Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_12193
- Subject:
- NM_001369347.1
- Aligned Length:
- 3525
- Identities:
- 2753
- Gaps:
- 771
Alignment
Query 1 ATGAAAAGAACTAAATGTGCTGACATTGACGTTGAGACACCGGACTCCATTCTGGTTAATACAAATCTGCGAGC 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGAAAAGAACTAAATGTGCTGACATTGACGTTGAGACACCGGACTCCATTCTGGTTAATACAAATCTGCGAGC 74
Query 75 ACTGATCAACAAGCACACATTTTCAGTCCTTCCTGGAGATTGCCAGCAACGACTGCTTTTACTACTCCCAGAGG 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 ACTGATCAACAAGCACACATTTTCAGTCCTTCCTGGAGATTGCCAGCAACGACTGCTTTTACTACTCCCAGAGG 148
Query 149 TAGATCGACAGGTTGGTCCAGATGGTTTAATGAAGTTAAATGGCTCAGCCCTTAACAATGAATTCTTCACTTCA 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 TAGATCGACAGGTTGGTCCAGATGGTTTAATGAAGTTAAATGGCTCAGCCCTTAACAATGAATTCTTCACTTCA 222
Query 223 GCAGCCCAAGGCTGGAAGGAAAGACTCTCAGAAGGTGAGTTTACACCTGAGATGCAGGTGAGAATTCGACAAGA 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GCAGCCCAAGGCTGGAAGGAAAGACTCTCAGAAGGTGAGTTTACACCTGAGATGCAGGTGAGAATTCGACAAGA 296
Query 297 GATTGAGAAGGAGAAAAAAGTGGAGCCATGGAAAGAACAATTCTTTGAAAGCTACTATGGGCAGAGTTCTGGCC 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 GATTGAGAAGGAGAAAAAAGTGGAGCCATGGAAAGAACAATTCTTTGAAAGCTACTATGGGCAGAGTTCTGGCC 370
Query 371 TGAGCCTTGAAGATTCTAAGAAATTGACAGCTTCTCCCAGTGATCCCAAAGTAAAGAAAACCCCAGCTGAACAA 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 TGAGCCTTGAAGATTCTAAGAAATTGACAGCTTCTCCCAGTGATCCCAAAGTAAAGAAAACCCCAGCTGAACAA 444
Query 445 CCAAAATCCATGCCTGTGTCAGAGGCCTCTCTTATCAGAATAGTTCCAGTAGTCTCCCAGTCAGAGTGTAAAGA 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 CCAAAATCCATGCCTGTGTCAGAGGCCTCTCTTATCAGAATAGTTCCAGTAGTCTCCCAGTCAGAGTGTAAAGA 518
Query 519 AGAAGCATTGCAAATGTCATCACCAGGCAGAAAAGAAGAGTGTGAAAGCCAAGGTGAAGTGCAGCCGAACTTCT 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 AGAAGCATTGCAAATGTCATCACCAGGCAGAAAAGAAGAGTGTGAAAGCCAAGGTGAAGTGCAGCCGAACTTCT 592
Query 593 CCACATCTTCAGAGCCCCTGCTTTCCTCAGCTCTCAATACACATGAGCTTAGCAGCATTCTTCCCATCAAGTGC 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 CCACATCTTCAGAGCCCCTGCTTTCCTCAGCTCTCAATACACATGAGCTTAGCAGCATTCTTCCCATCAAGTGC 666
Query 667 CCAAAGGATGAGGATCTCTTGGAGCAGAAGCCAGTCACCTCTGCTGAACAGGAATCTGAGAAGAACCATCTCAC 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 CCAAAGGATGAGGATCTCTTGGAGCAGAAGCCAGTCACCTCTGCTGAACAGGAATCTGAGAAGAACCATCTCAC 740
Query 741 CACAGCTTCTAATTATAACAAAAGTGAAAGCCAAGAATCTTTAGTTACATCGCCAAGCAAACCCAAGAGTCCTG 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 CACAGCTTCTAATTATAACAAAAGTGAAAGCCAAGAATCTTTAGTTACATCGCCAAGCAAACCCAAGAGTCCTG 814
