247 CTAGTCCCCAAGCCACCTCCAGCAAAGCCTTCTAGGCCCCGGCCGAAGAGTCGAATTTCTCGGTACAGGACCAG 320
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 CTAGTCCCCAAGCCACCTCCAGCAAAGCCTTCTAGGCCCCGGCCGAAGAGTCGAATTTCTCGGTACAGGACCAG 1628
Query 321 TTCAGCCCAAAGACTAAAGCGTCAGAAGCAGGCCAATGCACAGCAGGCAGAATTGTCACAAGCTGCCTTGGAAG 394
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 TTCAGCCCAAAGACTAAAGCGTCAGAAGCAGGCCAATGCACAGCAGGCAGAATTGTCACAAGCTGCCTTGGAAG 1702
Query 395 AGGGAGGAAGTAACAGTTTAGTAACTCCTACTGAAGCTGGAAGTCTAGACAGTTCAGGAGAAAACAGGCCATTA 468
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 AGGGAGGAAGTAACAGTTTAGTAACTCCTACTGAAGCTGGAAGTCTAGACAGTTCAGGAGAAAACAGGCCATTA 1776
Query 469 ACAGGGTCTGACCCAACTGTGGTGTCAATTACTGGATCCCATGTCAACCGTGCTGCATCTAAATACCCCAAAAC 542
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 ACAGGGTCTGACCCAACTGTGGTGTCAATTACTGGATCCCATGTCAACCGTGCTGCATCTAAATACCCCAAAAC 1850
Query 543 CAAAAAGTATCTAGTTACAGAATGGTTGAATGACAAAGCAGAGAAGCAAGAGTGCCCTGTTGAGTGCCCTTTAC 616
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 CAAAAAGTATCTAGTTACAGAATGGTTGAATGACAAAGCAGAGAAGCAAGAGTGCCCTGTTGAGTGCCCTTTAC 1924
Query 617 GTATCACAACGGATCCAACTGTACTGGCAACGACCCTAAACATGTTACCAGGTCTTATCCATTCCCCGTTAATT 690
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 GTATCACAACGGATCCAACTGTACTGGCAACGACCCTAAACATGTTACCAGGTCTTATCCATTCCCCGTTAATT 1998
Query 691 TGCACCACCCCCAAACACTACATTCGCTTTGGCTCACCCTTTATCCCTGAGAGACGTCGAAGGCCCCTTCTGCC 764
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 TGCACCACCCCCAAACACTACATTCGCTTTGGCTCACCCTTTATCCCTGAGAGACGTCGAAGGCCCCTTCTGCC 2072
Query 765 TGATGGCACATTCAGCTCCTGTAAGAAGCGCTGGATAAAACAAGCCTTAGAAGAAGGGATGACTCAAACATCAT 838
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073 TGATGGCACATTCAGCTCCTGTAAGAAGCGCTGGATAAAACAAGCCTTAGAAGAAGGGATGACTCAAACATCAT 2146
Query 839 CTGTACCCCAAGAGACTAGAACTCAGCACCTATACCAAAGCAATGAGAATAGTAGCTCTTCTAGTATCTGCAAA 912
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147 CTGTACCCCAAGAGACTAGAACTCAGCACCTATACCAAAGCAATGAGAATAGTAGCTCTTCTAGTATCTGCAAA 2220
Query 913 GACAATGCAGACTTGTTGAGCCCATTAAAGAAATGGAAGTCTCGCTATCTGATGGAGCAGAATGTCACCAAGTT 986
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221 GACAATGCAGACTTGTTGAGCCCATTAAAGAAATGGAAGTCTCGCTATCTGATGGAGCAGAATGTCACCAAGTT 2294
Query 987 ACTTCGGCCTCTGTCTCCAGTCACACCACCCCCTCCCAATTCAGGCTCAAAGAGTCCCCAGCTGGCCACACCTG 1060
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295 ACTTCGGCCTCTGTCTCCAGTCACACCACCCCCTCCCAATTCAGGCTCAAAGAGTCCCCAGCTGGCCACACCTG 2368
Query 1061 GCTCATCTCACCCAGGAGAAGAGGAGTGTCGAAATGGATACAGCCTCATGTTTTCACCAGTCACATCTCTTACT 1134
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369 GCTCATCTCACCCAGGAGAAGAGGAGTGTCGAAATGGATACAGCCTCATGTTTTCACCAGTCACATCTCTTACT 2442
