Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_12415
- Subject:
- NM_001363104.2
- Aligned Length:
- 1680
- Identities:
- 1467
- Gaps:
- 213
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGGCAGCAGCCAGACTCCTGCCAGTGCCGGCAGGACCCCAGCCCCTGTCGTTCCAGGCCAAGCTGACCTTCGA 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 GGATGTGGCTGTGCTCCTCTCCCAGGATGAATGGGACCGCCTGTGCCCTGCTCAGAGGGGTCTCTACAGAAATG 148
Query 1 --ATGATGGAAACCTATGGGAATGTAGTCTCATTGGGACTTCCAGGATCCAAGCCTGACATAATCTCCCAGCTG 72
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 TGATGATGGAAACCTATGGGAATGTAGTCTCATTGGGACTTCCAGGATCCAAGCCTGACATAATCTCCCAGCTG 222
Query 73 GAGCGAGGGGAAGATCCCTGGGTCCTGGACAGGAAGGGGGCTAAGAAGAGCCAGGGCCTGTGGAGTGACTACTC 146
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GAGCGAGGGGAAGATCCCTGGGTCCTGGACAGGAAGGGGGCTAAGAAGAGCCAGGGCCTGTGGAGTGACTACTC 296
Query 147 AGACAACCTCAAATATGACCACACTACAGCCTGTACACAACAAGACAGTTTATCTTGTCCATGGGAATGTGAAA 220
| ||||||||||
Sbjct 297 A---------------------------------------------------------------GAATGTGAAA 307
Query 221 CCAAGGGAGAGAGTCAAAATACAGACTTGAGTCCGAAGCCATTAATTTCAGAGCAAACAGTGATTCTGGGGAAA 294
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 308 CCAAGGGAGAGAGTCAAAATACAGACTTGAGTCCGAAGCCATTAATTTCAGAGCAAACAGTGATTCTGGGGAAA 381
Query 295 ACACCCTTGGGGAGGATTGATCAAGAAAATAATGAAACAAAGCAAAGCTTCTGTCTGAGTCCAAACTCTGTTGA 368
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 382 ACACCCTTGGGGAGGATTGATCAAGAAAATAATGAAACAAAGCAAAGCTTCTGTCTGAGTCCAAACTCTGTTGA 455
Query 369 CCACCGTGAAGTTCAGGTCTTAAGCCAAAGCATGCCACTCACTCCGCACCAGGCAGTGCCTAGTGGAGAGAGGC 442
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 456 CCACCGTGAAGTTCAGGTCTTAAGCCAAAGCATGCCACTCACTCCGCACCAGGCAGTGCCTAGTGGAGAGAGGC 529
Query 443 CCTACATGTGTGTTGAGTGTGGGAAGTGCTTTGGCCGGAGTTCCCACCTCCTTCAGCATCAGCGTATCCACACT 516
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 530 CCTACATGTGTGTTGAGTGTGGGAAGTGCTTTGGCCGGAGTTCCCACCTCCTTCAGCATCAGCGTATCCACACT 603
Query 517 GGAGAGAAGCCCTATGTGTGCAGTGTATGTGGGAAGGCCTTCAGCCAGAGCTCAGTCCTTAGTAAACACAGGAG 590
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 604 GGAGAGAAGCCCTATGTGTGCAGTGTATGTGGGAAGGCCTTCAGCCAGAGCTCAGTCCTTAGTAAACACAGGAG 677
Query 591 AATTCACACAGGTGAGAAGCCCTATGAGTGTAATGAGTGTGGAAAAGCCTTTAGAGTGAGCTCAGATCTTGCTC 664
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 678 AATTCACACAGGTGAGAAGCCCTATGAGTGTAATGAGTGTGGAAAAGCCTTTAGAGTGAGCTCAGATCTTGCTC 751
Query 665 AGCATCACAAGATACATACAGGAGAGAAGCCTCACGAATGTCTTGAGTGTCGGAAAGCCTTCACTCAACTCTCA 738
