Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_12497
- Subject:
- XM_024446877.1
- Aligned Length:
- 1290
- Identities:
- 1024
- Gaps:
- 219
Alignment
Query 1 AT-GGATCTC-----ATTCC---AAACTTTGC-----------CATGGA----------AACATGGGT-TCTTG 43
|| ||||.|| |.|.| ||..||||| .||||| |||||.|.| |||
Sbjct 1 ATGGGATTTCTGAAAAGTGCCTTAAGTTTTGCTGAAGATGAAGAATGGAAGAGAATACGAACATTGCTATCT-- 72
Query 44 TGGCTACCAGCCTGGTACTCC--TCTATATTT-------ATGGGACCCA----TTC---------ACATAAACT 95
||||| .|.|.|| |.||.|.|| ||||..|||| ||| |.||| |
Sbjct 73 ------CCAGC---TTTCACCAGTGTAAAATTCAAGGAAATGGTCCCCATCATTTCCCAATGTGGAGATA---T 134
Query 96 TTT--TAAGAAGCTGGGAATTCCTGGGCCAACCCCTCTGCCTTTTCTGG-------GAACTATTTTGTTCTACC 160
.|| |.||||| ||||.|.|| || ||||
Sbjct 135 GTTGGTGAGAAG---------CCTGAGGCA-----------------GGAAGCAGAGAAC-------------- 168
Query 161 TTAGGAGGTC--TC----TGAATAAGATTCCCAGCTGGGCGTGGTGGCTCACGCC-----TGTAATC-CCAGCA 222
||.|.||| || ||| |||||| .|.|.|.|||..||.|| ||||||| |..|||
Sbjct 169 --AGCAAGTCCATCAACTTGA--AAGATT---------TCTTTGGGGCCTACACCATGGATGTAATCACTGGCA 229
Query 223 C----TTTGGGAGGCTGAAGCAGGAGGAT----------CACCTAAGGTC--------------AGGAGTTCGA 268
| ||| |||| ||||...|||...| ||| |||.|| |.|| |
Sbjct 230 CATTATTT-GGAG--TGAACTTGGATTCTCTCAACAATCCAC--AAGATCCCTTTCTGAAAAATATGA-----A 293
Query 269 GACCAGCTTTGCCAACATGGG--TCTTTGGA---ATTTTGACAGAGAAT-GTAATGAAAAATACGGAGAAATGT 336
|| |||||| .||.||.|| |.|||||| .||||.|| | .|||| ||
Sbjct 294 GA--AGCTTT--TAAAATTGGATTTTTTGGATCCCTTTTTAC------TCTTAAT-----AT------------ 340
Query 337 GGGGCACTCTTTCCATTTCTTACCCCAGTTTTTGAAGCCCTAAATATCGGTTTGTTTCCAAAAGATGTTACCCA 410
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 341 ----CACTCTTTCCATTTCTTACCCCAGTTTTTGAAGCCCTAAATATCGGTTTGTTTCCAAAAGATGTTACCCA 410
Query 411 TTTTTTAAAAAATTCCATTGAAAGGATGAAAGAAAGTCGCCTCAAAGATAAACAAAAGCATCGAGTAGATTTCT 484
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 411 TTTTTTAAAAAATTCCATTGAAAGGATGAAAGAAAGTCGCCTCAAAGATAAACAAAAGCATCGAGTAGATTTCT 484
Query 485 TTCAACAGATGATCGACTCCCAGAATTCCAAAGAAACAAAGTCCCATAAAGCTCTGTCTGATCTGGAGCTTGTG 558
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 485 TTCAACAGATGATCGACTCCCAGAATTCCAAAGAAACAAAGTCCCATAAAGCTCTGTCTGATCTGGAGCTTGTG 558
Query 559 GCCCAGTCAATTATCATCATTTTTGCTGCCTATGACACAACTAGCACCACTCTCCCCTTCATTATGTATGAACT 632
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 559 GCCCAGTCAATTATCATCATTTTTGCTGCCTATGACACAACTAGCACCACTCTCCCCTTCATTATGTATGAACT 632
Query 633 GGCCACTCACCCTGATGTCCAGCAGAAACTGCAGGAGGAGATTGACGCAGTTTTACCCAATAAGGCACCTGTCA 706
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 633 GGCCACTCACCCTGATGTCCAGCAGAAACTGCAGGAGGAGATTGACGCAGTTTTACCCAATAAGGCACCTGTCA 706
Query 707 CCTACGATGCCCTGGTACAGATGGAGTACCTTGACATGGTGGTGAATGAAACGCTCAGATTATTCCCAGTTGTT 780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 707 CCTACGATGCCCTGGTACAGATGGAGTACCTTGACATGGTGGTGAATGAAACGCTCAGATTATTCCCAGTTGTT 780
Query 781 AGTAGAGTTACGAGAGTCTGCAAGAAAGATATTGAAATCAATGGAGTGTTCATTCCCAAAGGGTTAGCAGTGAT 854
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 781 AGTAGAGTTACGAGAGTCTGCAAGAAAGATATTGAAATCAATGGAGTGTTCATTCCCAAAGGGTTAGCAGTGAT 854
Query 855 GGTTCCAATCTATGCTCTTCACCATGACCCAAAGTACTGGACAGAGCCTGAGAAGTTCTGCCCTGAA---AGGT 925
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 855 GGTTCCAATCTATGCTCTTCACCATGACCCAAAGTACTGGACAGAGCCTGAGAAGTTCTGCCCTGAAAGTAGGT 928
Query 926 TCAGTAAGAAGAACAAGGACAGCATAGATCTTTACAGATACATACCTTTTGGAGCTGGACCCCGAAACTGCATT 999
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 929 TCAGTAAGAAGAACAAGGACAGCATAGATCTTTACAGATACATACCTTTTGGAGCTGGACCCCGAAACTGCATT 1002
Query 1000 GGCATGAGGTTTGCTCTCACAAACATAAAACTTGCTGTCATTAGAGCACTGCAGAACTTCTCCTTCAAACCTTG 1073
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1003 GGCATGAGGTTTGCTCTCACAAACATAAAACTTGCTGTCATTAGAGCACTGCAGAACTTCTCCTTCAAACCTTG 1076
Query 1074 TAAAGAGACTCAGATCCCACTGAAATTAGACAATCTACCAATTCTTCAACCAGAAAAACCTATTGTTCTAAAAG 1147
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1077 TAAAGAGACTCAGATCCCACTGAAATTAGACAATCTACCAATTCTTCAACCAGAAAAACCTATTGTTCTAAAAG 1150
Query 1148 TGCACTTAAGAGATGGGATTACAAGTGGACCC 1179
||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1151 TGCACTTAAGAGATGGGATTACAAGTGGACCC 1182