Protein Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_12570
- Subject:
- NM_001330302.2
- Aligned Length:
- 1057
- Identities:
- 685
- Gaps:
- 372
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 MSSQQFPRLGAPSTGLSQAPSQIANSGSAGLINPAATVNDESGRDSEVSAREHMSSSSSLQSREEKQEPVVVRP 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 YPQVQMLSTHHAVASATPVAVTAPPAHLTPAVPLSFSEGLMKPPPKPTMPSRPIAPAPPSTLSLPPKVPGQVTV 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 149 TMESSIPQASAIPVATISGQQGHPSNLHHIMTTNVQMSIIRSNAPGPPLHIGASHLPRGAAAAAVMSSSKVTTV 222
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 223 LRPTSQLPNAATAQPAVQHIIHQPIQSRPPVTTSNAIPPAVVATVSATRAQSPVITTTAAHATDSALSRPTLSI 296
Query 1 ----------------------------------------MAQKTIFSTGTPVAAATVAPILATNTIPSATTAG 34
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Sbjct 297 QHPPSAAISIQRPAQSRDVTTRITLPSHPALGTPKQQLHTMAQKTIFSTGTPVAAATVAPILATNTIPSATTAG 370
Query 35 SVSHTQAPTSTIVTMTVPSHSSHATAVTTSNIPVAKVVPQQITHTSPRIQPDYPAERSSLIPISGHRASPNPVA 108
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Sbjct 371 SVSHTQAPTSTIVTMTVPSHSSHATAVTTSNIPVAKVVPQQITHTSPRIQPDYPAERSSLIPISGHRASPNPVA 444
Query 109 METRSDNRPSVPVQFQYFLPTYPPSAYPLAAHTYTPITSSVSTIRQYPVSAQAPNSAITAQTGVGVASTVHLNP 182
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Sbjct 445 METRSDNRPSVPVQFQYFLPTYPPSAYPLAAHTYTPITSSVSTIRQYPVSAQAPNSAITAQTGVGVASTVHLNP 518
Query 183 MQLMTVDASHARHIQGIQPAPISTQGIQPAPIGTPGIQPAPLGTQGIHSATPINTQGLQPAPMGTQQPQPEGKT 256
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Sbjct 519 MQLMTVDASHARHIQGIQPAPISTQGIQPAPIGTPGIQPAPLGTQGIHSATPINTQGLQPAPMGTQQPQPEGKT 592
Query 257 SAVVLADGATIVANPISNPFSAAPAATTVVQTHSQSASTNAPAQGSSPRPSILRKKPATD-------------- 316
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Sbjct 593 S-VVLADGATIVANPISNPFSAAPAATTVVQTHSQSASTNAPAQGSSPRPSILRKKPATDGMAVRKTLIPPQPP 665
Query 317 ---------------------GAKPKSEIHVSMATPVTVSMETVSNQNNDQPTIAVPPTAQQPPPTIPTMIAAA 369
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Sbjct 666 DVASPRVESSMRSTSGSPRPAGAKPKSEIHVSMATPVTVSMETVSNQNNDQPTIAVPPTAQQPPPTIPTMIAAA 739
Query 370 SPPSQPAVALSTIPGAVPITPPITTIAAAPPPSVTVGGSLSSVLGPPVPEIKVKEEVEPMDIMRPVSAVPPLAT 443
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Sbjct 740 SPPSQPAVALSTIPGAVPITPPITTIAAAPPPSVTVGGSLSSVLGPPVPEIKVKEEVEPMDIMRPVSAVPPLAT 813
Query 444 NTVSPSLALLANNLSMPTSDLPPGASPRKKPRKQQHVISTEEGDMMETNSTDDEKSTAKSLLVKAEKRKSPPKE 517
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Sbjct 814 NTVSPSLALLANNLSMPTSDLPPGASPRKKPRKQQHVISTEEGDMMETNSTDDEKSTAKSLLVKAEKRKSPPKE 887
Query 518 YIDEEGVRYVPVRPRPPITLLRHYRNPWKAAYHHFQRYSDVRVKEEKKAMLQEIANQKGVSCRAQGWKVHLCAA 591
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Sbjct 888 YIDEEGVRYVPVRPRPPITLLRHYRNPWKAAYHHFQRYSDVRVKEEKKAMLQEIANQKGVSCRAQGWKVHLCAA 961
Query 592 QLLQLTNLEHDVYERLTNLQEGIIPKKKAATDDDLHRINELIQGNMQRCKLVMDQISEARDSMLKVLDHKDRVL 665
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Sbjct 962 QLLQLTNLEHDVYERLTNLQEGIIPKKKAATDDDLHRINELIQGNMQRCKLVMDQISEARDSMLKVLDHKDRVL 1035
Query 666 KLLNKNGTVKKVSKLKRKEKV 686
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Sbjct 1036 KLLNKNGTVKKVSKLKRKEKV 1056
