Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_12581
• Subject: NM_001322043.1
• Aligned Length: 1824
• Identities: 1542
• Gaps: 279

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGGCGGCCCCCATCCTGAAAGTGGCCTATGTTGAAGTGTGGTCATCCAATGGAACAGAAAATTATTCAAAGAC  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  ATTTACAACACAGCTTGTGGATATGGGGGCAAAGGTTTCAAAAACTTTTAACAAACAAGTAACTCACGTTATCT  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  TCAAAGATGGCTACCAGAGCACTTGGGACAAAGCTCAGAAGAGAGGCGTAAAGCTCGTTTCGGTGCTCTGGGTG  222

Query    1  ---------------------------------------------------------ATGAATGAACACTTATC  17
                                                                     |||||||||||||||||
Sbjct  223  GAAAAATGCAGGACAGCTGGAGCACACATTGATGAATCATTGTTCCCTGCAGCTAATATGAATGAACACTTATC  296

Query   18  AAGCCTAATTAAAAAAAAACGTAAATGTATGCAGCCCAAGGATTTTAATTTTAAAACACCAGAAAATGATAAGA  91
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AAGCCTAATTAAAAAAAAACGTAAATGTATGCAGCCCAAAGATTTTAATTTTAAAACACCAGAAAATGATAAGA  370

Query   92  GATTTCAGAAGAAATTTGAGAAAATGGCTAAAGAGCTACAAAGGCAAAAAACAAATCTAGATGATGATGTACCT  165
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GATTTCAGAAGAAATTTGAGAAAATGGCTAAAGAGCTACAAAGGCAAAAAACAAATCTAGATGATGATGTACCT  444

Query  166  ATTCTCTTATTTGAATCTAATGGTTCATTAATATATACTCCCACAATTGAAATTAATAGTAGTCACCACAGCGC  239
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  ATTCTCTTATTTGAATCTAATGGTTCATTAATATATACTCCCACAATTGAAATTAATAGTAGTCACCACAGCGC  518

Query  240  AATGGAGAAGAGATTACAAGAGATGAAGGAGAAAAGGGAAAATCTTTCCCCCACCTCTTCCCAAATGATTCAGC  313
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AATGGAGAAGAGATTACAAGAGATGAAGGAGAAAAGGGAAAATCTTTCCCCCACCTCTTCCCAAATGATTCAGC  592

Query  314  AGTCTCATGATAATCCAAGTAACTCTCTGTGTGAAGCACCTTTGAACATTTCACGTGATACTTTGTGTTCAGAT  387
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AGTCTCATGATAATCCAAGTAACTCTCTGTGTGAAGCACCTTTGAACATTTCACGTGATACTTTGTGTTCAGAT  666

Query  388  GAATACTTTGCTGGTGGCTTACACTCATCTTTTGATGATCTTTGTGGAAACTCAGGATGTGGAAATCAGGAAAG  461
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GAATACTTTGCTGGTGGCTTACACTCATCTTTTGATGATCTTTGTGGAAACTCAGGATGTGGAAATCAGGAAAG  740

Query  462  GAAGTTGGAAGGATCCATTAATGACATTAAAAGTGATGTGTGTATTTCTTCACTTGTATTGAAAGCAAATAATA  535
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GAAGTTGGAAGGATCCATTAATGACATTAAAAGTGATGTGTGTATTTCTTCACTTGTATTGAAAGCAAATAATA  814

Query  536  TTCATTCATCACCATCTTTCACTCACCTCGATAAATCAAGTCCTCAGAAATTTCTGAGTAATCTTTCAAAGGAA  609
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TTCATTCATCACCATCTTTCACTCACCTCGATAAATCAAGTCCTCAGAAATTTCTGAGTAATCTTTCAAAGGAA  888

Query  610  GAAATAAACTTGCAAAGAAATATTGCAGGTAAAGTAGTCACCCCTCACCAAAAGCAGGCTGCAGGTATGTCTCA  683
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GAAATAAACTTGCAAAGAAATATTGCAGGTAAAGTAGTCACCCCTGACCAAAAGCAGGCTGCAGGTATGTCTCA  962

