Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_12191
• Subject: NM_139119.2
• Aligned Length: 2250
• Identities: 1935
• Gaps: 315

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGGAAGATCTGTTTGAAACTTTCCAAGATGAGATGGGATTCTCCAACATGGAAGATGATGGCCCAGAAGAGGA  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  GGAGCGTGTGGCTGAGCCTCAAGCTAACTTTAACACCCCTCAAGCTCTACGGTTTGAGGAACTACTGGCCAACC  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  TACTAAATGAACAACATCAGATAGCGAAGGAACTATTTGAACAGCTGAAGATGAAGAAACCTTCAGCCAAACAG  222

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  223  CAGAAGGAGGTAGAGAAGGTTAAACCCCAGTGTAAGGAAGTTCATCAGACCCTGATTCTGGACCCAGCACAAAG  296

Query    1  -------------------ATGCAGCAGCATGTTCAGCTCTTGACACAAATCCACCTTCTTGCCACCTGCAACC  55
                               |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GAAGAGACTCCAGCAGCAGATGCAGCAGCATGTTCAGCTCTTGACACAAATCCACCTTCTTGCCACCTGCAACC  370

Query   56  CCAATCTCAATCCGGAGGCCAGTAGCACCAGGATATGTCTTAAAGAGCTGGGAACCTTTGCTCAAAGCTCCATC  129
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CCAATCTCAATCCGGAGGCCAGTAGCACCAGGATATGTCTTAAAGAGCTGGGAACCTTTGCTCAAAGCTCCATC  444

Query  130  GCCCTTCACCATCAGTACAACCCCAAGTTTCAGACCCTGTTCCAACCCTGTAACTTGATGGGAGCTATGCAGCT  203
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GCCCTTCACCATCAGTACAACCCCAAGTTTCAGACCCTGTTCCAACCCTGTAACTTGATGGGAGCTATGCAGCT  518

Query  204  GATTGAAGACTTCAGCACACATGTCAGCATTGACTGCAGCCCTCATAAAACTGTCAAGAAGACTGCCAATGAAT  277
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GATTGAAGACTTCAGCACACATGTCAGCATTGACTGCAGCCCTCATAAAACTGTCAAGAAGACTGCCAATGAAT  592

Query  278  TTCCCTGTTTGCCAAAGCAAGTGGCTTGGATCCTGGCCACAAGCAAGGTTTTCATGTATCCAGAGTTACTTCCA  351
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TTCCCTGTTTGCCAAAGCAAGTGGCTTGGATCCTGGCCACAAGCAAGGTTTTCATGTATCCAGAGTTACTTCCA  666

Query  352  GTGTGTTCCCTGAAGGCAAAGAATCCCCAGGATAAGATCCTCTTCACCAAGGCTGAGGACAATTTGTTAGCTTT  425
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GTGTGTTCCCTGAAGGCAAAGAATCCCCAGGATAAGATCCTCTTCACCAAGGCTGAGGACAATTTGTTAGCTTT  740

Query  426  AGGACTGAAGCATTTTGAAGGGACTGAGTTTCTTAACCCTCTAATCAGCAAGTACCTTCTAACCTGCAAGACTG  499
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  AGGACTGAAGCATTTTGAAGGGACTGAGTTTCTTAACCCTCTAATCAGCAAGTACCTTCTAACCTGCAAGACTG  814

Query  500  CCCGCCAACTGACAGTGAGAATCAAGAACCTCAACATGAACAGAGCTCCTGACAACATCATTAAATTTTATAAG  573
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CCCGCCAACTGACAGTGAGAATCAAGAACCTCAACATGAACAGAGCTCCTGACAACATCATTAAATTTTATAAG  888

Query  574  AAGACCAAACAGCTGCCAGTCCTAGGAAAATGCTGTGAAGAGATCCAGCCACATCAGTGGAAGCCACCTATAGA  647
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AAGACCAAACAGCTGCCAGTCCTAGGAAAATGCTGTGAAGAGATCCAGCCACATCAGTGGAAGCCACCTATAGA  962

Query  648  GAGAGAAGAACACCGGCTCCCATTCTGGTTAAAGGCCAGTCTGCCATCCATCCAGGAAGAACTGCGGCACATGG  721
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GAGAGAAGAACACCGGCTCCCATTCTGGTTAAAGGCCAGTCTGCCATCCATCCAGGAAGAACTGCGGCACATGG  1036

Query  722  CTGATGGTGCTAGAGAGGTAGGAAATATGACTGGAACCACTGAGATCAACTCAGATCAAGGCCTAGAAAAAGAC  795
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CTGATGGTGCTAGAGAGGTAGGAAATATGACTGGAACCACTGAGATCAACTCAGATCAAGGCCTAGAAAAAGAC  1110

Query  796  AACTCAGAGTTGGGGAGTGAAACTCGGTACCCACTGCTATTGCCTAAGGGTGTAGTCCTGAAACTGAAGCCAGT  869
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  AACTCAGAGTTGGGGAGTGAAACTCGGTACCCACTGCTATTGCCTAAGGGTGTAGTCCTGAAACTGAAGCCAGT  1184

