Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_12409
- Subject:
- NM_021196.3
- Aligned Length:
- 3411
- Identities:
- 3057
- Gaps:
- 354
Alignment
Query 1 ATGAAGGTGAAGGAGGAGAAGGCTGGGGTAGGAAAGCTGGACCACACTAACCACAGGAGGAGATTTCCGGATCA 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGAAGGTGAAGGAGGAGAAGGCTGGGGTAGGAAAGCTGGACCACACTAACCACAGGAGGAGATTTCCGGATCA 74
Query 75 GAAAG--------------------------------------------------------------------- 79
|||||
Sbjct 75 GAAAGAATGCCCTCCTATCCACATTGGGCTTCCAGTACCCACTTACCCTCAAAGAAAAACTGACCAGAAGGGAC 148
Query 80 -------------------------------------------------------------------------- 79
Sbjct 149 ATCTTTCAGGCCTGCAAAAAGTCCACTGGGGCCTGCGGCCAGACCAGCCACAGCAGGAACTGACTGGCCCAGGG 222
Query 80 -------------------------------------------------GGTCCCCAGCTGCTGAGCAGCTCCA 104
|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 AGTGGGGCAAGCAGCCAGGACAGCAGCATGGATCTTATCAGCAGGACTCGGTCCCCAGCTGCTGAGCAGCTCCA 296
Query 105 GGACATCCTGGGGGAGGAAGATGAGGCTCCCAACCCCACCCTCTTTACAGAGATGGATACTCTGCAGCATGACG 178
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 GGACATCCTGGGGGAGGAAGATGAGGCTCCCAACCCCACCCTCTTTACAGAGATGGATACTCTGCAGCATGACG 370
Query 179 GAGACCAGATGGAGTGGAAGGAGTCAGCCAGGTGGATAAAGTTTGAAGAAAAGGTAGAGGAAGGCGGCGAACGC 252
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 GAGACCAGATGGAGTGGAAGGAGTCAGCCAGGTGGATAAAGTTTGAAGAAAAGGTAGAGGAAGGCGGCGAACGC 444
Query 253 TGGAGCAAGCCCCACGTGTCCACACTATCCCTGCACAGCCTCTTCGAGCTCCGTACCTGCCTGCAGACGGGGAC 326
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 TGGAGCAAGCCCCACGTGTCCACACTATCCCTGCACAGCCTCTTCGAGCTCCGTACCTGCCTGCAGACGGGGAC 518
Query 327 GGTGCTGCTGGATTTGGACAGTGGCTCCTTACCACAGATCATAGATGATGTCATTGAGAAGCAGATTGAGGATG 400
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 GGTGCTGCTGGATTTGGACAGTGGCTCCTTACCACAGATCATAGATGATGTCATTGAGAAGCAGATTGAGGATG 592
Query 401 GTCTCCTGCGGCCAGAGCTCCGGGAGAGGGTCAGTTACGTCCTCCTGAGGAGGCACCGCCACCAAACCAAGAAG 474
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 GTCTCCTGCGGCCAGAGCTCCGGGAGAGGGTCAGTTACGTCCTCCTGAGGAGGCACCGCCACCAAACCAAGAAG 666
Query 475 CCCATCCACCGCTCCTTAGCTGACATTGGGAAGTCAGTCTCCACCACAAATCGCAGTCCTGCCCGGAGCCCTGG 548
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 CCCATCCACCGCTCCTTAGCTGACATTGGGAAGTCAGTCTCCACCACAAATCGCAGTCCTGCCCGGAGCCCTGG 740
Query 549 TGCTGGCCCGAGTCTACACCACTCCACGGAAGACCTGCGGATGCGGCAGAGTGCAAATTACGGACGTCTGTGTC 622
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 TGCTGGCCCGAGTCTACACCACTCCACGGAAGACCTGCGGATGCGGCAGAGTGCAAATTACGGACGTCTGTGTC 814
Query 623 ATGCCCAGAGCAGAAGCATGAATGACATTTCTCTCACCCCAAACACAGACCAGCGGAAAAACAAATTCATGAAG 696
