Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_12238
- Subject:
- XM_006522722.2
- Aligned Length:
- 2495
- Identities:
- 1882
- Gaps:
- 316
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGGCGTTCCCTCACCTACAACAGCCTAGTTTCCTTCTGGCTAGCCTGAAAGCTGACTCTATAAATAAGCCCTT 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 TGCACAACGTTGCCAAGATTTGGTGAAAGTCATTGAGGATTTTCCAGCCAAGGAATTGCATGCCGTCTTCCCAT 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 149 GGCTGGTGGAAAGCATCTTTGGCAGCCTGGATGGTGTCCTTGTTGGTTGGAATCTCCGATGCCTACAGGGACGT 222
Query 1 ------------------------------------------------------ATGATGAAGTTGGTTTATAA 20
||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GTGAACCCTGTGGAGTACAGCACAGCGATGGAATTTCTAGACCCAAGTGGTCCAATGATGAAGTTGGTTTATAA 296
Query 21 GCTTCAAGCTGAAGACTATAAGTTCGACTTTCCTGTCTCCT-ACTTGCCTGGTCCTGTGAAGGCGTCCATCCAG 93
.||||||||||||||||||||.||.||.||||||||||||| .||| |||||.|||||||||||.|||||.||.
Sbjct 297 ACTTCAAGCTGAAGACTATAACTTTGATTTTCCTGTCTCCTGTCTT-CCTGGCCCTGTGAAGGCATCCATTCAA 369
Query 94 GAG--TGCATCCTCCCTGACAGTCCTCTGTACCACAACAAGGTCCAGTTCACCCCTACTGGGGGCCTTGGTCTG 165
||| || |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||..||||.||.||.||||||||.|||
Sbjct 370 GAGAATG--TCCTCCCTGACAGTCCTCTGTACCACAACAAAGTCCAGTTTCCCCCGACCGGAGGCCTTGGCCTG 441
Query 166 AACTTGGCCCTGAATCCGTTCGAGTATTACATATTCTTCTTTGCCTTGAGCCTCATCACTCAGAAGCCACTTCC 239
|||.|||||||.|||||.||.||.||.||.||.||||.||||||.||||||||||||.||||.||||||.|..|
Sbjct 442 AACCTGGCCCTCAATCCATTTGAATACTATATGTTCTACTTTGCTTTGAGCCTCATCTCTCAAAAGCCAATGTC 515
Query 240 TGTGTCCCTCCACGTCCGTACTTCAGACTGTGCCTATTTCATCCTGGTGGACAGGTACCTGTCATGGTTCCTGC 313
|.||.|||||||.|||||||||||.||||||||||||||||.|||||||||.||||||||.|||||||||||.|
Sbjct 516 TATGACCCTCCATGTCCGTACTTCGGACTGTGCCTATTTCACCCTGGTGGATAGGTACCTATCATGGTTCCTAC 589
Query 314 CCACCGAAGGCAGTGTGCCCCCACCACTCTCCTCCAGCCCAGGGGGGACCAGCCCCTCACCACCTCCCAGGACA 387
||||.||||||||.||.||.||||||||||.||||||.|||||.||..||||||||||||||.|||||||.|||
Sbjct 590 CCACTGAAGGCAGCGTACCTCCACCACTCTGCTCCAGTCCAGGAGGCTCCAGCCCCTCACCAGCTCCCAGAACA 663
Query 388 CCAGCCATACCCTTTGCTTCCTATGGCCTCCACCACACTAGCCTCCTAAAGCGACACATCTCTCATCAGACATC 461
||||||||.||||||||.||||||||||| |||||||||||||.|.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 664 CCAGCCATGCCCTTTGCCTCCTATGGCCT---CCACACTAGCCTCTTGAAGCGACACATCTCTCATCAGACATC 734
Query 462 TGTGAATGCAGACCCCGCCTCCCACGAGATCTGGAGGTCAGAAACTCTGCTCCAGGTTTTTGTTGAAATGTGGC 535
|||||||||||||||.||.|||||.|||||||||.|||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 735 TGTGAATGCAGACCCTGCATCCCATGAGATCTGGCGGTCAGAAACTCTCCTCCAGGTTTTTGTGGAAATGTGGC 808
Query 536 TTCATCACTATTCCTTGGAGATGTATCAAAAAATGCAGTCCCCTCATGCCAAGCTGGAGGTTCTGCACTACCGA 609
|||||||.||.|||.||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.||||||||||.|||||||||
Sbjct 809 TTCATCATTACTCCCTGGAGATGTACCAAAAAATGCAGTCCCCTCATGCCAAGTTGGAGGTTCTACACTACCGA 882
Query 610 CTCAGTGTCTCCAGCGCCCTCTACAGCCCCGCCCAACCCAGCCTCCAGGCCCTCCACGCCTACCAAGAGTCGTT 683
||||.||||||||||||||||.|||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 883 CTCACTGTCTCCAGCGCCCTCCACAGCCCTGCCCAACCCAGCCTCCAGGCCCTCCACGCCTACCAAGAGTCCTT 956
Query 684 CACGCCTACTGAGGAGCATGTGTTGGTGGTGCGCCTGCTGCTGAAGCACCTGCACGCCTTTGCCAACAGCCTGA 757
||||||||||||.|||||.|||.|||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 957 CACGCCTACTGAAGAGCACGTGCTGGTGGTACGCCTGCTGCTGAAGCACCTGCATGCCTTTGCCAACAGCCTGA 1030
Query 758 AGCCAGAGCAGGCCTCACCCTCCGCCCACTCCCACGCCACCAGCCCCCTGGAGGAGTTCAAACGGGCTGCTGTC 831
|||||||.|||||.||.||.||.||.||||||||.||||||||.||.||||||||.|||||||||||.||.||.
