Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_12519
- Subject:
- NM_023923.4
- Aligned Length:
- 2155
- Identities:
- 1849
- Gaps:
- 284
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGGGACAAGCTGATGTCTCCAGACCGGTAAATCCAGATGCAGTTGAGGAAGCAGACCAGCCCACTACAGAGCC 74
Query 1 ----ATGGTCCTGGACAGTGTGGAAGCAGGAGACACAACACCTCCTACCAAAAGGAAGAGCAAGTTCTCAGGCT 70
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 AGGCATGGTCCTGGACAGTGTGGAAGCAGGAGACACAACACCTCCTACCAAAAGGAAGAGCAAGTTCTCAGGCT 148
Query 71 TTGGCAAGATCTTCAAGCCCTGGAAATGGAGGAAAAAAAAAAGTAGTGATAAATTTAAAGAGACTTCAGAAGTT 144
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 TTGGCAAGATCTTCAAGCCCTGGAAATGGAGGAAAAAAAAAAGTAGTGATAAATTTAAAGAGACTTCAGAAGTT 222
Query 145 TTAGAACGGAAAATATCTATGCGAAAGCCAAGAGAAGAGCTGGTTAAGAGAGGGGTTCTGTTGGAAGACCCTGA 218
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 TTAGAACGGAAAATATCTATGCGAAAGCCAAGAGAAGAGCTGGTTAAAAGAGGGGTTCTGTTGGAAGACCCTGA 296
Query 219 GCAAGGTGGTGAGGATCCAGGAAAGCCAAGCGATGCCATGTTAAAGAATGGCCATACCACCCCCATAGGGAATG 292
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 GCAAGGTGGTGAGGATCCAGGAAAGCCAAGCGATGCCATGTTAAAGAATGGCCATACCACCCCCATAGGGAATG 370
Query 293 CCAGATCATCTAGTCCAGTCCAAGTAGAGGAAGAGCCAGTAAGATTAGCAAGTCTTAGGAAAGCTATTCCAGAA 366
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 CCAGATCATCTAGTCCAGTCCAAGTAGAGGAAGAGCCAGTAAGATTAGCAAGTCTTAGGAAAGCTATTCCAGAA 444
Query 367 GAGGACCTAAAGAAACGACTAGGCTCAACTGGAAGCCAGCCTAATTCTGAAGCAGAGTCTGTTCCTGAGAATGT 440
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GAGGACCTAAAGAAACGACTAGGCTCAACTGGAAGCCAGCCTAATTCTGAAGCAGAGTCTGTTCCTGAGAATGT 518
Query 441 ACCCAAACCACCTTTACTTCCTCCCAAAAGACCCTTGTCCTCTTCTCATGAAGCAAGTGAAGGGCAAGCAAAGG 514
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 ACCCAAACCACCTTTACTTCCTCCCAAAAGACCCTTGTCCTCTTCTCATGAAGCAAGTGAAGGGCAAGCAAAGG 592
Query 515 ATGCCACTTCCTCTGGCGGCACGGCAAGGTTCATCATCTCCACCTCCATCACCACAGCACCCGCTGCCACCACT 588
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 ATGCCACTTCCTCTGGCGGCACGGCAAGGTTCATCATCTCCACCTCCATCACCACAGCACCCGCTGCCACCACT 666
Query 589 GCTGCCACAAGCCTTGCAAAGACTGTTAATCTCTCTGTCACCCCTTCCCCAGCACCCAGGACTCTGCCTGCTGC 662
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 GCTGCCACAAGCCTTGCAAAGACTGTTAATCTCTCTGTCACCCCTTCCCCAGCACCCAGGACTCTGCCTGCTGC 740
Query 663 TCCTGCCAGCACTAACACTACTGCTACCCCAAGCCTCACTCATATGGTCCCTGCCAAGCAGCCCCCTATCCCTC 736
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 TCCTGCCAGCACTAACACTACTGCTACCCCAAGCCTCACTCATATGGTCCCTGCCAAGCAGCCCCCTATCCCTC 814
Query 737 CCCCTAAACCAGCTCACAGAAATAGCAACCCTGTCATTGCTGAACTGTCCCAAGCAATAAACAGTGGTACATTG 810
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 CCCCTAAACCAGCTCACAGAAATAGCAACCCTGTCATTGCTGAACTGTCCCAAGCAATAAACAGTGGTACATTG 888
Query 811 TTATCAAAACCGTCCCCACCCTTACCACCTAAGAGAGGCATTCCATCAACCTCAGTACCCACCTTGGAGTCTGC 884
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 TTATCAAAACCGTCCCCACCCTTACCACCTAAGAGAGGCATTCCATCAACCTCAGTACCCACCTTGGAGTCTGC 962
Query 885 TGCTGCCATCACCACAAAAACACCAAGTGATGAAAGAGAGAAGAGCACGTGTTCTATGGGCTCGGAACTACTAC 958
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 TGCTGCCATCACCACAAAAACACCAAGTGATGAAAGAGAGAAGAGCACGTGTTCTATGGGCTCGGAACTACTAC 1036
Query 959 CAATGATCTCACCTCGCTCTCCGTCCCCCCCACTGCCTACTCATATACCTCCAGAGCCTCCACGCACCCCTCCA 1032
