Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_12191
• Subject: NM_018253.3
• Aligned Length: 2217
• Identities: 1935
• Gaps: 282

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGGGATTCTCCAACATGGAAGATGATGGCCCAGAAGAGGAGGAGCGTGTGGCTGAGCCTCAAGCTAACTTTAA  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  CACCCCTCAAGCTCTACGGTTTGAGGAACTACTGGCCAACCTACTAAATGAACAACATCAGATAGCGAAGGAAC  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  TATTTGAACAGCTGAAGATGAAGAAACCTTCAGCCAAACAGCAGAAGGAGGTAGAGAAGGTTAAACCCCAGTGT  222

Query    1  ------------------------------------------------------------ATGCAGCAGCATGT  14
                                                                        ||||||||||||||
Sbjct  223  AAGGAAGTTCATCAGACCCTGATTCTGGACCCAGCACAAAGGAAGAGACTCCAGCAGCAGATGCAGCAGCATGT  296

Query   15  TCAGCTCTTGACACAAATCCACCTTCTTGCCACCTGCAACCCCAATCTCAATCCGGAGGCCAGTAGCACCAGGA  88
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TCAGCTCTTGACACAAATCCACCTTCTTGCCACCTGCAACCCCAATCTCAATCCGGAGGCCAGTAGCACCAGGA  370

Query   89  TATGTCTTAAAGAGCTGGGAACCTTTGCTCAAAGCTCCATCGCCCTTCACCATCAGTACAACCCCAAGTTTCAG  162
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TATGTCTTAAAGAGCTGGGAACCTTTGCTCAAAGCTCCATCGCCCTTCACCATCAGTACAACCCCAAGTTTCAG  444

Query  163  ACCCTGTTCCAACCCTGTAACTTGATGGGAGCTATGCAGCTGATTGAAGACTTCAGCACACATGTCAGCATTGA  236
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  ACCCTGTTCCAACCCTGTAACTTGATGGGAGCTATGCAGCTGATTGAAGACTTCAGCACACATGTCAGCATTGA  518

Query  237  CTGCAGCCCTCATAAAACTGTCAAGAAGACTGCCAATGAATTTCCCTGTTTGCCAAAGCAAGTGGCTTGGATCC  310
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CTGCAGCCCTCATAAAACTGTCAAGAAGACTGCCAATGAATTTCCCTGTTTGCCAAAGCAAGTGGCTTGGATCC  592

Query  311  TGGCCACAAGCAAGGTTTTCATGTATCCAGAGTTACTTCCAGTGTGTTCCCTGAAGGCAAAGAATCCCCAGGAT  384
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TGGCCACAAGCAAGGTTTTCATGTATCCAGAGTTACTTCCAGTGTGTTCCCTGAAGGCAAAGAATCCCCAGGAT  666

Query  385  AAGATCCTCTTCACCAAGGCTGAGGACAATTTGTTAGCTTTAGGACTGAAGCATTTTGAAGGGACTGAGTTTCT  458
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AAGATCCTCTTCACCAAGGCTGAGGACAATTTGTTAGCTTTAGGACTGAAGCATTTTGAAGGGACTGAGTTTCT  740

Query  459  TAACCCTCTAATCAGCAAGTACCTTCTAACCTGCAAGACTGCCCGCCAACTGACAGTGAGAATCAAGAACCTCA  532
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TAACCCTCTAATCAGCAAGTACCTTCTAACCTGCAAGACTGCCCGCCAACTGACAGTGAGAATCAAGAACCTCA  814

Query  533  ACATGAACAGAGCTCCTGACAACATCATTAAATTTTATAAGAAGACCAAACAGCTGCCAGTCCTAGGAAAATGC  606
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  ACATGAACAGAGCTCCTGACAACATCATTAAATTTTATAAGAAGACCAAACAGCTGCCAGTCCTAGGAAAATGC  888

Query  607  TGTGAAGAGATCCAGCCACATCAGTGGAAGCCACCTATAGAGAGAGAAGAACACCGGCTCCCATTCTGGTTAAA  680
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TGTGAAGAGATCCAGCCACATCAGTGGAAGCCACCTATAGAGAGAGAAGAACACCGGCTCCCATTCTGGTTAAA  962

Query  681  GGCCAGTCTGCCATCCATCCAGGAAGAACTGCGGCACATGGCTGATGGTGCTAGAGAGGTAGGAAATATGACTG  754
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GGCCAGTCTGCCATCCATCCAGGAAGAACTGCGGCACATGGCTGATGGTGCTAGAGAGGTAGGAAATATGACTG  1036

Query  755  GAACCACTGAGATCAACTCAGATCAAGGCCTAGAAAAAGACAACTCAGAGTTGGGGAGTGAAACTCGGTACCCA  828
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GAACCACTGAGATCAACTCAGATCAAGGCCTAGAAAAAGACAACTCAGAGTTGGGGAGTGAAACTCGGTACCCA  1110

Query  829  CTGCTATTGCCTAAGGGTGTAGTCCTGAAACTGAAGCCAGTTGCCGACCGTTTCCCCAAGAAGGCTTGGAGACA  902
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CTGCTATTGCCTAAGGGTGTAGTCCTGAAACTGAAGCCAGTTGCCGACCGTTTCCCCAAGAAGGCTTGGAGACA  1184

