Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_12542
- Subject:
- XM_011528285.2
- Aligned Length:
- 1551
- Identities:
- 1257
- Gaps:
- 279
Alignment
Query 1 ATGCGGGGGAGCCCGGGCGACGCGGAGCGGCGGCAGCGCTGGGGTCGCCTGTTCGAGGAGCTGGACAGTAACAA 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGCGGGGGAGCCCGGGCGACGCGGAGCGGCGGCAGCGCTGGGGTCGCCTGTTCGAGGAGCTGGACAGTAACAA 74
Query 75 GGATGGCCGCGTGGACGTGCACGAGTTGCGCCAGGGGCTGGCCAGGCTGGGCGGGGGCAACCCAGACCCCGGCG 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 GGATGGCCGCGTGGACGTGCACGAGTTGCGCCAGGGGCTGGCCAGGCTGGGCGGGGGCAACCCAGACCCCGGCG 148
Query 149 CCCAACAGGGTATCTCCTCTGAGGGTGATGCTGACCCAGATGGCGGGCTCGACCTGGAGGAATTTTCCCGCTAT 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 CCCAACAGGGTATCTCCTCTGAGGGTGATGCTGACCCAGATGGCGGGCTCGACCTGGAGGAATTTTCCCGCTAT 222
Query 223 CTGCAGGAGCGGGAACAGCGTCTGCTGCTCATGTTTCACAGTCTTGACCGGAACCAGGATGGTCACATTGATGT 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 CTGCAGGAGCGGGAACAGCGTCTGCTGCTCATGTTTCACAGTCTTGACCGGAACCAGGATGGTCACATTGATGT 296
Query 297 CTCTGAGATCCAACAGAGTTTCCGAGCTCTGGGCATTTCCATCTCGCTGGAGCAGGCTGAGAAAATTTTGCACA 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 CTCTGAGATCCAACAGAGTTTCCGAGCTCTGGGCATTTCCATCTCGCTGGAGCAGGCTGAGAAAATTTTGCACA 370
Query 371 GCATGGACCGAGACGGCACAATGACCATTGACTGGCAAGAATGGCGCGACCACTTCCTGTTGCATTCGCTGGAA 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 GCATGGACCGAGACGGCACAATGACCATTGACTGGCAAGAATGGCGCGACCACTTCCTGTTGCATTCGCTGGAA 444
Query 445 AATGTGGAGGACGTGCTGTATTTCTGGAAGCATTCCACGCTCTCTTCTGCTGGGTTCTCTGCCTGGATAAAAGA 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 AATGTGGAGGACGTGCTGTATTTCTGGAAGCATTCCACGCTCTCTTCTGCTGGGTTCTCTGCCTGGATAAAAGA 518
Query 519 TTCTACGGCTGAACAGAATCGTTCAAAAACCACGGTCTTGGCCAGGCGCAGTGGCTCACACCTGAAATCCCAGC 592
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 519 TTCTACGGCTGAACAGAATCGTTCAAAAACCACGGTCTTGGCCAGGCGCAGTGGCTCACACCTAAAATCCCAGC 592
Query 593 ACTTTGGGAGGCCGAAGTGGGCGGATCACGAGGTCCTGGACATTGGCGAGTGCCTGACAGTGCCGGACGAGTTC 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 ACTTTGGGAGGCCGAAGTGGGCGGATCACGAGGTCCTGGACATTGGCGAGTGCCTGACAGTGCCGGACGAGTTC 666
Query 667 TCAAAGCAAGAGAAGCTGACGGGCATGTGGTGGAAACAGCTGGTGGCCGGCGCAGTGGCAGGTGCCGTGTCACG 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 TCAAAGCAAGAGAAGCTGACGGGCATGTGGTGGAAACAGCTGGTGGCCGGCGCAGTGGCAGGTGCCGTGTCACG 740
