Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_12570
- Subject:
- NM_001330300.2
- Aligned Length:
- 3066
- Identities:
- 2055
- Gaps:
- 1011
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGAGTTCTCAACAGTTTCCTCGGTTAGGAGCCCCTTCTACCGGGCTGAGCCAGGCCCCTTCTCAGATTGCAAA 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 CAGTGGTTCTGCTGGATTGATAAACCCAGCTGCTACAGTCAATGATGAATCTGGTCGAGATTCTGAAGTCAGTG 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 149 CCAGGGAGCACATGAGTTCCAGCAGCTCCCTCCAGTCCCGGGAGGAGAAGCAAGAGCCTGTTGTGGTAAGGCCC 222
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 223 TATCCACAGGTGCAGATGTTGTCGACACACCATGCTGTCGCATCAGCCACACCTGTTGCAGTGACAGCCCCGCC 296
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 297 AGCACACCTGACGCCAGCAGTGCCACTTTCATTTTCGGAGGGACTTATGAAGCCGCCCCCGAAGCCCACCATGC 370
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 371 CTAGCCGTCCCATTGCTCCTGCTCCACCTTCTACCCTGTCACTTCCCCCCAAGGTTCCAGGGCAGGTTACCGTT 444
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 445 ACCATGGAGAGTAGCATCCCTCAAGCTTCAGCCATTCCTGTGGCAACAATCAGTGGACAACAGGGCCATCCCAG 518
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 519 TAACCTGCATCACATCATGACTACAAATGTGCAAATGTCTATCATCCGCAGCAATGCTCCTGGGCCCCCTCTTC 592
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 593 ACATTGGAGCTTCTCATTTACCTCGAGGTGCAGCTGCTGCTGCTGTGATGTCCAGTTCTAAAGTAACCACAGTC 666
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 667 CTGAGGCCGACCTCACAGCTGCCAAATGCTGCTACTGCTCAGCCAGCAGTACAGCACATCATTCACCAACCAAT 740
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 741 CCAGTCTCGGCCACCTGTGACCACCTCCAATGCCATCCCTCCTGCTGTGGTAGCAACTGTCTCAGCCACCAGAG 814
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 815 CTCAGTCTCCAGTCATCACTACGACAGCGGCGCATGCTACTGATTCAGCACTTAGTAGGCCAACCTTGTCTATC 888
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 889 CAGCATCCTCCATCTGCAGCAATCAGTATTCAGCGTCCTGCCCAGTCACGAGATGTCACAACAAGAATCACACT 962
Query 1 ----------------------------------------------ATGGCTCAGAAAACAATCTTCAGTACTG 28
||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 ACCATCTCACCCTGCATTAGGGACGCCAAAACAGCAGCTTCATACAATGGCTCAGAAAACAATCTTCAGTACTG 1036
Query 29 GCACGCCAGTGGCTGCAGCCACAGTAGCACCTATTTTGGCAACCAACACCATTCCTTCAGCGACCACAGCTGGA 102
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 GCACGCCAGTGGCTGCAGCCACAGTAGCACCTATTTTGGCAACCAACACCATTCCTTCAGCGACCACAGCTGGA 1110
Query 103 TCTGTGTCACACACGCAAGCTCCCACAAGTACCATTGTTACCATGACAGTACCCTCCCATTCCTCCCATGCTAC 176
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 TCTGTGTCACACACGCAAGCTCCCACAAGTACCATTGTTACCATGACAGTACCCTCCCATTCCTCCCATGCTAC 1184
Query 177 TGCTGTGACCACCTCAAACATCCCAGTCGCCAAGGTGGTGCCCCAGCAGATCACGCACACTTCTCCTCGGATCC 250
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 TGCTGTGACCACCTCAAACATCCCAGTCGCCAAGGTGGTGCCCCAGCAGATCACGCACACTTCTCCTCGGATCC 1258