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 ATGCCCAGAGCAGAAGCATGAATGACATTTCTCTCACCCCAAACACAGACCAGCGGAAAAACAAATTCATGAAG 888
Query 697 AAGATCCCCAAGGACTCAGAAGCGTCCAACGTGCTCGTGGGCGAGGTGGACTTCCTAGACCAGCCATTCATCGC 770
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 AAGATCCCCAAGGACTCAGAAGCGTCCAACGTGCTCGTGGGCGAGGTGGACTTCCTAGACCAGCCATTCATCGC 962
Query 771 GTTCGTGCGCCTCATCCAGTCGGCCATGCTGGGAGGAGTGACCGAGGTGCCTGTCCCCACCAGATTTCTGTTTA 844
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 GTTCGTGCGCCTCATCCAGTCGGCCATGCTGGGAGGAGTGACCGAGGTGCCTGTCCCCACCAGATTTCTGTTTA 1036
Query 845 TACTACTGGGACCTTCTGGGAGAGCAAAATCCTACAATGAAATTGGCCGTGCCATTGCAACCCTCATGGTAGAT 918
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 TACTACTGGGACCTTCTGGGAGAGCAAAATCCTACAATGAAATTGGCCGTGCCATTGCAACCCTCATGGTAGAT 1110
Query 919 GATCTCTTCAGTGACGTGGCCTACAAAGCCCGCAATCGGGAAGATCTGATCGCAGGAATTGATGAATTTCTGGA 992
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 GATCTCTTCAGTGACGTGGCCTACAAAGCCCGCAATCGGGAAGATCTGATCGCAGGAATTGATGAATTTCTGGA 1184
Query 993 TGAGGTCATCGTCCTTCCTCCTGGAGAATGGGACCCAAATATCCGGATTGAGCCCCCCAAGAAGGTGCCCTCTG 1066
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 TGAGGTCATCGTCCTTCCTCCTGGAGAATGGGACCCAAATATCCGGATTGAGCCCCCCAAGAAGGTGCCCTCTG 1258
Query 1067 CTGACAAGAGGAAATCTGTGTTCTCCCTAGCAGAGCTGGGCCAGATGAATGGCTCTGTGGGAGGAGGCGGCGGA 1140
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 CTGACAAGAGGAAATCTGTGTTCTCCCTAGCAGAGCTGGGCCAGATGAATGGCTCTGTGGGAGGAGGCGGCGGA 1332
Query 1141 GCTCCTGGAGGAGGCAATGGAGGTGGTGGTGGTGGTGGCAGTGGCGGCGGGGCTGGCAGTGGCGGGGCCGGCGG 1214
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 GCTCCTGGAGGAGGCAATGGAGGTGGTGGTGGTGGTGGCAGTGGCGGCGGGGCTGGCAGTGGCGGGGCCGGCGG 1406
Query 1215 AACAAGCAGCGGGGATGATGGAGAGATGCCAGCCATGCATGAAATCGGGGAGGAACTTATCTGGACAGGAAGGT 1288
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 AACAAGCAGCGGGGATGATGGAGAGATGCCAGCCATGCATGAAATCGGGGAGGAACTTATCTGGACAGGAAGGT 1480
Query 1289 TCTTCGGTGGCCTGTGTCTGGATATCAAGAGGAAGTTGCCCTGGTTCCCAAGTGACTTCTATGATGGCTTCCAC 1362
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 TCTTCGGTGGCCTGTGTCTGGATATCAAGAGGAAGTTGCCCTGGTTCCCAAGTGACTTCTATGATGGCTTCCAC 1554
Query 1363 ATTCAGTCCATCTCTGCCATCCTATTCATCTACCTCGGCTGTATCACCAACGCGATCACCTTTGGTGGGCTTCT 1436
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 ATTCAGTCCATCTCTGCCATCCTATTCATCTACCTCGGCTGTATCACCAACGCGATCACCTTTGGTGGGCTTCT 1628
Query 1437 GGGGGATGCCACCGACAATTATCAGGGAGTGATGGAGAGCTTCCTGGGCACTGCCATGGCTGGCTCCTTGTTCT 1510
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 GGGGGATGCCACCGACAATTATCAGGGAGTGATGGAGAGCTTCCTGGGCACTGCCATGGCTGGCTCCTTGTTCT 1702
