Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroadEn_12409
Subject:
XM_006505965.2
Aligned Length:
3498
Identities:
2712
Gaps:
468

Alignment

Query    1  ---------------------------------------ATGAAGGTGAAGGAGGAGAAGGCTGGGGTAGGAAA  35
                                                   |||||||||.|.|||||||||||||||||...|||
Sbjct    1  ATGGAACTCTCTCATGGCTGTCACAGCATATCAAGGGTGATGAAGGTGGACGAGGAGAAGGCTGGGGTCAAAAA  74

Query   36  GCTGGACCACACTAACCACAGGAGG--------------AGATTTCC---------------------------  68
            ||||||||.|||.|.|.|||.||||              ||||||||                           
Sbjct   75  GCTGGACCCCACAAGCTACAAGAGGAGACAGCCAGAACAAGATTTCCCTTCAATTCATATTGGGTTTCCAGTTC  148

Query   69  --------------------------------------------------------------------------  68
                                                                                      
Sbjct  149  CCAGTTACTCTCAAAGAAAAAGCGACTCAAAGGGACATCTTTCAGGCCTGCAAAAAGTCCAGTGGTCCCTGAAA  222

Query   69  ----------------------------------GGATCAG---------------------------------  75
                                              |||||||                                 
Sbjct  223  CCAGGCAAGCCTCAGCAGGAGCTGGCTGGCCCAGGGATCAGGGCCAGCAGCCAGGGAGGTGCCGTGGATTTTAC  296

Query   76  --AAAG-----GGTCCCCAGCTGCTGAGCAGCTCCAGGACATCCTGGGGGAGGAAGATGAGGCTCCCAACCCCA  142
              ||||     ||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CAAAAGGACTCGGTCTCCAGCTGCTGAGCAGCTGCAGGACATCCTGGGGGAGGAAGATGAGGCTCCCAACCCCA  370

Query  143  CCCTCTTTACAGAGATGGATACTCTGCAGCATGACGGAGACCAGATGGAGTGGAAGGAGTCAGCCAGGTGGATA  216
            |||||||.|||||||||||.|||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CCCTCTTCACAGAGATGGACACTCTACAGCATGATGGGGACCAGATGGAGTGGAAGGAGTCAGCCAGGTGGATA  444

Query  217  AAGTTTGAAGAAAAGGTAGAGGAAGGCGGCGAACGCTGGAGCAAGCCCCACGTGTCCACACTATCCCTGCACAG  290
            ||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||
Sbjct  445  AAATTTGAAGAAAAGGTAGAGGAAGGAGGAGAACGATGGAGCAAGCCCCATGTGTCCACGCTGTCCCTGCACAG  518

Query  291  CCTCTTCGAGCTCCGTACCTGCCTGCAGACGGGGACGGTGCTGCTGGATTTGGACAGTGGCTCCTTACCACAGA  364
            .|||||.||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||.||||||.|||||||..|||||.|||||||||
Sbjct  519  TCTCTTTGAGCTCCGCACCTGCCTGCAGACAGGGACAGTGCTACTGGATCTGGACAGCTGCTCCCTACCACAGA  592

Query  365  TCATAGATGATGTCATTGAGAAGCAGATTGAGGATGGTCTCCTGCGGCCAGAGCTCCGGGAGAGGGTCAGTTAC  438
            ||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.|||||.||.||||||||||||||||||||.|||
Sbjct  593  TCATAGATGATGTCATTGAGAAGCAGATAGAGGATGGACTTCTGCGACCTGAGCTCCGGGAGAGGGTCAGCTAC  666

Query  439  GTCCTCCTGAGGAGGCACCGCCACCAAACCAAGAAGCCCATCCACCGCTCCTTAGCTGACATTGGGAAGTCAGT  512
            ||.||||||||||.|||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||.|.||.|||||.||||||||.||
Sbjct  667  GTGCTCCTGAGGAAGCATCGTCACCAAACCAAGAAGCCCATCCACCGTTCCCTTGCAGACATCGGGAAGTCGGT  740