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 752 AGCATCACAAGATACATACAGGAGAGAAGCCTCACGAATGTCTTGAGTGTCGGAAAGCCTTCACTCAACTCTCA 825
Query 739 CATCTCATTCAGCACCAGCGGATCCACACGGGAGAAAGGCCATATGTGTGTCCGTTGTGTGGGAAAGCCTTCAA 812
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 826 CATCTCATTCAGCACCAGCGGATCCACACGGGAGAAAGGCCATATGTGTGTCCGTTGTGTGGGAAAGCCTTCAA 899
Query 813 CCATAGCACTGTTCTGCGGAGCCACCAGAGGGTACACACTGGGGAGAAGCCTCACAGGTGCAATGAGTGTGGGA 886
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 900 CCATAGCACTGTTCTGCGGAGCCACCAGAGGGTACACACTGGGGAGAAGCCTCACAGGTGCAATGAGTGTGGGA 973
Query 887 AAACCTTCAGTGTGAAGAGGACACTGCTGCAGCACCAGAGGATCCACACCGGGGAGAAGCCCTACACGTGCAGC 960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 974 AAACCTTCAGTGTGAAGAGGACACTGCTGCAGCACCAGAGGATCCACACCGGGGAGAAGCCCTACACGTGCAGC 1047
Query 961 GAGTGTGGGAAGGCCTTCAGCGACCGCTCAGTCCTCATTCAGCACCACAACGTGCACACCGGGGAGAAGCCCTA 1034
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1048 GAGTGTGGGAAGGCCTTCAGCGACCGCTCAGTCCTCATTCAGCACCACAACGTGCACACCGGGGAGAAGCCCTA 1121
Query 1035 TGAGTGCAGTGAGTGTGGGAAGACCTTCAGCCACCGCTCCACACTGATGAATCACGAGCGGATCCACACCGAGG 1108
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1122 TGAGTGCAGTGAGTGTGGGAAGACCTTCAGCCACCGCTCCACACTGATGAATCACGAGCGGATCCACACCGAGG 1195
Query 1109 AAAAGCCCTATGCATGCTACGAATGTGGGAAGGCCTTCGTTCAGCACTCACACCTGATCCAGCACCAGAGAGTC 1182
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1196 AAAAGCCCTATGCATGCTACGAATGTGGGAAGGCCTTCGTTCAGCACTCACACCTGATCCAGCACCAGAGAGTC 1269
Query 1183 CACACTGGGGAGAAGCCCTATGTGTGTGGTGAATGTGGGCACGCCTTCAGTGCACGCCGGTCTCTGATCCAGCA 1256
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1270 CACACTGGGGAGAAGCCCTATGTGTGTGGTGAATGTGGGCACGCCTTCAGTGCACGCCGGTCTCTGATCCAGCA 1343
Query 1257 TGAGAGAATCCACACAGGTGAAAAGCCCTTCCAGTGCACAGAATGTGGCAAAGCCTTCAGCCTGAAAGCAACTC 1330
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1344 TGAGAGAATCCACACAGGTGAAAAGCCCTTCCAGTGCACAGAATGTGGCAAAGCCTTCAGCCTGAAAGCAACTC 1417
Query 1331 TGATTGTGCACCTGAGGACCCACACGGGCGAGAAGCCATATGAGTGCAATAGCTGCGGGAAGGCCTTCAGCCAG 1404
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1418 TGATTGTGCACCTGAGGACCCACACGGGCGAGAAGCCATATGAGTGCAATAGCTGCGGGAAGGCCTTCAGCCAG 1491
Query 1405 TACTCAGTGCTCATCCAGCACCAGCGGATCCACACAGGCGAGAAGCCCTATGAGTGCGGGGAGTGTGGGCGTGC 1478
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1492 TACTCAGTGCTCATCCAGCACCAGCGGATCCACACAGGCGAGAAGCCCTATGAGTGCGGGGAGTGTGGGCGTGC 1565
Query 1479 CTTCAACCAGCATGGCCACCTAATCCAGCACCAGAAAGTGCACAGAAAGTTG 1530
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1566 CTTCAACCAGCATGGCCACCTAATCCAGCACCAGAAAGTGCACAGAAAGTTG 1617