Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_12623
- Subject:
- NM_001284403.2
- Aligned Length:
- 843
- Identities:
- 683
- Gaps:
- 141
Alignment
Query 1 ATG---AAAGAC----------CAGCATTT-----------ACGAGGTTTCTTCT----------CAGA----- 35
||| ..|||| |.|||||| .|||| ||||.|| ||||
Sbjct 1 ATGGTCCGAGACAGTATGGCTGCTGCATTTCGGCCCTCGAATCGAG--TTCTCCTGCAGGCGCTGCAGATTTTG 72
Query 36 --------------------CTCCACATCATTCA---------------------------------------- 49
||||...||..|||
Sbjct 73 GTGTATCCTGGGGTGGGAGGCTCCGGCTCTGTCAGCTGCCGCTGCCCTCTCGGAGCTAAAAGATACCTACTTAC 146
Query 50 --ATATTTTGATGGATATGTTA-------TTTATCAAAGGCAAA--------------TA-------------T 87
|||.|.||.|| |..||| ||.|.||||.| ||| || |
Sbjct 147 AGATAATGTGGTG---AAATTAAAAGAATTTCAACAAAAG-AAAGTGGCTGTTGCATGTAATCTTTCTGGCACT 216
Query 88 AAAAGTGCTTTGCAAGTATTGATAGAGATGAAAAACCAAGATGTGAAGTTCACCAAAGATACCTATGTTCTTGC 161
|||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 217 AAAGGTGCTTTGCAAGTATTGATAGAGATGAAAAACCAAGATGTGAAGTTCACCAAAGATACCTATGTTCTTGC 290
Query 162 TTTTGCAATTTGCTACAAACTGAATAGCCCTGAGTCTTTCAAAATCTGTACTACATTAAGAGAAGAAGCTCTAC 235
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 291 TTTTGCAATTTGCTACAAACTGAATAGCCCTGAGTCTTTCAAAATCTGTACTACATTAAGAGAAGAAGCTCTAC 364
Query 236 TCAAAGGAGAAATTCTCTCCAGGAGAGCATCCTGTTTCGCTGTGGCATTAGCTCTGAATCAGAATGAGATGGCA 309
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 365 TCAAAGGAGAAATTCTCTCCAGGAGAGCATCCTGTTTCGCTGTGGCATTAGCTCTGAATCAGAATGAGATGGCA 438
Query 310 AAAGCTGTGTCCATTTTTTCTCAAATCATGAATCCAGAAAGCATAGCCTGCATTAATTTAAATATTATAATCCA 383
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 439 AAAGCTGTGTCCATTTTTTCTCAAATCATGAATCCAGAAAGCATAGCCTGCATTAATTTAAATATTATAATCCA 512
Query 384 TATCCAGTCAAATATGTTGGAAAACCTGATAAAGACTCTAAAAAATGCTGCAGAAGGAAATTTATCAAAATTTG 457
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 513 TATCCAGTCAAATATGTTGGAAAACCTGATAAAGACTCTAAAAAATGCTGCAGAAGGAAATTTATCAAAATTTG 586
Query 458 TGAAAAGACATGTGTTCTCGGAGGAAGTGCTGGCCAAAGTGAGGGAAAAAGTGAAGGATGTGCCTGCCCTTGTG 531
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 587 TGAAAAGACATGTGTTCTCGGAGGAAGTGCTGGCCAAAGTGAGGGAAAAAGTGAAGGATGTGCCTGCCCTTGTG 660
Query 532 GCCAAATTTGATGAGATCTATGGGACACTGCACATCACTGGCCAGGTCACCACTGATTCTTTGGATGCTGTGCT 605
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 661 GCCAAATTTGATGAGATCTATGGGACACTGCACATCACTGGCCAGGTCACCACTGATTCTTTGGATGCTGTGCT 734
Query 606 CTGCCACACCCCCAGGGACAGGAAATCTCACACGTTGCTATTAAACAAGAGGATGGTCAGCCGTCGCACCTTCC 679
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 735 CTGCCACACCCCCAGGGACAGGAAATCTCACACGTTGCTATTAAACAAGAGGATGGTCAGCCGTCGCACCTTCC 808
Query 680 AGCCACTCAGCCAGTCCCTGTTGGCTGAG 708
|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 809 AGCCACTCAGCCAGTCCCTGTTGGCTGAG 837