Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_12277
- Subject:
- NM_018414.5
- Aligned Length:
- 1800
- Identities:
- 1411
- Gaps:
- 387
Alignment
Query 1 ATGAGGTCCTGCCTGTGGAGATGCAGGCACCTGAGCCAAGGCGTCCAGTGGTCCTTGCTTCTGGCTGTCCTGGT 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGAGGTCCTGCCTGTGGAGATGCAGGCACCTGAGCCAAGGCGTCCAGTGGTCCTTGCTTCTGGCTGTCCTGGT 74
Query 75 CTTCTTTCTCTTCGCCTTGCCCTCTTTTATTAAGGAGCCTCAAACAAAGCCTTCCAGGCATCAACGCACAGAGA 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CTTCTTTCTCTTCGCCTTGCCCTCTTTTATTAAGGAGCCTCAAACAAAGCCTTCCAGGCATCAACGCACAGAGA 148
Query 149 ACATTAAAGAAAGGTCTCTACAGTCCCTGGCAAAGCCTAAGTCCCAGGCACCCACAAGGGCAAGGAGGACAACC 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 ACATTAAAGAAAGGTCTCTACAGTCCCTGGCAAAGCCTAAGTCCCAGGCACCCACAAGGGCAAGGAGGACAACC 222
Query 223 ATCTATGCAGAGCCAGTGCCAGAGAACAATGCCCTCAACACACAAACCCAGCCCAAGGCCCACACCACCGGAGA 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 ATCTATGCAGAGCCAGTGCCAGAGAACAATGCCCTCAACACACAAACCCAGCCCAAGGCCCACACCACCGGAGA 296
Query 297 CAGAGGAAAGGAGGCCAACCAGGCACCGCCGGAGGAGCAGGACAAGGTGCCCCACACAGCACAGAGGGCAGCAT 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 CAGAGGAAAGGAGGCCAACCAGGCACCGCCGGAGGAGCAGGACAAGGTGCCCCACACAGCACAGAGGGCAGCAT 370
Query 371 GGAAGAGCCCAGAAAAAGAGAAAACCATGGTGAACACACTGTCACCCAGAGGGCAAGATGCAGGGATGGCCTCT 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 GGAAGAGCCCAGAAAAAGAGAAAACCATGGTGAACACACTGTCACCCAGAGGGCAAGATGCAGGGATGGCCTCT 444
Query 445 GGCAGGACAGAGGCACAATCATGGAAGAGCCAGGACACAAAGACGACCAAAGGAAATGGGGGCCAGACCAGGAA 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GGCAGGACAGAGGCACAATCATGGAAGAGCCAGGACACAAAGACGACCCAAGGAAATGGGGGCCAGACCAGGAA 518
Query 519 GCTGACGGCCTCCAGGACGGTGTCAGAGAAGCACCAGGGCAAAGCGGCAACCACAGCCAAGACGCTCATTCCCA 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 GCTGACGGCCTCCAGGACGGTGTCAGAGAAGCACCAGGGCAAAGCGGCAACCACAGCCAAGACGCTCATTCCCA 592
Query 593 AAAGTCAGCACAGAATGCTGGCTCCCACAGGAGCAGTGTCAACAAGGACGAGACAGAAAGGAGTGACCACAGCA 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 AAAGTCAGCACAGAATGCTGGCTCCCACAGGAGCAGTGTCAACAAGGACGAGACAGAAAGGAGTGACCACAGCA 666
Query 667 GTCATCCCACCTAAGGAGAAGAAACCTCAGGCCACCCCACCCCCTGCCCCTTTCCAGAGCCCCACGACGCAGAG 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 GTCATCCCACCTAAGGAGAAGAAACCTCAGGCCACCCCACCCCCTGCCCCTTTCCAGAGCCCCACGACGCAGAG 740
Query 741 AAACCAAAGACTGAAGGCCGCCAACTTCAAATCTGAGCCTCGGTGGGATTTTGAGGAAAAATACAGCTTCGAAA 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 AAACCAAAGACTGAAGGCCGCCAACTTCAAATCTGAGCCTCGGTGGGATTTTGAGGAAAAATACAGCTTCGAAA 814
Query 815 TAGGAGGCCTTCAGACGACTTGCCCTGACTCTGTGAAGATCAAAGCCTCCAAGTCGCTGTGGCTCCAGAAACTC 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 TAGGAGGCCTTCAGACGACTTGCCCTGACTCTGTGAAGATCAAAGCCTCCAAGTCGCTGTGGCTCCAGAAACTC 888
