Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_12223
• Subject: NM_001127370.3
• Aligned Length: 1362
• Identities: 1257
• Gaps: 105

Alignment

Query    1  ATGGAGTTGGCGACTCGCTACCAGATCCCTAAAGAAGTGGCTGACATCTTTAACGCCCCCAGTGATGATGAAGA  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  GTTTGTTGGCTTCCGAGATGATGTTCCCATGGAAACCCTCTCGTCAGAGGAGAGCTGCGATAGTTTTGACTCAC  148
                                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ----------------------------ATGGAAACCCTCTCGTCAGAGGAGAGCTGCGATAGTTTTGACTCAC  46

Query  149  TAGAGTCAGGGAAA---CAGGATGTGCGCTTTCATTCCAAATACTTCACAGAAGAGCTAAGAAGAATTTTTATA  219
            ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   47  TAGAGTCAGGGAAACAGCAGGATGTGCGCTTTCATTCCAAATACTTCACAGAAGAGCTAAGAAGAATTTTTATA  120

Query  220  GAGGACACTGACTCAGAGACTGAGGATTTTGCAGGATTTACGCAGAGTGATCTGAATGGAAAGACTAACCCAGA  293
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  121  GAGGACACTGACTCAGAGACTGAGGATTTTGCAGGATTTACGCAGAGTGATCTGAATGGAAAGACTAACCCAGA  194

Query  294  AGTAATGGTCGTGGAGTCAGATTTGAGTGATGATGGCAAAGCATCTTTGGTGAGCGAGGAAGAGGAAGATGAAG  367
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  195  AGTAATGGTCGTGGAGTCAGATTTGAGTGATGATGGCAAAGCATCTTTGGTGAGCGAGGAAGAGGAAGATGAAG  268

Query  368  AAGAAGATAAGGCTACCCCTAGAAGAAGCAGGTCTAGAAGAAGTAGTATTGGTCTTCGAGTAGCCTTTCAGTTC  441
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  269  AAGAAGATAAGGCTACCCCTAGAAGAAGCAGGTCTAGAAGAAGTAGTATTGGTCTTCGAGTAGCCTTTCAGTTC  342

Query  442  CCCACCAAGAAGCTGGCCAACAAACCAGATAAAAACAGTTCTTCCGAGCAGTTGTTTTCTAGCGCACGCTTACA  515
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  343  CCCACCAAGAAGCTGGCCAACAAACCAGATAAAAACAGTTCTTCCGAGCAGTTGTTTTCTAGCGCACGCTTACA  416

Query  516  GAATGAGAAAAAAACAATTCTTGAAAGAAAGAAAGACTGTAGACAGGTGATACAAAGGGAAGATTCTACCTCTG  589
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  417  GAATGAGAAAAAAACAATTCTTGAAAGAAAGAAAGACTGTAGACAGGTGATACAAAGGGAAGATTCTACCTCTG  490

Query  590  AGTCTGAGGATGACTCTCGGGATGAGAGCCAGGAGAGTTCAGATGCTTTGCTGAAAAGGACCATGAACATCAAG  663
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  491  AGTCTGAGGATGACTCTCGGGATGAGAGCCAGGAGAGTTCAGATGCTTTGCTGAAAAGGACCATGAACATCAAG  564

Query  664  GAGAACAAAGCCATGCTTGCCCAGTTATTGGCGGAATTGAACTCGATGCCAGATTTCTTCCCAGTACGAACCCC  737
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  565  GAGAACAAAGCCATGCTTGCCCAGTTATTGGCGGAATTGAACTCGATGCCAGATTTCTTCCCAGTACGAACCCC  638

Query  738  AACCTCAGCTTCTAGGAAGAAGACAGTGAGGCGGGCCTTCTCGGAGGGACAGATCACGCGGCGTATGAACCCAA  811
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  639  AACCTCAGCTTCTAGGAAGAAGACAGTGAGGCGGGCCTTCTCGGAGGGACAGATCACGCGGCGTATGAACCCAA  712

Query  812  CCCGGAGTGCGCGGCCTCCTGAGAAGTTTGCTCTAGAGAACTTCACTGTCTCAGCCGCTAAATTTGCGGAAGAG  885
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  713  CCCGGAGTGCGCGGCCTCCTGAGAAGTTTGCTCTAGAGAACTTCACTGTCTCAGCCGCTAAATTTGCGGAAGAG  786

Query  886  TTTTACAGCTTCCGAAGAAGGAAGACAATTGGGGGGAAATGCCGGGAGTACAGACGACGTCACCGTATATCTTC  959
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  787  TTTTACAGCTTCCGAAGAAGGAAGACAATTGGGGGGAAATGCCGGGAGTACAGACGACGTCACCGTATATCTTC  860

Query  960  TTTTCGGCCAGTGGAGGATATCACCGAAGAGGACTTAGAAAATGTTGCCATAACTGTTCGAGATAAAATCTATG  1033
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  861  TTTTCGGCCAGTGGAGGATATCACCGAAGAGGACTTAGAAAATGTTGCCATAACTGTTCGAGATAAAATCTATG  934

Query 1034  ATAAAGTTCTGGGTAACACGTGCCATCAGTGTCGACAAAAGACCATCGACACCAAGACAGTGTGTCGGAACCAG  1107
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  935  ATAAAGTTCTGGGTAACACGTGCCATCAGTGTCGACAAAAGACCATCGACACCAAGACAGTGTGTCGGAACCAG  1008

Query 1108  GGTTGCTGTGGTGTGCGAGGACAGTTCTGTGGACCATGCCTGCGGAACCGCTATGGGGAGGATGTCAGATCGGC  1181
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1009  GGTTGCTGTGGTGTGCGAGGACAGTTCTGTGGACCATGCCTGCGGAACCGCTATGGGGAGGATGTCAGATCGGC  1082

Query 1182  ATTGCTGGACCCGGATTGGGTGTGTCCCCCCTGTCGTGGGATCTGCAATTGCAGCTACTGTCGGAAGCGTGACG  1255
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1083  ATTGCTGGACCCGGATTGGGTGTGTCCCCCCTGTCGTGGGATCTGCAATTGCAGCTACTGTCGGAAGCGTGACG  1156

Query 1256  GCCGCTGTGCCACAGGAATCCTCATTCATCTGGCCAAGTTTTATGGTTATGACAATGTTAAGGAATATCTGGAG  1329
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1157  GCCGCTGTGCCACAGGAATCCTCATTCATCTGGCCAAGTTTTATGGTTATGACAATGTTAAGGAATATCTGGAG  1230

Query 1330  AGCTTACAAAAGGAGCTGGTAGAAGACAAT  1359
            ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1231  AGCTTACAAAAGGAGCTGGTAGAAGACAAT  1260