Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_12460
• Subject: XM_011238947.1
• Aligned Length: 1034
• Identities: 782
• Gaps: 142

Alignment

Query    1  ATGAAACCACAGTGGCATGATTTGCTTCCATGCAAACTGGGGATTTGGTTTTGCCTTACACTAAAAGCATTACC  74
                                         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct    1  -----------------------------ATGCAAACTGGGGATTTGGTTTTGCCTTACACTAAAAGCATTGCC  45

Query   75  TCACCTCATCCAGGATGCTGGGCAGTTTTATGCTAAATATAAAGAAACAAGATTGAAGGAAAAGGAAGATGCAC  148
            |||.||.||||||                                ||||               |||||     
Sbjct   46  TCATCTAATCCAG--------------------------------AACA---------------GAAGA-----  67

Query  149  TGACTAGAACTGAACTTGAAACACTTCAAAAACAGAAGAAAGTTAAAAAACCAAAACCTGAATTTCCTGTATAC  222
                        ||.||                     ||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.
Sbjct   68  ------------AAGTT---------------------AAAGTTAAAAAACCAAAACCAGAATTTCCTGTGTAT  108

Query  223  ACACCTTTAGAAACTACATATATTCAGTCTTATGATCATGGAACTTCCATAGAAGAAATTGAGGAACAAATGGA  296
            |..||||||||||.|||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||
Sbjct  109  ATGCCTTTAGAAAATACGTATATTCAGTCTTATGATCATGGAACTTCTATTGAAGAAATTGAGGAGCAAATGGA  182

Query  297  TGATTGGTTGGAAAACAGGAACCGAACACAGAAAAAACAGGCACCTGAATGGACAGAAGAGGACCTCAGCCAAC  370
            |||.|||.|||||||||||||..||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  183  TGACTGGCTGGAAAACAGGAAAAGAACACAGAAAAGACAGGCACCTGAATGGACAGAAGAGGACCTCAGTCAAC  256

Query  371  TGACAAGAAGTATGGTTAAGTTCCCAGGAGGGACTCCAGGTCGATGGGAAAAGATTGCCCACGAATTGGGTCGA  444
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||
Sbjct  257  TGACAAGAAGTATGGTTAAGTTCCCAGGAGGGACTCCAGGTCGATGGGACAAGATTGCCCATGAATTGGGTCGA  330

Query  445  TCTGTGACAGATGTGACAACCAAAGCCAAGCAACTGAAGGATTCAGTGACCTGCTCCCCAGGAATGGTTAGACT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||.|||||.|||.|||||||.||||||...||.||
Sbjct  331  TCTGTGACAGATGTGACAACCAAAGCCAAGGAACTGAAGGACTCAGTCACCAGCTCCCCCGGAATGACCAGGCT  404

Query  519  CTCCGAACTCAAATCGACAGTTCAGAATTCCAGGCCCATCAAAACGGCCACCACCTTGCCCGATGACATGATCA  592
            |||.|||||.||.||.|..|.|||||||||||||||.|||||.|..|||||..|||||||.||||||||.||||
Sbjct  405  CTCTGAACTTAAGTCAAATGGTCAGAATTCCAGGCCAATCAAGATAGCCACAGCCTTGCCAGATGACATCATCA  478

Query  593  CCCAGCGAGAGGACGCAGAGGGGG---TGGCAGCGGAGGAGGAGCAGGAGG-----GAGACTCCGGTGAGCAGG  658
            |.|||||.||||||.|||..||||   ||   |.|||.||||||||.||||     |||     ||||||||||
Sbjct  479  CGCAGCGGGAGGACTCAGCAGGGGCCATG---GAGGATGAGGAGCACGAGGCTGCTGAG-----GGTGAGCAGG  544

Query  659  AGACCGGGGCCACTGATGCCCGGCCTCGGAGGCGGAAGCCAGCCA-GGCTGCTGGAGGCTACAGCGAAGCC---  728
            ||.|.|.|.||||.||.|||||.|||||||||||||||.|||||| |||.||| ||||||     |.|.||   
Sbjct  545  AGTCAGCGACCACAGAAGCCCGACCTCGGAGGCGGAAGTCAGCCAGGGCGGCT-GAGGCT-----GTAACCAGA  612

Query  729  --GGAGCCAGAGGAGAAGTCCAGAGCCAAGCGGCAGAAGGACTTTGACATAGCAGAACAAAACGAGTCCAGCGA  800
              ||||||||||||||||...||||..|||.||||.||.||||||||.|||.|||||||||||||.|||||.||
Sbjct  613  GTGGAGCCAGAGGAGAAGCTGAGAGGAAAGAGGCAAAAAGACTTTGATATATCAGAACAAAACGATTCCAGTGA  686

Query  801  CGAGGAGAGCCTGAGAAAAGAGAGAGCTCGGTCTGCAGAGGAGCCGTGGACTCAAAATCAACAGAAACTTCTGG  874
            |||.||||..|...|||||||.|||.||||..|||||||||||.||||||||||.|.|||.|||||||||||||
Sbjct  687  CGAAGAGAAACAACGAAAAGAAAGAACTCGTGCTGCAGAGGAGGCGTGGACTCAGAGTCAGCAGAAACTTCTGG  760

Query  875  AACTGGCGTTGCAGCAGTACCCAAGGGGATCCTCTGACTGCTGGGACAAAATAGCCAGATGTGTCCCGTCCAAG  948
            ||.||||.||.|||||.|||||.|..|||.|.||||||.||||||||||||||||||.||||||||||||.|||
Sbjct  761  AATTGGCATTACAGCAATACCCTAAAGGAGCTTCTGACCGCTGGGACAAAATAGCCAAATGTGTCCCGTCTAAG  834

Query  949  AGCAAGGAAGACTGTATCGCTAGGTACAAGTTGCTGGTTGAACTGGTCCAAAAGAAAAAACAAGCTAAAAGC  1020
            ||.|||||||||||.||.|||||.||||||.||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||
Sbjct  835  AGTAAGGAAGACTGCATTGCTAGATACAAGCTGCTGGTTGAACTGGTCCAAAAGAAAAAGCAGGCTAAAAGC  906