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 CAATGATCTCACCTCGCTCTCCGTCCCCCCCACTGCCTACTCATATACCTCCAGAGCCTCCACGCACCCCTCCA 1110
Query 1033 TTCCCTGCTAAGACTTTTCAAGTTGTGCCAGAAATTGAGTTTCCACCATCCTTAGATCTACACCAGGAGATTCC 1106
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 TTCCCTGCTAAGACTTTTCAAGTTGTGCCAGAAATTGAGTTTCCACCATCCTTAGATCTACACCAGGAGATTCC 1184
Query 1107 CCAGCAGGAAGATCAGAAAAAGGAAGTCCCCAAGAGGATACTGGACCAGAACTTTGGGGAGCCCCATATACCCT 1180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 CCAGCAGGAAGATCAGAAAAAGGAAGTCCCCAAGAGGATACTGGACCAGAACTTTGGGGAGCCCCATATACCCT 1258
Query 1181 CTAGGCTGCCTCCACTCCCACTGCATATTCGAATCCAGCAGGCCCTCACCAGCCCACTTCCCATGACTCCTATT 1254
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 CTAGGCTGCCTCCACTCCCACTGCATATTCGAATCCAGCAGGCCCTCACCAGCCCACTTCCCATGACTCCTATT 1332
Query 1255 CTGGAGGGTTCTCACAGAGCTCATTCGTTGCTTTTTGAAAACAGTGACAGCTTTTCTGAGGACAGCAGTACGCT 1328
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 CTGGAGGGTTCTCACAGAGCTCATTCGTTGCTTTTTGAAAACAGTGACAGCTTTTCTGAGGACAGCAGTACGCT 1406
Query 1329 GGGTCGGACCAGGTCTCTTCCCATCACTATTGAAATGCTAAAAGTTCCAGACGATGAAGAAGAAGAGGAGCAAA 1402
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 GGGTCGGACCAGGTCTCTTCCCATCACTATTGAAATGCTAAAAGTTCCAGACGATGAAGAAGAAGAGGAGCAAA 1480
Query 1403 CCTGTCCATCCACATTCAGTGAAGAAATGACACCTACCTCAGTCATTCCTAAATTACCACAGTGTCTACGGGAG 1476
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 CCTGTCCATCCACATTCAGTGAAGAAATGACACCTACCTCAGTCATTCCTAAATTACCACAGTGTCTACGGGAG 1554
Query 1477 GAAGAAGAGAAGGAGAGCGACTCTGATTCAGAAGGTCCCATTCAGTACCGAGATGAAGAAGATGAAGATGAAAG 1550
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 GAAGAAGAGAAGGAGAGCGACTCTGATTCAGAAGGTCCCATTCAGTACCGAGATGAAGAAGATGAAGATGAAAG 1628
Query 1551 CTATCAGAGTGCTCTCGCCAACAAAGTGAAGAGGAAAGACACACTGGCAATGAAGTTGAACCACAGACCCAGTG 1624
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 CTATCAGAGTGCTCTCGCCAACAAAGTGAAGAGGAAAGACACACTGGCAATGAAGTTGAACCACAGACCCAGTG 1702
Query 1625 AACCAGAGTTGAACCTGAATTCTTGGCCTTGTAAAAGCAAGGAGGAGTGGAATGAAATACGGCACCAGATTGGA 1698
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 AACCAGAGTTGAACCTGAATTCTTGGCCTTGTAAAAGCAAGGAGGAGTGGAATGAAATACGGCACCAGATTGGA 1776
Query 1699 AACACACTGATCCGGCGACTGAGTCAAAGACCAACACCAGAAGAACTAGAACAACGCAATATATTGCAAC---A 1769
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1777 AACACACTGATCCGGCGACTGAGTCAAAGACCAACACCAGAAGAACTAGAACAACGCAATATATTGCAACCTAA 1850
Query 1770 ATAT-----------------AGA-----GTGAAATTTGGCCTTAAAAGTCTCCTCACTGAGAAGGTTTGG--- 1818
|.|| ||| |.|||| |||||.|||..|||||| ||||.|.|..|
Sbjct 1851 AAATGAAGCTGATCGTCAGGCAGAAAAACGAGAAA-------TTAAACGTCGGCTCACT-AGAAAGCTCAGTCA 1916
Query 1819 -------------GCT----TCCTTG---GGGCTATT-TG--------TGAGCATGTTCAG------------- 1850
||| |||||| ||...||| || |||..||||..||
Sbjct 1917 AAGGCCAACTGTCGCTGAACTCCTTGCCAGGAAGATTCTGAGGTTTAATGAATATGTAGAGGTAACAGATGCTC 1990
Query 1851 -----TCTGAC-----------CAATCCAT------------CCCCTGTTCTCTCAGCACT-ACTTGGC----- 1890
|.|||| |||.||.| |||||| || ||..|||
Sbjct 1991 AAGATTATGACCGGCGAGCCGACAAACCTTGGACCAAACTGACCCCTG-----------CTGACAAGGCTGCCA 2053
Query 1891 -------------------------------------------------------------------------- 1890
Sbjct 2054 TAAGAAAAGAATTAAATGAATTTAAAAGCTCCGAGATGGAGGTTCATGAAGAGAGCAAACATTTTACACGCTAC 2127
Query 1891 --------- 1890
Sbjct 2128 CATCGTCCA 2136