Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_12639
• Subject: XM_017022583.1
• Aligned Length: 2084
• Identities: 1459
• Gaps: 622

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGGGCCGGTTTTATGAGTGGGAACCATTTGCAGAAGTAAAAGGCAATCGCAAATGTGAGTTGAACTGCCAGGC  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  AATGGGCTACCGCTTCTATGTACGGCAAGCTGAGAAAGTCATCGATGGCACCCCCTGTGACCAGAACGGCACGG  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  CCATCTGTGTGTCTGGGCAGTGCAAGAGCATTGGCTGTGATGACTACTTAGGCTCCGACAAAGTCGTGGACAAA  222

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  223  TGTGGGGTGTGTGGAGGAGACAACACGGGCTGTCAGGTTGTGTCGGGCGTGTTTAAGCATGCCCTCACCAGCCT  296

Query    1  ----------------------------------------------------------ATGTACAAGAGCAACA  16
                                                                      ||||||||||||||||
Sbjct  297  GGGCTACCACCGCGTCGTGGAGATTCCCGAGGGAGCCACGAAAATCAACATCACGGAGATGTACAAGAGCAACA  370

Query   17  ACTATTTGGCCCTGAGAAGTCGTTCTGGACGCTCCATCATCAATGGGAACTGGGCAATTGATCGACCAGGAAAA  90
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ACTATTTGGCCCTGAGAAGTCGTTCTGGACGCTCCATCATCAATGGGAACTGGGCAATTGATCGACCAGGAAAA  444

Query   91  TACGAGGGCGGAGGGACCATGTTCACCTACAAGCGTCCAAATGAGATTTCGAGCACTGCCGGAGAGTCCTTTTT  164
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TACGAGGGCGGAGGGACCATGTTCACCTACAAGCGTCCAAATGAGATTTCGAGCACTGCCGGAGAGTCCTTTTT  518

Query  165  GGCGGAAGGTCCCACCAACGAGATCTTGGATGTCTACATGATACACCAGCAGCCAAACCCAGGCGTGCACTACG  238
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GGCGGAAGGTCCCACCAACGAGATCTTGGATGTCTACATGATACACCAGCAGCCAAACCCAGGCGTGCACTACG  592

Query  239  AGTACGTGATCATGGGGACCAACGCCATCAGCCCCCAGGTGCCACCCCACAGGAGACCAGGGGAACCCTTCAAT  312
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AGTACGTGATCATGGGGACCAACGCCATCAGCCCCCAGGTGCCACCCCACAGGAGACCAGGGGAACCCTTCAAT  666

Query  313  GGCCAGATGGTGACAGAAGGCAGGAGCCAGGAGGAGGGAGAACAGAAAGGGAGGAACGAGGAGAAGGAAGACTT  386
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GGCCAGATGGTGACAGAAGGCAGGAGCCAGGAGGAGGGAGAACAGAAAGGGAGGAACGAGGAGAAGGAAGACTT  740

Query  387  GCGTGGGGAGGCCCCTGAGATGTTCACCTCAGAATCGGCACAGACCTTCCCAGTCAGGCATCCAGACAGATTTT  460
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GCGTGGGGAGGCCCCTGAGATGTTCACCTCAGAATCGGCACAGACCTTCCCAGTCAGGCATCCAGACAGATTTT  814

Query  461  CTCCCCATCGACCGGACAACTTGGTGCCACCAGCACCGCAGCCCCCACGGCGCAGCCGGGATCACAACTGGAAG  534
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CTCCCCATCGACCGGACAACTTGGTGCCACCAGCACCGCAGCCCCCACGGCGCAGCCGGGATCACAACTGGAAG  888

Query  535  CAGCTTGGGACAACAGAATGTTCCACGACCTGTGGGAAAGGATCGCAGTACCCTATTTTCCGCTGTGTGCACAG  608
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CAGCTTGGGACAACAGAATGTTCCACGACCTGTGGGAAAGGATCGCAGTACCCTATTTTCCGCTGTGTGCACAG  962

Query  609  AAGCACTCATGAAGAGGCTCCTGAGAGTTACTGTGACTCCAGCATGAAGCCGACCCCCGAGGAGGAGCCCTGCA  682
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  AAGCACTCATGAAGAGGCTCCTGAGAGTTACTGTGACTCCAGCATGAAGCCGACCCCCGAGGAGGAGCCCTGCA  1036

Query  683  ACATCTTCCCTTGCCCAGCCTTCTGGGACATCGGGGAGTGGTCTGAGTGCAGCAAGACCTGTGGCCTGGGCATG  756
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  ACATCTTCCCTTGCCCAGCCTTCTGGGACATCGGGGAGTGGTCTGAGTGCAGCAAGACCTGTGGCCTGGGCATG  1110

