Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_12258
• Subject: NM_001300750.1
• Aligned Length: 1500
• Identities: 1334
• Gaps: 141

Alignment

Query    1  ATGG---------AAGC---------ACCTGACTACGAAGTGCTATCCGTGCGAG-AACAGCTATTCCACGAGA  55
            ||||         ||||         ||||      |||||           ||| |||.|||           
Sbjct    1  ATGGTTAATGTGAAAGCCCTTTGTGAACCT------GAAGT-----------GAGCAACTGCT-----------  46

Query   56  GGATCCGCGAGTGT-ATTATATCAACA--CTTCTGTTTGCAACACTGTACATCCTCTGCCACATCTTCC-----  121
            ||||    ||.||| ||||.....|||  | |||||.| ||.|        ||||||.|.|...|||||     
Sbjct   47  GGAT----GAATGTCATTACGGGCACAGGC-TCTGTGT-CATC--------TCCTCTCCTAGTGCTTCCACAGC  106

Query  122  --TGACCCG----CTTCAAGAAGCCTGCTGAGTTCACCACAGTGGATGATGAAGATGCCACCGTCAACAAGATT  189
              .||||.|    ||.|..||.|.|||..||    ||  |.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  107  CAGGACCAGAGACCTCCCTGATGACTGGGGA----AC--CTGTGGATGATGAAGATGCCACCGTCAACAAGATT  174

Query  190  GCGCTCGAGCTGTGCACCTTTACCCTGGCAATTGCCCTGGGTGCTGTCCTGCTCCTGCCCTTCTCCATCATCAG  263
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  175  GCGCTCGAGCTGTGCACCTTTACCCTGGCAATTGCCCTGGGTGCTGTCCTGCTCCTGCCCTTCTCCATCATCAG  248

Query  264  CAATGAGGTGCTGCTCTCCCTGCCTCGGAACTACTACATCCAGTGGCTCAACGGCTCCCTCATCCATGGCCTCT  337
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  249  CAATGAGGTGCTGCTCTCCCTGCCTCGGAACTACTACATCCAGTGGCTCAACGGCTCCCTCATCCATGGCCTCT  322

Query  338  GGAACCTTGTTTTTCTCTTCTCCAACCTGTCCCTCATCTTCCTCATGCCCTTTGCATATTTCTTCACTGAGTCT  411
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  323  GGAACCTTGTTTTTCTCTTCTCCAACCTGTCCCTCATCTTCCTCATGCCCTTTGCATATTTCTTCACTGAGTCT  396

Query  412  GAGGGCTTTGCTGGCTCCAGAAAGGGTGTCCTGGGCCGGGTCTATGAGACAGTGGTGATGTTGATGCTCCTCAC  485
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  397  GAGGGCTTTGCTGGCTCCAGAAAGGGTGTCCTGGGCCGGGTCTATGAGACAGTGGTGATGTTGATGCTCCTCAC  470

Query  486  TCTGCTGGTGCTAGGTATGGTGTGGGTGGCATCAGCCATTGTGGACAAGAACAAGGCCAACAGAGAGTCACTCT  559
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  471  TCTGCTGGTGCTAGGTATGGTGTGGGTGGCATCAGCCATTGTGGACAAGAACAAGGCCAACAGAGAGTCACTCT  544

Query  560  ATGACTTTTGGGAGTACTATCTCCCCTACCTCTACTCATGCATCTCCTTCCTTGGGGTTCTGCTGCTCCTGTTG  633
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  545  ATGACTTTTGGGAGTACTATCTCCCCTACCTCTACTCATGCATCTCCTTCCTTGGGGTTCTGCTGCTCCTGGTG  618

Query  634  TGTACTCCACTGGGTCTCGCCCGCATGTTCTCCGTCACTGGGAAGCTGCTAGTCAAGCCCCGGCTGCTGGAAGA  707
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  619  TGTACTCCACTGGGTCTCGCCCGCATGTTCTCCGTCACTGGGAAGCTGCTAGTCAAGCCCCGGCTGCTGGAAGA  692