Sbjct 1031 AGCCAGATCAGGCTTCGCCATCTGCACACTCCCATGCCACCAGTCCGCTGGAGGAATTCAAACGGGCCGCAGTG 1104
Query 832 CCGAGGTTCGTCCAGCAGAAACTCTACCTCTTCTTGCAGCATTGCTTTGGCCACTGGCCCCTGGACGCATCGTT 905
||..|.||.|||||||||||.||.|||.|||||.|||||||.||.||||||||||||||.|||||.|||.|.||
Sbjct 1105 CCTCGCTTTGTCCAGCAGAAGCTGTACGTCTTCCTGCAGCACTGTTTTGGCCACTGGCCTCTGGATGCAACCTT 1178
Query 906 CAGAGCTGTCCTGGAGATGTGGCTGAGCTACCTGCAGCCGTGGCGGTACGCGCCTGACAAGCAGGCTCCGGGCA 979
||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||.|||.||||.||.|||||.||.|||||||.|||||
Sbjct 1179 CAGAGCTGTCTTGGAGATGTGGCTGAGCTACCTGCAGCCATGGAGGTATGCCCCTGAGAAACAGGCTCAGGGCA 1252
Query 980 GCGACTCCCAGCCCCGGTGTGTGTCGGAGAAATGGGCACCCTTTGTCCAGGAGAACCTGCTGATGTACACCAAG 1053
||||..|||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||..|||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1253 GCGATCCCCAGCCACGGTGTGTGTCAGAGAAGTGGGCACCCTTCATCCAGGAAAACCTGCTGATGTACACCAAG 1326
Query 1054 TTGTTTGTGGGCTTTCTGAACCGCGCGCTCCGCACAGACCTGGTCAGCCCCAAGCACGCGCTCATGGTGTTCCG 1127
.||||||||.|||||||||||||.||.||.|||||||||||.||||||||||||.|.||.||||||||.|||||
Sbjct 1327 CTGTTTGTGAGCTTTCTGAACCGTGCCCTACGCACAGACCTTGTCAGCCCCAAGAATGCACTCATGGTCTTCCG 1400
Query 1128 AGTGGCCAAAGTCTTTGCCCAGCCCAACCTGGCTGAGATGATTCAGAAAGGTGAGCAGCTATTCCTGGAGCCAG 1201
||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|
Sbjct 1401 AGTGGCTAAGGTCTTTGCCCAGCCCAACCTGGCTGAGATGATCCAGAAAGGTGAGCAGCTGTTCCTGGAGCCGG 1474
Query 1202 AGCTGGTCATCCCCCACCGCCAGCACCGACTCTTCACGGCCCCCACATTCACTGGGAGCTTCCTGTCACCCTGG 1275
||||..||||||||||||||||.|||||.||||||||.|.|.|||| .||||||||||||||.|||
Sbjct 1475 AGCTCATCATCCCCCACCGCCAACACCGGCTCTTCACAGTCACCAC---------CAGCTTCCTGTCACCATGG 1539
Query 1276 CCACCAGCGGTCACTGATGCCTCCTTCAAGGTGAAGAGCCACGTCTACAGCCTGGAGGGCCAGGACTGCAAGTA 1349
||.||.|..||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||.||||||||.||
Sbjct 1540 CCCCCTGTTGTGACAGATGCCTCCTTCAAGGTGAAGAGCCATGTCTATAGCCTAGAGGGCCAAGACTGCAAATA 1613
Query 1350 CACCCCGATGTTTGGGCCCGAGGCCCGCACCCTGGTCCTGCGCCTCGCTCAGCTCATCACACAGGCCAAACACA 1423
.|||||.||||||||.||.||...|||.|||||||||.|||||||.|||||||||||||||||||||||.||.|
Sbjct 1614 TACCCCAATGTTTGGTCCTGAAATCCGAACCCTGGTCTTGCGCCTTGCTCAGCTCATCACACAGGCCAAGCAGA 1687
Query 1424 CAGCCAAGTCCATCTCCGACCAGTGTGCGGAGAGCCCGGCTGGCCACTCCTTCCTCTCATGGCTGGGCTTTAGC 1497
|.||||||||||||||.||.||||.||.|||.|||||..||||||.|||||||||.|||||||||..||||.||
Sbjct 1688 CTGCCAAGTCCATCTCTGATCAGTATGTGGAAAGCCCAACTGGCCGCTCCTTCCTGTCATGGCTGACCTTTGGC 1761