Query 1511 GCCTCTTCTCGGGACAGCCTCTCATCATTCTCAGCAGCACGGGGCCCATCCTCATCTTTGAGAAGCTCCTCTTC 1584
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 GCCTCTTCTCGGGACAGCCTCTCATCATTCTCAGCAGCACGGGGCCCATCCTCATCTTTGAGAAGCTCCTCTTC 1776
Query 1585 GACTTCAGCAAAGGCAATGGCCTGGACTACATGGAGTTCCGCCTCTGGATTGGCCTACACTCAGCTGTCCAGTG 1658
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 GACTTCAGCAAAGGCAATGGCCTGGACTACATGGAGTTCCGCCTCTGGATTGGCCTACACTCAGCTGTCCAGTG 1850
Query 1659 CCTTATCCTAGTGGCCACAGATGCCAGCTTTATCATCAAATATATCACCCGCTTCACCGAGGAGGGCTTCTCCA 1732
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 CCTTATCCTAGTGGCCACAGATGCCAGCTTTATCATCAAATATATCACCCGCTTCACCGAGGAGGGCTTCTCCA 1924
Query 1733 CCCTTATCAGCTTCATCTTCATCTACGATGCCATCAAGAAGATGATCGGTGCCTTCAAGTACTACCCTATCAAT 1806
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 CCCTTATCAGCTTCATCTTCATCTACGATGCCATCAAGAAGATGATCGGTGCCTTCAAGTACTACCCTATCAAT 1998
Query 1807 ATGGACTTCAAGCCAAACTTCATCACTACCTACAAGTGCGAGTGTGTCGCCCCTGACACAGTGAATACAACCGT 1880
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 ATGGACTTCAAGCCAAACTTCATCACTACCTACAAGTGCGAGTGTGTCGCCCCTGACACAGTGAATACAACCGT 2072
Query 1881 GTTCAATGCTTCAGCCCCATTGGCACCAGACACCAACGCTTCTCTGTACAACCTCCTTAACCTCACAGCGTTGG 1954
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073 GTTCAATGCTTCAGCCCCATTGGCACCAGACACCAACGCTTCTCTGTACAACCTCCTTAACCTCACAGCGTTGG 2146
Query 1955 ACTGGTCCCTGCTGAGCAAGAAGGAGTGTCTGAGCTACGGCGGGCGCCTGCTTGGGAATTCCTGCAAGTTTATC 2028
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147 ACTGGTCCCTGCTGAGCAAGAAGGAGTGTCTGAGCTACGGCGGGCGCCTGCTTGGGAATTCCTGCAAGTTTATC 2220
Query 2029 CCAGACCTGGCGCTCATGTCCTTCATCCTTTTCTTTGGGACATACTCCATGACCCTGACCCTGAAGAAGTTCAA 2102
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221 CCAGACCTGGCGCTCATGTCCTTCATCCTTTTCTTTGGGACATACTCCATGACCCTGACCCTGAAGAAGTTCAA 2294
Query 2103 ATTCAGCCGCTATTTTCCTAC----------------------------------------------------- 2123
|||||||||||||||||||||
Sbjct 2295 ATTCAGCCGCTATTTTCCTACCAAGGTCCGGGCCCTGGTGGCTGACTTTTCCATTGTTTTCTCCATCCTGATGT 2368
Query 2124 -------------------------------------------------------------CAAGCCAACGCGG 2136
|||||||||||||
Sbjct 2369 TCTGTGGAATCGATGCCTGTTTTGGCCTAGAAACTCCCAAGCTGCATGTGCCCAGTGTCATCAAGCCAACGCGG 2442
Query 2137 CCTGACCGAGGCTGGTTCGTGGCCCCCTTTGGGAAGAACCCGTGGTGGGTATACCCAGCAAGCATCCTGCCCGC 2210
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443 CCTGACCGAGGCTGGTTCGTGGCCCCCTTTGGGAAGAACCCGTGGTGGGTATACCCAGCAAGCATCCTGCCCGC 2516
Query 2211 CCTGCTGGTGACCATCCTGATCTTCATGGACCAGCAGATCACTGCCGTCATTGTCAACCGGAAGGAGAACAAAC 2284
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517 CCTGCTGGTGACCATCCTGATCTTCATGGACCAGCAGATCACTGCCGTCATTGTCAACCGGAAGGAGAACAAAC 2590
