Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_12639
• Subject: NM_172444.4
• Aligned Length: 1985
• Identities: 1290
• Gaps: 526

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGTTTGTCAGCTACCTGTTATTAACATTGTTCCACACTGAGACAGCAATGTTAGCAAGACCTGGGGGAGAGAG  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  CATTGGCTGTGACGACTTCCTGGGATCTGACAAAGTCTTGGACAAGTGCGGGGTGTGTGGAGGTGATAACACGG  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  GCTGCCAGGTGGTGTCGGGAGTGTTCAAGCACGCCCTCACCAGCCTGGGCTACCACCGGGTTGTAGAGATTCCC  222

Query    1  ------------------------------ATGTACAAGAGCAACAACTATTTGGCCCTGAGAAGTCGTTCTGG  44
                                          |||.||||||||||||||||.||.|||.||.|||||||.|||||
Sbjct  223  CAAGGAGCTACGAAAATTAACATTACAGAGATGCACAAGAGCAACAACTACTTAGCCTTGCGAAGTCGCTCTGG  296

Query   45  ACGCTCCATCATCAATGGGAACTGGGCAATTGATCGACCAGGAAAATACGAGGGCGGAGGGACCATGTTCACCT  118
            .|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||.||.|||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct  297  CCGCTCCATCATCAATGGGAACTGGGCAATCGATCGCCCGGGGAAGTACGAGGGCGGAGGGACAATGTTCACCT  370

Query  119  ACAAGCGTCCAAATGAGATTTCGAGCACTGCCGGAGAGTCCTTTTTGGCGGAAGGTCCCACCAACGAGATCTTG  192
            ||||.||.||.||.|||.|.||.||||||||.||.|||||||||.||||.||.||||||||.||.||||||.||
Sbjct  371  ACAAACGACCGAACGAGGTCTCCAGCACTGCGGGGGAGTCCTTTCTGGCTGAGGGTCCCACTAATGAGATCCTG  444

Query  193  GATGTCTACATGATACACCAGCAGCCAAACCCAGGCGTGCACTACGAGTACGTGATCATGGGGACCAACGCCAT  266
            ||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||.|||||.|||||||||||||||.|||..||.|||||
Sbjct  445  GATGTCTATATGATACACCAGCAGCCCAACCCAGGAGTCCACTATGAGTACGTGATCATGAGGAATAATGCCAT  518

Query  267  CAGCCCCCAGGTGCCACCCCACAGGAGACCAGGGGAACCCTTCAATGGCCAGATGG-TGACAGAAGGCAGGAGC  339
            ||||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||.||||||||.|||.||| .|| .||||.|||..||
Sbjct  519  CAGCCCACAGGTGCCACCACACAGGAGACCAGGAGAACCTTTCAATGGGCAGCTGGAAGA-GGAAGACAGAGGC  591

Query  340  CAGGAGGAGGGAGAACAGAAAGGGAG--GAACGAGGAGAAGGAAGACTTGCGTGGGGAGGCCCCTGAGATGTTC  411
            ||||||||..||||  |||.||||||  ||||.||||.||||||||||..|..|..||||||||||||.|.|||
Sbjct  592  CAGGAGGACAGAGA--AGAGAGGGAGAAGAACCAGGAAAAGGAAGACTCACAAGTCGAGGCCCCTGAGGTATTC  663

Query  412  ACCTCAGAATCGGCACAGACCTTCCCAGTCAGGCATCCAGACAGATTTTCTCCCCATCGACCGGACAACTTGGT  485
            ||.||||||||..|.|||||||||||||||||||||||.||.|||||..||.||||.|||||.|||||||||||
Sbjct  664  ACGTCAGAATCCACGCAGACCTTCCCAGTCAGGCATCCGGAGAGATTCCCTTCCCACCGACCAGACAACTTGGT  737

Query  486  GCCACCAGCACCGCAGCCCCCACGGCGCAGCCGGGATCACAACTGGAAGCAGCTTGGGACAACAGAATGTTCCA  559
            |||.||||||||.|||||||||.||||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||||
Sbjct  738  GCCCCCAGCACCACAGCCCCCAAGGCGAAGCCGGGACCACAACTGGAAGCAGCTGGGGACAACAGAATGCTCCA  811

Query  560  CGACCTGTGGGAAAGGATCGCAGTACCCTATTTTCCGCTGTGTGCACAGAAGCACTCATGAAGAGGCTCCTGAG  633
            |.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||.|||.||.||.||||.|||.|||
Sbjct  812  CCACCTGTGGGAAAGGATCGCAGTACCCTATCTTCCGCTGCGTGCACAGAAACACACACGAGGAGGTTCCCGAG  885

Query  634  AGTTACTGTGACTCCAGCATGAAGCCGACCCCCGAGGAGGAGCCCTGCAACATCTTCCCTTGCCCAGCCTTCTG  707
            ||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||.|||||||.||||||||||||||
Sbjct  886  AGCTACTGTGACTCCAGCATGAAGCCGACCCCAGAGGAGGAACCCTGCAACCTCTTCCCCTGCCCAGCCTTCTG  959

Query  708  GGACATCGGGGAGTGGTCTGAGTGCAGCAAGACCTGTGGCCTGGGCATGCAGCACCGCCAGGTTCTGTGCCGCC  781
            ||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||||
Sbjct  960  GGACATCGGGGAGTGGTCGGAGTGCAGCAAGACCTGTGGTCTGGGCATGCAGCACCGCCAGGTCCTGTGTCGCC  1033

