Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_12542
• Subject: NM_024103.3
• Aligned Length: 1551
• Identities: 1285
• Gaps: 252

Alignment

Query    1  ATGCGGGGGAGCCCGGGCGACGCGGAGCGGCGGCAGCGCTGGGGTCGCCTGTTCGAGGAGCTGGACAGTAACAA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCGGGGGAGCCCGGGCGACGCGGAGCGGCGGCAGCGCTGGGGTCGCCTGTTCGAGGAGCTGGACAGTAACAA  74

Query   75  GGATGGCCGCGTGGACGTGCACGAGTTGCGCCAGGGGCTGGCCAGGCTGGGCGGGGGCAACCCAGACCCCGGCG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GGATGGCCGCGTGGACGTGCACGAGTTGCGCCAGGGGCTGGCCAGGCTGGGCGGGGGCAACCCAGACCCCGGCG  148

Query  149  CCCAACAGGGTATCTCCTCTGAGGGTGATGCTGACCCAGATGGCGGGCTCGACCTGGAGGAATTTTCCCGCTAT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CCCAACAGGGTATCTCCTCTGAGGGTGATGCTGACCCAGATGGCGGGCTCGACCTGGAGGAATTTTCCCGCTAT  222

Query  223  CTGCAGGAGCGGGAACAGCGTCTGCTGCTCATGTTTCACAGTCTTGACCGGAACCAGGATGGTCACATTGATGT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CTGCAGGAGCGGGAACAGCGTCTGCTGCTCATGTTTCACAGTCTTGACCGGAACCAGGATGGTCACATTGATGT  296

Query  297  CTCTGAGATCCAACAGAGTTTCCGAGCTCTGGGCATTTCCATCTCGCTGGAGCAGGCTGAGAAAATTTTGCACA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CTCTGAGATCCAACAGAGTTTCCGAGCTCTGGGCATTTCCATCTCGCTGGAGCAGGCTGAGAAAATTTTGCACA  370

Query  371  GCATGGACCGAGACGGCACAATGACCATTGACTGGCAAGAATGGCGCGACCACTTCCTGTTGCATTCGCTGGAA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GCATGGACCGAGACGGCACAATGACCATTGACTGGCAAGAATGGCGCGACCACTTCCTGTTGCATTCGCTGGAA  444

Query  445  AATGTGGAGGACGTGCTGTATTTCTGGAAGCATTCCACGCTCTCTTCTGCTGGGTTCTCTGCCTGGATAAAAGA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                                    
Sbjct  445  AATGTGGAGGACGTGCTGTATTTCTGGAAGCATTCCAC------------------------------------  482

Query  519  TTCTACGGCTGAACAGAATCGTTCAAAAACCACGGTCTTGGCCAGGCGCAGTGGCTCACACCTGAAATCCCAGC  592
                                                                                      
Sbjct  483  --------------------------------------------------------------------------  482

Query  593  ACTTTGGGAGGCCGAAGTGGGCGGATCACGAGGTCCTGGACATTGGCGAGTGCCTGACAGTGCCGGACGAGTTC  666
                                           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  483  -------------------------------GGTCCTGGACATTGGCGAGTGCCTGACAGTGCCGGACGAGTTC  525

Query  667  TCAAAGCAAGAGAAGCTGACGGGCATGTGGTGGAAACAGCTGGTGGCCGGCGCAGTGGCAGGTGCCGTGTCACG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  526  TCAAAGCAAGAGAAGCTGACGGGCATGTGGTGGAAACAGCTGGTGGCCGGCGCAGTGGCAGGTGCCGTGTCACG  599

Query  741  GACAGGCACGGCCCCTCTGGACCGCCTCAAGGTCTTCATGCAGGTCCATGCCTCAAAGACCAACCGGCTGAACA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  600  GACAGGCACGGCCCCTCTGGACCGCCTCAAGGTCTTCATGCAGGTCCATGCCTCAAAGACCAACCGGCTGAACA  673