Query 1498 TCCATGGACACCAATGGCTCCTACACAGCCAACGACCTGGACGAGATGGGGCAAGACAGTGTCCGGAAGACAGA 1571
..||..|||||.|||.|||.||||.|||||||.||||||||.||.||.||.||.|||||..||||.||||||||
Sbjct 1762 CTCACAGACACAAATAGCTGCTACCCAGCCAATGACCTGGATGAAATAGGTCAGGACAGCATCCGCAAGACAGA 1835
Query 1572 TGAATACCTGGAGAAGGCCCTGGAGTACCTGCGCCAGATATTCCGGCTCAGCGAAGCGCAGCTCAGG--CAGTT 1643
.||.|||.|.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||| || |||.|
Sbjct 1836 CGAGTACTTAGAAAAGGCCCTGGAGTACCTGCGCCAGATATTCCGGCTCAGCGAAGCCCAGCT--GGCCCAGCT 1907
Query 1644 CACACTCGCCTTGGGCACCACCCAGGATGAGAATGGAAAAAAGCAACTCCCCGACTGCATCGTGGGTGAGGACG 1717
|||.||.|||.||||.|...|.|.|||.||||||||.||..||||.|||||.||.|||||.|||||.||.||.|
Sbjct 1908 CACGCTTGCCCTGGGGAGTGCTCGGGACGAGAATGGGAAGCAGCAGCTCCCAGATTGCATTGTGGGGGAAGAAG 1981
Query 1718 GACTCATCCTTACGCCCCTGGGGCGGTACCAGATCATCAATGGGCTGCGAAGGTTTGAAATTGAGTACCAGGGG 1791
|||||||||||||.|||.||||.||.|||||||||||.|||||.|||||||||||.||.||||||||||||||.
Sbjct 1982 GACTCATCCTTACACCCTTGGGCCGCTACCAGATCATTAATGGTCTGCGAAGGTTCGAGATTGAGTACCAGGGA 2055
Query 1792 GACCCGGAGCTGCAGCCCATCCGGAGCTATGAGATCGCCAGCTTGGTCCGCACACTCTTTAGGCTGTCGTCTGC 1865
|||...|||||||||||||||||||||||.||.|||.||||..|||||||..|||||||..|||||||.|||||
Sbjct 2056 GACTTAGAGCTGCAGCCCATCCGGAGCTACGAAATCACCAGTCTGGTCCGTGCACTCTTCCGGCTGTCCTCTGC 2129
Query 1866 CATCAACCACAGATTTGCAGGACAGATGGCGGCTCTGTGTTCCCGGGATGACTTCCTCGGCAGCTTCTGTCGCT 1939
||||||||..|||||||||||.||||||||.||||||||.||||||.||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 2130 CATCAACCGTAGATTTGCAGGCCAGATGGCAGCTCTGTGCTCCCGGAATGACTTCCTTGGCAGCTTCTGTCGCT 2203
Query 1940 ACCACCTCACAGAACCTGGGCTGGCCAGCAGGCACCTGCTGAGCCCTGTGGGGCGGAGGCAGGTGGCCGGCCAC 2013
||||||||||.||.||||...||..||.|||.||.||||||||||||||.|||||||||||||| |
Sbjct 2204 ACCACCTCACTGAGCCTGCCTTGAGCAACAGACATCTGCTGAGCCCTGTAGGGCGGAGGCAGGT---------C 2268
Query 2014 ACC---------CGCGGCCCCAGGCTCAGCCTGCGCTTCCTGGGCAGTTACCGGACGCTGGTCTCGCTGCTGCT 2078
||| ||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.|||.||..|||.|||.|
Sbjct 2269 ACCAATCCTGCACGGGGCCCCAGGCTCAGCCTCCGTTTCCTGGGCAGTTACCGGACACTGCTCCTGCTCCTGAT 2342
Query 2079 GGCCTTCTTCGTGGCCTCTCTGTTCTGCGTCGGGCCCCTCCCATGCACGCTGCTGCTCACCCTGGGCTATGTCC 2152
|||||||||.|||||.||||||||||||.|.||||||||..|.|||.|..||||.||...|||.||.||.||||
Sbjct 2343 GGCCTTCTTTGTGGCTTCTCTGTTCTGCATTGGGCCCCTGTCCTGCTCCTTGCTCCTGGTCCTAGGATACGTCC 2416
Query 2153 TCTACGCCTCTGCCATGACACTGCTGACCGAGCGGGGGAAGCTGCACCAGCCC 2205
||||.|||...||.|||||||||||.||.||.|||||||||||||||||||.|
Sbjct 2417 TCTATGCCATAGCTATGACACTGCTCACTGAACGGGGGAAGCTGCACCAGCTC 2469