Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_12211
• Subject: NM_018420.3
• Aligned Length: 1641
• Identities: 1602
• Gaps: 36

Alignment

Query    1  ------------------------------------ATGGGCATCTACCAGATGTACTTGTGCTTCCTGCTGGC  38
                                                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGAGGTGGAGGAGGCGTTCCAGGCGGTGGGGGAGATGGGCATCTACCAGATGTACTTGTGCTTCCTGCTGGC  74

Query   39  CGTGCTGCTGCAGCTCTACGTGGCCACGGAGGCCATCCTCATTGCACTGGTTGGGGCCACGCCATCCTACCACT  112
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CGTGCTGCTGCAGCTCTACGTGGCCACGGAGGCCATCCTCATTGCACTGGTTGGGGCCACGCCATCCTACCACT  148

Query  113  GGGACCTGGCAGAGCTCCTGCCAAATCAGAGCCACGGTAACCAGTCAGCTGGTGAAGACCAGGCCTTTGGGGAC  186
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GGGACCTGGCAGAGCTCCTGCCAAATCAGAGCCACGGTAACCAGTCAGCTGGTGAAGACCAGGCCTTTGGGGAC  222

Query  187  TGGCTCCTGACAGCCAACGGCAGTGAGATCCATAAGCACGTGCATTTCAGCAGCAGCTTCACCTCCATCGCCTC  260
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TGGCTCCTGACAGCCAACGGCAGTGAGATCCATAAGCACGTGCATTTCAGCAGCAGCTTCACCTCCATCGCCTC  296

Query  261  GGAGTGGTTTTTAATTGCCAACAGATCCTACAAAGTCAGTGCAGCAAGCTCTTTTTTCTTCAGTGGTGTATTTG  334
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GGAGTGGTTTTTAATTGCCAACAGATCCTACAAAGTCAGTGCAGCAAGCTCTTTTTTCTTCAGTGGTGTATTTG  370

Query  335  TTGGAGTTATCTCTTTTGGTCAGCTTTCAGATCGCTTCGGAAGGAAAAAAGTCTATCTCACAGGTTTTGCTCTT  408
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TTGGAGTTATCTCTTTTGGTCAGCTTTCAGATCGCTTCGGAAGGAAAAAAGTCTATCTCACAGGTTTTGCTCTT  444

Query  409  GACATCTTATTTGCAATTGCAAATGGATTTTCCCCCTCATATGAGTTCTTTGCAGTAACTCGCTTCCTGGTGGG  482
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GACATCTTATTTGCAATTGCAAATGGATTTTCCCCCTCATATGAGTTCTTTGCAGTAACTCGCTTCCTGGTGGG  518

Query  483  CATGATGAATGGAGGGATGTCGCTGGTGGCCTTTGTCTTGCTTAATGAGTGTGTGGGCACCGCCTACTGGGCAC  556
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CATGATGAATGGAGGGATGTCGCTGGTGGCCTTTGTCTTGCTTAATGAATGTGTGGGCACCGCCTACTGGGCAC  592

Query  557  TTGCAGGATCGATTGGCGGCCTCTTCTTTGCAGTTGGCATTGCCCAATATGCCCTGTTAGGATACTTCATCCGC  630
            ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TTGCAGGATCGATTGGCGGCCTGTTCTTTGCAGTTGGCATTGCCCAATATGCCCTGTTAGGATACTTCATCCGC  666

Query  631  TCCTGGAGGACCCTAGCCATTCTGGTTAACCTGCAGGGAACGGTGGTCTTTCTCTTATCTTTATTCATTCCTGA  704
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TCCTGGAGGACCCTAGCCATTCTGGTTAACCTGCAGGGAACGGTGGTCTTTCTCTTATCTTTATTCATTCCTGA  740

Query  705  ATCACCTCGTTGGTTATACTCCCAGGGTCGACTGAGTGAGGCTGAAGAGGCGCTGTACCTCATTGCCAAGAGGA  778
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  ATCACCTCGTTGGTTATACTCCCAGGGTCGACTGAGTGAGGCTGAAGAGGCGCTGTACCTCATTGCCAAGAGGA  814