Query 815 GGGTTGAAAAACCAATAGTGAAGCCCACAGCAGGAGCGGGTCCACAGGAGACTAATATGAAAGAACCTCTAGCA 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 GGGTTGAAAAACCAATAGTGAAGCCCACAGCAGGAGCGGGTCCACAGGAGACTAATATGAAAGAACCTCTAGCA 888
Query 889 ACTCTTGTTGATCAGAGCCCAGAAAGCCTCAAGAGGAAGTCTTCCCTCACCCAAGAAGAGGCCCCTGTGAGCTG 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 ACTCTTGTTGATCAGAGCCCAGAAAGCCTCAAGAGGAAGTCTTCCCTCACCCAAGAAGAGGCCCCTGTGAGCTG 962
Query 963 GGAGAAGAGGCCACGTGTCACTGAGAATCGCCAGCACCAGCAGCCATTTCAGGTCTCACCACAGCCCTTTCTCA 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 GGAGAAGAGGCCACGTGTCACTGAGAATCGCCAGCACCAGCAGCCATTTCAGGTCTCACCACAGCCCTTTCTCA 1036
Query 1037 ATAGAGGGGACAGAATCCAGGTGCGAAAAGTACCACCTCTCAAGATCCCGGTCTCCAGAATCTCCCCCATGCCG 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 ATAGAGGGGACAGAATCCAGGTGCGAAAAGTACCACCTCTCAAGATCCCGGTCTCCAGAATCTCCCCCATGCCG 1110
Query 1111 TTTCATCCATCGCAGGTCTCTCCCAGGGCTCGTTTTCCAGTCTCCATCACTAGTCCTAACAGAACAGGAGCCAG 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 TTTCATCCATCGCAGGTCTCTCCCAGGGCTCGTTTTCCAGTCTCCATCACTAGTCCTAACAGAACAGGAGCCAG 1184
Query 1185 AACTCTTGCAGACATCAAAGCAAAAGCCCAACTGGTCAAAGCACAGAGGGCAGCAGCTGCCGCTGCCGCCGCAG 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 AACTCTTGCAGACATCAAAGCAAAAGCCCAACTGGTCAAAGCACAGAGGGCAGCAGCTGCCGCTGCCGCCGCAG 1258
Query 1259 CTGCTGCAGCCGCCTCAGTTGGAGGGACCATTCCAGGACCTGGCCCAGGGGGTGGACAAGGTCCAGGAGAGGGT 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 CTGCTGCAGCCGCCTCAGTTGGAGGGACCATTCCAGGACCTGGCCCAGGGGGTGGACAAGGTCCAGGAGAGGGT 1332
Query 1333 GGTGAAGGGCAGACTGCTAGAGGAGGCAGTCCAGGCTCAGACAGAGTCAGTGAAACTGGAAAGGGCCCCACACT 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 GGTGAAGGGCAGACTGCTAGAGGAGGCAGTCCAGGCTCAGACAGAGTCAGTGAAACTGGAAAGGGCCCCACACT 1406
Query 1407 GGAACTGGCAGGAACTGGAAGCAGGGGAGGTACGAGAGAGCTTTTACCCTGTGGTCCAGAGACTCAGCCCCAGT 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 GGAACTGGCAGGAACTGGAAGCAGGGGAGGTACGAGAGAGCTTTTACCCTGTGGTCCAGAGACTCAGCCCCAGT 1480
Query 1481 CTGAGACCAAGACCACCCCAAGCCAGGCACAGCCTCATAGTGTCTCTGGAGCACAACTACAGCAAACCCCCCCA 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 CTGAGACCAAGACCACCCCAAGCCAGGCACAGCCTCATAGTGTCTCTGGAGCACAACTACAGCAAACCCCCCCA 1554
Query 1555 GTGCCTCCAACACCTGCCGTCAGTGGAGCATGCACAAGTGTCCCATCACCAGTCCACATAGAGAAATTGGATAA 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 GTGCCTCCAACACCTGCCGTCAGTGGAGCATGCACAAGTGTCCCATCACCAGCCCACATAGAGAAATTGGATAA 1628
Query 1629 TGAAAAACTGAACCCCACCAGAGCAACAGCCACAGTGGCCTCTGTCAGCCATCCACAAGGGCCCAGTAGTTGCA 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 TGAAAAACTGAACCCCACCAGAGCAACAGCCACAGTGGCCTCTGTCAGCCATCCACAAGGGCCCAGTAGTTGCA 1702
