Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_12258
- Subject:
- NM_029098.3
- Aligned Length:
- 1467
- Identities:
- 1266
- Gaps:
- 60
Alignment
Query 1 ATGGAAGCACCTGACTACGAAGTGCTATCCGTGCGAGAACAGCTATTCCACGAGAGGATCCGCGAGTGTATTAT 74
|||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||.||||||||||.||.||
Sbjct 1 ATGGAAGCAGCTGACTACGAAGTGCTATCCGTGCGAGAACAGCTGTTCCACGACAGGGTCCGCGAGTGCATCAT 74
Query 75 ATCAACACTTCTGTTTGCAACACTGTACATCCTCTGCCACATCTTCCTGACCCGCTTCAAGAAGCCTGCTGAGT 148
.||||.||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CTCAATACTTCTGTTTGCAACACTCTACATCCTCTGCCATATCTTCCTGACCCGCTTCAAGAAGCCTGCTGAGT 148
Query 149 TCACCACAGTGGATGATGAAGATGCCACCGTCAACAAGATTGCGCTCGAGCTGTGCACCTTTACCCTGGCAATT 222
||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||..|.
Sbjct 149 TCACCACAGTGGATGATGAAGATGCCACAGTTAACAAGATTGCGCTGGAGCTGTGCACCTTTACCCTGGCGGTC 222
Query 223 GCCCTGGGTGCTGTCCTGCTCCTGCCCTTCTCCATCATCAGCAATGAGGTGCTGCTCTCCCTGCCTCGGAACTA 296
||||||||.||.|||.|.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||..||||.||.|||||
Sbjct 223 GCCCTGGGCGCCGTCTTACTCCTGCCCTTCTCCATCATCAGCAACGAGGTGCTGCTCTCGTTGCCACGCAACTA 296
Query 297 CTACATCCAGTGGCTCAACGGCTCCCTCATCCATGGCCTCTGGAACCTTGTTTTTCTCTTCTCCAACCTGTCCC 370
||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||
Sbjct 297 CTACATCCAGTGGCTCAATGGCTCCCTCATCCATGGTCTGTGGAACCTCGTTTTCCTCTTCTCCAATCTGTCCC 370
Query 371 TCATCTTCCTCATGCCCTTTGCATATTTCTTCACTGAGTCTGAGGGCTTTGCTGGCTCCAGAAAGGGTGTCCTG 444
||.|||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 TCGTCTTCCTTATGCCCTTTGCATATTTCTTCACAGAGTCTGAAGGCTTTGCTGGCTCCAGAAAGGGTGTCCTG 444
Query 445 GGCCGGGTCTATGAGACAGTGGTGATGTTGATGCTCCTCACTCTGCTGGTGCTAGGTATGGTGTGGGTGGCATC 518
|||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||.||.|||||||||||||||||
Sbjct 445 GGCCGGGTCTACGAGACAGTGGTGATGTTGATCCTCCTCACGCTGCTTGTGCTGGGCATGGTGTGGGTGGCATC 518
Query 519 AGCCATTGTGGACAAGAACAAGGCCAACAGAGAGTCACTCTATGACTTTTGGGAGTACTATCTCCCCTACCTCT 592
.||||||||.|||||..|||||||||.|||.|||||.|||||.|||||.|||||||||||.||||||||.||||
Sbjct 519 CGCCATTGTAGACAATGACAAGGCCAGCAGGGAGTCGCTCTACGACTTCTGGGAGTACTACCTCCCCTATCTCT 592
Query 593 ACTCATGCATCTCCTTCCTTGGGGTTCTGCTGCTCCTGTTGTGTACTCCACTGGGTCTCGCCCGCATGTTCTCC 666
||||.||.|||||||||||.||.|||||||||||.|||.||||.||||||||.||||||||||||||||||||.