Query  684  GGAGACGTTTGAAGAGAAGTATCGTTTGTCTCCTACCTTATCTTCAACAAAAGGCCACCTTTTGATACATTCAA  757
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GGAGACGTTTGAAGAGAAGTATCGTTTGTCTCCTACCTTATCTTCAACAAAAGGCCACCTTTTGATACATTCAA  1036

Query  758  GACCCAGGAGTTCCTCAGTAAAGAGAAAAAGAGTATCACATGGCTCCCATTCACCTCCGAAGGAAAAATGCAAG  831
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GACCCAGGAGTTCCTCAGTAAAGAGAAAAAGAGTATCACATGGCTCCCATTCACCTCCGAAGGAAAAATGCAAG  1110

Query  832  AGAAAGAGGAGCACCAGGAGATCTATCATGCCGAGGCTGCAGCTGTGCAGGTCGGAAGGCAGGCTGCAGCACGT  905
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 1111  AGAAAGAGGAGCACCAGGAGATCTATCATGCCGAGGCTGCAGCTGTGCAGGTCGGAAGACAGGCTGCAGCACGT  1184

Query  906  GGCGGGACCTGCCCTGGAGGCTCTTAGCTGTGGGGAGTCTTCATATGATGACTATTTTTCACCTGATAATCTTA  979
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GGCGGGACCTGCCCTGGAGGCTCTTAGCTGTGGGGAGTCTTCATATGATGACTATTTTTCACCTGATAATCTTA  1258

Query  980  AGGAAAGGTATTCAGAGAATCTTCCTCCTGAATCTCAGCTGCCATCAAGCCCTGCTCAGTTGAGCTGCAGAAGT  1053
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  AGGAAAGGTATTCAGAGAATCTTCCTCCTGAATCTCAGCTGCCATCAAGCCCTGCTCAGTTGAGCTGCAGAAGT  1332

Query 1054  CTTTCTAAGAAGGAGAGAACAAGCATATTTGAAATGTCTGATTTTTCCTGCGTTGGCAAAAAAACCAGAACAGT  1127
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  CTTTCTAAGAAGGAGAGAACAAGCATATTTGAAATGTCTGATTTTTCCTGCGTTGGCAAAAAAACCAGAACAGT  1406

Query 1128  TGACATTACCAATTTCACAGCAAAAACCATCTCCAGTCCTCGGAAAACTGGAAATGGTGAAGGCCGTGCAACTT  1201
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  TGACATTACCAATTTCACAGCAAAAACCATCTCCAGTCCTCGGAAAACTGGAAATGGTGAAGGCCGTGCAACTT  1480

Query 1202  CGAGTTGCGTGACTTCTGCCCCTGAAGAAGCCCTAAGGTGTTGTAGACAGGCTGGGAAAGAAGACGCATGCCCA  1275
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  CGAGTTGCGTGACTTCTGCCCCTGAAGAAGCCCTAAGGTGTTGTAGACAGGCTGGGAAAGAAGACGCATGCCCA  1554

Query 1276  GAGGGAAATGGCTTTTCTTACACCATTGAGGACCCTGCTCTTCCAAAAGGACATGATGATGATTTAACTCCTTT  1349
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  GAGGGAAATGGCTTTTCTTACACCATTGAGGACCCTGCTCTTCCAAAAGGACATGATGATGATTTAACTCCTTT  1628

Query 1350  GGAAGGAAGCCTTGAAGAAATGAAAGAAGCGGTTGGTCTGAAAAGCACACAGAACAAAGGTACCACTTCCAAAA  1423
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  GGAAGGAAGCCTTGAAGAAATGAAAGAAGCGGTTGGTCTGAAAAGCACACAGAACAAAGGTACCACTTCCAAAA  1702

Query 1424  TATCAAACTCCTCTGAAGGCGAAGCCCAGAGTGAACATGAGCCATGTTTTATAGTTGACTGTAACATGGAGACG  1497
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  TATCAAACTCCTCTGAAGGCGAAGCCCAGAGTGAACATGAGCCATGTTTTATAGTTGACTGTAACATGGAGACG  1776

Query 1498  TCTACAGAAGAGAAGGAAAACTTACCCGGAGGATACAGTGGAAGTATG  1545
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  TCTACAGAAGAGAAGGAAAACTTACCCGGAGGATACAGTGGAAGTATG  1824