Query 1703 GACAGGAGAAAGCACCTTCTCCAA-------------------------------------------------- 1726
||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 GACAGGAGAAAGCACCTTCTCCAACAGGTCCTGCTCTAATCTCAGGTGCCTCACCTGTTCATTGTGCAGCTGAT 1776
Query 1727 -------------------------------------------------------------------------- 1726
Sbjct 1777 GGCACAGTTGAGCTCAAAGCAGGTCCTAGTAAGAATATACCTAACCCTTCAGCCTCATCAAAGACAGATGCTAG 1850
Query 1727 -------------------------------------------------------------------------- 1726
Sbjct 1851 TGTGCCAGTGGCTGTAACTCCCTCCCCTTTAACATCTTTATTGACCACAGCCACTTTAGAAAAGCTTCCTGTAC 1924
Query 1727 -------------------------------------------------------------------------- 1726
Sbjct 1925 CCCAGGTCAGTGCAACTACAGCACCTGCTGGATCAGCTCCACCCTCGAGCACTTTGCCAGCAGCTTCTAGCCTT 1998
Query 1727 -------------------------------------------------------------------------- 1726
Sbjct 1999 AAAACCCCAGGAACTTCTTTAAACATGAATGGACCCACTTTAAGACCAACCTCTAGTATCCCTGCTAATAATCC 2072
Query 1727 -------------------------------------------------------------------------- 1726
Sbjct 2073 TTTAGTGACTCAGCTGCTTCAAGGCAAAGATGTTCCCATGGAGCAAATTCTGCCTAAACCTCTCACCAAAGTTG 2146
Query 1727 -------------------------------------------------------------------------- 1726
Sbjct 2147 AAATGAAAACGGTTCCACTGACTGCAAAAGAGGAAAGGGGGATGGGAGCGCTCATAGCTACCAACACAACAGAA 2220
Query 1727 -------------------------------------------------------------------------- 1726
Sbjct 2221 AATAGCACCAGAGAGGAAGTTAATGAGAGACAGTCCCATCCAGCTACGCAGCAGCAGCTGGGCAAAACCTTGCA 2294
Query 1727 -------------------------------------------------------------------------- 1726
Sbjct 2295 AAGTAAGCAGCTCCCCCAGGTTCCAAGGCCCCTTCAGCTCTTTTCAGCTAAGGAGCTGAGGGACTCCAGCATTG 2368
Query 1727 -------------------------------------------------------------------------- 1726
Sbjct 2369 ACACACACCAATACCACGAAGGACTAAGTAAAGCAACCCAAGATCAGATCCTTCAGACTCTCATTCAGAGGGTT 2442
Query 1727 -------------------------------------------------------CAGGTTTCCAGCTGGAAGA 1745
|||||||||||||||||||
Sbjct 2443 CGGAGGCAGAATCTTCTCTCAGTTGTGCCGCCCTCACAGTTCAACTTCGCTCACTCAGGTTTCCAGCTGGAAGA 2516
Query 1746 CATCTCCACAAGCCAGAGGTTCATGCTGGGTTTTGCTGGCAGAAGGACATCCAAACCTGCAATGGCAGGGCACT 1819
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517 CATCTCCACAAGCCAGAGGTTCATGCTGGGTTTTGCTGGCAGAAGGACATCCAAACCTGCAATGGCAGGGCACT 2590
Query 1820 ACTTACTGAATATTTCTACCTACGGCCGGGGCTCAGAGAGCTTTAGGAGGACCCATTCTGTAAACCCTGAAGAT 1893
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591 ACTTACTGAATATTTCTACCTACGGCCGGGGCTCAGAGAGCTTTAGGAGGACCCATTCTGTAAACCCTGAAGAT 2664
Query 1894 CGTTTTTGTCTAAGCAGCCCCACTGAAGCCTTGAAAATGGGATATACAGACTGTAAAAATGCAACAGGAGAGAG 1967
