Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_12415
• Subject: XM_006520929.3
• Aligned Length: 1683
• Identities: 1226
• Gaps: 231

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGGCAGCAGCCGGGCTTCTACCGCTGCCAGCAGCACCACAGGCCAAAGTGACCTTTGAGGATGTGGCTGTTCT  74

Query    1  -------------------------------------------------------------ATGATGGAAACCT  13
                                                                         ||||||||.||||
Sbjct   75  GCTGTCTCAGGAGGAGTGGGCCCGCCTGGGCCCTGCTCAGCGGGGCCTCTACCGACACGTCATGATGGAGACCT  148

Query   14  ATGGGAATGTAGTCTCATTGGGACTTCCAGGATCCAAGCCTGACATAATCTCCCAGCTGGAGCGAGGGGAAGAT  87
            |.|||||||||||||||.||||||||||||||||.|||||||...|.||||||||||||||||||||.|||||.
Sbjct  149  ACGGGAATGTAGTCTCACTGGGACTTCCAGGATCTAAGCCTGTTGTGATCTCCCAGCTGGAGCGAGGAGAAGAC  222

Query   88  CCCTGGGTCC----TGGACA-GGAAGGGGGCTAAGAAGAGCCAGGGCCTGTGGAGTGACTACTCAGACAACCTC  156
            ||.|||||||    |||||| ||||..|.|||     |||||||.|||||.|.||||||.|||||         
Sbjct  223  CCGTGGGTCCTGGATGGACAGGGAACCGAGCT-----GAGCCAGAGCCTGGGAAGTGACCACTCA---------  282

Query  157  AAATATGACCACACTACAGCCTGTACACAACAAGACAGTTTATCTTGTCCATGGGAATGTGAAACCAAGGGAGA  230
                                                                  |||||..||.||||||.|||
Sbjct  283  ------------------------------------------------------GAATGCAAAGCCAAGGAAGA  302

Query  231  GAGTCAAAATACAGACTTGA--GTCCGAAGCCATTAATTTCAG----AGCAAACAGTGATTCTGGGGAAAACAC  298
            ||..|||||.||||||||||  ||.|.|  ||||||||.||||    ||| |.|||.||..|||..|.||||||
Sbjct  303  GAACCAAAACACAGACTTGAATGTGCCA--CCATTAATCTCAGACGAAGC-ATCAGCGACGCTGACGGAAACAC  373

Query  299  CCTTGGGGAGGATTGATCAAGAAAATAATGAAACA-AAGCAAAGCTTCTGTCTG----AGTCCAAACTCTGTTG  367
            |..||.|||.|.|||.|.|||||..|.|..||||| ||.|.|||     |||||    ||||||||..|..|||
Sbjct  374  CGCTGAGGAAGGTTGCTGAAGAACGTTACAAAACAGAACCGAAG-----GTCTGCCCCAGTCCAAAGCCCATTG  442

Query  368  ACCACCGTGAA-GTTCAGGTCTTAAGCCAAAGCATGCCACTCACTCCG-CACCAGGCAGTGCCTAGTGGAGAGA  439
            .|| ||..||| |..||.|..||.|.||..||..|.||..|..| ||| |.||||.|.|..||.||||..||||
Sbjct  443  GCC-CCCAGAATGCCCACGGGTTGAACCCTAGTGTACCCGTTGC-CCGACCCCAGACGGCTCCCAGTGTTGAGA  514

Query  440  GGCCCTACATGTGTGTTGAGTGTGGGAAGTGCTTTGGCCGGAGTTCCCACCTCCTTCAGCATCAGCGTATCCAC  513
            |.|||||.||.||..||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.||.|||
Sbjct  515  GACCCTATATCTGCATTGAGTGTGGAAAGTGCTTTGGTCGGAGCTCCCATCTCCTTCAGCATCAGCGAATACAC  588

Query  514  ACTGGAGAGAAGCCCTATGTGTGCAGTGTATGTGGGAAGGCCTTCAGCCAGAGCTCAGTCCTTAGTAAACACAG  587
            |||||.|||||||||||.||.|||..||||||.||.|||||.|||||||||||.||.|||||.||.||.|||||
Sbjct  589  ACTGGCGAGAAGCCCTACGTATGCCATGTATGCGGAAAGGCTTTCAGCCAGAGTTCCGTCCTGAGCAAGCACAG  662

Query  588  GAGAATTCACACAGGTGAGAAGCCCTATGAGTGTAATGAGTGTGGAAAAGCCTTTAGAGTGAGCTCAGATCTTG  661
            |.|.||.|||||.||.|||||||||||.||||||||.||.|||||.|||||||||.|.|||||.||.||.||||
Sbjct  663  GCGGATCCACACGGGCGAGAAGCCCTACGAGTGTAACGAATGTGGGAAAGCCTTTCGCGTGAGTTCCGACCTTG  736

Query  662  CTCAGCATCACAAGATACATACAGGAGAGAAGCCTCACGAATGTCTTGAGTGTCGGAAAGCCTTCACTCAACTC  735
            |.|||||.||||||||.||.||.|||||||||||||||||.|||||.||.|||.||||.||.|||||.||.|||
Sbjct  737  CCCAGCACCACAAGATCCACACCGGAGAGAAGCCTCACGAGTGTCTGGAATGTGGGAAGGCGTTCACCCAGCTC  810