Query  903  GAAGCGTTCATCAGTCCTGAAACCCCTCCTTATCCAACCCAGCCCCTCTCTCCAGCCCAGCTTCAACCCTGGGA  976
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GAAGCGTTCATCAGTCCTGAAACCCCTCCTTATCCAACCCAGCCCCTCTCTCCAGCCCAGCTTCAACCCTGGGA  1258

Query  977  AAACACCAGCCCAATCAACTCATTCAGAAGCCCCTCCGAGCAAAATGGTGCTCCGGATTCCTCACCCAATACAG  1050
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  AAACACCAGCCCAATCAACTCATTCAGAAGCCCCTCCGAGCAAAATGGTGCTCCGGATTCCTCACCCAATACAG  1332

Query 1051  CCAGCCACTGTTTTACAGACAGTTCCAGGTGTCCCTCCACTGGGGGTCAGTGGAGGTGAGAGTTTTGAGTCTCC  1124
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  CCAGCCACTGTTTTACAGACAGTTCCAGGTGTCCCTCCACTGGGGGTCAGTGGAGGTGAGAGTTTTGAGTCTCC  1406

Query 1125  TGCAGCACTGCCTGCTATGCCCCCTGAGGCCAGGACAAGCTTCCCTCTGTCTGAGTCCCAGACTTTGCTCTCTT  1198
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  TGCAGCACTGCCTGCTATGCCCCCTGAGGCCAGGACAAGCTTCCCTCTGTCTGAGTCCCAGACTTTGCTCTCTT  1480

Query 1199  CTGCCCCTGTGCCCAAGGTAATGATGCCCTCCCCTGCCTCTTCCATGTTTCGAAAGCCATATGTGAGACGGAGA  1272
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  CTGCCCCTGTGCCCAAGGTAATGATGCCCTCCCCTGCCTCTTCCATGTTTCGAAAGCCATATGTGAGACGGAGA  1554

Query 1273  CCCTCAAAAAGAAGGGGAGCCAGGGCCTTTCGCTGTATCAAACCTGCCCCTGTTATCCACCCTGCATCTGTTAT  1346
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  CCCTCAAAAAGAAGGGGAGCCAGGGCCTTTCGCTGTATCAAACCTGCCCCTGTTATCCACCCTGCATCTGTTAT  1628

Query 1347  CTTCACTGTTCCTGCTACCACTGTGAAGATTGTGAGCCTTGGCGGTGGCTGTAACATGATCCAGCCTGTCAATG  1420
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  CTTCACTGTTCCTGCTACCACTGTGAAGATTGTGAGCCTTGGCGGTGGCTGTAACATGATCCAGCCTGTCAATG  1702

Query 1421  CGGCTGTGGCCCAGAGTCCCCAGACTATTCCCATCGCCACCCTCTTGGTTAACCCTACTTCCTTCCCCTGTCCA  1494
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  CGGCTGTGGCCCAGAGTCCCCAGACTATTCCCATCGCCACCCTCTTGGTTAACCCTACTTCCTTCCCCTGTCCA  1776

Query 1495  TTGAACCAGCCCCTTGTGGCCTCCTCTGTCTCACCCTTAATTGTTTCTGGCAATTCTGTGAATCTTCCTATACC  1568
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  TTGAACCAGCCCCTTGTGGCCTCCTCTGTCTCACCCTTAATTGTTTCTGGCAATTCTGTGAATCTTCCTATACC  1850

Query 1569  ATCCACCCCTGAAGATAAGGCCCACATGAATGTGGACATTGCTTGTGCTGTGGCTGATGGGGAAAATGCCTTTC  1642
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  ATCCACCCCTGAAGATAAGGCCCACATGAATGTGGACATTGCTTGTGCTGTGGCTGATGGGGAAAATGCCTTTC  1924

Query 1643  AGGGCCTAGAACCCAAATTAGAGCCCCAGGAACTATCTCCTCTCTCTGCTACTGTTTTCCCCAAAGTGGAACAT  1716
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  AGGGCCTAGAACCCAAATTAGAGCCCCAGGAACTATCTCCTCTCTCTGCTACTGTTTTCCCCAAAGTGGAACAT  1998

Query 1717  AGCCCAGGGCCTCCACCAGTCGATAAACAGTGCCAAGAAGGATTGTCAGAGAACAGTGCCTATCGCTGGACCGT  1790
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  AGCCCAGGGCCTCCACCAGTCGATAAACAGTGCCAAGAAGGATTGTCAGAGAACAGTGCCTATCGCTGGACCGT  2072

Query 1791  TGTGAAAACAGAGGAGGGAAGGCAAGCTCTGGAGCCGCTCCCTCAGGGCATCCAGGAGTCTCTAAACAACTCTT  1864
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  TGTGAAAACAGAGGAGGGAAGGCAAGCTCTGGAGCCGCTCCCTCAGGGCATCCAGGAGTCTCTAAACAACTCTT  2146

Query 1865  CCCCTGGGGATTTAGAGGAAGTTGTCAAGATGGAACCTGAAGATGCTACAGAGGAAATCAGTGGATTTCTT  1935
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  CCCCTGGGGATTTAGAGGAAGTTGTCAAGATGGAACCTGAAGATGCTACAGAGGAAATCAGTGGATTTCTT  2217