Query  513  CTCCACCACAAATCGCAGTCCTGCCCGGAGC-CCTGGTGCTGGCCCGAGTCTACACCACTCCACGGAAGACCTG  585
            .|||||.||.||.||.||..||||||||||| ||| ..||.|||||.|.|||.||||.||||||.||.||||||
Sbjct  741  TTCCACGACGAACCGAAGCTCTGCCCGGAGCTCCT-CAGCAGGCCCAACTCTGCACCGCTCCACTGAGGACCTG  813

Query  586  CGGATGCGGCAGAGTGCAAATTACGGACGTCTGTGTCATGCCCAGAGCAGAAGCATGAATGACATTTCTCTCAC  659
            .||||.||.||.||..|.|..||.||.|.||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||..||
Sbjct  814  AGGATTCGACAAAGCACCAGCTATGGTCATCTGTGTCATGCCCAGAGTAGAAGCATGAATGACATCTCTCATAC  887

Query  660  CCCAAACACAGACCAGCGGAAAAACAAATTCATGAAGAAGATCCCCAAGGACTCAGAAGCGTCCAACGTGCTCG  733
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct  888  CCCAAACACAGACCAGCGGAAAAACAAATTCATGAAGAAGATTCCCAAGGACTCAGAAGCTTCCAACGTGCTCG  961

Query  734  TGGGCGAGGTGGACTTCCTAGACCAGCCATTCATCGCGTTCGTGCGCCTCATCCAGTCGGCCATGCTGGGAGGA  807
            |||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||.||.||.||..|||||||.||||||||||||||.
Sbjct  962  TGGGCGAGGTGGACTTCCTGGACCAGCCATTCATTGCATTTGTTCGTCTTGTCCAGTCTGCCATGCTGGGAGGG  1035

Query  808  GTGACCGAGGTGCCTGTCCCCACCAGATTTCTGTTTATACTACTGGGACCTTCTGGGAGAGCAAAATCCTACAA  881
            |||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||.|.||||||||.|||||||||||.|||||.||
Sbjct 1036  GTGACAGAGGTGCCTGTCCCCACCAGATTTCTGTTCATACTATTAGGACCTTCCGGGAGAGCAAAGTCCTATAA  1109

Query  882  TGAAATTGGCCGTGCCATTGCAACCCTCATGGTAGATGATCTCTTCAGTGACGTGGCCTACAAAGCCCGCAATC  955
            |||.||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||.|||||.||.|||||.||.|||||.||.||.|
Sbjct 1110  TGAGATTGGCCGAGCCATCGCAACCCTCATGGTGGATGATCTATTCAGCGATGTGGCTTATAAAGCTCGGAACC  1183

Query  956  GGGAAGATCTGATCGCAGGAATTGATGAATTTCTGGATGAGGTCATCGTCCTTCCTCCTGGAGAATGGGACCCA  1029
            |.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||
Sbjct 1184  GAGAAGATCTGATCGCAGGGATTGATGAATTTCTAGACGAGGTCATTGTCCTTCCCCCTGGAGAGTGGGACCCA  1257

Query 1030  AATATCCGGATTGAGCCCCCCAAGAAGGTGCCCTCTGCTGACAAGAGGAAATCTGTGTTCTCCCTAGCAGAGCT  1103
            ||.|||.|.||||||||.||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||.
Sbjct 1258  AACATCAGAATTGAGCCACCCAAGAAAGTTCCCTCAGCTGACAAGAGGAAATCTGTGTTCTCTCTGGCAGAGCC  1331

Query 1104  GGGCCAGATGAATGGCTCTGTGGGAGGAGGCGGCGGAG-CTC--CTGGAGGAGGCAATGGAGGTGGTGGTGGTG  1174
            ||||||||||||||||||||||||.|||   ||||||| |||  |||||||||||                   
Sbjct 1332  GGGCCAGATGAATGGCTCTGTGGGCGGA---GGCGGAGCCTCGGCTGGAGGAGGC-------------------  1383