Query  708  CCTGGAGGAGCAGCTGTACTGCTCAGCCTTTGAGGAGGCAGCCCTGACCCGCAGGATCTGTAATCCTACTTCCT  781
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  693  CCTGGAGGAGCAGCTGTACTGCTCAGCCTTTGAGGAGGCAGCCCTGACCCGCAGGATCTGTAATCCTACTTCCT  766

Query  782  GCTGGCTGCCTTTAGACATGGAGCTGCTACACAGACAGGTCCTGGCTCTGCAGACACAGAGGGTCCTGCTGGAG  855
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  767  GCTGGCTGCCTTTAGACATGGAGCTGCTACACAGACAGGTCCTGGCTCTGCAGACACAGAGGGTCCTGCTGGAG  840

Query  856  AAGAGGCGGAAGGCTTCAGCCTGGCAACGGAACCTGGGCTACCCCCTGGCTATGCTGTGCTTGCTGGTGCTGAC  929
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  841  AAGAGGCGGAAGGCTTCAGCCTGGCAACGGAACCTGGGCTACCCCCTGGCTATGCTGTGCTTGCTGGTGCTGAC  914

Query  930  GGGCCTGTCTGTGCTCATTGTGGCCATCCACATCCTGGAGCTGCTCATCGATGAGGCTGCCATGCCCCGAGGCA  1003
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  915  GGGCCTGTCTGTGCTCATTGTGGCCATCCACATCCTGGAGCTGCTCATCGATGAGGCTGCCATGCCCCGAGGCA  988

Query 1004  TG------------------------------------------------------------CAGGTTGTACTC  1017
            ||                                                            ||||||||||||
Sbjct  989  TGCAGGGTACCTCCTTAGGCCAGGTCTCCTTCTCCAAGCTGGGCTCCTTTGGTGCCGTCATTCAGGTTGTACTC  1062

Query 1018  ATCTTTTACCTAATGGTGTCCTCAGTTGTGGGCTTCTATAGCTCTCCACTCTTCCGGAGCCTGCGGCCCAGATG  1091
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1063  ATCTTTTACCTAATGGTGTCCTCAGTTGTGGGCTTCTATAGCTCTCCACTCTTCCGGAGCCTGCGGCCCAGATG  1136

Query 1092  GCACGACACTGCCATGACGCAGATAATTGGGAACTGTGTCTGTCTCCTGGTCCTAAGCTCAGCACTTCCTGTCT  1165
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1137  GCACGACACTGCCATGACGCAGATAATTGGGAACTGTGTCTGTCTCCTGGTCCTAAGCTCAGCACTTCCTGTCT  1210

Query 1166  TCTCTCGAACCCTGGGGCTCACTCGCTTTGACCTGCTGGGTGACTTTGGACGCTTCAACTGGCTGGGCAATTTC  1239
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1211  TCTCTCGAACCCTGGGGCTCACTCGCTTTGACCTGCTGGGTGACTTTGGACGCTTCAACTGGCTGGGCAATTTC  1284

Query 1240  TACATTGTGTTCCTCTACAACGCAGCCTTTGCAGGCCTCACCACACTCTGTCTGGTGAAGACCTTCACTGCAGC  1313
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1285  TACATTGTGTTCCTCTACAACGCAGCCTTTGCAGGCCTCACCACACTCTGTCTGGTGAAGACCTTCACTGCAGC  1358

Query 1314  TGTGCGGGCAGAGCTGATCCGGGCCTTTGGGCTGGACAGACTGCCGCTGCCCGTCTCCGGTTTCCCCCAGGCAT  1387
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1359  TGTGCGGGCAGAGCTGATCCGGGCCTTTGGGCTGGACAGACTGCCGCTGCCCGTCTCCGGTTTCCCCCAGGCAT  1432

Query 1388  CTAGGAAGACCCAGCACCAG  1407
            ||||||||||||||||||||
Sbjct 1433  CTAGGAAGACCCAGCACCAG  1452