Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_12415
- Subject:
- XM_011245617.2
- Aligned Length:
- 1683
- Identities:
- 1226
- Gaps:
- 231
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGGCAGCAGCCGGGCTTCTACCGCTGCCAGCAGCACCACAGGCCAAAGTGACCTTTGAGGATGTGGCTGTTCT 74
Query 1 -------------------------------------------------------------ATGATGGAAACCT 13
||||||||.||||
Sbjct 75 GCTGTCTCAGGAGGAGTGGGCCCGCCTGGGCCCTGCTCAGCGGGGCCTCTACCGACACGTCATGATGGAGACCT 148
Query 14 ATGGGAATGTAGTCTCATTGGGACTTCCAGGATCCAAGCCTGACATAATCTCCCAGCTGGAGCGAGGGGAAGAT 87
|.|||||||||||||||.||||||||||||||||.|||||||...|.||||||||||||||||||||.|||||.
Sbjct 149 ACGGGAATGTAGTCTCACTGGGACTTCCAGGATCTAAGCCTGTTGTGATCTCCCAGCTGGAGCGAGGAGAAGAC 222
Query 88 CCCTGGGTCC----TGGACA-GGAAGGGGGCTAAGAAGAGCCAGGGCCTGTGGAGTGACTACTCAGACAACCTC 156
||.||||||| |||||| ||||..|.||| |||||||.|||||.|.||||||.|||||
Sbjct 223 CCGTGGGTCCTGGATGGACAGGGAACCGAGCT-----GAGCCAGAGCCTGGGAAGTGACCACTCA--------- 282
Query 157 AAATATGACCACACTACAGCCTGTACACAACAAGACAGTTTATCTTGTCCATGGGAATGTGAAACCAAGGGAGA 230
|||||..||.||||||.|||
Sbjct 283 ------------------------------------------------------GAATGCAAAGCCAAGGAAGA 302
Query 231 GAGTCAAAATACAGACTTGA--GTCCGAAGCCATTAATTTCAG----AGCAAACAGTGATTCTGGGGAAAACAC 298
||..|||||.|||||||||| ||.|.| ||||||||.|||| ||| |.|||.||..|||..|.||||||
Sbjct 303 GAACCAAAACACAGACTTGAATGTGCCA--CCATTAATCTCAGACGAAGC-ATCAGCGACGCTGACGGAAACAC 373
Query 299 CCTTGGGGAGGATTGATCAAGAAAATAATGAAACA-AAGCAAAGCTTCTGTCTG----AGTCCAAACTCTGTTG 367
|..||.|||.|.|||.|.|||||..|.|..||||| ||.|.||| ||||| ||||||||..|..|||
Sbjct 374 CGCTGAGGAAGGTTGCTGAAGAACGTTACAAAACAGAACCGAAG-----GTCTGCCCCAGTCCAAAGCCCATTG 442
Query 368 ACCACCGTGAA-GTTCAGGTCTTAAGCCAAAGCATGCCACTCACTCCG-CACCAGGCAGTGCCTAGTGGAGAGA 439
.|| ||..||| |..||.|..||.|.||..||..|.||..|..| ||| |.||||.|.|..||.||||..||||
Sbjct 443 GCC-CCCAGAATGCCCACGGGTTGAACCCTAGTGTACCCGTTGC-CCGACCCCAGACGGCTCCCAGTGTTGAGA 514
Query 440 GGCCCTACATGTGTGTTGAGTGTGGGAAGTGCTTTGGCCGGAGTTCCCACCTCCTTCAGCATCAGCGTATCCAC 513
|.|||||.||.||..||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.||.|||
Sbjct 515 GACCCTATATCTGCATTGAGTGTGGAAAGTGCTTTGGTCGGAGCTCCCATCTCCTTCAGCATCAGCGAATACAC 588
Query 514 ACTGGAGAGAAGCCCTATGTGTGCAGTGTATGTGGGAAGGCCTTCAGCCAGAGCTCAGTCCTTAGTAAACACAG 587
|||||.|||||||||||.||.|||..||||||.||.|||||.|||||||||||.||.|||||.||.||.|||||
Sbjct 589 ACTGGCGAGAAGCCCTACGTATGCCATGTATGCGGAAAGGCTTTCAGCCAGAGTTCCGTCCTGAGCAAGCACAG 662
Query 588 GAGAATTCACACAGGTGAGAAGCCCTATGAGTGTAATGAGTGTGGAAAAGCCTTTAGAGTGAGCTCAGATCTTG 661
|.|.||.|||||.||.|||||||||||.||||||||.||.|||||.|||||||||.|.|||||.||.||.||||
Sbjct 663 GCGGATCCACACGGGCGAGAAGCCCTACGAGTGTAACGAATGTGGGAAAGCCTTTCGCGTGAGTTCCGACCTTG 736
Query 662 CTCAGCATCACAAGATACATACAGGAGAGAAGCCTCACGAATGTCTTGAGTGTCGGAAAGCCTTCACTCAACTC 735
|.|||||.||||||||.||.||.|||||||||||||||||.|||||.||.|||.||||.||.|||||.||.|||
Sbjct 737 CCCAGCACCACAAGATCCACACCGGAGAGAAGCCTCACGAGTGTCTGGAATGTGGGAAGGCGTTCACCCAGCTC 810