Query 1175  GTGGCAGTGGCGGCGGGGCTGGCAGTGGCGGGGCCGGCGGAACAAGCAGCGGGGATGATGGAGAGATGCCAGCC  1248
              |||||||||||.||||||||..|..|||||||.||||||....||||.||.||.||.|..|||||||||||.
Sbjct 1384  --GGCAGTGGCGGAGGGGCTGGAGGCAGCGGGGCTGGCGGAGTGGGCAGTGGCGACGAAGCTGAGATGCCAGCT  1455

Query 1249  ATGCATGAAATCGGGGAGGAACTTATCTGGACAGGAAGGTTCTTCGGTGGCCTGTGTCTGGATATCAAGAGGAA  1322
            |||||.||||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||.||.||.||||||||||||.||||||||||
Sbjct 1456  ATGCACGAAATCGGGGAGGAGCTGATCTGGACCGGAAGGTTCTTTGGAGGACTGTGTCTGGATGTCAAGAGGAA  1529

Query 1323  GTTGCCCTGGTTCCCAAGTGACTTCTATGATGGCTTCCACATTCAGTCCATCTCTGCCATCCTATTCATCTACC  1396
            |.||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.|.||||||||||||||..|.||.||||||||||
Sbjct 1530  GCTGCCCTGGTTCCCAAGCGACTTCTATGATGGCTTCCACCTCCAGTCCATCTCTGCTGTTCTGTTCATCTACC  1603

Query 1397  TCGGCTGTATCACCAACGCGATCACCTTTGGTGGGCTTCTGGGGGATGCCACCGACAATTATCAGGGAGTGATG  1470
            ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||.|||
Sbjct 1604  TCGGCTGTATTACCAACGCGATCACCTTTGGTGGGCTTCTGGGGGATGCCACAGACAACTACCAGGGAGTAATG  1677

Query 1471  GAGAGCTTCCTGGGCACTGCCATGGCTGGCTCCTTGTTCTGCCTCTTCTCGGGACAGCCTCTCATCATTCTCAG  1544
            ||||||||||||||||||||||||||||||..|||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||
Sbjct 1678  GAGAGCTTCCTGGGCACTGCCATGGCTGGCAGCTTGTTCTGCCTCTTCTCGGGGCAGCCTCTTATCATCCTCAG  1751

Query 1545  CAGCACGGGGCCCATCCTCATCTTTGAGAAGCTCCTCTTCGACTTCAGCAAAGGCAATGGCCTGGACTACATGG  1618
            ||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|.||||||||||||||||||||
Sbjct 1752  CAGCACAGGACCCATCCTCATCTTTGAGAAGCTCCTCTTTGACTTCAGCAAGGCCAATGGCCTGGACTACATGG  1825

Query 1619  AGTTCCGCCTCTGGATTGGCCTACACTCAGCTGTCCAGTGCCTTATCCTAGTGGCCACAGATGCCAGCTTTATC  1692
            |||||||||||||||||||.||.||||||||..|||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1826  AGTTCCGCCTCTGGATTGGTCTTCACTCAGCCATCCAGTGCCTTATTCTGGTGGCCACAGATGCCAGCTTTATC  1899

Query 1693  ATCAAATATATCACCCGCTTCACCGAGGAGGGCTTCTCCACCCTTATCAGCTTCATCTTCATCTACGATGCCAT  1766
            |||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1900  ATCAAGTATATCACCCGCTTCACCGAAGAGGGCTTCTCCACCCTCATCAGCTTCATCTTCATCTACGACGCCAT  1973

Query 1767  CAAGAAGATGATCGGTGCCTTCAAGTACTACCCTATCAATATGGACTTCAAGCCAAACTTCATCACTACCTACA  1840
            |||.||||||||.|||||||||||.|||||.||.||.||.|.||||||||||||..||||||||||.|||||||
Sbjct 1974  CAAAAAGATGATTGGTGCCTTCAAATACTATCCCATTAACACGGACTTCAAGCCTGACTTCATCACCACCTACA  2047

