Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_12488
• Subject: XM_005260804.2
• Aligned Length: 1362
• Identities: 935
• Gaps: 426

Alignment

Query    1  ATGGTCTTCTGTCTGTCGAGCGAGGAGCCGCGCCGCCCGCTGCGAAGCGACATGGTCCACTTCCAGGCCTCGGA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGTCTTCTGTCTGTCGAGCGAGGAGCCGCGCCGCCCGCTGCGAAGCGACATGGTCCACTTCCAGGCCTCGGA  74

Query   75  AGTCCAGCAGCTGCTACACAACAAGTTCGTGGTCATCTTGGGGGACTCCATTCAGAGGGCTGTGTACAAGGACC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  AGTCCAGCAGCTGCTACACAACAAGTTCGTGGTCATCTTGGGGGACTCCATTCAGAGGGCTGTGTACAAGGACC  148

Query  149  TGGTGCTCTTGCTCCAGAAAGACTCACTGCTCACAGCTGCCCAGCTGAAAGCCA--------------------  202
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                    
Sbjct  149  TGGTGCTCTTGCTCCAGAAAGACTCACTGCTCACAGCTGCCCAGCTGAAAGCCAAGGGGGAGCTGAGCTTTGAA  222

Query  203  --------------------------------------------------------------------------  202
                                                                                      
Sbjct  223  CAGGACCAGCTGGTGGCTGGGGGCCAGCTGGGCGAGCTGCACAACGGGACACAGTATCGTGAGGTCCGCCAGTT  296

Query  203  -----------------------------------------------------------AGTACCTTGAGGATG  217
                                                                       |||||||||||||||
Sbjct  297  CTGCTCGGGCTCTGGCCACCACCTTGTGCGCTTCTACTTCCTCACTCGTGTTTACTCCGAGTACCTTGAGGATG  370

Query  218  TTCTGGAAGAGCTGACATATGGACCTGCCCCGGACCTGGTGATCATCAACTCCTGCCTCTGGGATCTCTCCAGA  291
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TTCTGGAAGAGCTGACATATGGACCTGCCCCGGACCTGGTGATCATCAACTCCTGCCTCTGGGATCTCTCCAGA  444

Query  292  TATGGTCGCTGCTCAATGGAGAGCTACCGGGAGAACCTGGAGCGGGTGTTTGTGCGCATGGACCAAGTATTGCC  365
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TATGGTCGCTGCTCAATGGAGAGCTACCGGGAGAACCTGGAGCGGGTGTTTGTGCGCATGGACCAAGTATTGCC  518

Query  366  AGACTCCTGCCTGCTGGTGTGGAACATGGCGATGCCCCTCGGGGAACGTATCACTGGGGGTTTCCTCCTGCCAG  439
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AGACTCCTGCCTGCTGGTGTGGAACATGGCGATGCCCCTCGGGGAACGTATCACTGGGGGTTTCCTCCTGCCAG  592

Query  440  AGCTCCAGCCCCTGGCAGGCTCCCTGCGGCGGGATGTGGTTGAAGGGAACTTCTACAGTGCTACGCTGGCCGGG  513
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AGCTCCAGCCCCTGGCAGGCTCCCTGCGGCGGGATGTGGTTGAAGGGAACTTCTACAGTGCTACGCTGGCCGGG  666

Query  514  GACCACTGCTTTGATGTCCTAGACCTCCACTTTCACTTCCGGCATGCAGTACAGCACCGTCATCGGGATGGTGT  587
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GACCACTGCTTTGATGTCCTAGACCTCCACTTTCACTTCCGGCATGCAGTACAGCACCGTCATCGGGATGGTGT  740

Query  588  CCACTGGGACCAGCATGTACACCGCCACCTCTCACACCTGCTTCTGA---------------------------  634
            |||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||                           
Sbjct  741  CCACTGGGACCAGCATGCACACCGCCACCTCTCACACCTGCTTCTGACCCATGTGGCTGACGCCTGGGGCGTGG  814

Query  635  --------------------------------------------------------------------------  634
                                                                                      
Sbjct  815  AGCTGCCCAAGCGTGGCTATCCCCCTGACCCGTGGATTGAGGACTGGGCAGAGATGAATCATCCATTCCAGGGA  888

Query  635  --------------------------------------------------------------------------  634
                                                                                      
Sbjct  889  AGCCATAGGCAGACCCCAGACTTCGGGGAGCACCTGGCCTTGCTCCCACCCCCACCTTCTTCTTTGCCTCCTCC  962

Query  635  --------------------------------------------------------------------------  634
                                                                                      
Sbjct  963  CATGCCTTTTCCCTACCCGCTTCCTCAGCCCTCGCCACCTCCCCTCTTCCCACCCCTGCCCCAGGATACCCCTT  1036

Query  635  ------------------------CCCATGAATTCTTCAACTATAATCCAGTGGAGGACTTCTCGATGCCACCC  684
                                    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TTTTCCCAGGCCAGCCCTTCCCACCCCATGAATTCTTCAACTATAATCCAGTGGAGGACTTCTCGATGCCACCC  1110

Query  685  CACTTAGGATGTGGCCCTGGAGTGAACTTTGTGCCTGGCCCTCTGCCACCTCCAATCCCTGGCCCTAATCCCCA  758
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CACTTAGGATGTGGCCCTGGAGTGAACTTTGTGCCTGGCCCTCTGCCACCTCCAATCCCTGGCCCTAATCCCCA  1184

Query  759  TGGTCAGCACTGGGGCCCAGTGGTCCACCGGGGGATGCCACGCTATGTTCCTAACAGCCCCTACCATGTGCGGA  832
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TGGTCAGCACTGGGGCCCAGTGGTCCACCGGGGGATGCCACGCTATGTTCCTAACAGCCCCTACCATGTGCGGA  1258

Query  833  GAATGGGGGGGCCCTGCAGGCAGCGGCTCAGACACTCAGAGAGACTGATCCACACATACAAACTGGACAGACGG  906
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  GAATGGGGGGGCCCTGCAGGCAGCGGCTCAGACACTCAGAGAGACTGATCCACACATACAAACTGGACAGACGG  1332

Query  907  CCTCCTGCCCATTCGGGGACATGGCCTGGG  936
            ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  CCTCCTGCCCATTCGGGGACATGGCCTGGG  1362