Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_12639
• Subject: XM_011522044.2
• Aligned Length: 2054
• Identities: 1459
• Gaps: 592

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGTATGTAAAAGGCAATCGCAAATGTGAGTTGAACTGCCAGGCAATGGGCTACCGCTTCTATGTACGGCAAGC  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  TGAGAAAGTCATCGATGGCACCCCCTGTGACCAGAACGGCACGGCCATCTGTGTGTCTGGGCAGTGCAAGAGCA  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  TTGGCTGTGATGACTACTTAGGCTCCGACAAAGTCGTGGACAAATGTGGGGTGTGTGGAGGAGACAACACGGGC  222

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  223  TGTCAGGTTGTGTCGGGCGTGTTTAAGCATGCCCTCACCAGCCTGGGCTACCACCGCGTCGTGGAGATTCCCGA  296

Query    1  ----------------------------ATGTACAAGAGCAACAACTATTTGGCCCTGAGAAGTCGTTCTGGAC  46
                                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GGGAGCCACGAAAATCAACATCACGGAGATGTACAAGAGCAACAACTATTTGGCCCTGAGAAGTCGTTCTGGAC  370

Query   47  GCTCCATCATCAATGGGAACTGGGCAATTGATCGACCAGGAAAATACGAGGGCGGAGGGACCATGTTCACCTAC  120
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GCTCCATCATCAATGGGAACTGGGCAATTGATCGACCAGGAAAATACGAGGGCGGAGGGACCATGTTCACCTAC  444

Query  121  AAGCGTCCAAATGAGATTTCGAGCACTGCCGGAGAGTCCTTTTTGGCGGAAGGTCCCACCAACGAGATCTTGGA  194
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AAGCGTCCAAATGAGATTTCGAGCACTGCCGGAGAGTCCTTTTTGGCGGAAGGTCCCACCAACGAGATCTTGGA  518

Query  195  TGTCTACATGATACACCAGCAGCCAAACCCAGGCGTGCACTACGAGTACGTGATCATGGGGACCAACGCCATCA  268
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TGTCTACATGATACACCAGCAGCCAAACCCAGGCGTGCACTACGAGTACGTGATCATGGGGACCAACGCCATCA  592

Query  269  GCCCCCAGGTGCCACCCCACAGGAGACCAGGGGAACCCTTCAATGGCCAGATGGTGACAGAAGGCAGGAGCCAG  342
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GCCCCCAGGTGCCACCCCACAGGAGACCAGGGGAACCCTTCAATGGCCAGATGGTGACAGAAGGCAGGAGCCAG  666

Query  343  GAGGAGGGAGAACAGAAAGGGAGGAACGAGGAGAAGGAAGACTTGCGTGGGGAGGCCCCTGAGATGTTCACCTC  416
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GAGGAGGGAGAACAGAAAGGGAGGAACGAGGAGAAGGAAGACTTGCGTGGGGAGGCCCCTGAGATGTTCACCTC  740

Query  417  AGAATCGGCACAGACCTTCCCAGTCAGGCATCCAGACAGATTTTCTCCCCATCGACCGGACAACTTGGTGCCAC  490
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  AGAATCGGCACAGACCTTCCCAGTCAGGCATCCAGACAGATTTTCTCCCCATCGACCGGACAACTTGGTGCCAC  814

Query  491  CAGCACCGCAGCCCCCACGGCGCAGCCGGGATCACAACTGGAAGCAGCTTGGGACAACAGAATGTTCCACGACC  564
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CAGCACCGCAGCCCCCACGGCGCAGCCGGGATCACAACTGGAAGCAGCTTGGGACAACAGAATGTTCCACGACC  888

Query  565  TGTGGGAAAGGATCGCAGTACCCTATTTTCCGCTGTGTGCACAGAAGCACTCATGAAGAGGCTCCTGAGAGTTA  638
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TGTGGGAAAGGATCGCAGTACCCTATTTTCCGCTGTGTGCACAGAAGCACTCATGAAGAGGCTCCTGAGAGTTA  962

Query  639  CTGTGACTCCAGCATGAAGCCGACCCCCGAGGAGGAGCCCTGCAACATCTTCCCTTGCCCAGCCTTCTGGGACA  712
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CTGTGACTCCAGCATGAAGCCGACCCCCGAGGAGGAGCCCTGCAACATCTTCCCTTGCCCAGCCTTCTGGGACA  1036

Query  713  TCGGGGAGTGGTCTGAGTGCAGCAAGACCTGTGGCCTGGGCATGCAGCACCGCCAGGTTCTGTGCCGCCAGGTG  786
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TCGGGGAGTGGTCTGAGTGCAGCAAGACCTGTGGCCTGGGCATGCAGCACCGCCAGGTTCTGTGCCGCCAGGTG  1110