Query 1841  AGTGCGAGTGTGTCGCCCCTGACACAGTGAATACAACCGTGTTCAATGCTTCAGCCCCATTGGCACCAGACACC  1914
            |.||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||..|.|||||||.|||||||||.||||||||.|||||
Sbjct 2048  AATGCGAGTGCGTCGCTCCTGACACAGTGAACACAACCACGGTCAATGCCTCAGCCCCACTGGCACCAAACACC  2121

Query 1915  AACGCTTCTCTGTACAACCTCCTTAACCTCACAGCGTTGGACTGGTCCCTGCTGAGCAAGAAGGAGTGTCTGAG  1988
            |||.|.||||||||||.||.||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 2122  AACACGTCTCTGTACACCCCCCTTAACCTCACAGCGCTGGACTGGTCCCTGCTGAGCAAGAAGGAGTGCCTGAG  2195

Query 1989  CTACGGCGGGCGCCTGCTTGGGAATTCCTGCAAGTTTATCCCAGACCTGGCGCTCATGTCCTTCATCCTTTTCT  2062
            ||||||||||||||||||.||||..||||||.||||..||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2196  CTACGGCGGGCGCCTGCTCGGGAGCTCCTGCCAGTTCGTCCCAGACCTGGCGCTCATGTCCTTCATCCTTTTCT  2269

Query 2063  TTGGGACATACTCCATGACCCTGACCCTGAAGAAGTTCAAATTCAGCCGCTATTTTCCTACCAAG---------  2127
            |||||||.||||||||||||.||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||         
Sbjct 2270  TTGGGACTTACTCCATGACCTTGACTCTGAAGAAATTCAAGTTCAGCCGCTATTTTCCCACCAAGGTCCGGACC  2343

Query 2128  --------------------------------------------------------------------------  2127
                                                                                      
Sbjct 2344  CTGGTGGCTGACTTCTCCATTGTATTCTCCATCCTGCTTTTCTGTGGAATCGATGCCTGTTTTGGCCTGCAGAC  2417

Query 2128  -CCAACGC------------------------------GGCCTGACCGAGGCTGGTTCGTGGCCCCCTTTGGGA  2170
             ||||.||                              ||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 2418  CCCAAAGCTGCACGTGCCTAGTGTCATTAAGCCCACAAGGCCCGACCGAGGCTGGTTCGTTGCCCCCTTTGGGA  2491

Query 2171  AGAACCCGTGGTGGGTATACCCAGCAAGCATCCTGCCCGCCCTGCTGGTGACCATCCTGATCTTCATGGACCAG  2244
            |||||||.||||||||.|||||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2492  AGAACCCTTGGTGGGTGTACCCTGCCAGCATCCTGCCGGCCCTGCTGGTGACCATCCTGATCTTCATGGACCAG  2565

Query 2245  CAGATCACTGCCGTCATTGTCAACCGGAAGGAGAACAAACTGAAGAAGGCTGCCGGCTACCATCTGGACCTGTT  2318
            ||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||||.||||||.||.||||||||||||||||||||
Sbjct 2566  CAGATCACCGCAGTCATTGTCAACCGGAAGGAGAACAAGCTGAGGAAGGCCGCTGGCTACCATCTGGACCTGTT  2639

Query 2319  CTGGGTGGGCATCCTCATGGCTTTGTGCTCCTTTATGGGGCTCCCCTGGTACGTGGCTGCCACGGTCATCTCCA  2392
            ||||||.|||||||||||||||.||||||||||.|..|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2640  CTGGGTAGGCATCCTCATGGCTCTGTGCTCCTTCACCGGGCTCCCCTGGTACGTGGCTGCCACGGTCATCTCCA  2713

Query 2393  TCGCCCACATCGACAGCCTCAAGATGGAGACAGAGACCAGTGCCCCTGGGGAGCAGCCCCAGTTTCTGGGAGTC  2466
            |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.|||
Sbjct 2714  TCGCCCACATCGACAGCCTCAAGATGGAGACGGAGACCAGTGCCCCGGGGGAACAGCCCCAGTTCCTGGGGGTC  2787

