Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_12494
• Subject: XM_017019825.1
• Aligned Length: 2073
• Identities: 1724
• Gaps: 348

Alignment

Query    1  ATGGCGGCGGCGGGTGTTGTGAGCGGGAAGATTATATATGAACAAGAAGGAGTATATATTCACTCATCTTGTGG  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  AAAGACCAATGACCAAGACGGCTTGATTTCAGGAATATTACGTGTTTTAGAAAAGGATGCCGAAGTAATAGTGG  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  ACTGGAGACCATTGGATGATGCATTAGATTCCTCTAGTATTCTCTATGCTAGAAAGGACTCCAGTTCAGTTGTA  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  GAATGGACTCAGGCCCCAAAAGAAAGAGGTCATCGAGGATCAGAACATCTGAACAGTTACGAAGCAGAATGGGA  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  CATGGTTAATACAGTTTCATTTAAAAGGAAACCACATACCAATGGAGATGCTCCAAGTCATAGAAATGGGAAAA  370
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  -ATGGTTAATACAGTTTCATTTAAAAGGAAACCACATACCAATGGAGATGCTCCAAGTCATAGAAATGGGAAAA  73

Query  371  GCAAATGGTCATTCCTGTTCAGTTTGACAGACCTGAAATCAATCAAGCAAAACAAAGAGGGTATGGGCTGGTCC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   74  GCAAATGGTCATTCCTGTTCAGTTTGACAGACCTGAAATCAATCAAGCAAAACAAAGAGGGTATGGGCTGGTCC  147

Query  445  TATTTGGTATTCTGTCTAAAGGATGACGTCGTTCTCCCTGCTCTACACTTTCATCAAGGAGATAGCAAACTACT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  148  TATTTGGTATTCTGTCTAAAGGATGACGTCGTTCTCCCTGCTCTACACTTTCATCAAGGAGATAGCAAACTACT  221

Query  519  GATTGAATCTCTTGAAAAATATGTGGTATTGTGTGAATCTCCACAGGATAAAAGAACACTTCTTGTGAATTGTC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  222  GATTGAATCTCTTGAAAAATATGTGGTATTGTGTGAATCTCCACAGGATAAAAGAACACTTCTTGTGAATTGTC  295

Query  593  AGAATAAGAGTCTTTCACAGTCTTTTGAAAATCTTCTTGATGAGCCAGCATATGGTTTAATACAAGCAGGACTG  666
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           
Sbjct  296  AGAATAAGAGTCTTTCACAGTCTTTTGAAAATCTTCTTGATGAGCCAGCATATGGTTTAATAC-----------  358

Query  667  CTAGACAGAAGAAAGCTGTTGTGGGCCATTCACCACTGGAAAAAAATTAAAAAGGACCCTTATACGGCAACTAT  740
                                                    ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  359  ----------------------------------------AAAAAATTAAAAAGGACCCTTATACGGCAACTAT  392

Query  741  GATAGGATTTTCCAAAGTCACAAACTACATTTTTGACAGTTTGAGAGGCAGCGATCCCTCTACACATCAACGAC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  393  GATAGGATTTTCCAAAGTCACAAACTACATTTTTGACAGTTTGAGAGGCAGCGATCCCTCTACACATCAACGAC  466

Query  815  CACCTTCAGAAATGGCAGATTTTCTTAGTGATGCTATTCCAGGTCTAAAGATAAATCAACAAGAAGAACCAGGA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  467  CACCTTCAGAAATGGCAGATTTTCTTAGTGATGCTATTCCAGGTCTAAAGATAAATCAACAAGAAGAACCAGGA  540

Query  889  TTTGAAGTCATCACAAGAATTGATTTGGGGGAACGCCCTGTTGTTCAAAGGAGAGAACCGGTATCACTGGAAGA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  541  TTTGAAGTCATCACAAGAATTGATTTGGGGGAACGCCCTGTTGTTCAAAGGAGAGAACCGGTATCACTGGAAGA  614

Query  963  ATGGACTAAGAACATTGATTCTGAAGGAAGAATTTTAAATGTAGATAATATGAAGCAGATGATATTTAGAGGGG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  615  ATGGACTAAGAACATTGATTCTGAAGGAAGAATTTTAAATGTAGATAATATGAAGCAGATGATATTTAGAGGGG  688

Query 1037  GACTTAGTCATGCATTGAGAAAGCAAGCATGGAAATTTCTTCTGGGTTATTTTCCCTGGGACAGTACCAAGGAG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  689  GACTTAGTCATGCATTGAGAAAGCAAGCATGGAAATTTCTTCTGGGTTATTTTCCCTGGGACAGTACCAAGGAG  762