Query  815  TCCTTGGGGGGCTTCGAAGCATGGTCCTTGAGGGAGGCATCCGCTCCCTGTGGCGCGGCAATGGTATTAATGTA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  674  TCCTTGGGGGGCTTCGAAGCATGGTCCTTGAGGGAGGCATCCGCTCCCTGTGGCGCGGCAATGGTATTAATGTA  747

Query  889  CTCAAGATTGCCCCCGAGTCAGCTATCAAGTTCATGGCCTATGAACAGATCAAGAGGGCCATCCTGGGGCAGCA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  748  CTCAAGATTGCCCCCGAGTCAGCTATCAAGTTCATGGCCTATGAACAGATCAAGAGGGCCATCCTGGGGCAGCA  821

Query  963  GGAGACACTGCATGTGCAGGAGCGCTTCGTGGCTGGCTCCCTGGCTGGTGCCACAGCCCAAACCATCATTTACC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  822  GGAGACACTGCATGTGCAGGAGCGCTTCGTGGCTGGCTCCCTGGCTGGTGCCACAGCCCAAACCATCATTTACC  895

Query 1037  CTATGGAGGTGCTGAAGACGCGGCTGACCTTGCGCCGGACGGGCCAGTATAAGGGGCTGCTGGACTGCGCCAGG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  896  CTATGGAGGTGCTGAAGACGCGGCTGACCTTGCGCCGGACGGGCCAGTATAAGGGGCTGCTGGACTGCGCCAGG  969

Query 1111  CGTATCCTGGAGAGGGAGGGGCCCCGTGCCTTCTACCGCGGCTACCTCCCCAACGTGCTGGGCATCATCCCCTA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  970  CGTATCCTGGAGAGGGAGGGGCCCCGTGCCTTCTACCGCGGCTACCTCCCCAACGTGCTGGGCATCATCCCCTA  1043

Query 1185  TGCGGGCATCGACCTGGCCGTCTACGAGACTCTGAAGAACTGGTGGCTTCAGCAGTACAGCCACGACTCGGCAG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1044  TGCGGGCATCGACCTGGCCGTCTACGAGACTCTGAAGAACTGGTGGCTTCAGCAGTACAGCCACGACTCGGCAG  1117

Query 1259  ACCCAGGCATCCTCGTGCTCCTGGCCTGCGGTACCATATCCAGCACCTGCGGCCAGATAGCCAGTTACCCGCTG  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1118  ACCCAGGCATCCTCGTGCTCCTGGCCTGCGGTACCATATCCAGCACCTGCGGCCAGATAGCCAGTTACCCGCTG  1191

Query 1333  GCCCTGGTCCGGACCCGCATGCAGGCACAAGGC----TGGAGTACAGTGGC---------TCGAT---------  1384
            |||||||||||||||||||||||||||||||.|    |.|||   .|||||         ||.||         
Sbjct 1192  GCCCTGGTCCGGACCCGCATGCAGGCACAAGCCTCCATCGAG---GGTGGCCCCCAGCTGTCCATGCTGGGTCT  1262

Query 1385  -----TTCAGATCACTG---CA--------------ACCTCTGC-----------------CTTC---CAGG--  1414
                 .|||.||| |||   ||              .|||||.|                 ||||   .|||  
Sbjct 1263  GCTACGTCACATC-CTGTCCCAGGAGGGCATGCGGGGCCTCTACCGGGGGATCGCCCCCAACTTCATGAAGGTT  1335

Query 1415  -TTCAAGC-----GATTCTCCT--------------------------GCC-------TCAGCCTCCAGAG  1446
             |||.|||     |..||||||                          |||       ||| |.|||||. 
Sbjct 1336  ATTCCAGCTGTGAGCATCTCCTATGTGGTCTACGAGAACATGAAGCAGGCCTTGGGGGTCA-CGTCCAGG-  1404