Query  779  ACCGCAAACTCAAGTGCACGTTCTCACTAACACACCCAGCCAACAGGAGCTGCAGGGAGACTGGAAGTTTCCTG  852
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  ACCGCAAACTCAAGTGCACGTTCTCACTAACACACCCAGCCAACAGGAGCTGCAGGGAGACTGGAAGTTTCCTG  888

Query  853  GATCTCTTTCGTTACCGGGTCCTGTTAGGACACACTTTGATCCTGATGTTCATCTGGTTTGTGTGCAGCTTGGT  926
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GATCTCTTTCGTTACCGGGTCCTGTTAGGACACACTTTGATCCTGATGTTCATCTGGTTTGTGTGCAGCTTGGT  962

Query  927  GTATTATGGCCTAACTCTGAGTGCGGGTGATCTAGGTGGAAGTATTTATGCCAACCTGGCCCTGTCTGGCCTCA  1000
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GTATTATGGCCTAACTCTGAGTGCGGGTGATCTAGGTGGAAGTATTTATGCCAACCTGGCCCTGTCTGGCCTCA  1036

Query 1001  TAGAGATTCAATCTTACCCTCTCTGTATCTACTTGATTAACCAAAAATGGTTTGGTCGGAAGCGAACATTATCA  1074
            |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TAGAGATTCCATCTTACCCTCTCTGTATCTACTTGATTAACCAAAAATGGTTTGGTCGGAAGCGAACATTATCA  1110

Query 1075  GCATTTCTGTGCCTAGGAGGACTGGCTTGTCTTATTGTAATGTTTCTTCCAGAAAAGAAAGACACAGGTGTGTT  1148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GCATTTCTGTGCCTAGGAGGACTGGCTTGTCTTATTGTAATGTTTCTTCCAGAAAAGAAAGACACAGGTGTGTT  1184

Query 1149  TGCAGTGGTGAACAGCCATTCCTTGTCCTTGCTGGGGAAGCTGACCATCAGTGCTGCCTTTAACATTGTTTATA  1222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TGCAGTGGTGAACAGCCATTCCTTGTCCTTGCTGGGGAAGCTGACCATCAGTGCTGCCTTTAACATTGTTTATA  1258

Query 1223  TCTACACCTCTGAGCTTTACCCTACAGTCATCAGGAATGTTGGGCTTGGAACTTGTTCCATGTTCTCCCGAGTT  1296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TCTACACCTCTGAGCTTTACCCTACAGTCATCAGGAATGTTGGGCTTGGAACTTGTTCCATGTTCTCCCGAGTT  1332

Query 1297  GGTGGGATTATTGCTCCCTTCATCCCCTCACTGAAATATGTGCAATGGTCTTTACCATTCATTGTCTTCGGAGC  1370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GGTGGGATTATTGCTCCCTTCATCCCCTCACTGAAATATGTGCAATGGTCTTTACCATTCATTGTCTTCGGAGC  1406

Query 1371  CACGGGTCTGACCTCCGGCCTCCTGAGTTTGTTATTGCCGGAGACCCTTAACAGTCCGCTGCTAGAAACATTCT  1444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  CACGGGTCTGACCTCCGGCCTCCTGAGTTTGTTATTGCCGGAGACCCTTAACAGTCCGCTGCTAGAAACATTCT  1480

Query 1445  CCGACCTTCAGGTGTATTCGTATCGCAGGCTGGGAGAAGAAGCATTATCTTTACAGGCTTTGGACCCCCAACAG  1518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  CCGACCTTCAGGTGTATTCGTATCGCAGGCTGGGAGAAGAAGCATTATCTTTACAGGCTTTGGACCCCCAACAG  1554

Query 1519  TGTGTGGACAAGGAGAGCTCTTTAGGGAGTGAGAGTGAGGAAGAGGAAGAATTTTATGATGCAGATGAAGAGAC  1592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  TGTGTGGACAAGGAGAGCTCTTTAGGGAGTGAGAGTGAGGAAGAGGAAGAATTTTATGATGCAGATGAAGAGAC  1628

Query 1593  TCAGATGATCAAG  1605
            |||||||||||||
Sbjct 1629  TCAGATGATCAAG  1641