Query 741 GACAGGCACGGCCCCTCTGGACCGCCTCAAGGTCTTCATGCAGGTCCATGCCTCAAAGACCAACCGGCTGAACA 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 GACAGGCACGGCCCCTCTGGACCGCCTCAAGGTCTTCATGCAGGTCCATGCCTCAAAGACCAACCGGCTGAACA 814
Query 815 TCCTTGGGGGGCTTCGAAGCATGGTCCTTGAGGGAGGCATCCGCTCCCTGTGGCGCGGCAATGGTATTAATGTA 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 TCCTTGGGGGGCTTCGAAGCATGGTCCTTGAGGGAGGCATCCGCTCCCTGTGGCGCGGCAATGGTATTAATGTA 888
Query 889 CTCAAGATTGCCCCCGAGTCAGCTATCAAGTTCATGGCCTATGAACAGATCAAGAGGGCCATCCTGGGGCAGCA 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 CTCAAGATTGCCCCCGAGTCAGCTATCAAGTTCATGGCCTATGAACAGATCAAGAGGGCCATCCTGGGGCAGCA 962
Query 963 GGAGACACTGCATGTGCAGGAGCGCTTCGTGGCTGGCTCCCTGGCTGGTGCCACAGCCCAAACCATCATTTACC 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 GGAGACACTGCATGTGCAGGAGCGCTTCGTGGCTGGCTCCCTGGCTGGTGCCACAGCCCAAACCATCATTTACC 1036
Query 1037 CTATGGAGGTGCTGAAGACGCGGCTGACCTTGCGCCGGACGGGCCAGTATAAGGGGCTGCTGGACTGCGCCAGG 1110
|||||
Sbjct 1037 CTATG--------------------------------------------------------------------- 1041
Query 1111 CGTATCCTGGAGAGGGAGGGGCCCCGTGCCTTCTACCGCGGCTACCTCCCCAACGTGCTGGGCATCATCCCCTA 1184
Sbjct 1042 -------------------------------------------------------------------------- 1041
Query 1185 TGCGGGCATCGACCTGGCCGTCTACGAGACTCTGAAGAACTGGTGGCTTCAGCAGTACAGCCACGACTCGGCAG 1258
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1042 -------------------------GAGACTCTGAAGAACTGGTGGCTTCAGCAGTACAGCCACGACTCGGCAG 1090
Query 1259 ACCCAGGCATCCTCGTGCTCCTGGCCTGCGGTACCATATCCAGCACCTGCGGCCAGATAGCCAGTTACCCGCTG 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1091 ACCCAGGCATCCTCGTGCTCCTGGCCTGCGGTACCATATCCAGCACCTGCGGCCAGATAGCCAGTTACCCGCTG 1164
Query 1333 GCCCTGGTCCGGACCCGCATGCAGGCACAAGGC----TGGAGTACAGTGGC---------TCGAT--------- 1384
|||||||||||||||||||||||||||||||.| |.||| .||||| ||.||
Sbjct 1165 GCCCTGGTCCGGACCCGCATGCAGGCACAAGCCTCCATCGAG---GGTGGCCCCCAGCTGTCCATGCTGGGTCT 1235
Query 1385 -----TTCAGATCACTG---CA--------------ACCTCTGC-----------------CTTC---CAGG-- 1414
.|||.||| ||| || .|||||.| |||| .|||
Sbjct 1236 GCTACGTCACATC-CTGTCCCAGGAGGGCATGCGGGGCCTCTACCGGGGGATCGCCCCCAACTTCATGAAGGTT 1308
Query 1415 -TTCAAGC-----GATTCTCCT--------------------------GCC-------TCAGCCTCCAGAG 1446
|||.||| |..|||||| ||| ||| |.|||||.
Sbjct 1309 ATTCCAGCTGTGAGCATCTCCTATGTGGTCTACGAGAACATGAAGCAGGCCTTGGGGGTCA-CGTCCAGG- 1377