Query 2467  AGGGAACAGAGAGTAACCGGCATCATCGTCTTCATCCTGACGGGAATCTCTGTCTTCCTGGCTCCCATCCTAAA  2540
            |||||.||||||||.||.||..||||.||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||.|||||.||
Sbjct 2788  AGGGAGCAGAGAGTTACTGGAGTCATGGTCTTCATCCTGACAGGCATCTCCGTCTTCCTGGCTCCTATCCTGAA  2861

Query 2541  GTGTATCCCCCTGCCGGTGCTGTACGGAGTCTTCCTCTACATGGGCGTGGCCTCCCTGAATGGCATCCAGTTCT  2614
            ||..||||||.||||.|||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2862  GTACATCCCCATGCCAGTGCTCTATGGAGTCTTCCTCTACATGGGTGTGGCCTCCCTGAATGGCATCCAGTTCT  2935

Query 2615  GGGAACGCTGCAAGCTCTTCCTGATGCCAGCCAAGCACCAGCCGGACCATGCCTTCCTGCGGCACGTGCCGCTG  2688
            ||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||.||.
Sbjct 2936  GGGAACGCTGTAAGCTTTTCCTCATGCCAGCCAAGCACCAGCCGGACCACGCTTTCCTGCGCCACGTGCCCCTT  3009

Query 2689  CGCCGGATCCACCTCTTCACCCTGGTGCAGATCCTCTGCCTGGCGGTGCTCTGGATCCTCAAATCCACGGTGGC  2762
            |||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||..|||||||||||||.||.||.||..||||
Sbjct 3010  CGCCGCATTCACCTGTTCACCCTGGTGCAGATCCTCTGCCTGGCCCTGCTCTGGATCCTTAAGTCAACCATGGC  3083

Query 2763  TGCCATCATCTTCCCGGTCATGATCCTGGGCCTCATCATCGTTCGAAGGCTTCTGGATTTCATCTTTTCCCAGC  2836
            |||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.||.||.||.|||||||
Sbjct 3084  TGCCATCATCTTCCCGGTCATGATCCTGGGCCTTATCATTGTTCGAAGGCTCCTGGACTTGATTTTCTCCCAGC  3157

Query 2837  ACGACCTGGCCTGGATTGACAACATCCTCCCAGAGAAGGAAAAAAAGGAGACAGACAAGAAGAGGAAGAGAAAA  2910
            |.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||.||||||||..
Sbjct 3158  ATGACCTGGCCTGGATTGACAATATCCTCCCAGAGAAGGACAAAAAGGAGACAGACAAGAAGAAGAAGAGAAGG  3231

Query 2911  AAAGGGGCCCACGAG--GACTGTGATGAGGA---------GCCCCAGTTCCCTCCTCCCTCGGTTATAAAGATT  2973
            ||||.||.|||.|||  |.|.|.||  ||||         |||||||||||.|||||||||.|||.|||||||.
Sbjct 3232  AAAGAGGTCCATGAGACGGCAGAGA--AGGAGGTGGCAATGCCCCAGTTCCTTCCTCCCTCAGTTGTAAAGATC  3303

Query 2974  CCCATGGAAAGTGTCCAATCAGATCCCCAAAACGGTATCCACTGCATTGCCA----------------------  3025
            |||||||||.||.|||.|||.|||||||||||||||||||||||..||||||                      
Sbjct 3304  CCCATGGAAGGTATCCCATCTGATCCCCAAAACGGTATCCACTGTGTTGCCAATGATGAGGATGCTGTGCCCGG  3377

Query 3026  --------------------------------------------------------------GAAAAAGATCTT  3037
                                                                          ||||||||||||
Sbjct 3378  GAGAAATAAAAAGAACTGGCCAAGAGCATGGGAACGCCACCATGTGCAGACACCCCTTTCCCGAAAAAGATCTT  3451

Query 3038  CCAGTTGGAGTTACTCACTC  3057
            ||||||||||||||||.|||
Sbjct 3452  CCAGTTGGAGTTACTCTCTC  3471