Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_12415
• Subject: NM_001363098.2
• Aligned Length: 1680
• Identities: 1530
• Gaps: 150

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGGCAGCAGCCAGACTCCTGCCAGTGCCGGCAGGACCCCAGCCCCTGTCGTTCCAGGCCAAGCTGACCTTCGA  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  GGATGTGGCTGTGCTCCTCTCCCAGGATGAATGGGACCGCCTGTGCCCTGCTCAGAGGGGTCTCTACAGAAATG  148

Query    1  --ATGATGGAAACCTATGGGAATGTAGTCTCATTGGGACTTCCAGGATCCAAGCCTGACATAATCTCCCAGCTG  72
              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TGATGATGGAAACCTATGGGAATGTAGTCTCATTGGGACTTCCAGGATCCAAGCCTGACATAATCTCCCAGCTG  222

Query   73  GAGCGAGGGGAAGATCCCTGGGTCCTGGACAGGAAGGGGGCTAAGAAGAGCCAGGGCCTGTGGAGTGACTACTC  146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GAGCGAGGGGAAGATCCCTGGGTCCTGGACAGGAAGGGGGCTAAGAAGAGCCAGGGCCTGTGGAGTGACTACTC  296

Query  147  AGACAACCTCAAATATGACCACACTACAGCCTGTACACAACAAGACAGTTTATCTTGTCCATGGGAATGTGAAA  220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AGACAACCTCAAATATGACCACACTACAGCCTGTACACAACAAGACAGTTTATCTTGTCCATGGGAATGTGAAA  370

Query  221  CCAAGGGAGAGAGTCAAAATACAGACTTGAGTCCGAAGCCATTAATTTCAGAGCAAACAGTGATTCTGGGGAAA  294
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CCAAGGGAGAGAGTCAAAATACAGACTTGAGTCCGAAGCCATTAATTTCAGAGCAAACAGTGATTCTGGGGAAA  444

Query  295  ACACCCTTGGGGAGGATTGATCAAGAAAATAATGAAACAAAGCAAAGCTTCTGTCTGAGTCCAAACTCTGTTGA  368
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  ACACCCTTGGGGAGGATTGATCAAGAAAATAATGAAACAAAGCAAAGCTTCTGTCTGAGTCCAAACTCTGTTGA  518

Query  369  CCACCGTGAAGTTCAGGTCTTAAGCCAAAGCATGCCACTCACTCCGCACCAGGCAGTGCCTAGTGGAGAGAGGC  442
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CCACCGTGAAGTTCAGGTCTTAAGCCAAAGCATGCCACTCACTCCGCACCAGGCAGTGCCTAGTGGAGAGAGGC  592

Query  443  CCTACATGTGTGTTGAGTGTGGGAAGTGCTTTGGCCGGAGTTCCCACCTCCTTCAGCATCAGCGTATCCACACT  516
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CCTACATGTGTGTTGAGTGTGGGAAGTGCTTTGGCCGGAGTTCCCACCTCCTTCAGCATCAGCGTATCCACACT  666

Query  517  GGAGAGAAGCCCTATGTGTGCAGTGTATGTGGGAAGGCCTTCAGCCAGAGCTCAGTCCTTAGTAAACACAGGAG  590
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GGAGAGAAGCCCTATGTGTGCAGTGTATGTGGGAAGGCCTTCAGCCAGAGCTCAGTCCTTAGTAAACACAGGAG  740

Query  591  AATTCACACAGGTGAGAAGCCCTATGAGTGTAATGAGTGTGGAAAAGCCTTTAGAGTGAGCTCAGATCTTGCTC  664
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  AATTCACACAGGTGAGAAGCCCTATGAGTGTAATGAGTGTGGAAAAGCCTTTAGAGTGAGCTCAGATCTTGCTC  814

Query  665  AGCATCACAAGATACATACAGGAGAGAAGCCTCACGAATGTCTTGAGTGTCGGAAAGCCTTCACTCAACTCTCA  738
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AGCATCACAAGATACATACAGGAGAGAAGCCTCACGAATGTCTTGAGTGTCGGAAAGCCTTCACTCAACTCTCA  888

