Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_12191
• Subject: NM_139118.2
• Aligned Length: 2448
• Identities: 1875
• Gaps: 573

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGGAGGAGGAGGCGAGCCGCAGCGCCGCGGCGACGAACCCAGGGAGTCGGCTTACCCGCTGGCCGCCTCCTGA  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  CAAGCGGGAGGGATCCGCGGTGGACCCAGGGAAGCGGAGGAGCCTGGCGGCCACCCCCTCTTCCTCACTTCCCT  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  GTACTCTCATCGCTCTCGGCCTCCGACACGAAAAGGAAGCAAATGAGCTGATGGAAGATCTGTTTGAAACTTTC  222

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  223  CAAGATGAGATGGGATTCTCCAACATGGAAGATGATGGCCCAGAAGAGGAGGAGCGTGTGGCTGAGCCTCAAGC  296

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  297  TAACTTTAACACCCCTCAAGCTCTACGGTTTGAGGAACTACTGGCCAACCTACTAAATGAACAACATCAGATAG  370

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  371  CGAAGGAACTATTTGAACAGCTGAAGATGAAGAAACCTTCAGCCAAACAGCAGAAGGAGGTAGAGAAGGTTAAA  444

Query    1  ---------------------------------------------------------------------ATGCA  5
                                                                                 |||||
Sbjct  445  CCCCAGTGTAAGGAAGTTCATCAGACCCTGATTCTGGACCCAGCACAAAGGAAGAGACTCCAGCAGCAGATGCA  518

Query    6  GCAGCATGTTCAGCTCTTGACACAAATCCACCTTCTTGCCACCTGCAACCCCAATCTCAATCCGGAGGCCAGTA  79
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GCAGCATGTTCAGCTCTTGACACAAATCCACCTTCTTGCCACCTGCAACCCCAATCTCAATCCGGAGGCCAGTA  592

Query   80  GCACCAGGATATGTCTTAAAGAGCTGGGAACCTTTGCTCAAAGCTCCATCGCCCTTCACCATCAGTACAACCCC  153
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GCACCAGGATATGTCTTAAAGAGCTGGGAACCTTTGCTCAAAGCTCCATCGCCCTTCACCATCAGTACAACCCC  666

Query  154  AAGTTTCAGACCCTGTTCCAACCCTGTAACTTGATGGGAGCTATGCAGCTGATTGAAGACTTCAGCACACATGT  227
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AAGTTTCAGACCCTGTTCCAACCCTGTAACTTGATGGGAGCTATGCAGCTGATTGAAGACTTCAGCACACATGT  740

Query  228  CAGCATTGACTGCAGCCCTCATAAAACTGTCAAGAAGACTGCCAATGAATTTCCCTGTTTGCCAAAGCAAGTGG  301
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CAGCATTGACTGCAGCCCTCATAAAACTGTCAAGAAGACTGCCAATGAATTTCCCTGTTTGCCAAAGCAAGTGG  814

Query  302  CTTGGATCCTGGCCACAAGCAAGGTTTTCATGTATCCAGAGTTACTTCCAGTGTGTTCCCTGAAGGCAAAGAAT  375
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CTTGGATCCTGGCCACAAGCAAGGTTTTCATGTATCCAGAGTTACTTCCAGTGTGTTCCCTGAAGGCAAAGAAT  888

Query  376  CCCCAGGATAAGATCCTCTTCACCAAGGCTGAGGACAATTTGTTAGCTTTAGGACTGAAGCATTTTGAAGGGAC  449
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                                    
Sbjct  889  CCCCAGGATAAGATCCTCTTCACCAAGGCTGAGGACAA------------------------------------  926

Query  450  TGAGTTTCTTAACCCTCTAATCAGCAAGTACCTTCTAACCTGCAAGACTGCCCGCCAACTGACAGTGAGAATCA  523
                                    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  927  ------------------------CAAGTACCTTCTAACCTGCAAGACTGCCCGCCAACTGACAGTGAGAATCA  976

Query  524  AGAACCTCAACATGAACAGAGCTCCTGACAACATCATTAAATTTTATAAGAAGACCAAACAGCTGCCAGTCCTA  597
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  977  AGAACCTCAACATGAACAGAGCTCCTGACAACATCATTAAATTTTATAAGAAGACCAAACAGCTGCCAGTCCTA  1050

Query  598  GGAAAATGCTGTGAAGAGATCCAGCCACATCAGTGGAAGCCACCTATAGAGAGAGAAGAACACCGGCTCCCATT  671
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1051  GGAAAATGCTGTGAAGAGATCCAGCCACATCAGTGGAAGCCACCTATAGAGAGAGAAGAACACCGGCTCCCATT  1124

Query  672  CTGGTTAAAGGCCAGTCTGCCATCCATCCAGGAAGAACTGCGGCACATGGCTGATGGTGCTAGAGAGGTAGGAA  745
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1125  CTGGTTAAAGGCCAGTCTGCCATCCATCCAGGAAGAACTGCGGCACATGGCTGATGGTGCTAGAGAGGTAGGAA  1198

Query  746  ATATGACTGGAACCACTGAGATCAACTCAGATCAAGGCCTAGAAAAAGACAACTCAGAGTTGGGGAGTGAAACT  819
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1199  ATATGACTGGAACCACTGAGATCAACTCAGATCAAGGCCTAGAAAAAGACAACTCAGAGTTGGGGAGTGAAACT  1272

Query  820  CGGTACCCACTGCTATTGCCTAAGGGTGTAGTCCTGAAACTGAAGCCAGTTGCCGACCGTTTCCCCAAGAAGGC  893
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1273  CGGTACCCACTGCTATTGCCTAAGGGTGTAGTCCTGAAACTGAAGCCAGTTGCCGACCGTTTCCCCAAGAAGGC  1346