Query  736  TCACATCTCATTCAGCACCAGCGGATCCACACGGGAGAAAGGCCATATGTGTGTCCGTTGTGTGGGAAAGCCTT  809
            ||.||.|||||.||.||.|||||||||||||||||.||..||||.||.||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct  811  TCCCACCTCATCCAACATCAGCGGATCCACACGGGGGAGCGGCCCTACGTGTGTCCCTTGTGTGGGAAAGCCTT  884

Query  810  CAACCATAGCACTGTTCTGCGGAGCCACCAGAGGGTACACACTGGGGAGAAGCCTCACAGGTGCAATGAGTGTG  883
            ||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.||||||..|||||||
Sbjct  885  CAACCACAGCACCGTCCTGCGGAGCCACCAGAGGGTGCACACTGGGGAGAAGCCTCACGGGTGCAGCGAGTGTG  958

Query  884  GGAAAACCTTCAGTGTGAAGAGGACACTGCTGCAGCACCAGAGGATCCACACCGGGGAGAAGCCCTACACGTGC  957
            ||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||.||.|.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  959  GGAAGACCTTCAGCGTGAAGAGGACGCTGCTGCAGCACCAGCGGGTGCACACCGGGGAGAAGCCCTACACGTGC  1032

Query  958  AGCGAGTGTGGGAAGGCCTTCAGCGACCGCTCAGTCCTCATTCAGCACCACAACGTGCACACCGGGGAGAAGCC  1031
            ||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||.||.||.||||||||.|||||.|||||||||||
Sbjct 1033  AGCGAGTGCGGGAAGGCCTTCAGCGACCGCTCCGTGCTCATCCAACATCACAACGTACACACTGGGGAGAAGCC  1106

Query 1032  CTATGAGTGCAGTGAGTGTGGGAAGACCTTCAGCCACCGCTCCACACTGATGAATCACGAGCGGATCCACACCG  1105
            .||.||||||||.|||||.||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||.||||.|||||..
Sbjct 1107  GTACGAGTGCAGCGAGTGCGGCAAGACCTTTAGCCACCGCTCCACCCTGATGAATCACGAGAGGATTCACACGC  1180

Query 1106  AGGAAAAGCCCTATGCATGCTACGAATGTGGGAAGGCCTTCGTTCAGCACTCACACCTGATCCAGCACCAGAGA  1179
            ||||.||||||||.||.||||||||.||.|||||||||||.||.||||||||.||.||.||||||||.||||||
Sbjct 1181  AGGAGAAGCCCTACGCGTGCTACGAGTGCGGGAAGGCCTTTGTCCAGCACTCGCATCTCATCCAGCATCAGAGA  1254

Query 1180  GTCCACACTGGGGAGAAGCCCTATGTGTGTGGTGAATGTGGGCACGCCTTCAGTGCACGCCGGTCTCTGATCCA  1253
            ||||||||.||.|||||.|||||.||||||||.||.|||||.||.||.|||||.|||||||||||.||||||||
Sbjct 1255  GTCCACACGGGAGAGAAACCCTACGTGTGTGGCGAGTGTGGCCATGCTTTCAGCGCACGCCGGTCCCTGATCCA  1328

Query 1254  GCATGAGAGAATCCACACAGGTGAAAAGCCCTTCCAGTGCACAGAATGTGGCAAAGCCTTCAGCCTGAAAGCAA  1327
            |||||||.|||||||||||||.||.||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1329  GCATGAGCGAATCCACACAGGCGAGAAACCCTTTCAGTGCACAGAGTGTGGCAAAGCCTTCAGCCTGAAAGCAA  1402

Query 1328  CTCTGATTGTGCACCTGAGGACCCACACGGGCGAGAAGCCATATGAGTGCAATAGCTGCGGGAAGGCCTTCAGC  1401
            |||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||
Sbjct 1403  CTCTGATCGTGCACCTGAGGACCCACACGGGCGAGAAACCCTATGAGTGCAATAGCTGCGGCAAGGCGTTCAGC  1476

Query 1402  CAGTACTCAGTGCTCATCCAGCACCAGCGGATCCACACAGGCGAGAAGCCCTATGAGTGCGGGGAGTGTGGGCG  1475
            ||||||||.|||||||||||.||||||.||||||||||.||.|||||.|||||||||||.||.|||||.||.||
Sbjct 1477  CAGTACTCGGTGCTCATCCAACACCAGAGGATCCACACCGGAGAGAAACCCTATGAGTGTGGCGAGTGCGGACG  1550

Query 1476  TGCCTTCAACCAGCATGGCCACCTAATCCAGCACCAGAAAGTGCACAGAAAGTTG  1530
            .||||||||||||||.||||||||.|||||.||.||||||||.||||..|||.||
Sbjct 1551  GGCCTTCAACCAGCACGGCCACCTGATCCAACATCAGAAAGTACACAAGAAGCTG  1605