Query 1111  GAAAGAACCCAATTACAAAAGCAAAAAACTGATGAATACTTCAGAATGAAACTGCAGTGGAAATCCATCAGCCA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  763  GAAAGAACCCAATTACAAAAGCAAAAAACTGATGAATACTTCAGAATGAAACTGCAGTGGAAATCCATCAGCCA  836

Query 1185  GGAACAAGAGAAAAGAAATTCGAGGTTAAGAGATTATAGAAGTCTTATCGAAAAAGATGTTAACAGAACAGATC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  837  GGAACAAGAGAAAAGAAATTCGAGGTTAAGAGATTATAGAAGTCTTATCGAAAAAGATGTTAACAGAACAGATC  910

Query 1259  GAACAAACAAGTTTTATGAAGGCCAAGATAATCCAGGGTTGATTTTACTTCATGACATTTTGATGACCTACTGT  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  911  GAACAAACAAGTTTTATGAAGGCCAAGATAATCCAGGGTTGATTTTACTTCATGACATTTTGATGACCTACTGT  984

Query 1333  ATGTATGATTTTGATTTAGGATATGTTCAAGGAATGAGTGATTTACTTTCCCCTCTTTTATATGTGATGGAAAA  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  985  ATGTATGATTTTGATTTAGGATATGTTCAAGGAATGAGTGATTTACTTTCCCCTCTTTTATATGTGATGGAAAA  1058

Query 1407  TGAAGTGGATGCCTTTTGGTGCTTTGCCTCTTACATGGACCAAATGCATCAGAATTTTGAAGAACAAATGCAAG  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1059  TGAAGTGGATGCCTTTTGGTGCTTTGCCTCTTACATGGACCAAATGCATCAGAATTTTGAAGAACAAATGCAAG  1132

Query 1481  GCATGAAGACCCAGCTAATTCAGCTGAGTACCTTACTTCGATTGTTAGACAGTGGATTTTGCAGTTACTTAGAA  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1133  GCATGAAGACCCAGCTAATTCAGCTGAGTACCTTACTTCGATTGTTAGACAGTGGATTTTGCAGTTACTTAGAA  1206

Query 1555  TCTCAGGACTCTGGATACCTTTATTTTTGCTTCAGGTGGCTTTTAATCAGATTCAAAAGGGAATTTGGTTTTCT  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 1207  TCTCAGGACTCTGGATACCTTTATTTTTGCTTCAGGTGGCTTTTAATCAGATTCAAAAGGGAATTTAGTTTTCT  1280

Query 1629  AGATATTCTTCGATTATGGGAGGTAATGTGGACCGAACTACCATGTACAAATTTCCATCTTCTTCTCTGTTGTG  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1281  AGATATTCTTCGATTATGGGAGGTAATGTGGACCGAACTACCATGTACAAATTTCCATCTTCTTCTCTGTTGTG  1354

Query 1703  CTATTCTGGAATCAGAAAAGCAGCAAATAATGGAAAAGCATTATGGCTTCAATGAAATACTTAAGCATATCAAT  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1355  CTATTCTGGAATCAGAAAAGCAGCAAATAATGGAAAAGCATTATGGCTTCAATGAAATACTTAAGCATATCAAT  1428

Query 1777  GAATTGTCCATGAAAATTGATGTGGAAGATATACTCTGCAAGGCAGAAGCAATTTCTCTACAGATGGTAAAATG  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1429  GAATTGTCCATGAAAATTGATGTGGAAGATATACTCTGCAAGGCAGAAGCAATTTCTCTACAGATGGTAAAATG  1502

Query 1851  CAAGGAATTGCCACAAGCAGTCTGTGAGATCCTTGGGCTTCAAGGCAGTGAAGTTACAACACCAGATTCAGACG  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1503  CAAGGAATTGCCACAAGCAGTCTGTGAGATCCTTGGGCTTCAAGGCAGTGAAGTTACAACACCAGATTCAGACG  1576

Query 1925  TTGGTGAAGACGAAAATGTTGTCATGACTCCTTGTCCTACATCTGCATTTCAAAGTAATGCCTTGCCTACACTC  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1577  TTGGTGAAGACGAAAATGTTGTCATGACTCCTTGTCCTACATCTGCATTTCAAAGTAATGCCTTGCCTACACTC  1650

Query 1999  TCTGCCAGTGGAGCCAGAAATGACAGCCCAACACAGATACCAGTGTCCTCAGATGTCTGCAGATTAACACCTGC  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1651  TCTGCCAGTGGAGCCAGAAATGACAGCCCAACACAGATACCAGTGTCCTCAGATGTCTGCAGATTAACACCTGC  1724

Query 2073  A  2073
            |
Sbjct 1725  A  1725