Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_12427
• Subject: XM_006503871.1
• Aligned Length: 2804
• Identities: 1868
• Gaps: 691

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGGAGCTGCGCTGTGGGGGATTGCTGTTCAGTTCTCGCTTTGATTCAGGGAACCTAGCCCATGTGGAAAAGGT  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  GGAGACTGTGTCTAGTGATGGGGAAGGCGTAGGAGGGGTGGCAACAGCCCCCGCTAGTGGGTCTGCTGCTTCCC  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  CTGACTACGAGTTCAACGTGTGGACCCGGCCTGACTGTGCTGAAACGGAATATGAAAATGGCAACAGGTCATGG  222

Query    1  ------------------------------------------------------ATGAACATGAACAAGCAGAG  20
                                                                  |||||||||||||||||.||
Sbjct  223  TTCTACTTCAGTGTCCGGGGAGGGACTCCAGGAAAGCTTATCAAGATCAACATTATGAACATGAACAAGCAAAG  296

Query   21  CAAGCTGTATTCCCAGGGCATGGCCCCCTTTGTGCGCACACTGCCCACCCGGCCACGCTGGGAACGCATTCGAG  94
            |||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct  297  CAAACTGTATTCCCAGGGCATGGCCCCCTTTGTGCGCACACTGCCTTCCCGGCCACGCTGGGAACGCATTAGAG  370

Query   95  ACCGGCCCACCTTTG-----------------------------------------------------------  109
            |.|||||||||||||                                                           
Sbjct  371  AGCGGCCCACCTTTGAGCTGGGGTCCAAGCTGAGCCCCTGCTTCAGCAAGCCTGAAGAAGCTGGTTCTCATGTG  444

Query  110  ----------------------------AGATGACAGAGACGCAGTTTGTGTTATCCTTTGTTCATCGTTTCGT  155
                                        |||||||||||||.|||||||||.|||||||||||||.||||||||
Sbjct  445  GAGAGTGTCAGAGGGAGGGAGTTGGTAAAGATGACAGAGACACAGTTTGTGCTATCCTTTGTTCACCGTTTCGT  518

Query  156  GGAGGGCCGTGGGGCCACCACCTTCTTCGCCTTCTGCTACCCCTTCTCCTACAGTGACTGCCAGGAACTGCTAA  229
            .||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|
Sbjct  519  AGAGGGCCGGGGAGCCACCACCTTCTTCGCCTTCTGCTACCCCTTCTCCTACAGTGACTGCCAGGATCTGCTGA  592

Query  230  ACCAGCTAGACCAGCGCTTTCCGGAGAACCACCCTACCCATAGCAGCCCCCTGGATACCATCTATTACCATCGG  303
            .|||||||||||||||||||.|.|||||..||.|||||||||||||.||.|||||||..||.||||||||.||.
Sbjct  593  GCCAGCTAGACCAGCGCTTTTCAGAGAATTACTCTACCCATAGCAGTCCTCTGGATAGTATTTATTACCACCGA  666

Query  304  GAGCTCCTTTGCTATTCTCTGGATGGACTTCGTGTAGATCTGCTGACGATCACTTCCTGCCATGGGCTTCGAGA  377
            |||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GAGCTTCTCTGCTATTCTCTGGATGGACTTCGTGTAGATCTACTAACAATCACTTCCTGCCATGGGCTTCGAGA  740

Query  378  AGATCGAGAGCCCCGTCTAGAGCAGCTATTTCCTGATACCAGCACCCCTCGACCATTCCGTTTCGCAGGCAAGA  451
            .|||||.||||||||.|||||||||||||||||||||..|.||||.||.|||||||||||||||.|||||||.|
Sbjct  741  TGATCGGGAGCCCCGACTAGAGCAGCTATTTCCTGATCTCGGCACTCCCCGACCATTCCGTTTCACAGGCAAAA  814

Query  452  GGATATTCTTCTTAAGCAGTAGAGTACACCCAGGGGAGACTCCATCTAGCTTTGTCTTCAATGGCTTTCTGGAC  525
            ||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct  815  GGATATTCTTCTTAAGCAGTAGGGTACACCCTGGAGAGACTCCATCTAGCTTTGTGTTCAATGGCTTTCTGGAC  888

Query  526  TTCATCCTCCGACCTGATGATCCCCGGGCCCAAACCCTCCGTCGCCTCTTCGTCTTTAAGCTGATTCCCATGTT  599
            ||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||.||.||||||.|||||||||||||
Sbjct  889  TTCATCCTTCGACCTGATGATCCCCGGGCACAAACTCTCCGTCGACTCTTTGTTTTTAAGTTGATTCCCATGTT  962

Query  600  GAACCCCGATGGTGTGGTCCGGGGACACTACCGCACAGACTCACGTGGAGTGAATCTGAACCGTCAGTACCTGA  673
            .|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct  963  AAACCCTGATGGTGTGGTCCGGGGCCACTACCGCACGGACTCCCGTGGAGTGAATCTGAACCGTCAGTACTTGA  1036