Query 2285 TGAAGAAGGCTGCCGGCTACCATCTGGACCTGTTCTGGGTGGGCATCCTCATGGCTTTGTGCTCCTTTATGGGG 2358
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591 TGAAGAAGGCTGCCGGCTACCATCTGGACCTGTTCTGGGTGGGCATCCTCATGGCTTTGTGCTCCTTTATGGGG 2664
Query 2359 CTCCCCTGGTACGTGGCTGCCACGGTCATCTCCATCGCCCACATCGACAGCCTCAAGATGGAGACAGAGACCAG 2432
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2665 CTCCCCTGGTACGTGGCTGCCACGGTCATCTCCATCGCCCACATCGACAGCCTCAAGATGGAGACAGAGACCAG 2738
Query 2433 TGCCCCTGGGGAGCAGCCCCAGTTTCTGGGAGTCAGGGAACAGAGAGTAACCGGCATCATCGTCTTCATCCTGA 2506
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2739 TGCCCCTGGGGAGCAGCCCCAGTTTCTGGGAGTCAGGGAACAGAGAGTAACCGGCATCATCGTCTTCATCCTGA 2812
Query 2507 CGGGAATCTCTGTCTTCCTGGCTCCCATCCTAAAGTGTATCCCCCTGCCGGTGCTGTACGGAGTCTTCCTCTAC 2580
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2813 CGGGAATCTCTGTCTTCCTGGCTCCCATCCTAAAGTGTATCCCCCTGCCGGTGCTGTACGGAGTCTTCCTCTAC 2886
Query 2581 ATGGGCGTGGCCTCCCTGAATGGCATCCAG-------------------------------------------- 2610
||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2887 ATGGGCGTGGCCTCCCTGAATGGCATCCAGATGGGGACCGGAGGGTCAGAATTCAAAATCCAGAAGAAGCTGAC 2960
Query 2611 ----TTCTGGGAACGCTGCAAGCTCTTCCTGATGCCAGCCAAGCACCAGCCGGACCATGCCTTCCTGCGGCACG 2680
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2961 TCCATTCTGGGAACGCTGCAAGCTCTTCCTGATGCCAGCCAAGCACCAGCCGGACCATGCCTTCCTGCGGCACG 3034
Query 2681 TGCCGCTGCGCCGGATCCACCTCTTCACCCTGGTGCAGATCCTCTGCCTGGCGGTGCTCTGGATCCTCAAATCC 2754
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3035 TGCCGCTGCGCCGGATCCACCTCTTCACCCTGGTGCAGATCCTCTGCCTGGCGGTGCTCTGGATCCTCAAATCC 3108
Query 2755 ACGGTGGCTGCCATCATCTTCCCGGTCATGATCCTGGGCCTCATCATCGTTCGAAGGCTTCTGGATTTCATCTT 2828
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3109 ACGGTGGCTGCCATCATCTTCCCGGTCATGATCCTGGGCCTCATCATCGTTCGAAGGCTTCTGGATTTCATCTT 3182
Query 2829 TTCCCAGCACGACCTGGCCTGGATTGACAACATCCTCCCAGAGAAGGAAAAAAAGGAGACAGACAAGAAGAGGA 2902
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3183 TTCCCAGCACGACCTGGCCTGGATTGACAACATCCTCCCAGAGAAGGAAAAAAAGGAGACAGACAAGAAGAGGA 3256
Query 2903 AGAGAAAAAAAGGGGCCCACGAGGACTGTGATGAGGAGCCCCAGTTCCCTCCTCCCTCGGTTATAAAGATTCCC 2976
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3257 AGAGAAAAAAAGGGGCCCACGAGGACTGTGATGAGGAGCCCCAGTTCCCTCCTCCCTCGGTTATAAAGATTCCC 3330
Query 2977 ATGGAAAGTGTCCAATCAGATCCCCAAAACGGTATCCACTGCATTGCCAGAAAAAGATCTTCCAGTTGGAGTTA 3050
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3331 ATGGAAAGTGTCCAATCAGATCCCCAAAACGGTATCCACTGCATTGCCAGAAAAAGATCTTCCAGTTGGAGTTA 3404
Query 3051 CTCACTC 3057
|||||||
Sbjct 3405 CTCACTC 3411