Query 1135 ACTGCTAGTCGCTGCAACACTCCTCTACAGTTT----------------------------------------- 1167
|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443 ACTGCTAGTCGCTGCAACACTCCTCTACAGTTTGAGAACATATCCTCCCCTGAGAGTTCCCCTGCGCATAGGCC 2516
Query 1168 ----------------GAGCTTTGTCACCGAAAAGACCTGGATTTGGCAAAAGTAGGATACCTTGACTCCAACA 1225
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517 CGAGTCCCTGTCACCCGAGCTTTGTCACCGAAAAGACCTGGATTTGGCAAAAGTAGGATACCTTGACTCCAACA 2590
Query 1226 CTAACAGCTGTGCTGATAGACCTTCCCTACTCAACTCAGGTCATTCTGACCTGGCTCCTCATCCCTCCCTCGGA 1299
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591 CTAACAGCTGTGCTGATAGACCTTCCCTACTCAACTCAGGTCATTCTGACCTGGCTCCTCATCCCTCCCTCGGA 2664
Query 1300 CCCACTTCTGAGACTGGTTTCCCAAGCAGAAGTGGAGATGGACATCAGACCCTCGTGAGAAACTCAGACCAGGC 1373
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2665 CCCACTTCTGAGACTGGTTTCCCAAGCAGAAGTGGAGATGGACATCAGACCCTCGTGAGAAACTCAGACCAGGC 2738
Query 1374 ATTTCGGACAGAGTTCAACTTGATGTATGCCTACTCCCCTTTGAATGCTATGCCTCGAGCAGATGGACTGTATC 1447
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2739 ATTTCGGACAGAGTTCAACTTGATGTATGCCTACTCCCCTTTGAATGCTATGCCTCGAGCAGATGGACTGTATC 2812
Query 1448 GAGGATCTCCTCTAGTGGGGGATAGGAAGCCTTTACATTTGGATGGGGGATATTGTTCCCCTGCAGAAGGATTT 1521
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2813 GAGGATCTCCTCTAGTGGGGGATAGGAAGCCTTTACATTTGGATGGGGGATATTGTTCCCCTGCAGAAGGATTT 2886
Query 1522 TCCAGCAGATATGAACATGGCTTAATGAAAGACCTCTCTCGTGGATCCTTGTCACCTGGTGGTGAAAGGGCCTG 1595
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2887 TCCAGCAGATATGAACATGGCTTAATGAAAGACCTCTCTCGTGGATCCTTGTCACCTGGTGGTGAAAGGGCCTG 2960
Query 1596 TGAAGGAGTCCCATCTGCCCCCCAGAACCCACCACAGAGGAAAAAAGTATCCCTGCTGGAGTACCGAAAACGGA 1669
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2961 TGAAGGAGTCCCATCTGCCCCCCAGAACCCACCACAGAGGAAAAAAGTATCCCTGCTGGAGTACCGAAAACGGA 3034
Query 1670 AACAAGAAGCTAAGGAAAATTCTGCTGGTGGGGGAGGTGACTCTGCACAGAGCAAAAGCAAGTCTGCAGGAGCT 1743
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3035 AACAAGAAGCTAAGGAAAATTCTGCTGGTGGGGGAGGTGACTCTGCACAGAGCAAAAGCAAGTCTGCAGGAGCT 3108
Query 1744 GGGCAAGGCAGCAGTAACTCCGTTTCCGACACTGGTGCCCATGGTGTGCAGGGATCCTCAGCCCGAACTCCATC 1817
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3109 GGGCAAGGCAGCAGTAACTCCGTTTCCGACACTGGTGCCCATGGTGTGCAGGGATCCTCAGCCCGAACTCCATC 3182
Query 1818 TTCCCCTCACAAAAAATTCTCCCCATCTCATTCCTCTATGTCCCATTTGGAGGCGGTAAGCCCATCAGATTCCA 1891
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3183 TTCCCCTCACAAAAAATTCTCCCCATCTCATTCCTCTATGTCCCATTTGGAGGCGGTAAGCCCATCAGATTCCA 3256
Query 1892 GAGGCACTTCTTCATCTCACTGCAGACCTCAAGAGAATATCAGCAGTAGGTGGATGGTTCCCACATCAGTAGAA 1965