Query  674  AGCCTGATGCCGTCCTGCACCCGGCCATCTATGGGGCCAAAGCTGTGCTTCTCTACCACCATGTGCACTCTCGT  747
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||.||.||.||||||||..|.
Sbjct 1037  AGCCTGATGCCGTCCTGCACCCGGCCATCTATGGCGCCAAAGCTGTGCTGCTTTATCATCACGTGCACTCGAGG  1110

Query  748  CTGAACTCCCAGAGTTCCTCTGAGCACCAGCCCAGT-TCCTGTCTCCCTCCTGATGCTCCTGTTTCTGACCTGG  820
            ||.|||.||.|||||.||.|..|.||.||.||||.| ||| .|||||||||.||.||.|||.|.||||||||.|
Sbjct 1111  CTCAACGCCAAGAGTCCCACGAACCAGCAACCCACTCTCC-ATCTCCCTCCGGAAGCCCCTCTCTCTGACCTCG  1183

Query  821  AGAAAGCCAACAATCTCCAAAATGAAGCTCAGTGTGGGCACTCAGCTGACAGGCATAACGCTG-----AAGCCT  889
            ||||||||||.||||||||.|||||||||||....|||||.|||.||||..||.|.|||.|||     ..||||
Sbjct 1184  AGAAAGCCAATAATCTCCACAATGAAGCTCACCTCGGGCAGTCACCTGATGGGGAAAACCCTGCGACTTGGCCT  1257

Query  890  GGAAACAAACAGAGCCAGCAGAACAGAAG-CTCAACAGTGTGTGGATTATGCCACAAC--AGTCTGCGGGGCTT  960
            |     |.|||||||||||||||.||||| || .||..|||||||.||||||||||.|  |.||  |.|..||.
Sbjct 1258  G-----AGACAGAGCCAGCAGAAGAGAAGACT-GACCCTGTGTGGCTTATGCCACAGCCAATTC--CTGAACTC  1323

Query  961  GAAGAGTCAGCCCCTGATACCATCCCCCCCAAAGAGAGTGGCGTTGCTTACTATGTGGACCTGCATGGACATGC  1034
            ||.|||.||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||.||||.||||||||
Sbjct 1324  GAGGAGCCAGCCCCTGACACCATCCCCCCAAAAGAGAGTGGTGTTGCTTACTATGTAGACTTGCACGGACATGC  1397

Query 1035  TTCCAAAAGGGGCTGCTTCATGTACGGAAACAGCTTTAGTGATGAGAGCACCCAGGTGGAAAACATGCTATATC  1108
            ||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1398  TTCCAAAAGGGGCTGCTTCATGTATGGCAACAGCTTTAGTGACGAGAGCACCCAGGTGGAAAACATGCTATATC  1471

Query 1109  CAAAGCTCATCTCCTTGAATTCAGCCCACTTCGACTTCCAGGGCTGCAATTTCTCAGAGAAGAATATGTATGCC  1182
            |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 1472  CAAAGCTCATCTCCTTGAATTCAGCCCACTTTGACTTCCAGGGCTGCAATTTCTCAGAGAAGAACATGTATGCC  1545

Query 1183  CGAGACCGTAGAGATGGCCAGTCTAAAGAGGGAAGCGGCCGTGTTGCAATCTACAAAGCCTCAGGGATAATCCA  1256
            |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1546  CGAGACCGTAGAGATGGCCAGTCCAAAGAGGGAAGCGGCCGTGTCGCAATCTACAAAGCCTCAGGGATAATCCA  1619

Query 1257  CAGCTACACACTTGAATGCAACTACAACACTGGACGCTCAGTAAACAGCATCCCTGCTGCCTGCCATGACAATG  1330
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 1620  CAGCTACACACTTGAATGCAACTACAACACTGGACGCTCAGTCAACAGCATCCCTGCTGCCTGCCATGACAACG  1693

Query 1331  GGCGTGCCAGCCCCCCTCCCCCGCCGGCTTTCCCCTCCAGATACACTGTGGAACTATTTGAGCAGGTGGGACGA  1404
            ||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||
Sbjct 1694  GGCGCGCCAGCCCCCCTCCCCCTCCGGCTTTCCCCTCCAGATACACTGTGGAACTATTCGAGCAGGTGGGGCGA  1767

Query 1405  GCTATGGCCATTGCAGCCCTGGACATGGCGGAATGTAATCCGTGGCCCCGAATTGTACTGTCAGAGCACAGCAG  1478
            |||||||||||.|||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||
Sbjct 1768  GCTATGGCCATCGCAGCTCTGGACATGGCAGAGTGTAATCCGTGGCCCCGAATTGTGCTGTCGGAACACAGCAG  1841

Query 1479  CCTTACTAATCTACGGGCCTGGATGCTGAAACATGTACGCAACAGCCGAGGCCTAAGCAGCACTCTGAATGTGG  1552
            |||.||.||.||.||.|||||||||||||..||.||.|||||||||.||||.||.|.|||..||..|||..|||
Sbjct 1842  CCTCACCAACCTGCGAGCCTGGATGCTGAGGCACGTGCGCAACAGCAGAGGGCTGACCAGTGCTGGGAACATGG  1915