Query  787  TACGCCAACCGCAGCCTGACGGTGCAGCCCTACCGCTGCCAGCACCTGGAGAAACCTGAGACCACCAGCACCTG  860
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  TACGCCAACCGCAGCCTGACGGTGCAGCCCTACCGCTGCCAGCACCTGGAGAAACCTGAGACCACCAGCACCTG  1184

Query  861  CCAACTCAAGATCTGCAGCGAGTGGCAGATCCGGACCGACTGGACCTCGTGCTCGGTGCCCTGCGGCGTGGGAC  934
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CCAACTCAAGATCTGCAGCGAGTGGCAGATCCGGACCGACTGGACCTCGTGCTCGGTGCCCTGCGGCGTGGGAC  1258

Query  935  AGAGGACCCGTGATGTGAAGTGTGTGAGCAACATTGGGGATGTGGTTGACGATGAGGAATGCAACATGAAGCTC  1008
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  AGAGGACCCGTGATGTGAAGTGTGTGAGCAACATTGGGGATGTGGTTGACGATGAGGAATGCAACATGAAGCTC  1332

Query 1009  CGGCCGAATGACATTGAGAACTGCGACATGGGACCCTGTGCCAAGAGCTGGTTCCTCACCGAGTGGAGCGAAAG  1082
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  CGGCCGAATGACATTGAGAACTGCGACATGGGACCCTGTGCCAAGAGCTGGTTCCTCACCGAGTGGAGCGAAAG  1406

Query 1083  GTGCTCAGCGGAGTGTGGGGCCGGAGTGCGGACACGCTCGGTGGTGTGCATGACCAACCATGTCAGCAGCCTGC  1156
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GTGCTCAGCGGAGTGTGGGGCCGGAGTGCGGACACGCTCGGTGGTGTGCATGACCAACCATGTCAGCAGCCTGC  1480

Query 1157  CCCTGGAGGGCTGTGGGAACAACCGGCCGGCAGAGGCCACCCCATGTGACAACGGACCCTGCACGGGCAAGGTG  1230
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  CCCTGGAGGGCTGTGGGAACAACCGGCCGGCAGAGGCCACCCCATGTGACAACGGACCCTGCACGGGCAAGGTG  1554

Query 1231  GAGTGGTTTGCCGGGAGCTGGAGTCAGTGTTCCATCGAGTGTGGGAGCGGGACGCAACAGAGGGAGGTGATTTG  1304
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  GAGTGGTTTGCCGGGAGCTGGAGTCAGTGTTCCATCGAGTGTGGGAGCGGGACGCAACAGAGGGAGGTGATTTG  1628

Query 1305  TGTTAGAAAGAATGCAGACACCTTTGAAGTGTTGGACCCCTCTGAATGTTCTTTCCTGGAGAAACCCCCCAGCC  1378
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  TGTTAGAAAGAATGCAGACACCTTTGAAGTGTTGGACCCCTCTGAATGTTCTTTCCTGGAGAAACCCCCCAGCC  1702

Query 1379  AGCAATCCTGCCACCTCAAGCCTTGCGGAGCCAAATGGTTTAGCACCGAATGGAGCATGAGTCTACAAAGAGCC  1452
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||.|.|.|||||| 
Sbjct 1703  AGCAATCCTGCCACCTCAAGCCTTGCGGAGCCAAATGGTTTAGCACCGAATGGAGCAT--GTGTTCCAAGAGC-  1773

Query 1453  ATGCTCACCAGG-------------CC---AAGT----------------------------------------  1470
             ||    |||||             ||   ||||                                        
Sbjct 1774  -TG----CCAGGGTGGCTTTCGGGTCCGGGAAGTGCGGTGTCTGTCTGATGACATGACTCTAAGTAACCTCTGT  1842

Query 1471  --------------------------------------------------------------------------  1470
                                                                                      
Sbjct 1843  GACCCTCAGTTGAAACCAGAAGAGAGAGAATCTTGTAACCCTCAGGACTGTGTCCCTGAAGTTGATGAAAACTG  1916

Query 1471  --------------------------------------------------------------------------  1470
                                                                                      
Sbjct 1917  CAAGGACAAGTACTACAACTGCAACGTGGTGGTCCAGGCAAGACTCTGTGTCTACAACTACTACAAGACCGCCT  1990

Query 1471  --------------------------------------------------------  1470
                                                                    
Sbjct 1991  GCTGTGCCTCCTGCACCCGTGTGGCCAACAGGCAGACGGGCTTCCTGGGGAGCAGA  2046