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2665 CGTTTTTGTCTAAGCAGCCCCACTGAAGCCTTGAAAATGGGATATACAGACTGTAAAAATGCAACAGGAGAGAG 2738
Query 1968 TAGCAGCAGCAAAGAAGATGACACTGATGAGGAAAGTACTGGTGATGAGCAGGAATCTGTCACAGTGAAAGAGG 2041
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2739 TAGCAGCAGCAAAGAAGATGACACTGATGAGGAAAGTACTGGTGATGAGCAGGAATCTGTCACAGTGAAAGAGG 2812
Query 2042 AGCCCCAGGTTTCCCAGAGTGCTGGCAAGGGTGACACAAGTTCAGGACCTCACAGCAGGGAAACTCTATCTACC 2115
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2813 AGCCCCAGGTTTCCCAGAGTGCTGGCAAGGGTGACACAAGTTCAGGACCTCACAGCAGGGAAACTCTATCTACC 2886
Query 2116 AGTGATTGCTTAGCTAGCAAGAATGTGAAGGCTGAGATACCATTGAATGAGCAAACCACTTTAAGTAAGGAGAA 2189
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2887 AGTGATTGCTTAGCTAGCAAGAATGTGAAGGCTGAGATACCATTGAATGAGCAAACCACTTTAAGTAAGGAGAA 2960
Query 2190 TTACCTGTTCACTAGAGGCCAAACATTTGATGAAAAGACCCTAGCCAGAGATTTAATTCAGGCAGCACAGAAGC 2263
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2961 TTACCTGTTCACTAGAGGCCAAACATTTGATGAAAAGACCCTAGCCAGAGATTTAATTCAGGCAGCACAGAAGC 3034
Query 2264 AGATGGCTCATGCAGTGAGAGGTAAGGCAATCCGTAGCAGCCCCGAGCTTTTCAGTTCTACTGTTCTTCCTCTG 2337
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3035 AGATGGCTCATGCAGTGAGAGGTAAGGCAATCCGTAGCAGCCCCGAGCTTTTCAGTTCTACTGTTCTTCCTCTG 3108
Query 2338 CCTGCAGACAGCCCCACCCACCAGCCCCTACTCCTTCCACCCCTGCAAACCCCGAAGTTGTATGGAAGCCCCAC 2411
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3109 CCTGCAGACAGCCCCACCCACCAGCCCCTACTCCTTCCACCCCTGCAAACCCCGAAGTTGTATGGAAGCCCCAC 3182
Query 2412 CCAGATAGGGCCAAGCTATAGAGGCATGATCAATGTCTCCACCTCATCTGACATGGACCATAACTCTGCTGTAC 2485
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3183 CCAGATAGGGCCAAGCTATAGAGGCATGATCAATGTCTCCACCTCATCTGACATGGACCATAACTCTGCTGTAC 3256
Query 2486 CAGGTAGCCAGGTATCTAGCAATGTAGGTGATGTCATGTCATTTTCAGTGACTGTCACTACCATCCCTGCTAGC 2559
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3257 CAGGTAGCCAGGTATCTAGCAATGTAGGTGATGTCATGTCATTTTCAGTGACTGTCACTACCATCCCTGCTAGC 3330
Query 2560 CAAGCTATGAATCCCAGCAGCCATGGCCAGACCATTCCTGTTCAGGCGTTCTCCGAAGAGAACAGCATAGAGGG 2633
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3331 CAAGCTATGAATCCCAGCAGCCATGGCCAGACCATTCCTGTTCAGGCGTTCTCCGAAGAGAACAGCATAGAGGG 3404
Query 2634 CACGCCTTCGAAATGTTACTGCCGCTTGAAAGCCATGATCATGTGCAAAGGCTGTGGCGCTTTCTGCCATGATG 2707
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3405 CACGCCTTCGAAATGTTACTGCCGCTTGAAAGCCATGATCATGTGCAAAGGCTGTGGCGCTTTCTGCCATGATG 3478
Query 2708 ATTGCATCGGCCCCTCCAAACTGTGCGTCTCCTGCCTTGTCGTTCGG 2754
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3479 ATTGCATCGGCCCCTCCAAACTGTGCGTCTCCTGCCTTGTCGTTCGG 3525