Query 1553  GTGTCAACAAGAA--GAGGGGCCTTCGAACTCCACCCAAAAGTCACAATGGGTTGCCTGTCTCCTGCTCCGAAA  1624
            |.|..|.||||||  |||||||  ||||||.||.||||||||..||||..|.||||||||.||||||||.||||
Sbjct 1916  GCGCGAGCAAGAAGCGAGGGGC--TCGAACCCCTCCCAAAAGCAACAACAGCTTGCCTGTTTCCTGCTCTGAAA  1987

Query 1625  ACACCTTGAGTCGGGCACGAAGTTTTAGCACCGGCACAAGTGCCGGTGGTAGCAGCAGCAGCCAACAAAATTCT  1698
            |..|..||||.||||..||.|||||||||||||||||.|||.|.|||||.||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1988  ATGCTCTGAGCCGGGTTCGCAGTTTTAGCACCGGCACGAGTACTGGTGGCAGCAGCAGCAGCCAACAAAACTCT  2061

Query 1699  CCACAGATGAAGAATTCCCCCAGCTTTCCTTTTCATGGCAGTCGGCCTGCAGGGCTGCCAGGCCTGGGCTCTAG  1772
            ||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||.||||.|||||.|||||||||||||||||
Sbjct 2062  CCACAGATGAAGAACTCTCCCAGCTTCCCTTTTCATGGCAGTCGGACTGCGGGGCTACCAGGCCTGGGCTCTAG  2135

Query 1773  TACCCAAAAGGTCACCCACCGGGTGCTGGGCCCCGTCAGAGAGCCCCGAAGC-CAGGACAGGAGACGGCAGCAG  1845
            .|||||||||||||.|||.||||||||||||||.|||||||||||||||.|| || |||||.||.||||..|||
Sbjct 2136  CACCCAAAAGGTCAGCCATCGGGTGCTGGGCCCTGTCAGAGAGCCCCGATGCTCA-GACAGAAGGCGGCGACAG  2208

Query 1846  CAGCCCCTGAACCATCG---TCCTGCAGGCAGCCTCGCTCCATCCCCAGCTCCTACTAGTTCTGGCCCAGCCTC  1916
            |||||.|||||||||||   |.|..||.|||||||.||.|||||||||.|||...||||||||||||||.||||
Sbjct 2209  CAGCCACTGAACCATCGCTCTACCACAAGCAGCCTGGCCCCATCCCCAACTCTGGCTAGTTCTGGCCCAACCTC  2282

Query 1917  CTCACACAAGCTGGGCTCCTGTCTACTGCCTGATTCATTCAACATACCAGGGAGCAGTTGCTCACTCTTGTCCT  1990
            |||||..||..||||||||||.||.||.||..|||||.|||.|.||.||||||||||.||||||.|||.|||.|
Sbjct 2283  CTCACGAAACATGGGCTCCTGCCTCCTACCCAATTCACTCAGCTTATCAGGGAGCAGCTGCTCATTCTCGTCTT  2356

Query 1991  CTGGAGACAAACCAGAGGCTGTCATGGTAATCGGGAAAGGTCTGCTAGGGACTGGAGCTCGGATGCCCTGCATC  2064
            |.||.|||||.|||||||||||||||||.||.||||||.|.||.||||||.||||.||||||||.||.|||||.
Sbjct 2357  CAGGGGACAAGCCAGAGGCTGTCATGGTGATTGGGAAAAGCCTACTAGGGGCTGGTGCTCGGATCCCTTGCATT  2430

Query 2065  AAGACTCGATTGCAGACCTGTCCGAGGAGAGTTTCCGCCAGGAGGGGTCCCGGATTCCCCAGGCTAGGCCCAGG  2138
            |.||||||||||                                               |||||||||||||||
Sbjct 2431  AGGACTCGATTG-----------------------------------------------CAGGCTAGGCCCAGG  2457

Query 2139  TTGGGCCGGGGCTCACCGCCGACTCGCAGAGGGA----------------------------------------  2172
            |||||||||.||||||||||||||||||||||||                                        
Sbjct 2458  TTGGGCCGGAGCTCACCGCCGACTCGCAGAGGGATGAGAGGTTCAAGCCCCACATCCCCCATCCCCCAGACCAG  2531

Query 2173  --------------------------------------------------------------------------  2172
                                                                                      
Sbjct 2532  AGAGAGCAGTGAGCTGGAGCCGGGACCCCACTCTGCTACACCAGGGCTGCCTCAGGCCGGCCCCCCACGGCCTC  2605

Query 2173  --------------------------------------------------------------------------  2172
                                                                                      
Sbjct 2606  GCTCTGCCCCCGCCTTTTCTCCTATTTCCTGTACTCTATCTGACTCCCCATCCCGGATTTGTTACAGCAGGGGG  2679

Query 2173  ------------------------------------------------------------------  2172
                                                                              
Sbjct 2680  CTCTTGAACCAATGTGAGGTTTGTTTTGTCCCTAAATCACCACCACTCACTATTTCTCCCAGGGTC  2745