Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_12211
• Subject: XM_024448238.1
• Aligned Length: 1650
• Identities: 1209
• Gaps: 417

Alignment

Query    1  ------------------------------------ATGGGCATCTACCAGATGTACTTGTGCTTCCTGCTGGC  38
                                                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGAGGTGGAGGAGGCGTTCCAGGCGGTGGGGGAGATGGGCATCTACCAGATGTACTTGTGCTTCCTGCTGGC  74

Query   39  CGTGCTGCTGCAGCTCTACGTGGCCACGGAGGCCATCCTCATTGCACTGGTTGGGGCCACGCCATCCTACCACT  112
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CGTGCTGCTGCAGCTCTACGTGGCCACGGAGGCCATCCTCATTGCACTGGTTGGGGCCACGCCATCCTACCACT  148

Query  113  GGGACCTGGCAGAGCTCCTGCCAAATCAGAGCCACGGTAACCAGTCAGCTGGTGAAGACCAGGCCTTTGGGGAC  186
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GGGACCTGGCAGAGCTCCTGCCAAATCAGAGCCACGGTAACCAGTCAGCTGGTGAAGACCAGGCCTTTGGGGAC  222

Query  187  TGGCTCCTGACAGCCAACGGCAGTGAGATCCATAAGCACGTGCATTTCAGCAGCAGCTTCACCTCCATCGCCTC  260
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TGGCTCCTGACAGCCAACGGCAGTGAGATCCATAAGCACGTGCATTTCAGCAGCAGCTTCACCTCCATCGCCTC  296

Query  261  GGAGTGGTTTTTAATTGCCAACAGATCCTACAAAGTCAGTGCAGCAAGCTCTTTTTTCTTCAGTGGTGTATTTG  334
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GGAGTGGTTTTTAATTGCCAACAGATCCTACAAAGTCAGTGCAGCAAGCTCTTTTTTCTTCAGTGGTGTATTTG  370

Query  335  TTGGAGTTATCTCTTTTGGTCAGCTTTCAGATCGCTTCGGAAGGAAAAAAGTCTATCTCACAGGTTTTGCTCTT  408
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TTGGAGTTATCTCTTTTGGTCAGCTTTCAGATCGCTTCGGAAGGAAAAAAGTCTATCTCACAGGTTTTGCTCTT  444

Query  409  GACATCTTATTTGCAATTGCAAATGGATTTTCCCCCTCATATGAGTTCTTTGCAGTAACTCGCTTCCTGGTGGG  482
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GACATCTTATTTGCAATTGCAAATGGATTTTCCCCCTCATATGAGTTCTTTGCAGTAACTCGCTTCCTGGTGGG  518

Query  483  CATGATGAATGGAGGGATGTCGCTGGTGGCCTTTGTCTTGCTTAATGAGTGTGTGGGCACCGCCTACTGGGCAC  556
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CATGATGAATGGAGGGATGTCGCTGGTGGCCTTTGTCTTGCTTAATGAATGTGTGGGCACCGCCTACTGGGCAC  592

Query  557  TTGCAGGATCGATTGGCGGCCTCTTCTTTGCAGTTGGCATTGCCCAATATGCCCTGTTAGGATACTTCATCCGC  630
            ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TTGCAGGATCGATTGGCGGCCTGTTCTTTGCAGTTGGCATTGCCCAATATGCCCTGTTAGGATACTTCATCCGC  666

Query  631  TCCTGGAGGACCCTAGCCATTCTGGTTAACCTGCAGGGAACGGTGGTCTTTCTCTTATCTTTATTCATTCCTGA  704
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TCCTGGAGGACCCTAGCCATTCTGGTTAACCTGCAGGGAACGGTGGTCTTTCTCTTATCTTTATTCATTCCTGA  740

Query  705  ATCACCTCGTTGGTTATACTCCCAGGGTCGACTGAGTGAGGCTGAAGAGGCGCTGTACCTCATTGCCAAGAGGA  778
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  ATCACCTCGTTGGTTATACTCCCAGGGTCGACTGAGTGAGGCTGAAGAGGCGCTGTACCTCATTGCCAAGAGGA  814

