Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_12542
• Subject: XM_011528283.2
• Aligned Length: 1493
• Identities: 1411
• Gaps: 70

Alignment

Query    1  ATGCGGGGGAGCCCGGGCGACGCGGAGCGGCGGCAGCGCTGGGGTCGCCTGTTCGAGGAGCTGGACAGTAACAA  74
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Sbjct    1  ATGCGGGGGAGCCCGGGCGACGCGGAGCGGCGGCAGCGCTGGGGTCGCCTGTTCGAGGAGCTGGACAGTAACAA  74

Query   75  GGATGGCCGCGTGGACGTGCACGAGTTGCGCCAGGGGCTGGCCAGGCTGGGCGGGGGCAACCCAGACCCCGGCG  148
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Sbjct   75  GGATGGCCGCGTGGACGTGCACGAGTTGCGCCAGGGGCTGGCCAGGCTGGGCGGGGGCAACCCAGACCCCGGCG  148

Query  149  CCCAACAGGGTATCTCCTCTGAGGGTGATGCTGACCCAGATGGCGGGCTCGACCTGGAGGAATTTTCCCGCTAT  222
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Sbjct  149  CCCAACAGGGTATCTCCTCTGAGGGTGATGCTGACCCAGATGGCGGGCTCGACCTGGAGGAATTTTCCCGCTAT  222

Query  223  CTGCAGGAGCGGGAACAGCGTCTGCTGCTCATGTTTCACAGTCTTGACCGGAACCAGGATGGTCACATTGATGT  296
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Sbjct  223  CTGCAGGAGCGGGAACAGCGTCTGCTGCTCATGTTTCACAGTCTTGACCGGAACCAGGATGGTCACATTGATGT  296

Query  297  CTCTGAGATCCAACAGAGTTTCCGAGCTCTGGGCATTTCCATCTCGCTGGAGCAGGCTGAGAAAATTTTGCACA  370
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Sbjct  297  CTCTGAGATCCAACAGAGTTTCCGAGCTCTGGGCATTTCCATCTCGCTGGAGCAGGCTGAGAAAATTTTGCACA  370

Query  371  GCATGGACCGAGACGGCACAATGACCATTGACTGGCAAGAATGGCGCGACCACTTCCTGTTGCATTCGCTGGAA  444
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Sbjct  371  GCATGGACCGAGACGGCACAATGACCATTGACTGGCAAGAATGGCGCGACCACTTCCTGTTGCATTCGCTGGAA  444

Query  445  AATGTGGAGGACGTGCTGTATTTCTGGAAGCATTCCACGCTCTCTTCTGCTGGGTTCTCTGCCTGGATAAAAGA  518
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Sbjct  445  AATGTGGAGGACGTGCTGTATTTCTGGAAGCATTCCACGCTCTCTTCTGCTGGGTTCTCTGCCTGGATAAAAGA  518

Query  519  TTCTACGGCTGAACAGAATCGTTCAAAAACCACGGTCTTGGCCAGGCGCAGTGGCTCACACCTGAAATCCCAGC  592
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Sbjct  519  TTCTACGGCTGAACAGAATCGTTCAAAAACCACGGTCTTGGCCAGGCGCAGTGGCTCACACCTAAAATCCCAGC  592

Query  593  ACTTTGGGAGGCCGAAGTGGGCGGATCACGAGGTCCTGGACATTGGCGAGTGCCTGACAGTGCCGGACGAGTTC  666
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Sbjct  593  ACTTTGGGAGGCCGAAGTGGGCGGATCACGAGGTCCTGGACATTGGCGAGTGCCTGACAGTGCCGGACGAGTTC  666

Query  667  TCAAAGCAAGAGAAGCTGACGGGCATGTGGTGGAAACAGCTGGTGGCCGGCGCAGTGGCAGGTGCCGTGTCACG  740
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Sbjct  667  TCAAAGCAAGAGAAGCTGACGGGCATGTGGTGGAAACAGCTGGTGGCCGGCGCAGTGGCAGGTGCCGTGTCACG  740