Query  894  TTGGAGACAGAAGCGTTCATCAGTCCTGAAACCCCTCCTTATCCAACCCAGCCCCTCTCTCCAGCCCAGCTTCA  967
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1347  TTGGAGACAGAAGCGTTCATCAGTCCTGAAACCCCTCCTTATCCAACCCAGCCCCTCTCTCCAGCCCAGCTTCA  1420

Query  968  ACCCTGGGAAAACACCAGCCCAATCAACTCATTCAGAAGCCCCTCCGAGCAAAATGGTGCTCCGGATTCCTCAC  1041
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1421  ACCCTGGGAAAACACCAGCCCAATCAACTCATTCAGAAGCCCCTCCGAGCAAAATGGTGCTCCGGATTCCTCAC  1494

Query 1042  CCAATACAGCCAGCCACTGTTTTACAGACAGTTCCAGGTGTCCCTCCACTGGGGGTCAGTGGAGGTGAGAGTTT  1115
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1495  CCAATACAGCCAGCCACTGTTTTACAGACAGTTCCAGGTGTCCCTCCACTGGGGGTCAGTGGAGGTGAGAGTTT  1568

Query 1116  TGAGTCTCCTGCAGCACTGCCTGCTATGCCCCCTGAGGCCAGGACAAGCTTCCCTCTGTCTGAGTCCCAGACTT  1189
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1569  TGAGTCTCCTGCAGCACTGCCTGCTATGCCCCCTGAGGCCAGGACAAGCTTCCCTCTGTCTGAGTCCCAGACTT  1642

Query 1190  TGCTCTCTTCTGCCCCTGTGCCCAAGGTAATGATGCCCTCCCCTGCCTCTTCCATGTTTCGAAAGCCATATGTG  1263
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1643  TGCTCTCTTCTGCCCCTGTGCCCAAGGTAATGATGCCCTCCCCTGCCTCTTCCATGTTTCGAAAGCCATATGTG  1716

Query 1264  AGACGGAGACCCTCAAAAAGAAGGGGAGCCAGGGCCTTTCGCTGTATCAAACCTGCCCCTGTTATCCACCCTGC  1337
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1717  AGACGGAGACCCTCAAAAAGAAGGGGAGCCAGGGCCTTTCGCTGTATCAAACCTGCCCCTGTTATCCACCCTGC  1790

Query 1338  ATCTGTTATCTTCACTGTTCCTGCTACCACTGTGAAGATTGTGAGCCTTGGCGGTGGCTGTAACATGATCCAGC  1411
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1791  ATCTGTTATCTTCACTGTTCCTGCTACCACTGTGAAGATTGTGAGCCTTGGCGGTGGCTGTAACATGATCCAGC  1864

Query 1412  CTGTCAATGCGGCTGTGGCCCAGAGTCCCCAGACTATTCCCATCGCCACCCTCTTGGTTAACCCTACTTCCTTC  1485
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1865  CTGTCAATGCGGCTGTGGCCCAGAGTCCCCAGACTATTCCCATCGCCACCCTCTTGGTTAACCCTACTTCCTTC  1938

Query 1486  CCCTGTCCATTGAACCAGCCCCTTGTGGCCTCCTCTGTCTCACCCTTAATTGTTTCTGGCAATTCTGTGAATCT  1559
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1939  CCCTGTCCATTGAACCAGCCCCTTGTGGCCTCCTCTGTCTCACCCTTAATTGTTTCTGGCAATTCTGTGAATCT  2012

Query 1560  TCCTATACCATCCACCCCTGAAGATAAGGCCCACATGAATGTGGACATTGCTTGTGCTGTGGCTGATGGGGAAA  1633
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2013  TCCTATACCATCCACCCCTGAAGATAAGGCCCACATGAATGTGGACATTGCTTGTGCTGTGGCTGATGGGGAAA  2086

Query 1634  ATGCCTTTCAGGGCCTAGAACCCAAATTAGAGCCCCAGGAACTATCTCCTCTCTCTGCTACTGTTTTCCCCAAA  1707
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2087  ATGCCTTTCAGGGCCTAGAACCCAAATTAGAGCCCCAGGAACTATCTCCTCTCTCTGCTACTGTTTTCCCCAAA  2160

Query 1708  GTGGAACATAGCCCAGGGCCTCCACCAGTCGATAAACAGTGCCAAGAAGGATTGTCAGAGAACAGTGCCTATCG  1781
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2161  GTGGAACATAGCCCAGGGCCTCCACCAGTCGATAAACAGTGCCAAGAAGGATTGTCAGAGAACAGTGCCTATCG  2234

Query 1782  CTGGACCGTTGTGAAAACAGAGGAGGGAAGGCAAGCTCTGGAGCCGCTCCCTCAGGGCATCCAGGAGTCTCTAA  1855
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2235  CTGGACCGTTGTGAAAACAGAGGAGGGAAGGCAAGCTCTGGAGCCGCTCCCTCAGGGCATCCAGGAGTCTCTAA  2308

Query 1856  ACAACTCTTCCCCTGGGGATTTAGAGGAAGTTGTCAAGATGGAACCTGAAGATGCTACAGAGGAAATCAGTGGA  1929
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2309  ACAACTCTTCCCCTGGGGATTTAGAGGAAGTTGTCAAGATGGAACCTGAAGATGCTACAGAGGAAATCAGTGGA  2382

Query 1930  TTTCTT  1935
            ||||||
Sbjct 2383  TTTCTT  2388