Query  782  AGGTGTACGCCAACCGCAGCCTGACGGTGCAGCCCTACCGCTGCCAGCACCTGGAGAAACCTGAGACCACCAGC  855
            |||||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||
Sbjct 1034  AGGTGTATGCCAACCGTAGCCTGACGGTGCAACCCTACCGCTGCCAGCACCTGGAGAAGCCAGAGACCACCAGC  1107

Query  856  ACCTGCCAACTCAAGATCTGCAGCGAGTGGCAGATCCGGACCGACTGGACCTCGTGCTCGGTGCCCTGCGGCGT  929
            ||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||
Sbjct 1108  ACCTGCCAGCTCAAGATCTGCAGCGAGTGGCAGATTCGGACCGACTGGACCTCGTGCTCAGTGCCCTGTGGCGT  1181

Query  930  GGGACAGAGGACCCGTGATGTGAAGTGTGTGAGCAACATTGGGGATGTGGTTGACGATGAGGAATGCAACATGA  1003
            |||.|||.|||||||.||.||||||||||||||||||||.|||||..||||..|.||.|||||.||||||||||
Sbjct 1182  GGGGCAGCGGACCCGAGACGTGAAGTGTGTGAGCAACATCGGGGACATGGTGCATGACGAGGAGTGCAACATGA  1255

Query 1004  AGCTCCGGCCGAATGACATTGAGAACTGCGACATGGGACCCTGTGCCAAGAGCTGGTTCCTCACCGAGTGGAGC  1077
            ||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.
Sbjct 1256  AGCTCCGGCCAAATGACATCGAGAACTGTGACATGGGGCCCTGTGCGAAGAGCTGGTTCCTCACAGAGTGGAGT  1329

Query 1078  GAAAGGTGCTCAGCGGAGTGTGGGGCCGGAGTGCGGACACGCTCGGTGGTGTGCATGACCAACCATGTCAGCAG  1151
            ||||||||||||||||||||||||||.||||||.|||||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1330  GAAAGGTGCTCAGCGGAGTGTGGGGCAGGAGTGAGGACACGTTCAGTGGTGTGCATGACCAACCACGTCAGCAG  1403

Query 1152  CCTGCCCCTGGAGGGCTGTGGGAACAACCGGCCGGCAGAGGCCACCCCATGTGACAACGGACCCTGCACGGGCA  1225
            ||||||..||||.|||||||||||||||.||||.|..|||||.||.||.||||||||.||.||||||||.||||
Sbjct 1404  CCTGCCGTTGGAAGGCTGTGGGAACAACAGGCCAGTGGAGGCTACGCCGTGTGACAATGGGCCCTGCACAGGCA  1477

Query 1226  AGGTGGAGTGGTTTGCCGGGAGCTGGAGTCAGTGTTCCATCGAGTGTGGGAGCGGGACGCAACAGAGGGAGGTG  1299
            |||||||||||||..|.||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||.||||||||.|||
Sbjct 1478  AGGTGGAGTGGTTCACTGGCAGCTGGAGTCAGTGTTCCATCGAGTGTGGCAGTGGGACACAGCAGAGGGAAGTG  1551

Query 1300  ATTTGTGTTAGAAAGAATGCAGACACCTTTGAAGTGTTGGACCCCTCTGAATGTTCTTTCCTGGAGAAACCCCC  1373
            ||.||||||||.||||||||||||||||||||||||.|.|||||.|.|||.|||||.|||||||||||.|||||
Sbjct 1552  ATCTGTGTTAGGAAGAATGCAGACACCTTTGAAGTGCTAGACCCTTATGAGTGTTCATTCCTGGAGAAGCCCCC  1625

Query 1374  CAGCCAGCAATCCTGCCACCTCAAGCCTTGCGGAGCCAAATGGTTTAGCACCGAATGGAGCATGAGTCTACAAA  1447
            .||||||||..|||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||.| || |.||
Sbjct 1626  AAGCCAGCAGGCCTGCCACCTCAAGCCTTGTGGAGCTAAATGGTTTAGCACAGAATGGAGCATGTG-CT-CCAA  1697

Query 1448  GAGC-----------------------------------------------CATGCTCACCAGGCCAAGT----  1470
            ||||                                               ||||   |||   ||||||    
Sbjct 1698  GAGCTGTCAGGGCGGATTCCGGGTGCGGGAAGTTCGGTGTCTCTCAGATGACATG---ACC---CCAAGTAGCC  1765

Query 1471  --------------------------------------------------------------------------  1470
                                                                                      
Sbjct 1766  TCTGCGACCCCCAGTTGAAACCAGAAGAGAGAGAGTCTTGTAACACTCAGGACTGTGTCCCTGAAGTTGATGAA  1839

Query 1471  --------------------------------------------------------------------------  1470
                                                                                      
Sbjct 1840  AACTGCAAGGACAAGTACTACAACTGCAACGTGGTGGTCCAGGCACGCCTCTGTGTCTACAACTACTACAAGAC  1913

Query 1471  -------------------------------------------------------------  1470
                                                                         
Sbjct 1914  TGCCTGCTGTGCCTCTTGCACCCGAGTGGCTAACAGACACGTGGGCTTTCTGGGGAGCCGA  1974