Query  779  ACCGCAAACTCAAGTGCACGTTCTCACTAACACACCCAGCCAACAGGAGCTGCAGGGAGACTGGAAGTTTCCTG  852
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  ACCGCAAACTCAAGTGCACGTTCTCACTAACACACCCAGCCAACAGGAGCTGCAGGGAGACTGGAAGTTTCCTG  888

Query  853  GATCTCTTTCGTTACCGGGTCCTGTTAGGACACACTTTGATCCTGATGTTCATCTGGTTTGTGTGCAGCTTGGT  926
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GATCTCTTTCGTTACCGGGTCCTGTTAGGACACACTTTGATCCTGATGTTCATCTGGTTTGTGTGCAGCTTGGT  962

Query  927  GTATTATGGCCTAACTCTGAGTGCGGGTGATCTAGGTGGAAGTATTTATGCCAACCTGGCCCTGTCTGGCCTCA  1000
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GTATTATGGCCTAACTCTGAGTGCGGGTGATCTAGGTGGAAGTATTTATGCCAACCTGGCCCTGTCTGGCCTCA  1036

Query 1001  TAGAGATTCAATCTTACCCTCTCTGTATCTACTTGATTAACCAAAAATGGTTTGGTCGGAAGCGAACATTATCA  1074
            |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TAGAGATTCCATCTTACCCTCTCTGTATCTACTTGATTAACCAAAAATGGTTTGGTCGGAAGCGAACATTATCA  1110

Query 1075  GCATTTCTGTGCCTAGGAGGACTGGCTTGTCTTATTGTAATGTTTCTTCCAGAAAAGAAAG-ACAC---AGGTG  1144
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||.
Sbjct 1111  GCATTTCTGTGCCTAGGAGGACTGGCTTGTCTTATTGTAATGTTTCTTCCAGAAAAGAAAGCACACCTGAGGTA  1184

Query 1145  TGTTTGCAGTGGTGAACAGCCATT-CCTTGTCCTTGCTGGGGAAGCTGACCATCAGTGCTGCCTTTAACATTGT  1217
            ||             ||||..||| ||||          ||||| |||                       |||
Sbjct 1185  TG-------------ACAGTGATTGCCTT----------GGGAA-CTG-----------------------TGT  1211

Query 1218  TTATATCTACACCTCTGAGCTTTACCCTACAGTCATCAGGAATGTTGGGCTTGGAACTTGTTCCATGTTCTCCC  1291
            ||                                          ||||.|.||           ||.||||   
Sbjct 1212  TT------------------------------------------TTGGCCGTG-----------ATTTTCT---  1229

Query 1292  GAGTTGGTGGGATTATTG-CTCCCTTCATC-CCCTCA--CTGAAATATGTGCAATGGTCTTTACCATTCATTGT  1361
             ||..||.||    |.|| .||.|..||.| |.||||  |||.|..|||||..|                    
Sbjct 1230  -AGAAGGAGG----AGTGAGTCACAACAACTCTCTCATGCTGGAGCATGTGATA--------------------  1278

Query 1362  CTTCGGAGCCACGGGTCTGACCTCCGGCCTCCTGAGTTTGTTATTGCCGGAGACCCTTAACAGTCCGCTGCTAG  1435
                                                                                      
Sbjct 1279  --------------------------------------------------------------------------  1278

Query 1436  AAACATTCTCCGACCTTCAGGTGTATTCGTATCGCAGGCTGGGAGAAGAAGCATTATCTTTACAGGCTTTGGAC  1509
                                                                                      
Sbjct 1279  --------------------------------------------------------------------------  1278

Query 1510  CCCCAACAGTGTGTGGACAAGGAGAGCTCTTTAGGGAGTGAGAGTGAGGAAGAGGAAGAATTTTATGATGCAGA  1583
                                                                                      
Sbjct 1279  --------------------------------------------------------------------------  1278

Query 1584  TGAAGAGACTCAGATGATCAAG  1605
                                  
Sbjct 1279  ----------------------  1278