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3257 GAGGCACTTCTTCATCTCACTGCAGACCTCAAGAGAATATCAGCAGTAGGTGGATGGTTCCCACATCAGTAGAA 3330
Query 1966 CGACTCCGAGAAGGAGGGAGCATCCCCAAGGTCCTCCGAAGCAGCGTGAGGGTGGCCCAAAAGGGAGAGCCCTC 2039
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3331 CGACTCCGAGAAGGAGGGAGCATCCCCAAGGTCCTCCGAAGCAGCGTGAGGGTGGCCCAAAAGGGAGAGCCCTC 3404
Query 2040 TCCCACATGGGAGAGTAACATCACAGAGAAAGACTCAGACCCTGCAGATGGAGAAGGCCCAGAGACATTAAGCT 2113
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3405 TCCCACATGGGAGAGTAACATCACAGAGAAAGACTCAGACCCTGCAGATGGAGAAGGCCCAGAGACATTAAGCT 3478
Query 2114 CAGCACTCTCTAAAGGAGCAACAGTTTACAGCCCTTCCAGATACAGCTACCAGCTCCTGCAGTGTGATAGTCCT 2187
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3479 CAGCACTCTCTAAAGGAGCAACAGTTTACAGCCCTTCCAGATACAGCTACCAGCTCCTGCAGTGTGATAGTCCT 3552
Query 2188 CGGACAGAATCACAAAGCCTCCTTCAGCAGAGTTCCTCCCCCTTCAGAGGACATCCTACACAGTCTCCAGGATA 2261
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3553 CGGACAGAATCACAAAGCCTCCTTCAGCAGAGTTCCTCCCCCTTCAGAGGACATCCTACACAGTCTCCAGGATA 3626
Query 2262 CAGTTATCGAACTACTGCACTGAGACCTGGAAACCCCCCCTCTCACGGTTCTTCAGAATCATCCCTCTCTTCCA 2335
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3627 CAGTTATCGAACTACTGCACTGAGACCTGGAAACCCCCCCTCTCACGGTTCTTCAGAATCATCCCTCTCTTCCA 3700
Query 2336 CGTCCTATTCCAGCCCCGCCCACCCTGTGTCCACAGACTCGTTGGCCCCATTTACGGGGACACCAGGGTATTTT 2409
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3701 CGTCCTATTCCAGCCCCGCCCACCCTGTGTCCACAGACTCGTTGGCCCCATTTACGGGGACACCAGGGTATTTT 3774
Query 2410 AGCAGCCAGCCACATTCTGGAAACAGCACTGGCAGCAATCTTCCAAGGAGGAGCTGCCCTTCTAGTGCTGCTAG 2483
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3775 AGCAGCCAGCCACATTCTGGAAACAGCACTGGCAGCAATCTTCCAAGGAGGAGCTGCCCTTCTAGTGCTGCTAG 3848
Query 2484 CCCTACCCTGCAGGGACCCTCAGACTCGCCAACCTCAGATTCAGTTTCTCAGTCCAGCACAGGAACTCTGAGTT 2557
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3849 CCCTACCCTGCAGGGACCCTCAGACTCGCCAACCTCAGATTCAGTTTCTCAGTCCAGCACAGGAACTCTGAGTT 3922
Query 2558 CCACCTCCTTTCCTCAGAACTCTAGGTCGTCATTGCCATCAGACTTACGGACTATCAGTCTGCCCAGTGCTGGG 2631
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3923 CCACCTCCTTTCCTCAGAACTCTAGGTCGTCATTGCCATCAGACTTACGGACTATCAGTCTGCCCAGTGCTGGG 3996
Query 2632 CAGTCAGCTGTCTACCAGGCCTCCAGGGTATCTGCGGTTTCCAATTCACAGCACTACCCACACCGTGGGAGTGG 2705
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3997 CAGTCAGCTGTCTACCAGGCCTCCAGGGTATCTGCGGTTTCCAATTCACAGCACTACCCACACCGTGGGAGTGG 4070
Query 2706 GGGTGTGCACCAGTACCGACTCCAGCCACTGCAAGGGTCAGGAGTCAAGACTCAGACGGGACTTTCC 2772
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4071 GGGTGTGCACCAGTACCGACTCCAGCCACTGCAAGGGTCAGGAGTCAAGACTCAGACGGGACTTTCC 4137