Query 736 TCACATCTCATTCAGCACCAGCGGATCCACACGGGAGAAAGGCCATATGTGTGTCCGTTGTGTGGGAAAGCCTT 809
||.||.|||||.||.||.|||||||||||||||||.||..||||.||.||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 811 TCCCACCTCATCCAACATCAGCGGATCCACACGGGGGAGCGGCCCTACGTGTGTCCCTTGTGTGGGAAAGCCTT 884
Query 810 CAACCATAGCACTGTTCTGCGGAGCCACCAGAGGGTACACACTGGGGAGAAGCCTCACAGGTGCAATGAGTGTG 883
||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.||||||..|||||||
Sbjct 885 CAACCACAGCACCGTCCTGCGGAGCCACCAGAGGGTGCACACTGGGGAGAAGCCTCACGGGTGCAGCGAGTGTG 958
Query 884 GGAAAACCTTCAGTGTGAAGAGGACACTGCTGCAGCACCAGAGGATCCACACCGGGGAGAAGCCCTACACGTGC 957
||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||.||.|.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 959 GGAAGACCTTCAGCGTGAAGAGGACGCTGCTGCAGCACCAGCGGGTGCACACCGGGGAGAAGCCCTACACGTGC 1032
Query 958 AGCGAGTGTGGGAAGGCCTTCAGCGACCGCTCAGTCCTCATTCAGCACCACAACGTGCACACCGGGGAGAAGCC 1031
||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||.||.||.||||||||.|||||.|||||||||||
Sbjct 1033 AGCGAGTGCGGGAAGGCCTTCAGCGACCGCTCCGTGCTCATCCAACATCACAACGTACACACTGGGGAGAAGCC 1106
Query 1032 CTATGAGTGCAGTGAGTGTGGGAAGACCTTCAGCCACCGCTCCACACTGATGAATCACGAGCGGATCCACACCG 1105
.||.||||||||.|||||.||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||.||||.|||||..
Sbjct 1107 GTACGAGTGCAGCGAGTGCGGCAAGACCTTTAGCCACCGCTCCACCCTGATGAATCACGAGAGGATTCACACGC 1180
Query 1106 AGGAAAAGCCCTATGCATGCTACGAATGTGGGAAGGCCTTCGTTCAGCACTCACACCTGATCCAGCACCAGAGA 1179
||||.||||||||.||.||||||||.||.|||||||||||.||.||||||||.||.||.||||||||.||||||
Sbjct 1181 AGGAGAAGCCCTACGCGTGCTACGAGTGCGGGAAGGCCTTTGTCCAGCACTCGCATCTCATCCAGCATCAGAGA 1254
Query 1180 GTCCACACTGGGGAGAAGCCCTATGTGTGTGGTGAATGTGGGCACGCCTTCAGTGCACGCCGGTCTCTGATCCA 1253
||||||||.||.|||||.|||||.||||||||.||.|||||.||.||.|||||.|||||||||||.||||||||
Sbjct 1255 GTCCACACGGGAGAGAAACCCTACGTGTGTGGCGAGTGTGGCCATGCTTTCAGCGCACGCCGGTCCCTGATCCA 1328
Query 1254 GCATGAGAGAATCCACACAGGTGAAAAGCCCTTCCAGTGCACAGAATGTGGCAAAGCCTTCAGCCTGAAAGCAA 1327
|||||||.|||||||||||||.||.||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1329 GCATGAGCGAATCCACACAGGCGAGAAACCCTTTCAGTGCACAGAGTGTGGCAAAGCCTTCAGCCTGAAAGCAA 1402
Query 1328 CTCTGATTGTGCACCTGAGGACCCACACGGGCGAGAAGCCATATGAGTGCAATAGCTGCGGGAAGGCCTTCAGC 1401
|||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||
Sbjct 1403 CTCTGATCGTGCACCTGAGGACCCACACGGGCGAGAAACCCTATGAGTGCAATAGCTGCGGCAAGGCGTTCAGC 1476
Query 1402 CAGTACTCAGTGCTCATCCAGCACCAGCGGATCCACACAGGCGAGAAGCCCTATGAGTGCGGGGAGTGTGGGCG 1475
||||||||.|||||||||||.||||||.||||||||||.||.|||||.|||||||||||.||.|||||.||.||
Sbjct 1477 CAGTACTCGGTGCTCATCCAACACCAGAGGATCCACACCGGAGAGAAACCCTATGAGTGTGGCGAGTGCGGACG 1550
Query 1476 TGCCTTCAACCAGCATGGCCACCTAATCCAGCACCAGAAAGTGCACAGAAAGTTG 1530
.||||||||||||||.||||||||.|||||.||.||||||||.||||..|||.||
Sbjct 1551 GGCCTTCAACCAGCACGGCCACCTGATCCAACATCAGAAAGTACACAAGAAGCTG 1605