Query 251 AGCCAGACTACCCTGCCGAGAGGAGTAGCCTGATTCCCATCTCCGGACATCGGGCCTCTCCCAATCCTGTGGCC 324
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 AGCCAGACTACCCTGCCGAGAGGAGTAGCCTGATTCCCATCTCCGGACATCGGGCCTCTCCCAATCCTGTGGCC 1332
Query 325 ATGGAAACCCGAAGTGACAACAGACCGTCTGTTCCCGTTCAGTTCCAATATTTTTTGCCAACTTACCCCCCTTC 398
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 ATGGAAACCCGAAGTGACAACAGACCGTCTGTTCCCGTTCAGTTCCAATATTTTTTGCCAACTTACCCCCCTTC 1406
Query 399 TGCATACCCACTGGCGGCACATACCTACACCCCAATCACCAGTTCCGTGTCCACTATCCGACAGTATCCAGTTT 472
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 TGCATACCCACTGGCGGCACATACCTACACCCCAATCACCAGTTCCGTGTCCACTATCCGACAGTATCCAGTTT 1480
Query 473 CAGCTCAGGCTCCAAACTCTGCCATCACAGCTCAGACTGGTGTTGGGGTAGCGTCTACCGTCCACCTAAACCCC 546
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 CAGCTCAGGCTCCAAACTCTGCCATCACAGCTCAGACTGGTGTTGGGGTAGCGTCTACCGTCCACCTAAACCCC 1554
Query 547 ATGCAGTTGATGACAGTGGATGCATCGCATGCTCGACATATTCAAGGGATCCAGCCAGCACCCATCAGTACCCA 620
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 ATGCAGTTGATGACAGTGGATGCATCGCATGCTCGACATATTCAAGGGATCCAGCCAGCACCCATCAGTACCCA 1628
Query 621 GGGTATCCAGCCGGCCCCCATTGGGACCCCAGGGATACAGCCTGCACCACTTGGCACACAGGGAATTCACTCAG 694
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 GGGTATCCAGCCGGCCCCCATTGGGACCCCAGGGATACAGCCTGCACCACTTGGCACACAGGGAATTCACTCAG 1702
Query 695 CAACCCCAATCAACACACAAGGGCTTCAGCCTGCACCTATGGGTACTCAGCAGCCTCAGCCTGAAGGAAAGACT 768
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 CAACCCCAATCAACACACAAGGGCTTCAGCCTGCACCTATGGGTACTCAGCAGCCTCAGCCTGAAGGAAAGACT 1776
Query 769 TCAGCAGTGGTGTTGGCAGATGGAGCCACAATTGTGGCCAACCCTATTAGCAATCCATTCAGTGCTGCTCCAGC 842
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 T---CAGTGGTGTTGGCAGATGGAGCCACAATTGTGGCCAACCCTATTAGCAATCCATTCAGTGCTGCTCCAGC 1847
Query 843 AGCAACAACCGTGGTGCAGACCCACAGCCAGAGTGCTAGCACCAACGCTCCCGCCCAGGGCTCATCGCCACGGC 916
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1848 AGCAACAACCGTGGTGCAGACCCACAGCCAGAGTGCTAGCACCAACGCTCCCGCCCAGGGCTCATCGCCACGGC 1921
Query 917 CAAGCATACTCCGGAAGAAACCTGCCACAGATGGTGCCAAACCCAAGTCTGAAATCCACGTGTCTATGGCCACT 990
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1922 CAAGCATACTCCGGAAGAAACCTGCCACAGATGGTGCCAAACCCAAGTCTGAAATCCACGTGTCTATGGCCACT 1995
Query 991 CCGGTCACTGTGTCCATGGAGACTGTATCCAATCAAAATAATGATCAGCCTACCATTGCCGTCCCTCCAACTGC 1064
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1996 CCGGTCACTGTGTCCATGGAGACTGTATCCAATCAAAATAATGATCAGCCTACCATTGCCGTCCCTCCAACTGC 2069
Query 1065 CCAGCAGCCCCCACCGACCATTCCAACTATGATTGCAGCAGCCAGTCCCCCGTCACAACCAGCCGTTGCCCTTT 1138
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2070 CCAGCAGCCCCCACCGACCATTCCAACTATGATTGCAGCAGCCAGTCCCCCGTCACAACCAGCCGTTGCCCTTT 2143
Query 1139 CAACCATTCCTGGAGCGGTCCCCATCACTCCACCCATCACCACCATTGCAGCTGCACCACCTCCATCAGTCACT 1212