Sbjct 593 ACTCCTGTATCTCCTTCCTCGGAGTTCTGCTGCTTCTGGTGTGCACTCCACTAGGTCTCGCCCGCATGTTCTCT 666
Query 667 GTCACTGGGAAGCTGCTAGTCAAGCCCCGGCTGCTGGAAGACCTGGAGGAGCAGCTGTACTGCTCAGCCTTTGA 740
||||||||||||.||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||.||||||||||||||||
Sbjct 667 GTCACTGGGAAGTTGCTGGTCAAGCCCCGGCTACTGGAAGACCTGGAGGAACAGCTGAACTGCTCAGCCTTTGA 740
Query 741 GGAGGCAGCCCTGACCCGCAGGATCTGTAATCCTACTTCCTGCTGGCTGCCTTTAGACATGGAGCTGCTACACA 814
|||||||||.|||||.||.||.|||||.|||||.||.||||||||||||||..|.||||||||.|||||.||.|
Sbjct 741 GGAGGCAGCTCTGACTCGAAGAATCTGCAATCCCACCTCCTGCTGGCTGCCACTGGACATGGAACTGCTGCATA 814
Query 815 GACAGGTCCTGGCTCTGCAGACACAGAGGGTCCTGCTGGAGAAGAGGCGGAAGGCTTCAGCCTGGCAACGGAAC 888
||||||||||||||||||||.|||||||||||||..||||.|||.|.||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 815 GACAGGTCCTGGCTCTGCAGGCACAGAGGGTCCTCTTGGAAAAGCGTCGGAAGGCGTCAGCCTGGCAACGGAAC 888
Query 889 CTGGGCTACCCCCTGGCTATGCTGTGCTTGCTGGTGCTGACGGGCCTGTCTGTGCTCATTGTGGCCATCCACAT 962
|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||..|||||||
Sbjct 889 CTGGGCTACCCTCTGGCCATGCTGTGCTTGCTGGTGCTGACGGGCCTGTCTGTCCTCATCGTGGCTGTCCACAT 962
Query 963 CCTGGAGCTGCTCATCGATGAGGCTGCCATGCCCCGAGGCATG------------------------------- 1005
||||||||||||.||.||.||||||||||||||.||.||||||
Sbjct 963 CCTGGAGCTGCTTATTGACGAGGCTGCCATGCCACGGGGCATGCAGGATGCTGCCCTAGGCCAGGCCTCCTTCT 1036
Query 1006 -----------------------------CAGGTTGTACTCATCTTTTACCTAATGGTGTCCTCAGTTGTGGGC 1050
||||||||.||.||.||||||||.||||||||||||||.|||||.
Sbjct 1037 CCAAACTGGGATCCTTTGGCGCCATCATCCAGGTTGTGCTGATATTTTACCTGATGGTGTCCTCAGTGGTGGGT 1110
Query 1051 TTCTATAGCTCTCCACTCTTCCGGAGCCTGCGGCCCAGATGGCACGACACTGCCATGACGCAGATAATTGGGAA 1124
|||||.||||||||||||||..|.||||||.||||.||.|||||.|||||..|.|||||.|||||.||||||||
Sbjct 1111 TTCTACAGCTCTCCACTCTTTGGAAGCCTGAGGCCTAGGTGGCATGACACATCGATGACACAGATCATTGGGAA 1184
Query 1125 CTGTGTCTGTCTCCTGGTCCTAAGCTCAGCACTTCCTGTCTTCTCTCGAACCCTGGGGCTCACTCGCTTTGACC 1198
|||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||.||||.||.||.||.||.||||||||||
Sbjct 1185 CTGTGTCTGCCTCCTGGTCCTCAGCTCAGCACTTCCTGTCTTCTCTAGAACTCTTGGCCTGACACGCTTTGACC 1258
Query 1199 TGCTGGGTGACTTTGGACGCTTCAACTGGCTGGGCAATTTCTACATTGTGTTCCTCTACAACGCAGCCTTTGCA 1272
|||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 1259 TGCTGGGTGACTTTGGACGCTTCAACTGGCTAGGCAATTTCTACATCGTGTTCCTCTACAACGCAGCCTTTGCT 1332
Query 1273 GGCCTCACCACACTCTGTCTGGTGAAGACCTTCACTGCAGCTGTGCGGGCAGAGCTGATCCGGGCCTTTGGGCT 1346
|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1333 GGCCTCACCACACTCTGTCTGGTGAAGACCTTCACGGCAGCTGTGAGGGCAGAGCTGATCCGAGCCTTTGGGCT 1406
Query 1347 GGACAGACTGCCGCTGCCCGTCTCCGGTTTCCCCCAGGCATCTAGGAAGACCCAGCACCAG 1407
||||||||||||.|||||.|||||.||.||.||||.|||.||||||||||..|||||.||.
Sbjct 1407 GGACAGACTGCCACTGCCTGTCTCTGGGTTTCCCCGGGCTTCTAGGAAGAAGCAGCATCAA 1467