Query  739  CATCTCATTCAGCACCAGCGGATCCACACGGGAGAAAGGCCATATGTGTGTCCGTTGTGTGGGAAAGCCTTCAA  812
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CATCTCATTCAGCACCAGCGGATCCACACGGGAGAAAGGCCATATGTGTGTCCGTTGTGTGGGAAAGCCTTCAA  962

Query  813  CCATAGCACTGTTCTGCGGAGCCACCAGAGGGTACACACTGGGGAGAAGCCTCACAGGTGCAATGAGTGTGGGA  886
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CCATAGCACTGTTCTGCGGAGCCACCAGAGGGTACACACTGGGGAGAAGCCTCACAGGTGCAATGAGTGTGGGA  1036

Query  887  AAACCTTCAGTGTGAAGAGGACACTGCTGCAGCACCAGAGGATCCACACCGGGGAGAAGCCCTACACGTGCAGC  960
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  AAACCTTCAGTGTGAAGAGGACACTGCTGCAGCACCAGAGGATCCACACCGGGGAGAAGCCCTACACGTGCAGC  1110

Query  961  GAGTGTGGGAAGGCCTTCAGCGACCGCTCAGTCCTCATTCAGCACCACAACGTGCACACCGGGGAGAAGCCCTA  1034
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GAGTGTGGGAAGGCCTTCAGCGACCGCTCAGTCCTCATTCAGCACCACAACGTGCACACCGGGGAGAAGCCCTA  1184

Query 1035  TGAGTGCAGTGAGTGTGGGAAGACCTTCAGCCACCGCTCCACACTGATGAATCACGAGCGGATCCACACCGAGG  1108
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TGAGTGCAGTGAGTGTGGGAAGACCTTCAGCCACCGCTCCACACTGATGAATCACGAGCGGATCCACACCGAGG  1258

Query 1109  AAAAGCCCTATGCATGCTACGAATGTGGGAAGGCCTTCGTTCAGCACTCACACCTGATCCAGCACCAGAGAGTC  1182
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  AAAAGCCCTATGCATGCTACGAATGTGGGAAGGCCTTCGTTCAGCACTCACACCTGATCCAGCACCAGAGAGTC  1332

Query 1183  CACACTGGGGAGAAGCCCTATGTGTGTGGTGAATGTGGGCACGCCTTCAGTGCACGCCGGTCTCTGATCCAGCA  1256
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  CACACTGGGGAGAAGCCCTATGTGTGTGGTGAATGTGGGCACGCCTTCAGTGCACGCCGGTCTCTGATCCAGCA  1406

Query 1257  TGAGAGAATCCACACAGGTGAAAAGCCCTTCCAGTGCACAGAATGTGGCAAAGCCTTCAGCCTGAAAGCAACTC  1330
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  TGAGAGAATCCACACAGGTGAAAAGCCCTTCCAGTGCACAGAATGTGGCAAAGCCTTCAGCCTGAAAGCAACTC  1480

Query 1331  TGATTGTGCACCTGAGGACCCACACGGGCGAGAAGCCATATGAGTGCAATAGCTGCGGGAAGGCCTTCAGCCAG  1404
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  TGATTGTGCACCTGAGGACCCACACGGGCGAGAAGCCATATGAGTGCAATAGCTGCGGGAAGGCCTTCAGCCAG  1554

Query 1405  TACTCAGTGCTCATCCAGCACCAGCGGATCCACACAGGCGAGAAGCCCTATGAGTGCGGGGAGTGTGGGCGTGC  1478
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  TACTCAGTGCTCATCCAGCACCAGCGGATCCACACAGGCGAGAAGCCCTATGAGTGCGGGGAGTGTGGGCGTGC  1628

Query 1479  CTTCAACCAGCATGGCCACCTAATCCAGCACCAGAAAGTGCACAGAAAGTTG  1530
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  CTTCAACCAGCATGGCCACCTAATCCAGCACCAGAAAGTGCACAGAAAGTTG  1680