Query  870  TGCCGACCGTTTCCCCAAGAAGGCTTGGAGACAGAAGCGTTCATCAGTCCTGAAACCCCTCCTTATCCAACCCA  943
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TGCCGACCGTTTCCCCAAGAAGGCTTGGAGACAGAAGCGTTCATCAGTCCTGAAACCCCTCCTTATCCAACCCA  1258

Query  944  GCCCCTCTCTCCAGCCCAGCTTCAACCCTGGGAAAACACCAGCCCAATCAACTCATTCAGAAGCCCCTCCGAGC  1017
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  GCCCCTCTCTCCAGCCCAGCTTCAACCCTGGGAAAACACCAGCCCAATCAACTCATTCAGAAGCCCCTCCGAGC  1332

Query 1018  AAAATGGTGCTCCGGATTCCTCACCCAATACAGCCAGCCACTGTTTTACAGACAGTTCCAGGTGTCCCTCCACT  1091
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  AAAATGGTGCTCCGGATTCCTCACCCAATACAGCCAGCCACTGTTTTACAGACAGTTCCAGGTGTCCCTCCACT  1406

Query 1092  GGGGGTCAGTGGAGGTGAGAGTTTTGAGTCTCCTGCAGCACTGCCTGCTATGCCCCCTGAGGCCAGGACAAGCT  1165
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GGGGGTCAGTGGAGGTGAGAGTTTTGAGTCTCCTGCAGCACTGCCTGCTATGCCCCCTGAGGCCAGGACAAGCT  1480

Query 1166  TCCCTCTGTCTGAGTCCCAGACTTTGCTCTCTTCTGCCCCTGTGCCCAAGGTAATGATGCCCTCCCCTGCCTCT  1239
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  TCCCTCTGTCTGAGTCCCAGACTTTGCTCTCTTCTGCCCCTGTGCCCAAGGTAATGATGCCCTCCCCTGCCTCT  1554

Query 1240  TCCATGTTTCGAAAGCCATATGTGAGACGGAGACCCTCAAAAAGAAGGGGAGCCAGGGCCTTTCGCTGTATCAA  1313
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  TCCATGTTTCGAAAGCCATATGTGAGACGGAGACCCTCAAAAAGAAGGGGAGCCAGGGCCTTTCGCTGTATCAA  1628

Query 1314  ACCTGCCCCTGTTATCCACCCTGCATCTGTTATCTTCACTGTTCCTGCTACCACTGTGAAGATTGTGAGCCTTG  1387
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  ACCTGCCCCTGTTATCCACCCTGCATCTGTTATCTTCACTGTTCCTGCTACCACTGTGAAGATTGTGAGCCTTG  1702

Query 1388  GCGGTGGCTGTAACATGATCCAGCCTGTCAATGCGGCTGTGGCCCAGAGTCCCCAGACTATTCCCATCGCCACC  1461
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  GCGGTGGCTGTAACATGATCCAGCCTGTCAATGCGGCTGTGGCCCAGAGTCCCCAGACTATTCCCATCGCCACC  1776

Query 1462  CTCTTGGTTAACCCTACTTCCTTCCCCTGTCCATTGAACCAGCCCCTTGTGGCCTCCTCTGTCTCACCCTTAAT  1535
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  CTCTTGGTTAACCCTACTTCCTTCCCCTGTCCATTGAACCAGCCCCTTGTGGCCTCCTCTGTCTCACCCTTAAT  1850

Query 1536  TGTTTCTGGCAATTCTGTGAATCTTCCTATACCATCCACCCCTGAAGATAAGGCCCACATGAATGTGGACATTG  1609
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  TGTTTCTGGCAATTCTGTGAATCTTCCTATACCATCCACCCCTGAAGATAAGGCCCACATGAATGTGGACATTG  1924

Query 1610  CTTGTGCTGTGGCTGATGGGGAAAATGCCTTTCAGGGCCTAGAACCCAAATTAGAGCCCCAGGAACTATCTCCT  1683
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  CTTGTGCTGTGGCTGATGGGGAAAATGCCTTTCAGGGCCTAGAACCCAAATTAGAGCCCCAGGAACTATCTCCT  1998

Query 1684  CTCTCTGCTACTGTTTTCCCCAAAGTGGAACATAGCCCAGGGCCTCCACCAGTCGATAAACAGTGCCAAGAAGG  1757
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  CTCTCTGCTACTGTTTTCCCCAAAGTGGAACATAGCCCAGGGCCTCCACCAGTCGATAAACAGTGCCAAGAAGG  2072

Query 1758  ATTGTCAGAGAACAGTGCCTATCGCTGGACCGTTGTGAAAACAGAGGAGGGAAGGCAAGCTCTGGAGCCGCTCC  1831
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  ATTGTCAGAGAACAGTGCCTATCGCTGGACCGTTGTGAAAACAGAGGAGGGAAGGCAAGCTCTGGAGCCGCTCC  2146

Query 1832  CTCAGGGCATCCAGGAGTCTCTAAACAACTCTTCCCCTGGGGATTTAGAGGAAGTTGTCAAGATGGAACCTGAA  1905
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  CTCAGGGCATCCAGGAGTCTCTAAACAACTCTTCCCCTGGGGATTTAGAGGAAGTTGTCAAGATGGAACCTGAA  2220

Query 1906  GATGCTACAGAGGAAATCAGTGGATTTCTT  1935
            ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  GATGCTACAGAGGAAATCAGTGGATTTCTT  2250