Query  757  CAGCACCGCCAGGTTCTGTGCCGCCAGGTGTACGCCAACCGCAGCCTGACGGTGCAGCCCTACCGCTGCCAGCA  830
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CAGCACCGCCAGGTTCTGTGCCGCCAGGTGTACGCCAACCGCAGCCTGACGGTGCAGCCCTACCGCTGCCAGCA  1184

Query  831  CCTGGAGAAACCTGAGACCACCAGCACCTGCCAACTCAAGATCTGCAGCGAGTGGCAGATCCGGACCGACTGGA  904
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CCTGGAGAAACCTGAGACCACCAGCACCTGCCAACTCAAGATCTGCAGCGAGTGGCAGATCCGGACCGACTGGA  1258

Query  905  CCTCGTGCTCGGTGCCCTGCGGCGTGGGACAGAGGACCCGTGATGTGAAGTGTGTGAGCAACATTGGGGATGTG  978
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CCTCGTGCTCGGTGCCCTGCGGCGTGGGACAGAGGACCCGTGATGTGAAGTGTGTGAGCAACATTGGGGATGTG  1332

Query  979  GTTGACGATGAGGAATGCAACATGAAGCTCCGGCCGAATGACATTGAGAACTGCGACATGGGACCCTGTGCCAA  1052
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GTTGACGATGAGGAATGCAACATGAAGCTCCGGCCGAATGACATTGAGAACTGCGACATGGGACCCTGTGCCAA  1406

Query 1053  GAGCTGGTTCCTCACCGAGTGGAGCGAAAGGTGCTCAGCGGAGTGTGGGGCCGGAGTGCGGACACGCTCGGTGG  1126
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GAGCTGGTTCCTCACCGAGTGGAGCGAAAGGTGCTCAGCGGAGTGTGGGGCCGGAGTGCGGACACGCTCGGTGG  1480

Query 1127  TGTGCATGACCAACCATGTCAGCAGCCTGCCCCTGGAGGGCTGTGGGAACAACCGGCCGGCAGAGGCCACCCCA  1200
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  TGTGCATGACCAACCATGTCAGCAGCCTGCCCCTGGAGGGCTGTGGGAACAACCGGCCGGCAGAGGCCACCCCA  1554

Query 1201  TGTGACAACGGACCCTGCACGGGCAAGGTGGAGTGGTTTGCCGGGAGCTGGAGTCAGTGTTCCATCGAGTGTGG  1274
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  TGTGACAACGGACCCTGCACGGGCAAGGTGGAGTGGTTTGCCGGGAGCTGGAGTCAGTGTTCCATCGAGTGTGG  1628

Query 1275  GAGCGGGACGCAACAGAGGGAGGTGATTTGTGTTAGAAAGAATGCAGACACCTTTGAAGTGTTGGACCCCTCTG  1348
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  GAGCGGGACGCAACAGAGGGAGGTGATTTGTGTTAGAAAGAATGCAGACACCTTTGAAGTGTTGGACCCCTCTG  1702

Query 1349  AATGTTCTTTCCTGGAGAAACCCCCCAGCCAGCAATCCTGCCACCTCAAGCCTTGCGGAGCCAAATGGTTTAGC  1422
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  AATGTTCTTTCCTGGAGAAACCCCCCAGCCAGCAATCCTGCCACCTCAAGCCTTGCGGAGCCAAATGGTTTAGC  1776

Query 1423  ACCGAATGGAGCATGAGTCTACAAAGAGCCATGCTCACCAGG-------------CC---AAGT----------  1470
            ||||||||||||||  ||.|.|.||||||  ||    |||||             ||   ||||          
Sbjct 1777  ACCGAATGGAGCAT--GTGTTCCAAGAGC--TG----CCAGGGTGGCTTTCGGGTCCGGGAAGTGCGGTGTCTG  1842

Query 1471  --------------------------------------------------------------------------  1470
                                                                                      
Sbjct 1843  TCTGATGACATGACTCTAAGTAACCTCTGTGACCCTCAGTTGAAACCAGAAGAGAGAGAATCTTGTAACCCTCA  1916

Query 1471  --------------------------------------------------------------------------  1470
                                                                                      
Sbjct 1917  GGACTGTGTCCCTGAAGTTGATGAAAACTGCAAGGACAAGTACTACAACTGCAACGTGGTGGTCCAGGCAAGAC  1990

Query 1471  --------------------------------------------------------------------------  1470
                                                                                      
Sbjct 1991  TCTGTGTCTACAACTACTACAAGACCGCCTGCTGTGCCTCCTGCACCCGTGTGGCCAACAGGCAGACGGGCTTC  2064

Query 1471  ------------  1470
                        
Sbjct 2065  CTGGGGAGCAGA  2076