Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_12276
• Subject: NM_001346716.1
• Aligned Length: 1143
• Identities: 1062
• Gaps: 81

Alignment

Query    1  ATGGGCGATCGCGAGCGCAACAAGAAGCGGCTGCTGGAGCTGCTGCGGGCGCCGGACACAGGCAACGCGCACTG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGGCGATCGCGAGCGCAACAAGAAGCGGCTGCTGGAGCTGCTGCGGGCGCCGGACACAGGCAACGCGCACTG  74

Query   75  CGCCGACTGCGGGGCGGCAGATCCCGACTGGGCCTCTTACAAGCTGGGGATCTTCATCTGTCTCAACTGCTGCG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CGCCGACTGCGGGGCGGCAGATCCCGACTGGGCCTCTTACAAGCTGGGGATCTTCATCTGTCTCAACTGCTGCG  148

Query  149  GCGTCCACCGTAACTTCCCTGACATCAGCAGAGTTAAATCTGTGCGACTTGACTTCTGGGACGACAGTATTGTG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GCGTCCACCGTAACTTCCCTGACATCAGCAGAGTTAAATCTGTGCGACTTGACTTCTGGGACGACAGTATTGTG  222

Query  223  GAGTTTATGATCCACAATGGAAACCTCCGTGTGAAGGCCAAGTTCGAAGCCAGAGTCCCAGCTTTCTACTACAT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GAGTTTATGATCCACAATGGAAACCTCCGTGTGAAGGCCAAGTTCGAAGCCAGAGTCCCAGCTTTCTACTACAT  296

Query  297  CCCCCAGGCCAACGACTGCCTGGTCTTAAAGGAACAATGGATTCGAGCTAAGTATGAGAGACGGGAATTTATGG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CCCCCAGGCCAACGACTGCCTGGTCTTAAAGGAACAATGGATTCGAGCTAAGTATGAGAGACGGGAATTTATGG  370

Query  371  CTGATGGGGAAACCATCTCGCTCCCAGGTAACCGAGAAGGATTCCTGTGGAAGCGAGGAAGGGACAACTCACAG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CTGATGGGGAAACCATCTCGCTCCCAGGTAACCGAGAAGGATTCCTGTGGAAGCGAGGAAGGGACAACTCACAG  444

Query  445  TTTCTGAGAAGGAAGTTTGTACTTCTGGCAAGAGAAGGCCTCCTGAAGTACTTCACAAAGGAACAGGGTAAAAG  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TTTCTGAGAAGGAAGTTTGTACTTCTGGCAAGAGAAGGCCTCCTGAAGTACTTCACAAAGGAACAGGGTAAAAG  518

Query  519  CCCCAAAGCTGTCATCAGCATTAAGGACTTGAATGCCACCTTCCAGACAGAGAAGATAGGGCACCCCCATGGGC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CCCCAAAGCTGTCATCAGCATTAAGGACTTGAATGCCACCTTCCAGACAGAGAAGATAGGGCACCCCCATGGGC  592

Query  593  TGCAGATCACCTACAGGAGAGATGGCCACACCAGGAACCTGTTTGTGTATCATGAAAGTGGGAAGGAGATAGTG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TGCAGATCACCTACAGGAGAGATGGCCACACCAGGAACCTGTTTGTGTATCATGAAAGTGGGAAGGAGATAGTG  666

Query  667  GACTGGTTCAATGCCCTCCGTGCAGCCCGTCTGCAGTACCTAAAAATGGCCTTTCCTGAACTCCCAGAGTCTGA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GACTGGTTCAATGCCCTCCGTGCAGCCCGTCTGCAGTACCTAAAAATGGCCTTTCCTGAACTCCCAGAGTCTGA  740

Query  741  GCTCGTGCCATTCCTCACCAGGAACTACCTCAAACAAGGCTTCATGGAAAAGACTGGGCCAA---AGAAAGAAC  811
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||
Sbjct  741  GCTCGTGCCATTCCTCACCAGGAACTACCTCAAACAAGGCTTCATGGAAAAGACTGGGCCAAAGCAGAAAGAAC  814

Query  812  CTTTCAAGAAAAGGTGGTTCGCCCTGGATTGCCATGAGCGGAGGCTGCTCTATTACAAGAACCCACTGGATGCC  885
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CTTTCAAGAAAAGGTGGTTCGCCCTGGATTGCCATGAGCGGAGGCTGCTCTATTACAAGAACCCACTGGATGCC  888

Query  886  TTCGAGCAGGGCCAGGTTTTTCTTGGGAACAAGGAGCAGGGATATGAAGCCTACGAAGACCTGCCCAAGGGCAT  959
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TTCGAGCAGGGCCAGGTTTTTCTTGGGAACAAGGAGCAGGGATATGAAGCCTACGAAGACCTGCCCAAGGGCAT  962

Query  960  CCGAGGAAATCGCTGGAAAGCCGGACTCACCATTGTCACCCCAGAGCGGAGATTTGTCCTCACTTGCCCCAGTG  1033
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
Sbjct  963  CCGAGGAAATCGCTGGAAAGCCGGACTCACCATTGTCACCCCAGAGCGGAGATTTGTCCTCACTTGCCCC----  1032

Query 1034  AGAAGGAACAGCAGGAATGGCTGGAAAGTTTGCGGGGTGTCCTGTCCAGCCCCTTGACGCCCCTCAACCGGCTT  1107
                                                                                      
Sbjct 1033  --------------------------------------------------------------------------  1032

Query 1108  ACTGCATCAACAGAGAGTGGCCGCAGCAGCAGG  1140
            |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1033  ACTGCATCAACAGAGAGTGGCCGCAGCAGCAGG  1065