Query  741  GACAGGCACGGCCCCTCTGGACCGCCTCAAGGTCTTCATGCAGGTCCATGCCTCAAAGACCAACCGGCTGAACA  814
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Sbjct  741  GACAGGCACGGCCCCTCTGGACCGCCTCAAGGTCTTCATGCAGGTCCATGCCTCAAAGACCAACCGGCTGAACA  814

Query  815  TCCTTGGGGGGCTTCGAAGCATGGTCCTTGAGGGAGGCATCCGCTCCCTGTGGCGCGGCAATGGTATTAATGTA  888
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Sbjct  815  TCCTTGGGGGGCTTCGAAGCATGGTCCTTGAGGGAGGCATCCGCTCCCTGTGGCGCGGCAATGGTATTAATGTA  888

Query  889  CTCAAGATTGCCCCCGAGTCAGCTATCAAGTTCATGGCCTATGAACAGATCAAGAGGGCCATCCTGGGGCAGCA  962
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Sbjct  889  CTCAAGATTGCCCCCGAGTCAGCTATCAAGTTCATGGCCTATGAACAGATCAAGAGGGCCATCCTGGGGCAGCA  962

Query  963  GGAGACACTGCATGTGCAGGAGCGCTTCGTGGCTGGCTCCCTGGCTGGTGCCACAGCCCAAACCATCATTTACC  1036
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Sbjct  963  GGAGACACTGCATGTGCAGGAGCGCTTCGTGGCTGGCTCCCTGGCTGGTGCCACAGCCCAAACCATCATTTACC  1036

Query 1037  CTATGGAGGTGCTGAAGACGCGGCTGACCTTGCGCCGGACGGGCCAGTATAAGGGGCTGCTGGACTGCGCCAGG  1110
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Sbjct 1037  CTATGGAGGTGCTGAAGACGCGGCTGACCTTGCGCCGGACGGGCCAGTATAAGGGGCTGCTGGACTGCGCCAGG  1110

Query 1111  CGTATCCTGGAGAGGGAGGGGCCCCGTGCCTTCTACCGCGGCTACCTCCCCAACGTGCTGGGCATCATCCCCTA  1184
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Sbjct 1111  CGTATCCTGGAGAGGGAGGGGCCCCGTGCCTTCTACCGCGGCTACCTCCCCAACGTGCTGGGCATCATCCCCTA  1184

Query 1185  TGCGGGCATCGACCTGGCCGTCTACGAGACTCTGAAGAACTGGTGGCTTCAGCAGTACAGCCACGACTCGGCAG  1258
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Sbjct 1185  TGCGGGCATCGACCTGGCCGTCTACGAGACTCTGAAGAACTGGTGGCTTCAGCAGTACAGCCACGACTCGGCAG  1258

Query 1259  ACCCAGGCATCCTCGTGCTCCTGGCCTGCGGTACCATATCCAGCACCTGCGGCCAGATAGCCAGTTACCCGCTG  1332
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Sbjct 1259  ACCCAGGCATCCTCGTGCTCCTGGCCTGCGGTACCATATCCAGCACCTGCGGCCAGATAGCCAGTTACCCGCTG  1332

Query 1333  GCCCTGGTCCGGACCCGCATGCAGGCACAAGGCTGGAGTACAGTGGCTCGATTTCAGATCACTG-----CAACC  1401
            |||||||||||||||||||||||||||||||                  ||||||  |||| ||     ||..|
Sbjct 1333  GCCCTGGTCCGGACCCGCATGCAGGCACAAG------------------GATTTC--ATCA-TGTTGCCCAGGC  1385

Query 1402  TCTGCCTTCCA-------GGTTCAAGCGATTCTCCTGCC-TCAGCCTCC---------------AGAG------  1446
            ||..|  ||.|       ||.|||||..||||.||.||| |||||||||               |.||      
Sbjct 1386  TCATC--TCGAACTCGTGGGGTCAAGGAATTCGCCAGCCTTCAGCCTCCCAACGTGCTGGGATTACAGGAAGCC  1457

Query 1447  -------------  1446
                         
Sbjct 1458  GGTGGTCATGCCA  1470