Query 889 TTTCTGCCCAACCTCACTCTCTTCCTGGACTCCAGACACTTCAACCAGAGTGAGTGGGACCGCCTGGAACACTT 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 TTTCTGCCCAACCTCACTCTCTTCCTGGACTCCAGACACTTCAACCAGAGTGAGTGGGACCGCCTGGAACACTT 962
Query 963 TGCACCACCCTTTGGCTTCATGGAGCTCAACTACTCCTTGGTGCAGAAGGTCGTGACACGCTTCCCTCCAGTGC 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 TGCACCACCCTTTGGCTTCATGGAGCTCAACTACTCCTTGGTGCAGAAGGTCGTGACACGCTTCCCTCCAGTGC 1036
Query 1037 CCCAGCAGCAGCTGCTCCTGGCCAGCCTCCCCGCTGGGAGCCTCCGGTGCATCACCTGTGCCGTGGTGGGCAAC 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 CCCAGCAGCAGCTGCTCCTGGCCAGCCTCCCCGCTGGGAGCCTCCGGTGCATCACCTGTGCCGTGGTGGGCAAC 1110
Query 1111 GGGGGCATCCTGAACAACTCCCACATAGGCCAGGAGATAGACAGTCACGACTACGTGTTCCGATTGAGCGGAGC 1184
||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 GGGGGCATCCTGAACAACTCCCACATGGGCCAGGAGATAGACAGTCACGACTACGTGTTCCGATTGAGCGGAGC 1184
Query 1185 TCTCATTAAAGGCTACGAACAGGATGTGGGGACTCGGACATCCTTCTACGGCTTTACCGCCTTCTCCCTGACCC 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 TCTCATTAAAGGCTACGAACAGGATGTGGGGACTCGGACATCCTTCTACGGCTTTACCGCCTTCTCCCTGACCC 1258
Query 1259 AGTCACTCCTTATATTGGGCAATCGGGGTTTCAAGAACGTGCCTCTTGGGA----------------------- 1309
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 AGTCACTCCTTATATTGGGCAATCGGGGTTTCAAGAACGTGCCTCTTGGGAAGGACGTCCGCTACTTGCACTTC 1332
Query 1310 -------------------------------------------------------------------------- 1309
Sbjct 1333 CTGGAAGGCACCCGGGACTATGAGTGGCTGGAAGCACTGCTTATGAATCAGACGGTGATGTCAAAAAACCTTTT 1406
Query 1310 -------AGGCACAGACCCCAGGAAGCTTTTCGGGAAGCCCTGCACATGGACAGGTACCTGTTGCTGCACCCAG 1376
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 CTGGTTCAGGCACAGACCCCAGGAAGCTTTTCGGGAAGCCCTGCACATGGACAGGTACCTGTTGCTGCACCCAG 1480
Query 1377 ACTTTCTCCGATACATGAAGAACAGGTTTCTGAGGTC------------------------------------- 1413
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 ACTTTCTCCGATACATGAAGAACAGGTTTCTGAGGTCTAAGACCCTGGATGGTGCCCACTGGAGGATATACCGC 1554
Query 1414 -------------------------------------------------------------------------- 1413
Sbjct 1555 CCCACCACTGGGGCCCTCCTGCTGCTCACTGCCCTTCAGCTCTGTGACCAGGTGAGTGCTTATGGCTTCATCAC 1628
Query 1414 -------------------------------------------------------------------------- 1413
Sbjct 1629 TGAGGGCCATGAGCGCTTTTCTGATCACTACTATGATACATCATGGAAGCGGCTGATCTTTTACATAAACCATG 1702
Query 1414 -------------------------------------------------------------------------- 1413
Sbjct 1703 ACTTCAAGCTGGAGAGAGAAGTCTGGAAGCGGCTACACGATGAAGGGATAATCCGGCTGTACCAGCGTCCTGGT 1776
Query 1414 ------------------------ 1413
Sbjct 1777 CCCGGAACTGCCAAAGCCAAGAAC 1800