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2144 CAACCATTCCTGGAGCGGTCCCCATCACTCCACCCATCACCACCATTGCAGCTGCACCACCTCCATCAGTCACT 2217
Query 1213 GTGGGTGGCAGTCTTTCCTCCGTCTTGGGCCCTCCCGTTCCTGAAATTAAAGTGAAAGAAGAAGTAGAACCAAT 1286
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2218 GTGGGTGGCAGTCTTTCCTCCGTCTTGGGCCCTCCCGTTCCTGAAATTAAAGTGAAAGAAGAAGTAGAACCAAT 2291
Query 1287 GGATATCATGAGGCCAGTTTCTGCAGTTCCTCCACTGGCTACCAACACTGTGTCTCCATCTCTTGCATTGCTGG 1360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2292 GGATATCATGAGGCCAGTTTCTGCAGTTCCTCCACTGGCTACCAACACTGTGTCTCCATCTCTTGCATTGCTGG 2365
Query 1361 CAAACAACTTGTCCATGCCTACAAGTGACCTACCACCTGGTGCCTCCCCAAGGAAAAAGCCTCGAAAGCAACAG 1434
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2366 CAAACAACTTGTCCATGCCTACAAGTGACCTACCACCTGGTGCCTCCCCAAGGAAAAAGCCTCGAAAGCAACAG 2439
Query 1435 CATGTGATCTCAACAGAAGAAGGTGACATGATGGAGACAAACAGCACTGATGATGAGAAGTCCACTGCCAAGAG 1508
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2440 CATGTGATCTCAACAGAAGAAGGTGACATGATGGAGACAAACAGCACTGATGATGAGAAGTCCACTGCCAAGAG 2513
Query 1509 TCTTCTGGTGAAGGCTGAGAAGCGCAAGTCTCCTCCCAAGGAGTATATTGATGAGGAAGGTGTGAGATATGTCC 1582
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2514 TCTTCTGGTGAAGGCTGAGAAGCGCAAGTCTCCTCCCAAGGAGTATATTGATGAGGAAGGTGTGAGATATGTCC 2587
Query 1583 CAGTGCGTCCAAGACCCCCCATTACTTTGCTTCGTCACTATCGGAACCCCTGGAAAGCTGCTTACCACCACTTT 1656
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2588 CAGTGCGTCCAAGACCCCCCATTACTTTGCTTCGTCACTATCGGAACCCCTGGAAAGCTGCTTACCACCACTTT 2661
Query 1657 CAGAGGTACAGTGACGTCCGGGTCAAAGAGGAGAAGAAAGCTATGCTGCAGGAAATAGCTAATCAGAAAGGAGT 1730
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2662 CAGAGGTACAGTGACGTCCGGGTCAAAGAGGAGAAGAAAGCTATGCTGCAGGAAATAGCTAATCAGAAAGGAGT 2735
Query 1731 ATCCTGTCGTGCTCAAGGCTGGAAAGTCCACCTCTGTGCTGCCCAGTTACTACAGCTGACGAATCTAGAACATG 1804
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2736 ATCCTGTCGTGCTCAAGGCTGGAAAGTCCACCTCTGTGCTGCCCAGTTACTACAGCTGACGAATCTAGAACATG 2809
Query 1805 ATGTCTATGAAAGACTTACTAACCTGCAGGAAGGGATTATCCCAAAGAAAAAAGCAGCAACAGATGATGATCTC 1878
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2810 ATGTCTATGAAAGACTTACTAACCTGCAGGAAGGGATTATCCCAAAGAAAAAAGCAGCAACAGATGATGATCTC 2883
Query 1879 CACCGAATAAACGAACTGATACAGGGAAATATGCAGAGGTGTAAACTTGTGATGGATCAAATCAGTGAAGCCAG 1952
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2884 CACCGAATAAACGAACTGATACAGGGAAATATGCAGAGGTGTAAACTTGTGATGGATCAAATCAGTGAAGCCAG 2957
Query 1953 AGACTCCATGCTTAAGGTTTTAGATCATAAAGACCGTGTCCTGAAGCTGCTTAACAAGAACGGGACTGTCAAAA 2026
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2958 AGACTCCATGCTTAAGGTTTTAGATCATAAAGACCGTGTCCTGAAGCTGCTTAACAAGAACGGGACTGTCAAAA 3031
Query 2027 AAGTGTCCAAATTGAAGCGAAAGGAAAAAGTC 2058
||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3032 AAGTGTCCAAATTGAAGCGAAAGGAAAAAGTC 3063